Các tiêu chuẩn, quy chuẩn về thương mại điện tử có tầm quan trọng rất lớn đối với sự phát triển thương mại điện tử. Kế hoạch tổng thể phát triển thương mại điện tử giai đoạn 2006 – 2010 đã nhấn mạnh tới việc phát triển các công nghệ hỗ trợ thương mại điện tử trên cơ sở khuyến khích chuyển giao công nghệ từ nước ngoài, ban hành và phổ cập các tiêu chuẩn chung sử dụng trong thương mại điện tử, đặc biệt là chuẩn trao đổi dữ liệu điện tử (EDI và ebXML). Nghị định số 57/2006/NĐ-CP ngày 29/6/2006 về thương mại điện tử quy định nhiệm vụ của cơ quan quản lý nhà nước đối với việc ban hành các tiêu chuẩn về thương mại điện tử. Tiếp đó, Nghị định số 127/2007/NĐ-CP ngày 01/8/2007 quy định chi tiết thi hành một số điều của Luật Tiêu chuẩn và Quy chuẩn kỹ thuật giao cho Bộ Công Th ương trách nhiệm xây dựng, ban hành quy chuẩn kỹ thuật quốc gia cho các dịch vụ liên quan đến hoạt động thương mại và thương mại điện tử. Trong hai năm 2006 và 2007, Bộ Khoa học và Công nghệ và một số bộ ngành và doanh nghiệp đã nghiên cứu, ban hành một số tiêu chuẩn và ứng dụng EDI và ebXML. Tuy nhiên, việc ban hành và phổ biến các tiêu chuẩn và quy chuẩn quốc gia về thương mại điện tử vẫn chưa tương xứng với xu hướng phát triển của loại hình giao dịch doanh nghiệp với doanh nghiệp (B2B) quy mô lớn. Năm 2008 các cơ quan quản lý nhà nước, đặc biệt là Bộ Công Th ương và Bộ Khoa học và Công nghệ cần đẩy mạnh hoạt động xây dựng, ban hành và phổ biến các tiêu chuẩn, quy chuẩn quốc gia về thương mại điện tử.