như trong doanh nghiệp nhà nước
Nhiều công ty cổ phần chưa có sự đổi mới thực sự trong quản trị công ty; phương pháp quản lý, lề lối làm việc, tư duy quản lý vẫn còn như DNNN. Hạn chế này rõ nhất là ở những doanh nghiệp mà Nhà nước còn giữ cổ phần chi phối, ban lãnh đạo của doanh nghiệp đều từ DNNN trước đó chuyển sang.
Một bộ phận cán bộ lãnh đạo, đảng viên ở các cấp, người lao động trong doanh nghiệp chưa nhận thức đúng đắn về công cuộc đổi mới, sắp xếp và cổ phần hoá DNNN. Một số khác còn mang nặng tư tưởng bao cấp, lo ngại sau cổ phần sẽ mất đặc quyền, đặc lợi. Một số cán bộ quản lý doanh nghiệp chưa tích cực trong việc lập phương án cổ phần hoá của đơn vị mình, còn kéo dài thời gian, gây khó khăn cho việc thực hiện chủ trương cổ phần hoá. Từ nghị quyết của Đảng sang thể chế, chính sách còn có khoảng cách nên sau một quá trình thực hiện có một vài chính sách còn sơ hở, gây nên tâm lý trong quần chúng do dự, một số cá nhân thực thi nhiệm vụ lợi dụng.
Đây là một trong những nguyên nhân làm cho thời gian thực hiện cổ phần hoá một doanh nghiệp còn dài, làm tiến độ cổ phần hoá chậm. Bên cạnh một số đơn vị triển khai tích cực, hoàn thành kế hoạch thì còn những đơn vị chưa hoàn thành theo đề án đã được phê duyệt. Thậm chí có đơn vị như Công ty Vận tải và Cơ khí thuỷ nhận kế hoạch cổ phần hóa từ năm 2004 nhưng đến hết năm 2006 vẫn chưa tiến hành xong việc xác định giá trị doanh nghiệp.
Trong một số công ty cổ phần, người lao động - cổ đông phần do nhận thức chưa đầy đủ về quyền và nghĩa vụ của mình, phần do sự hiểu biết pháp luật về công ty cổ phần còn hạn chế, nên có nơi quyền làm chủ chưa được
công tác quản lý của Hội đồng quản trị, sự điều hành của giám đốc. Nhiều nội dung của cơ chế, chính sách quản lý công ty cổ phần như: chính sách tiền lương, tiền thưởng… vẫn còn áp dụng như DNNN.
DNNN bản thân nó chứa đựng nhiều yếu tố của lịch sử dẫn đến sự trì trệ. Ví dụ tồn tại lao động dôi dư, không được đào tạo bài bản, tài chính DNNN không minh bạch, cơ chế lựa chọn cán bộ không tốt, chưa thực sự là lựa chọn nhân tài cho doanh nghiệp. Sau cổ phần hoá, các thành viên còn thiếu kinh nghiệm quản lý đối với loại hình CtyCP, dẫn đến tạo điều kiện cho công ty phát huy tốt chức năng sau cổ phần hoá cũng hạn chế; Hình thức đổi mới doanh nghiệp còn chậm vận dụng nhiều hình thức hoạt động, lúc đầu chủ yếu chỉ thực hiện ở hình thức cổ phần hoá, sau đó mới vận dụng sang nhiều hình thức khác.Các doanh nghiệp đã không lường hết khó khăn sau khi tiến hành đại hội cổ đông lần thứ nhất. Nguyên nhân là do để tiến hành cổ phần hoá, những người lãnh đạo đã không trung thực khi đưa ra các phương án cổ phần hoá, không dám công bố tình hình tài chính thực của công ty… điều đó đã làm cho bộ máy quản lý mới lúng túng, đùn đẩy trách nhiệm. Hầu hết các đơn vị thành viên sau cổ phần hoá không tính chính xác và đầy đủ cổ tức cho các cổ đông. Sức ỳ trong bộ máy quản lý vẫn còn rất lớn…
Dễ thấy nhất là những DNNN còn giữ cổ phần chi phối (trên 51%), ban lãnh đạo đều từ DNNN trước đó chuyển sang, phần đông lãnh đạo có tâm lý "tính ngắn hạn nhiều hơn tính dài hạn", tư tưởng "làm đến đâu hay đến đó" còn phổ biến, bộ máy biên chế cồng kềnh, hiểu biết pháp luật về cổ phần hoá còn hạn chế. Bên cạnh đó, chế độ kế toán của DNNN lỏng lẻo đã làm cho "bức tranh" tài chính doanh nghiệp méo mó, vì vậy khi thực hiện sắp xếp doanh nghiệp hậu cổ phần hoá là cả một vấn đề hết sức nan giải.