Nhỡn tổng quan thỡ kiểm toỏn khoản mục thuế GTGT trong kiểm toỏn BCTC chung của cụng ty AASC được vận dụng và hoàn thiện, khụng bỏ sút cỏc cụng việc, tuõn thủ theo Chuẩn mực kiểm toỏn và quy trỡnh kiểm toỏn, đảm bảo chất lượng cuộc kiểm toỏn.Tuy nhiờn trong thực tế vẫn tồn tại một số vấn đề như sau :
Trước hết là những tồn tại do thực tế khỏch quan. Thực tế việc lập kế hoạch mới chỉ như một bản thụng bỏo về cụng việc thực hiện cũng như phương phỏp, và thời gian nhúm kiểm toỏn tiến hành, bản kế hoạch chưa cú thụng tin đầy đủ về tỡnh hỡnh hoạt động và kinh doanh của khỏch hàng, hệ thống kế toỏn cũng như hệ thống KSNB của khỏch hàng. Việc thực hiện tỡm hiểu những vần đề trờn mới chỉ sơ bộ, chưa cú nhiều thử nghiệm kiểm soỏt nờn tập trung nhiều đến thử nghiệm cơ bản.
Luật thuế GTGT mới xuất hiện ở nước ta nhưng trờn thực tế qua những lần sửa đổi Luật, bản thõn nú cũng đó vướng mắc rất nhiều cần được trao đổi và thỏo gỡ. Chẳng hạn như việc ỏp dụng thuế suất thuế GTGT từ Thụng tư 120 /2003/TT-BTC đến Thụng tư 62/2004/TT-BTC và mới nhất là thụn g tư 04/2009/TT-BTC ngày 13/01/2009. Một trong những điểm thay đổi quan trọng trong luật sửa đổi này đú là đối tượng khụng chịu thuế từ 28 giảm xuống cũn 25, cỏc mức thuế suất 0%, 5%, 10% sẽ được ỏp dụng theo từng nhúm đối tượng. Việc thay đổi này làm ỏp dụng thuế suất dễ quản lý hơn
trước, vừa tạo sự thụng thoỏng cho việc tớnh thuế vừa giảm tiểu khả năng thực hiện gian lận trốn thực hiện nghĩa vụ thuế với Nhà nước. Tuy nhiờn trờn thực tế nhiều mặt hàng khi ỏp dụng thuế suất thuế GTGT do cỏch vận dụng khỏc nhau dẫn đến chưa thống nhất, thậm chớ mõu thuẫn, gặp nhiều lỳng tỳng, cú thể xảy ra với một số mặt hàng như bột đỏ, bỡnh nước inox. Ngay cả về kờ khai thuế, sau nhiều lần sửa đổi cỏc mẫu tờ khai thuế GTGT cũng như Bảng kờ kốm theo, Thụng tư 127/2004 quy định một mẫu tờ khai chuẩn nhất với mục đớch tạo tớnh linh hoạt hơn trong kờ khai nhưng vẫn đảm bảo tớnh chặt chẽ. Tuy nhiờn qua vận dụng vào thực tế lại cú nhiều vướng mắc. Tờ khai thuế GTGT mẫu mới là cơ sở để doanh nghiệp chủ đọng trong việc kờ khai hàng thỏng, nhưng trờn tờ khai chưa cú chỉ tiờu thể hiện số thuế GTGT nộp thừa, nộp thiếu trong cỏc kỳ trước, đặc biệt chưa thể hiện rừ số thuế GTGT cỏc cơ sở phụ thuộc doanh nghiệp hoạt động tại cỏc địa phương khỏc trụ sỏ chớnh tạm nộp chuyển số thuế này về trụ sở chớnh để doanh nghiệp thực hiện quyết toỏn, kờ khai thuế một cỏch chớnh xỏc, thuận lợi hơn.
