Thanh tra ngân hàng thực hiện quy chế giám sát từ xa, căn cứ và các báo cáo cân đối tài khỏan kế toán, các chỉ tiêu báo cáo thống kê ngoài cân đối và các loại báo cáo khác do tổ chức tín dụng gửi đến theo chế độ báo cáo thống kê đối với các tổ chức tín dụng, Thanh tra ngân hàng đã xử lý số liệu, tổng hợp và phân tích tình hình hoạt động đối với từng TCTD và toàn hệ thống TCTD theo các nội dung cụ thể. Phần mềm xử lý số liệu cho hoạt động giám sát từ xa viết trên môi trường FOXPRO nên có nhiều hạn chế; chạy trên máy PC đơn lẻ nên khó khăn trong việc chia sẻ dữ liệu; dữ liệu đầu vào chưa đầy đủ; xử lý dữ liệu không đồng bộ, tính tự động hóa thấp, kết xuất đầu ra cứng nhắc không thuận tiện cho người sử dụng vì công nghệ áp dụng đã lạc hậu, thiếu độ linh hoạt, việc chuyển đổi dữ liệu sang các chế độ ứng dụng như Ecxel, Winword không thực hiện được, không có khả năng kết nối với các ứng dụng khác (ví dụ với các ứng dụng của Trung tâm thông tin tín dụng CIC)
Tính linh hoạt của phần mềm chương trình giám sát từ xa đang sử dụng thấp nên không thể đáp ứng được các yêu cầu hiện tại và tương lai. Quá trình cải cách hành chính ngành ngân hàng và đổi mới hoạt động của thanh tra ngân
hàng yêu cầu áp dụng một hệ thống mở, có độ linh hoạt cao để có thể bổ sung, sửa đổi chương trình bất cứ khi nào mà không phải lập trình thêm.
Các cuộc thanh tra tại chỗ được tiến hành hiện nay vẫn chủ yếu dựa trên công nghệ thủ công là giấy bút. Tuy đã có sự hỗ trợ của máy tính nhưng vẫn không thể đáp ứng yêu cầu mở rộng mạng lưới chi nhánh và ứng dụng công nghệ hiện đại trong việc cung cấp các dịch vụ ngân hàng hiện đại của các NHTM. Do đó, công nghệ quản lý của NHNN cũng phải được tăng cường để đáp ứng yêu cầu phát triển mạnh mẽ của hệ thống ngân hàng và yêu cầu hội nhập trong lĩnh vực tài chính ngân hàng trong thời gian tới.