Cú thể núi hệ thống thụng tin là trỏi tim của mọi hoạt đọng núi chung và hoạt động logistics núi riờng, quản lý chuỗi logistics là quản lý cả dũng vật chất lẫn dũng thụng tin. Nếu thiếu một trong hai thỡ hoạt động đú chưa phải là hoạt động logistics thật sự.Chi nhỏnh chủ yếu vẫn sử dụng hệ thống thụng tin truyền thống (điện thoại, fax, email) để trao đổi thụng tin, gửi và nhận chứng từ với khỏch hàng, hải quan. Trong khi những nước quanh ta như Singapore, Thailand, Malaysia…đó ỏp dụng hệ thống trao đổi thụng tin điện tử cho phộp cỏc bờn liờn quan liờn lạc với nhau bằng kỹ thuật mạng tin học tiờn tiến,thụng quan bằng cỏc thiết bị điện tử. Hầu như cỏc cụng ty Việt Nam núi chung và Chi nhỏnh núi riờng, chưa cụng ty nào cú phần mềm hay hệ thống thụng tin kết nối với cỏc đối tỏc của riờng mỡnh.
Mức độ ứng dụng cụng nghệ thụng tin và thương mại điện tử chưa cao, chưa đồng bộ và chưa thực sự đạt hiệu quả. Chi nhỏnh chưa tham gia sử dụng chứng từ điện tử và hợp đồng điện tử. Nếu xột trờn khớa cạnh xõy dựng website thỡ website Cụng ty cổ phần Hàng hải Sài Gũn núi chung và Chi nhỏnh miền bắc cụng ty cổ phần Hàng Hải Sài Gũn núi riờng, chỉ mang tớnh giới thiệu đơn thuần về doanh nghiệp, về dịch vụ của doanh nghiệp mà chưa cung cấp được cỏc tiện ớch mà khỏch hàng cần như cụng cụ theo dừi đơn hàng( track and trace), lịch tàu, đăng kớ điện tử (e-booking), theo dừi chứng từ…..
Chi nhỏnh mới chỉ xử lý đơn hàng trờn hệ thống phần mềm quản lý như BPCS, hay Web Map Service – WMS .
Trong khi đú, cỏc doanh nghiệp lớn trong ngành tại Việt Nam đó ỏp dụng cụng nghệ thụng tin rất nhiều trong việc cung cấp dịch vụ logisitcs. Vớ dụ Hệ thống thụng tin của Maersk bao gồm: Hệ thống trao đổi thụng tin giữa cỏc văn phũng Maersk logistics trờn khắp thế giới - Maersk communication system (MCS); hệ thống quản lý đơn hàng - Operation & documentation Excution system (MODS); hệ thống cho phộp cụng ty gửi những yờu cầu xếp
hàng qua mạng nhanh chúng và tiện lợi - online booking & documentation system for shipper (M*power shipper); kiểm tra tỡnh trạng hàng húa của khỏch hàng - client visibility tool( M*Power); hệ thống tự động tớnh toỏn - global airfreight system và phỏt hành chứng từ cho cỏc lụ hàng hàng khụng, quản lý mó hàng - e-label system, in nhón hiệu hàng húa, mó số, mó vạch.
Một trong những nguyờn nhõn chớnh khiến cho khả năng ỏp dụng cụng nghệ thụng tin vào hoạt động cung cấp dịch vụ logistics của chi nhỏnh chưa thực sự tốt là vốn đầu tư. Để ỏp dụng bất kỡ chương trỡnh quản trị hay hỗ trợ hoạt động nào cũng đũi hỏi việc đầu tư 1 khoản tiền rất lớn cũng như việc xõy dựng 1 đội ngũ nhõn viờn tiếp quản và triển khai cỏc ứng dụng đú. Đõy khụng phải là một việc dễ thực hiện đối với chi nhỏnh. Tuy nhiờn, việc ứng dụng nhiều hơn nữa những thành tựu trong lĩnh vực cụng nghệ thụng tin vào việc cung cấp dịch vụ của chi nhỏnh là một vấn đề cấp thiết, và để ứng dụng thành cụng thỡ phải cú kế hoạch lõu dài.