Đối với bất kỳ một dự án nào thì quy trình soạn thảo đều có ảnh hưởng lớn đến chất lượng công tác lập dự án. Hiệu quả dự án đầu tư phụ thuộc rất nhiều vào sự phối hợp, phân công, bố trí công việc giữa các phòng ban trong công ty. Do vậy, để công tác lập dự án ngày càng hoàn thiện hơn, thì quy trình thực hiện dự án đầu tư của
Các dự án được lập tại Công ty đều được tuân theo quy trình như đã trình bày ở phần trên, phù hợp với xu hướng chung nhưng đôi khi rập khuôn cũng gây nên những hạn chế, giảm tính sáng tạo trong từng dự án cụ thể. Quy trình soạn thảo dự án đầu tư được tuân theo hai quy trình: quy trình thông thường và quy trình theo cấp độ nghiên cứu. Tùy từng dự án mà người lập dự án sẽ sử dụng quy trình cho phù hợp, hoặc kết hợp cả hai quy trình. Khi sử dụng quy trình thông thường vẫn còn một số hạn chế gặp phải do đó một số dự án thực hiện chưa được tốt. Lập dự án có ảnh hưởng rất lớn đến tiến độ thi công công trình. Do công ty Vinashin Motor là đơn vị trực thuộc Tập đoàn nên dự án được soạn thảo xong phải qua nhiều cấp có thẩm quyền thẩm định, phê duyệt. Lập dự án sẽ do phòng Dự án tại Công ty trực tiếp soạn thảo, sau đó sẽ được trình lên Giám đốc Công ty thẩm định, phê duyệt, cuối cùng sẽ được trình lên Tập đoàn thẩm định và cho phép đầu tư. Do đó, nếu dự án không đạt yêu cầu sẽ phải chỉnh sửa, bổ sung, hơn nữa lại qua nhiều cấp thẩm định rất mất thời gian, làm chậm tiến độ dự án. Bên cạnh đó, hầu hết các dự án được lập đều không thực hiện đầy đủ việc nghiên cứu trong 3 giai đoạn: nghiên cứu cơ hội đầu tư, nghiên cứu tiền khả thi, nghiên cứu khả thi mà đi thẳng vào nghiên cứu khả thi nên chất lượng chưa cao. Vì vậy, giải pháp đưa ra là: với bước lập đề cương kế hoạch thực hiện, CNDA cần tiến hành lập chi tiết, cụ thể, đưa ra các mốc thời gian quy định cán bộ lập dự án phải hoàn thành công việc của mình đúng thời gian. Tiếp đó, cấn tập hợp, thu thập đầy đủ tài liệu, thông tin có liên quan cho công tác lập dự án. Khi tiến hành lập dự án chính thức cần tăng cường công tác giám sát, kiểm tra, đôn đốc cán bộ lập dự án hoàn thành công việc theo đúng thời gian tiến độ.
Lập dự án là công việc mang tính chất tập thể, trách nhiệm gắn liền với từng phòng ban và từng cá nhân tham gia soạn thảo dự án. Để thồng nhất được toàn bộ ý kiến của từng phòng ban và cá nhân là một việc không phải lúc nào cũng thuận lợi. Việc lập dự án không chỉ do mỗi phòng Dự án đảm nhiệm mà còn bao gồm các cán bộ phòng xây dựng, phòng kinh doanh, phòng tổ chức hành chính nhân sự cùng phối hợp với phòng dự án, do đó sẽ có những quan điểm khác nhau về dự án được lập mà lập dự án là công việc rất cần sự nỗ lực của cả tập thể. Điều này ảnh hưởng rất lớn
đến chất lượng của dự án được lập và hơn nữa gây lên sự thất thoát, lãng phí. Vì vậy, để công tác lập dự án ngày càng hoàn thiện hơn thì cần đổi mới và hoàn thiện quy trình lập dự án tại Công ty. Cần thành lập tổ chuyên viên chuyên trách trong lĩnh vực lập dự án và cử một người làm quản lý, giám sát, kiểm tra việc thực hiện công việc. Phải cần có sự phối hợp thống nhất giữa các phòng ban trong Công ty để chất lượng của dự án được lập tốt hơn. Bên cạnh đó, cần tăng cường công tác kiểm tra, giám sát tiến trình thực hiện công việc. Đồng thời phải thường xuyên nâng cao năng lực trình độ cho CNDA là người chịu trách nhiệm cao nhất và có quyết định lớn nhất đến các công việc liên quan đến dự án. Ngoài ra, cần phải xây dựng cơ cấu tổ chức hợp lý tại Công ty. Bất kỳ một công ty nào muốn hoạt động tốt trước hết phải có một bộ máy quản lý tốt. Nếu Công ty được tổ chức quản lý tốt thì có thể đẩy nhanh được tiến độ thực hiện công việc, tiết kiệm được thời gian và chi phí, sức lực của con người. Bộ máy quản lý của công ty bao gồm các bộ phận: Đại hội đồng cổ đông, hội đồng quản trị, ban kiểm soát, giám đốc, phó giám đốc, và các phòng ban. Nếu chức năng lãnh đạo của Công ty luôn được đảm bảo và phù hợp thì các hoạt động của công ty sẽ đi đúng hướng đạt hiệu quả như mong muốn.Do đó, trong thời gian tới công ty nên bồi dưỡng năng lực quản lý cho bộ phân lãnh đạo, bổ sung những nhân sự có trình độ chuyên môn cao trong công tác lập dự án. Cần phân công nhiệm vụ cho các phòng ban một cách rõ ràng là nhiệm vụ hết sức cần thiết hiện nay để khắc phục tình trạng làm việc chồng chéo nhau, đùn đẩy trốn tránh nhiệm vụ. Phải có sự thống nhất, phối hợp chặt chẽ về công việc giữa các phòng ban trong công ty để tạo ra sự thông suốt trong quá trình quản lý các hoạt động của dự án nhằm tạo ra hiệu quả tốt nhất.