Qui trình kiểm toán là trình tự thực hiện các bớc công việc mà kiểm toán viên phân chia thành từng giai đoạn để tiến hành kiểm toán hay còn gọi là việc thiết kế một chơng trình kiểm toán.
Mỗi một loại hình doanh nghiệp có một nét đặc thù riêng ảnh hởng đến nội dung và trình tự công việc nhng thông thờng qui trình kiểm toán phải trải qua 3 giai đoạn sau:
- Lập kế hoạch kiểm toán: giai đoạn này thực hiện các công việc nh tìm hiểu về ngân hàng, xác định khối lợng công việc, sắp xếp thời gian và nhân sự, xây dựng chơng trình kiểm toán chi tiết …
- Thực hiện kiểm toán: Thực chất của giai đoạn này là các kiểm toán viên thu thập bằng chứng kiểm toán, thực hiện theo các chơng trình và nội dung hoạch định trong giai đoạn trên.
- Hoàn tất và lập báo cáo kiểm toán: Giai đoạn thực hiện việc tổng hợp và đành giá lại công việc đã thực hiện ở giai đoạn Thực hiện kiểm toán. Sau đó, soạn thảo ra một văn bản trình bày những ý kiến nhận xét của kiểm toán về những thông tin đợc kiểm toán, văn bản này đợc gọi là báo cáo kiểm toán. Thông thờng, báo cáo kiểm toán có 4 loại: Chấp nhận toàn bộ, chấp nhận từng phần, không chấp nhận và từ chối đa ra ý kiến.
Từng giai đoạn đều có một ý nghĩa quan trọng riêng và đợc thực hiện theo một trình tự thống nhất. Đồng thời việc thiết kế một chơng trình kiểm toán nh trên có ý nghĩa trong việc đánh giá sự thành công và chất lợng mỗi cuộc kiểm toán.