Trước năm 1988, hệ thống ngân hàng Việt Nam là hệ thống ngân hàng một cấp, thực chất chỉ có một ngân hàng, vừa thực hiện chức năng quản lý nhà nước về lĩnh vực tiền tệ, tín dụng vừa
thực hiện chức năng kinh doanh. Tình trạng thừa, thiếu nguồn vốn cuẩ các chi nhánh được điều chuyển từ những chi nhánh khác hoặc được thỏa mãn bằng quỹ phát hành. Vì vậy thị trường tiền tệ ngân hàng không có cơ hội phát triển.
Ngày 20/3/1988, Hội đồng Bộ trưởng đã ban hành Nghị định 53/HĐBT về tổ chức bộ máy Ngân hàng Nhà nước (NHNN), bước đầu hình thành hệ thống ngân hàng 2 cấp ở dạng sơ khai. Tháng 5/1990, 2 pháp lệnh Ngân hàng ra đời đã hình thành rõ hệ thống ngân hàng 2 cấp, tách bạch chức năng quản lý nhà nước: quản lý vĩ mô của NHNN và chức năng kinh doanh của các tổ chức ngân hàng tín dụng. Đây là điều kiện cần và đủ để thị trường liên ngân hàng ra đời và phát triển ở Việt Nam.
Ngày 7/10/1992, Thị trường liên ngân hàng ở Việt Nẩm đời theo chỉ thị số 07/CT-NH1 của Thống đốc NHNN, cho phép các tổ chức tín dụng được thực hiện việc cho vay và đi vay lẫn nhau. Tháng 7/1993, thị trường nội tệ liên ngân hàng chính thức đi vào hoạt động gắn liền với cacshoatj động của các trung tâm thanh toán bù trừ. Tiếp đó, trong hai năm 1993 và 1994 hai trung tâm giao dịch ngoại tệ lần lươt được thành lập ở hai đầu đất nước – thành phố Hồ Chí Minh và Hà Nội. Từ đó đến nay, có thể nói rằng hoạt động của thị trường liên ngân hàng ở Việt Nam đã được coi là một bộ phận cấu thành và có ý nghĩa nhất định trong quá trình hoàn thiện và phát trển thị trường tiền tệ của nước ta.
Báo cáo về hoạt động của NHNN quý 3/2011, mục “ lãi suất liên ngân hàng” ghi vắn tắt: “ Trong quý 3/2011, lãi suất thị trường nội tệ liên ngân hàng có xu hướng giảm; tuy nhiên trong tuần đầu tháng 9, lãi sất thị trường liên ngân hàng tăng đột biến; NHNN đã kịp thời hỗ trợ thanh khoản kịp thời qua nghiệp vụ thị trường mở, nên lãi suất thị trường nội tệ liên ngân hàng đã giảm dần và có xu hướng ổn định. Hiện lãi suất cho vay qua đêm ở mức 12-13%/năm, 1-2 tuần 13,5-14%/năm, 1 tháng 14,5-15%/năm”. Trong một bản tin chi tiết từ ngày 10-14/10, NHNN cho biết lãi suất thị trường liên ngân hàng đã tăng 3-3,5%/năm. Đối với kỳ hạn qua đêm, lãi suất khoảng 16-16,5% một năm, kỳ hạn 1 tuần khoảng 17-17,5% một năm và mặc dù có tăng nhưng vốn khả dụng của các tổ chức tín dụng vẫn đủ khả năng thanh toán.
*Năm 2012 thời gian gần đây, lãi suất trên thị trường liên ngân hàng giảm khá mạnh.
Theo Ngân hàng Nhà nước Việt Nam, trong tuần từ 23-27/7/2012 tổng doanh số giao dịch trên thị trường liên ngân hàng bằng VND đạt xấp xỉ 115.026 tỷ đồng, bình quân khoảng 23.005 tỷ đồng/ngày. Các giao dịch liên ngân hàng tập trung chủ yếu vào các thời kỳ ngắn hạn, khi doanh số giao dịch kỳ hạn này đạt khoảng 77.730 tỷ đồng, tương đương 68% tổng doanh số
giao dịch bằng VND. Đến nay, thời hạn giao dịch có thể là qua đêm, 1 tuần, 1 tháng, 3 tháng, 6 tháng, v.v....
Giá cả giao dịch trên thị trường tiền tệ liên ngân hàng được thiết lập trên cơ sở bình quân hóa lãi suất chào của các ngân hàn thương mại do ngân hàng nhà nước lựa chọn.