Đối với công tác tham dự thầu của công ty, bên cạnh những thành tựu đạt được vẫn còn tồn tại một số hạn chế cần khắc phục. Có thể dẫn ra một số hạn chế nổi bật như sau:
Thứ nhất, đa số các gói thầu đã trúng đều thuộc lĩnh vực xây lắp
Như đã nêu trên, lĩnh vực kinh doanh chính của LICOGI 13 là nhận thầu xây lắp và kinh doanh vật liệu xây dựng. Tuy nhiên đa số những gói thầu mà công ty tham gia mới chỉ là các gói thầu xây lắp. Còn các gói thầu cung cấp hàng hóa, dịch vụ chỉ chiếm một tỷ trọng nhỏ trong cơ cấu các gói thầu đã trúng của công ty. Thông thường vật liệu xây dựng thuộc phạm vi kinh doanh của LICOGI 13 nhằm phục vụ trực tiếp cho các gói thầu xây lắp của công ty. Nhưng điều đó cũng cho thấy cung cấp vât liệu xây dựng đơn thuần chưa phải là thế mạnh của LICOGI 13. Điều này đồng nghĩa với việc trong các gói thầu cung cấp hàng hoá, uy tín và năng lực của công ty chưa thực sự đủ mạnh để có thể giành được hợp đồng
Có thể nhận thấy trong năm 2008, công ty chỉ tham gia thi công khoảng 5 công trình các loại. Nếu đánh giá một cách tổng thế thì có thể nói đây cũng chưa phải là tỷ lệ thấp nhất trong tất cả các năm. Tuy nhiên nếu kết hợp đánh giá sự phát triển của công nghiệp xây dựng trong nước và thâm niên hoạt động trong lĩnh vực xây lắp của công ty thì đây chưa phải là con số tương xứng với tiềm lực của LICOGI 13.
Thứ ba, một số gói thầu đã thua với nguyên nhân đáng tiếc
Qua đánh giá HSDT của một số gói thầu đã thua, có thể thấy công tác chuẩn bị HSDT của công ty được thực hiện khá công phu. Tuy nhiên có một số gói thầu công ty đã thua do chính những nguyên nhân chủ quan