Trong quỏ trỡnh tổ chức chứng từ, kế toỏn đảm bảo đỳng nguyờn tắc về biểu mẫu, luõn chuyển, ký duyệt đồng thời cũng tuõn thủ cỏc chế độ, kiểm tra, ghi số, bảo quản, lưu trữ và huỷ chứng từ. Khi tập hợp đủ chứng từ thỡ kế toỏn mới tiến hành ghi sổ. Vỡ vậy, đảm bảo tớnh đầy đủ, an toàn cho chứng từ. Việc sắp xếp, phõn loại chứng từ cũng được thực hiện một cỏch hợp lý, chứng từ của phần hành kế toỏn nào thỡ kế toỏn
phần hành đú chịu trỏch nhiệm bảo quản và lưu trữ. Cỏc chứng từ về thu chi nhập xuất đều được sắp xếp và đúng file để tiện theo dừi.
Hệ thống sổ sỏch, chứng từ ban đầu được tổ chức khoa học hợp phỏp, hợp lệ, tuõn thủ đỳng chế độ kế toỏn hiện hành của bộ trưởng bộ tài chớnh. Việc ỏp dụng hỡnh thức kế toỏn nhật ký chung hoàn toàn phự hợp quy mụ sản xuất, kinh doanh của cụng ty, phự hợp chuyờn mụn kế toỏn cựng việc ỏp dụng chương trỡnh kế toỏn mỏy tại cụng ty.
Mỗi loại chứng từ cú một vị trớ khỏc nhau trong quản lý và tổ chức cú đặc điểm khỏc nhau. Sự khỏc nhau khụng chỉ về nội dung mà cũn khỏc nhau về trỡnh tự cũng như thời gian luõn chuyển. Điều này cũn phụ thuộc vào quy mụ, đặc điểm của từng đơn vị. Hoàn thiện luõn chuyển chứng từ tức là làm sao cho việc luõn chuyển đú được nhanh nhất mà vẫn đảm bảo được nguyờn tắc tài chớnh kế toỏn. Trong cụng việc hạch toỏn tổng hợp, vận dụng hợp lý hệ thống tài khoản kế toỏn cũng là một yếu tố quan trọng vỡ hạch toỏn tổng hợp là việc ghi chộp phản ỏnh cỏc nghiệp vụ kinh tế phỏt sinh một cỏch tổng hợp trờn cơ sở cỏc chứng từ cung cấp từ khõu hạch toỏn ban đầu tạo ra cỏc thụng tin tổng hợp để đỏp ứng cỏc nhu cầu quản lý. Trờn cơ sở thụng tin này cấp trờn cú thể cú những quyết định kịp thời đem lại hiệu quả cao cho đơn vị.
Hệ thống chứng từ ban đầu phản ỏnh số lượng, chất lượng lao động, cỏc bảng chấm cụng, phiếu giao việc, sổ số ngày cụng làm việc được ghi chộp chớnh xỏc rừ ràng. Lưu chuyển chứng từ sổ sỏch theo đỳng trỡnh tự như quy định đảm bảo tớnh chớnh xỏc số liệu nghiệp vụ kinh tế phỏt sinh. Việc thanh toỏn lương được thực hiện tương đối tốt, đỳng kỳ hạn, chớnh xỏc hợp lý thoả đỏng cho người lao động.