IV. CÁCH XÁC ĐỊNH TẦN SỐ HOÁN VỊ GEN
2.2Xét trường hợp ba cặp gen dị hợp tử tức là bốn lớp tám kiểu hình
3. Ứng dụng nhận dạng kiểu gen củ aP khi biết tỷ lệ kiểu hìn hở đời con
2.2Xét trường hợp ba cặp gen dị hợp tử tức là bốn lớp tám kiểu hình
Ở đây chúng ta chỉ xét trường hợp F1 dị hợp tử ba cặp gen có trao đổi chéo kép với lai phân tích
Để dễ hình dung chúng ta xét một số bài toán cụ thể như sau
Bài toán 1. Xét 3 gen liên kết theo trật tự sau A 30 B 20 D
Nếu một thể dị hợp tử cả 3 cặp gen
aBd AbD
được lai với
abd abd
thì tỷ lệ các kiểu hình theo lý thuyết là bao nhiêu trong hai trường hợp có nhiễu và không có nhiễu? Giả sử tần số của các cá thể có trao đổi chéo kép là tích các tần số trao đổi đơn
Vì đây là phép lai phân tích nên tần số của các loại giao tử sẽ bằng tần số của các kiểu hình * Ta xét trường hợp không có nhiễu tức I = 0
- Tính tần số của trao đổi chéo kép
Các lớp kiểu hình do trao đổi chéo kép là ABD và abd. Vậy tần số trao đổi chéo kép là 06 . 0 2 . 0 3 .
0 × = . Vì tái tổ hợp là tương hỗ nên 0.06 0.03 2
1× = là tần số của mỗi lớp ABD và
abd và bằng 0.03.
- Tính tần số trao đổi chéo đơn giữa A và B
Ta có tần số trao đổi chéo giữa A và B là 0.3 tần số này bằng tổng tần số trao đổi chéo đơn và tần số trao đổi chéo kép, vì vậy
Tần số trao đổi chéo – tần số trao đổi chéo kép = tổng tần số của các trao đổi chéo đơn Vậy tần số trao đổi chéo đơn giữa A và B là 0.3−0.06=0.24
Tần số mỗi lớp ABd và abDsẽ bằng 0.12
- Tính tần số trao đổi chéo đơn giữa B và D 14 . 0 06 . 0 2 .
0 − = tần số mỗi lớp Abd và aBD là 0.07
- Tính các cá thể tạo ra do liên kết gen hoàn toàn bằng cách lấy 1 trừ đi tất cả các cá thể có tái tổ hợp 56 . 0 ) 06 . 0 14 . 0 24 . 0 ( 1− + + =
Tần số mỗi lớp AbD và aBd sẽ là 0.28 * Trường hợp có nhiễu với I = 0.2
Trong một số trường hợp việc xẩy ra một trao đổi chéo sẽ ức chế hoặc khuếch đại một trao đổi chéo thứ hai bên cạnh. Hiện tượng này được gọi là nhiễu (I – interference) và được tính I = 1 – CC
Để tính toán trước hết tần số trao đổi chéo kép theo lý thuyết phải được tính lại như sau Vì I = 1 – CC do CC = 0.8
CC = (tần số trao đổi chéo kép thực tế)/(tần số trao đổi chéo kép lý thuyết)
Tức là 0.8 = (tần số trao đổi chéo kép thực tế)/(tần số trao đổi chéo kép lý thuyết) Suy ra - Tần số trao đổi chéo kép thực tế = 0.8×0.06=0.048
- Vì vậy tần số các lớp trao đổi chéo kép bằng 0.048
- Tần số trao đổi chéo đơn giữa A và B là 0.3−0.048=0.252 - Tần số trao đổi chéo đơn giữa B và D là 0.2−0.048=0.152 - Và tần số các lớp không do trao đổi chéo tạo thành là 0.548
Bài 2. Xét có thể có 3 cặp gen lặn liên kết với nhau: abdabd cùng nằm trên nhiễm sắc thể thứ hai của ruồi giấm. Khoảng cách giữa 3 gen như sau
…a……….15cM…………b……….7cM…….d…
Nếu lai con cái aBDAbd với con đực abdabd . Cho CC = 0.6. Hãy tính tần số các lớp kiểu hình. Giải:
Trước hết ta cần hiểu hệ số CC là gì?
Tần số trao đổi chéo kép theo lý thuyết được tính bằng tích của các tần số trao đổi chéo đơn. Tuy nhiên tần số trao đổi chéo kép thực tế (được tính bằng tổng số cá thể tạo thành từ trao đổi chéo kép so với tổng số cá thể nghiên cứu) có thể sai khác với tần số trao đổi chéo kép lý thuyết. Từ đó ta có khái niệm hệ số trùng lặp (CC – coefficient of coincidence)
CC = (tần số trao đổi chéo kép thực tế)/(tần số trao đổi chéo kép lý thuyết)
Trao đổi chéo đơn giữa a và b đó là ABD và abd ; và trao đổi chéo đơn giữa b và d là AbD và
aBd. Trao đổi chéo kép là ABd và abD. Vì a cách b 15cM và b cách d 7 cM nên tần số trao đổi chéo kép lý thuyết là 0.15×0.07=0.0105.
Vậy tần số trao đổi chéo kép thực tế là CC×0.0105=0.6×0.0105=0.006 Vì các lớp tương hỗ có tỷ lệ bằng nhau nên tần số mỗi lớp ABd = abD=0.003 Tần số trao đổi chéo đơn giữa a và b là: 0.15−0.006=0.144 => mỗi lớp
ABD = abd = 0.072
Tần số trao đổi chéo đơn giữa b và d là: 0.07−0.006=0.064 => mỗi lớp
AbD = aBd = 0.032
Tần số lớp không có tái tổ hợp còn lại là: 1−(0.006+0.144+0.064) =0.786 Mỗi lớp Abd = aBD là 0.393
2786 786 . 0 = Kết quả ta có ở thế hệ lai tỷ lệ Abd 0.393 AbD 0.032 aBD 0.393 aBd 0.032 ABD 0.072 ABd 0.003 abd 0.072 abD 0.003