- Thiếu sự thống nhất cỏc quy trỡnh làm thủ tục hải quan nhập khẩu mỏy múc, thiờt bị tạo tài sản cố định của dự ỏn đầu tư tại tất cả cỏc Chi cục trờn toàn quốc.
- Quy trỡnh thủ tục hải quan nhập khẩu mỏy múc, thiết bị tạo tài sản cố định của dự ỏn đầu tư về cơ bản vẫn là một quy trỡnh thủ cụng, mặc dự cú ứng dụng cụng nghệ thụng tin ở một số cụng đoạn nhưng cũn thiếu đồng bộ và chưa đỏp ứng được yờu cầu.
- Tỷ lệ khai bỏo từ xa của cỏc doanh nghiệp nhập khẩu mỏy múc, thiết bị tạo tài sản cố định của dự ỏn đầu tư phõn bổ khụng đồng đều giữa cỏc địa phương, cú nơi tỷ lệ này rất thấp hoặc chưa thực hiện.
- Xảy ra tỡnh trạng chồng chộo nghiệp vụ giữa bước 1 và bước 2.
- Tỷ lệ hàng thực kiểm cũn lớn và kiểm húa thủ cụng tạo ra cỏc kẽ hở để cỏn bộ cụng chức hải quan nhũng nhiễu gõy phiền hà cho doanh nghiệp.
- Thời gian thụng quan cũn tương đối dài ở cỏc khõu thụng quan như tiếp nhận tờ khai, kiểm tra sơ bộ, kiểm tra tớnh thuế, kiểm tra hàng húa.
- Việc xỏc định trị giỏ tớnh thuế đối với mặt hàng này cũn mang nặng tớnh hỡnh thức, đối phú.
- Đa số mỏy múc, thiết bị tạo tài sản cố định của dự ỏn đầu tư đều thuộc đối tượng được miễn giảm thuế, tuy nhiờn, việc xột miễn giảm thuế vẫn thực hiện thủ cụng mang nặng tớnh chủ quan, tạo kẽ hở cho gian lận thương mại.
- Cỏn bộ hải quan gặp khú khăn rất lớn trong việc xỏc định sự đồng bộ, phự hợp của cỏc thiết bị mỏy múc khi đó thỏo rời để nhập khẩu cả dõy chuyền trong khõu kiểm tra thực tế hàng hoỏ đối với mặt hàng này.
- Quy trỡnh thủ tục hải quan nhập khẩu mỏy múc, thiết bị tạo tài sản cố định của dự ỏn đầu tư chưa tỏch bạch được việc kiểm tra thực tế hàng hoỏ đối với hàng hoỏ luồng xanh và luồng vàng.
- Cụng tỏc phỳc tập hồ sơ mặt hàng này chưa được chỳ trọng, khụng giỳp ớch được nhiều cho quy trỡnh kiểm tra sau thụng quan.
- Bộ hồ sơ hải quan cần nộp của doanh nghiệp nhập khẩu mỏy múc, thiết bị tạo tài sản cố định của dự ỏn đầu tư cũn phức tạp.