Nổi lo con giống:
-Nỗi lo hàng đầu trong NTTS ở phía Nam hiện nay, vẫn là vấn đề con giống, nhất là khâu chất lượng. Một ví dụ điển hình là về sản xuất và nuôi cá tra ở ĐBSCL,thì theo Cục Nuôi trồng thuỷ sản, hiện nay, về cơ bản, việc sản xuất giống cá tra ở ĐBSCL đã đáp ứng đủ nhu cầu nuôi của toàn vùng (1,3-1,5 tỷ con/năm). Tuy nhiên, chất lượng cá giống nhìn chung khá thấp do đàn bố mẹ được tuyển chọn từ cá thịt và điều kiện ương dưỡng giống không đảm bảo yêu cầu kỹ thuật. Hoạt động ương dưỡng cá giống hiện đang bị thả nổi, khi chỉ có 1/4 trong khoảng 4.000 hộ ương nuôi con giống là có đăng ký kinh doanh và sản xuất thường xuyên với quy mô lớn. Còn phần lớn các hộ ương nuôi không đăng ký kinh doanh, sản xuất nhỏ và không thường xuyên, không áp dụng đúng các yếu tố kỹ thuật cần thiết, khiến cho chất lượng cá bột thấp, tỷ lệ hao hụt lớn, tỷ lệ sống chỉ đạt 15-20%, thậm chí có đợt chỉ đạt 2-3%…
- Nông dân nuôi tôm sú ở tỉnh Long An cũng gặp tình trạng tương tự,do giống
tôm phụ thuộc tới 95% nguồn giống ở các tỉnh miền Trung. Vì thế, vào đầu vụ nuôi tôm 2009, ngành nông nghiệp Long An đã tổ chức đoàn ra tận các tỉnh sản xuất giống tôm sú ở Duyên hải miền Trung để cùng phối hợp trong việc kiểm soát chất lượng con giống đưa về Long An. Thế nhưng, trên thực tế, vẫn chỉ có 25-30% lượng tôm sú giống được thả nuôi ở Long An là đã qua kiểm dịch.Về vấn đề này, ông Nguyễn Khắc Lâm, Chi cục trưởng Chi cục NTTS tỉnh Ninh Thuận cho biết, tỉnh này có khoảng 500 cơ sở sản xuất tôm giống (tôm sú và tôm thẻ), với tổng sản lượng từ 12-15 tỷ con giống/năm. Trong đó, các cơ quan chức năng chỉ tiến hành kiểm dịch được 60% tôm sú giống và 40% tôm thẻ chân trắng giống. Riêng nguồn tôm sú giống bố mẹ thì đến giờ vẫn chưa kiểm soát được. Lý giải về sự yếu kém này, ông Lâm cho rằng hiện
nay chúng ta đang quan tâm đầu tư cho khâu nuôi thương phẩm mà chưa quan tâm tới khâu sản xuất giống, nhất là ở công nghệ. Vì thế, mới có tình trạng ở Ninh Thuận có 500 cơ sở sản xuất giống tôm thì cũng có… chừng ấy “công nghệ” sản xuất tôm giống khác nhau. Mà những “công nghệ” đều do mỗi hộ làm giống tự nghĩ ra qua quá trình làm giống của mình.
-Chất lượng giống tôm càng xanh cũng đang là vấn đề khiến các nhà quản lý phải “đau đầu”. Theo Cục NTTS, hiện nay, ở ĐBSCL có khoảng 80 trại nuôi tôm càng xanh, tổng sản lượng trên 150 triệu tôm giống, chỉ đáp ứng được 30% nhu cầu nuôi của toàn vùng. Chính vì vậy, một nguồn không nhỏ tôm ấu trùng đang được nhập qua Trung Quốc theo đường tiểu ngạch, rồi được đưa vào Nam qua đường hàng không. Theo các nhà khoa học thuỷ sản, tôm càng xanh Trung Quốc tuy có cùng nguồn gốc với tôm càng xanh ĐBSCL, nhưng được nhập từ Thái Lan đã khá lâu nên đã bị thoái hoá, cỡ nhỏ, tiêu tốn nhiều thức ăn. Đồng thời, con giống vận chuyển đường dài bị sốc môi trường làm sức khỏe suy giảm, dễ bị nhiễm bệnh đục cơ do virus MrNV và XSV gây ra, có thể bị chết hàng loạt hoặc chậm lớn. Chính vì thế, nuôi tôm càng xanh bằng nguồn giống Trung Quốc cho hiệu quả kinh tế thấp. Thế nhưng, đáng lo ngại là nhiều người ương giống đang cố tình trộn lẫn giống tôm Trung Quốc với giống tôm địa phương để tăng lợi nhuận, khiến cho người nuôi bị thiệt hại không nhỏ.
Nguồn nhân lực dồi dào nhưng chất lượng thấp, chưa đáp ứng được nhu cầu xã hội:
- Theo TS Võ Hùng Dũng, Giám đốc Phòng Thương mại và Công nghiệp Việt
Nam - Chi nhánh Cần Thơ (VCCI Cần Thơ), cho rằng: “Hiện nay, hầu như tỉnh nào ở ĐBSCL cũng có trường ĐH và trường nào cũng đào tạo đa ngành, chưa chuyên sâu vào một ngành nào để đào tạo được những chuyên gia, chuyên viên cho vùng và cả nước. Vì lẽ đó, năm nào cũng cho “ra lò” hàng loạt cử nhân với chất lượng ngang nhau, gây dư thừa trong tổng thể nhưng lại thiếu phân khúc của một số ngành. Các KCN của vùng cũng vậy, chỗ nào cũng có chế biến thủy sản, dệt may…, không có KCN nào chuyên dụng một loại hàng. Do đó, các KCN kêu gọi đầu tư giống nhau, sử dụng một loại lao động, vô hình trung hút loại lao động này nhưng không đào tạo được thêm loại lao động của ngành nghề khác, dẫn tới thiếu liên kết, thiếu hợp tác, không tạo được sự cạnh tranh”.
Chưa khai thác tốt thị trường nội địa:
- Những năm trước đây do phải nhập dây chuyền đồng bộ từ nước ngoài nên
-Sự mất cân đối giữa khu vực sản xuất nguyên liệu và khu vực chế biến xuất khẩu. Nói rõ hơn, khu vực sản xuất nguyên liệu chưa đáp ứng được nhu cầu và chưa theo kịp được khu vực chế biến xuất khẩu. Sự mất cân đối này xuất phát từ nhiều yếu tố, như trình độ tổ chức sản xuất chưa cao, sản lượng và chất lượng cũng như sự phối hợp giữa hai khu vực còn yếu.