Thủ đô Hà Nội là trung tâm tài chính tiền tệ, là nơi tập trung các cơ quan đầu não của các định chế tài chính, các tổ chức kinh tế lớn, thu nhập và trình độ dân trí cao…nên đây là địa bàn tiềm năng của hoạt động ngân hàng, đặc biệt là hoạt động huy động vốn. MHB Chi nhánh Hà Nội ra đời trong bối cảnh cạnh tranh khốc liệt giữa các ngân hàng, huy động vốn lại là chiến lợc kinh doanh của nhiều ngân hàng trên địa bàn nên công tác huy động vốn ngay từ đầu đã đợc Ban Lãnh đạo MHB Chi nhánh Hà Nội đặc biệt quan tâm.
Huy động vốn bao gồm toàn bộ các hoạt động tạo ra nguồn vốn cho ngân hàng. Tuy nhiên, MHB Chi nhánh Hà Nội đơn thuần chỉ là chi nhánh của một NHTM, mới đi vào hoạt động nên nguồn vốn huy động của MHB Chi nhánh Hà Nội chỉ bao gồm các nguồn tiền gửi.
Chính thức đi vào hoạt động từ ngày 16/10/2003, đến thời điểm 31/12/2003, tổng nguồn vốn của MHB Chi nhánh Hà Nội đạt 187,5 tỷ đồng, đến cuối năm 2004,
tổng nguồn vốn đạt 2465 tỷ đồng, thời điểm cuối năm 2005, tổng nguồn vốn đã lên tới 3075 tỷ đồng, cuối năm 2006 tổng nguồn vốn đạt con số kỷ lục 3887 tỷ đồng. Tốc độ tăng trởng vốn bình quân hàng năm đạt trên 400% cho thấy mặc dù gặp nhiều khó khăn từ buổi đầu thành lập, nhng chỉ sau hơn 3 năm hoạt động, MHB Chi nhánh Hà Nội đã hoàn toàn chủ động đợc nguồn vốn của mình, đáp ứng nhu cầu sử dụng vốn tại Chi nhánh và hệ thống, quan trọng hơn MHB Chi nhánh Hà Nội đã khẳng định đợc vị thế của Ngân hàng Phát triển nhà đồng bằng sông Cửu Long trên địa bàn Thủ đô Hà Nội, khẳng định bớc đi đúng đắn của MHB khi mở rộng hoạt động ra các tỉnh phía Bắc.