Vị trí địa lý vùng bãi bồi ven biển huyện Kim Sơn nằm trong khoảng: 19026'40'' - 20000' Vĩ độ Bắc.
10602'05'' - 106005'20'' Kinh độ Đông.
Vùng nghiên cứu (BM1 - BM3) nằm phía Đông huyện Kim Sơn, phía Bắc giáp các xã Cồn Thoi, thị trấn Bình Minh, Kim Tân, phía Nam giáp vịnh Bắc Bộ, phía Đông có sông Đáy và phía Tây có sông Càn.
Khí hậu vùng bãi bồi Kim Sơn nằm trong hệ khí hậu nhiệt đới gió mùa, Nhịp điệu mùa của vùng đợc phân chi tiết nh sau:
- Mùa ma từ tháng 6 đến tháng 10 hàng năm (trùng với mùa hè), chiếm 70% lợng ma cả năm của khu vực.
- Mùa khô kéo dài từ tháng 11 đến tháng 3 hoặc tháng 4 năm sau (trùng với mùa Đông), trong đó, mùa khô hạn nhất tập trung vào tháng 3 - tháng 4 (xem bảng 1)
Bảng 1: Một số đặc trng khí hậu của vùng bãi bồi Kim Sơn
T Đặc trng khí hậu của vùng Đơn vị Trị số ở vùng
nghiên cứu 1 Vận tốc gió Trung bình m/s 3,8 2 Bức xạ Tổng bức xạ Kcal/cm2 120,000 8 Lợng ma Mùa ma nhiều Các tháng ma lớn Các tháng ma ít mm mm/tháng mm/tháng 1658 347/tháng 8 -395/tháng 9 208/tháng 3 - tháng 11 10 Tổng số giờ nắng Trong mùa ma Trong tháng VII Trong tháng VIII Trong tháng IX Giờ 1120 217 174 168
Nguồn: "Đặc điểm khí hậu, thuỷ văn tỉnh Ninh Bình", Tổng cục khí tợng, thuỷ văn, 1998
Khí hậu vùng bãi bồi có ảnh hởng khá lớn tới đời sống, sản xuất và phát triển vùng: Mùa ma kéo dài từ tháng 6 đến tháng 10 hàng năm (nhất là ma bão) ảnh hởng rất lớn đến việc thu hoạch tôm, cua.... tổng bức xạ của vùng là khá lớn (120,000 Kcal/cm2), nhiệt độ trung bình mặt đất, tổng lợng bốc hơi trong vụ hè thu khá cao (260C và 487 mm)... ảnh hởng không nhỏ tới năng suất cây lúa, công việc chăm sóc, nuôi trồng thuỷ hải sản...
Chế độ thuỷ văn vùng bãi bồi Kim Sơn là chế độ thuỷ văn biển Đông và thuỷ văn cửa sông. Chế độ thuỷ văn cửa sông chịu ảnh hởng lớn nhất là cửa sông Đáy, một trong những cửa sông quan trọng của hệ thống sông Hồng, đóng vai trò quan trọng trong vận tải nớc và bùn cát từ đất liền ra biển Đông (khoảng 23% lợng nớc lũ và bùn cát của sông Hồng).
Hàng năm, có 1- 2 trận bão đổ bộ trực tiếp và 2- 3 trận bão khác ảnh hởng tới vùng này. Nớc biển dâng trong bão tại vùng này chỉ khi cơn bão có tâm đổ bộ vào khu vực bờ biển Thanh Hoá và Bắc Nghệ An. Qua tính toán cho thấy, mực nớc dâng trong bão có thể đạt từ 2-3 m tại vùng bãi bồi Kim Sơn.
Vùng này nằm trong vùng bồi lắng, tích tụ, xu thế ngày càng phát triển ra biển. Sự bồi tụ này do hai yếu tố biển và sông tạo nên và có xu hớng phát triển về phía Nam (ảnh hởng của sông Đáy và sông Càn - hớng chảy của hai sông này đều có hớng Bắc Nam).