Hơn nữa đến kỳ tài chớnh của năm nhào đo hiện tại doanh nghiệp mới phỏt hiện ra sai sút thỡ cú thể điều chỉnh chỉ tiờu liờn quan như hàng hoỏ, dịch vụ, thuế GTGT bỏn ra, mua vào của cỏc kỳ năm tài chớnh trước đõy. Trong trường hợp này, việc xử lý tờ khai theo mẫu hiện hành để đảm bảo nắm bắt chớnh xỏc số liệu về thuế GTGT phải nộp cảu từng năm tài chớnh trước đõy và hiện tại là rất khú khăn và chưa đồng bộ, nhất là việc thực hiện trờn mỏy tớnh của chương trỡnh quản lý thuế hiện hành. Do đú cần cú những điều chỉnh về quy định kờ khai trong cỏc trường hợp này kể cả mẫu biểu thể hiện và chương trỡnh xử lý để hoàn chỉnh hơn.
Ngoài những tồn tại do thực tế khỏch quan như trờn là những vấn đề tồn tại từ bản thõn quy trỡnh kiểm toỏn thuế GTGT tại AASC. Những tồn tại này cú thẻ được kể đến như :
Trong quỏ trỡnh tỡm hiểu khỏch hàng, đặc biệt tỡm hiểu khoản mục thuế cựng với quỏ trỡnh đỏnh giỏ hệ thống KSNB, cụng ty AASC đó cú chuỗi bảng biểu hỏi nhằm đỏnh giỏ hệ thống KSNB, tuy nhiờn bảng này chỉ cho cỏc khoản mục như tiền, tài sản cố định, kho, nhõn sự và cỏc khoản trớch theo lương mà khụng cú cho khoản mục thuế. Thực tế khoản mục thuế cú liờn quan rừ nột đến khoản mục doanh thu, do đú ở phần trỡnh bày trờn cũng chỉ cú biểu cõu hỏi về hệ thống KSNB đối với phần doanh thu.
Cỏc bảng phỏng vấn, cõu trả lời mới chỉ cú là cú, khụng hoặc khụng ỏp dụng mà trong thực tế cũn cú những trường hợp bao hàm cả 2, nờn theo em, nờn cú cột tỷ lệ phần trăm theo chọn mẫu đơn vị ỏp dụng cỏc thủ tục, chế độ đú.
Thủ tục phõn tớch ỏp dụng trong cỏc giai đoạn kiểm toỏn, khi xem xột mối quan hệ mới chỉ xem xột cỏc thụng tin tài chớnh chứ chưa xem xột đến cỏc thụng tin phi tài chớnh.
Thực tế việc kiểm toỏn theo chương trỡnh chung của cụng ty quỏ cồng kềnh, đối khi chồng chộo lờn nhau, nờn thực tế KTV khi kiểm toỏn chưa xỏc định khối lượng cụng việc phự hợp để giảm thiểu thời gian kiểm toỏn khoản mục này. Do đú cần phõn mục những nghiệp vụ bất thường và khụng bất thường, nghiệp vụ đặc biệt để kiểm tra.
Thực tế khi kiểm tra chứng từ cũng dễ trựng chộo lờn phần làm chi phớ, do đú khối lượng thời gian tăng, giảm năng suất kiểm toỏn khi làm việc.
Giấy làm việc của KTV cú sử dụng biện phỏp phi xỏc xuất để kiểm tra hoỏ đơn, chứng từ, phương phỏp này tiết kiệm thời gian nhưng lại khụng đầy đủ thụng tin, dẫn đến người soỏt xột sẽ khụng biết soỏt xột từ đõu, khụng biết người thực hiện ỏp dụng thủ tục gỡ, nhằm mục tiờu gỡ.
Một số cụng ty cú trang bị cho mỗi KTV mỏy tớnh xỏch tay và cú luụn phần mềm kiểm toỏn, giảm tải phần viết giấy, khối lượng cụng việc vỡ thế cũng nhanh hơn nhiều, do đú trong quỏ trỡnh hội nhập và chuyển đổi này, AASC ứng dụng phần mềm vào trong kiểm toỏn sẽ giỳp KTV nhanh chúng trong việc kiểm toỏn, nõng cao năng suất mà chất lượng vẫn được đảm bảo.
3.2 Tớnh tất yếu và phương hướng hoàn thiện quy trỡnh kiểm toỏn khoản mục thuế GTGT trong kiểm toỏn BCTC tại AASC