Các doanh nghiệp nộp thuế giá trị gia tăng theo phơng pháp khấu trừ có trách nhiệm tự kê khai, xác định mức thuế phải nộp đúng theo quy định và chủ động nộp thuế vào kho bạc nhà nớc theo thông báo của cơ quan thuế.
Do đặc điểm của lĩnh vực xây dựng là khá phức tạp cùng với tính tự giác của doanh nghiệp cha cao nên việc kê khai thuế đầu ra đầu vào là cha hợp lý. Thực tế cho thấy có rất nhiều dấu hiệu tiêu cực đã xảy ra, vì ai cũng muốn lợi cho riêng mình mà bất chấp thủ đoạn, bên mua, bên bán cấu kết với nhau, bên bán cần có hoá đơn có số thuế thấp, bên mua cần có hoá đơn có số thuế cao, hoặc có trờng hợp mua hàng hoá về không sử dụng cho mục đích kinh doanh nhng vẫn kê khai sử dụng cho mục đích kinh doanh để đợc khấu trừ.
Dới đây là một số doanh nghiệp điển hình vi phạm trong kê khai thuế đầu ra, đầu vào:
Đơn vị tính: Triệu đồng Tên doanh
nghiệp Thuế Năm 2003 Năm 2004 GTGT đầu ra Thuế GTGT đầu vào Thuế GTGT phải nộp Thuế GTGT đầu ra Thuế GTGT đầu vào Thuế GTGT phải nộp DN XD Xuân Chung 204 280 - 76 300 428 - 128 Công ty TNHH Phú Quý 6 172 135 37 280 147 133 Khách Sạn Huy Hoàng 532 416 116 613 462 151
CTy XD Miền
Đông 1233 871 326 901 1365 - 464
DN XD Trung
Thành 238 235 3 546 528 18
Qua bảng số liệu trên ta thấy có một số doanh nghiệp có số thuế giá trị gia tăng đầu vào đợc khấu trừ lớn hơn số thuế đầu ra nh: doanh nghiệp xây dựng Xuân Chung, trong năm 2003 có số thuế phải nộp là (- 76 triệu đồng), trong năm 2004, doanh nghiệp này có số thuế phải nộp là ( - 128 triệu đồng). Theo quy định của luật thuế giá trị gia tăng thì những đơn vị có số thuế dầu vào lớn hơn số thuế đầu ra trong 3 tháng liên tục thì sẽ đợc xét hoàn thuế. Qua điều tra của cơ quan thuế thì thấy doanh nghiệp xây dựng Xuân Chung có số thuế phải nộp là ( - 76 triệu đồng) năm 2003 và ( - 128 triệu đồng) năm 2004 nhng không phải trong 3 tháng liên tục nên không đợc hoàn thuế mà đợc khấu trừ vào các tháng tiếp theo tức là sẽ đợc trừ vào số thuế phải nộp của các tháng tiếp theo.
Ngoài ra còn có một doanh nghiệp nữa có số thuế đầu vào lớn hơn đầu ra là Công ty xây dựng Miền Đông thuế đầu vào là 1365 triệu đồng, thuế đầu ra là 901 triệu đồng, số thuế phải nộp là ( - 464 triệu đồng ).
Qua điều tra thì thấy doanh nghiệp này có số thuế đầu vào lớn hơn số thuế đầu ra trong 3 tháng liên tiếp nên doanh nghiệp này đã đợc hoàn thuế. Số tiền đợc hoàn là ( - 464 triệu đồng) còn Công ty TNHH Phú Quý 6 và Doanh nghiệp Trung Thành , Khách Sạn Huy Hoàng đều có số thuế giá trị gia tăng đầu ra lớn hơn số thuế giá trị gia tăng đầu vào, và số thuế mà 3 doanh nghiệp này nộp cho nhà nớc mỗi năm đều tăng. Cụ thể đối với doanh nghiệp Phú Quý 6 năm 2004 thuế phải nộp là (133 triệu đồng), Khách Sạn Huy Hoàng năm 2004 số thuế phải nộp là (151 triệu đồng) doanh nghiệp Trung Thành năm 2004 thuế phải nộp là (18 triệu đồng),
điều này chứng tỏ doanh nghiệp mỗi năm đều có doanh thu tăng nên số thuế nộp cho nhà nớc càng cao.
Nhìn chung công tác quản lý kê khai thuế đầu ra, đầu vào để xác định số thuế giá trị gia tăng phải nộp là một vấn đề hết sức phức tạp đòi hỏi cán bộ thuế phải có chuyên môn cao, bên cạnh đó còn phải đi sâu tìm hiểu thực tế để nhanh chóng phát hiện và ngăn chặn các sai phạm trong quy trình quản lý thuế.