Kháng nguyên O:
Hiện nay đã tìm thấy gần 70 yếu tố kháng nguyên O khác nhau. Dựa trên kháng
nguyên O người ta chia Salmonella thành các nhĩm A.B,C,D… Mỗi nhĩm mang một yếu tố kháng nguyên đặc hiệu nhĩm. Mỗi lồi mang một yếu tố khác nhau, những yếu tố đĩ cấu tạo thành cơng thức O của từng lồi.
Kháng nguyên H:
Hầu hết Salmonella đều cĩ kháng nguyên H trừ S. gallinarum và S. pullorum.
Kháng nguyên H của Salmonella cĩ thể cĩ tính đặc hiệu đơn hoặc kép. Những lồi Salmonella cĩ kháng nguyên H mang tính đặc hiệu đơn khi gặp kháng huyết thanh
tương ứng sẽ mất khả năng di động. Những lồi cĩ kháng nguyên H mang tính đặc hiệu kép khi nuơi cấy chúng trong mơi trường cĩ kháng huyết thanh tương ứng với kháng nguyên H thì chúng vẫn di động và biểu hiện tính đặc hiệu của kháng nguyên H kia. Dựa vào kháng nguyên H người ta chia Salmonella thành các serotyp (typ huyết thanh). Kháng nguyên H lai được chia thành hai phase: phase 1 đặc hiệu và phase 2 khơng đặc hiệu. Thường các chủng Salmonella đều cĩ cả hai phase này (trừ S. typhi và
S. paratyphi).
Kháng nguyên K:
Kháng nguyên K chỉ cĩ ở S. typhy và S. paratyphi C và cịn được gọi là kháng
nguyên Vi (Virulence). Kháng nguyên Vi dưới dạng một lớp rất mỏng khơng quan sát được bằng kính hiển vi quang học thơng thường. Tuy nhiên kháng nguyên Vi cĩ thể bao phủ kín kháng nguyên O, trong trường hợp này vi khuẩn sẽ khơng ngưng kết mặc
dù trộn với kháng huyết thanh O đặc hiệu. Muốn cho hiện tượng ngưng kết O xuất hiện, cần phải làm nĩng huyền dịch vi khuẩn (1000C trong 20 phút) để tách kháng nguyên K ra khỏi tế bào. Kháng nguyên Vi khơng tham gia trong việc gây bệnh.