Kiểm kê là công việc thực hiện trước khi chính thức kiểm toán. Công việc này được thực hiện nếu kiểm toán viên thấy cần bổ sung các bằng chứng kiểm toán đối với một số khoản mục. Quá trình chứng kiến kiểm kê được chuẩn bị và thực hiện kĩ lưỡng đảm bảo kết quả kiểm kê là khách quan, đáng tin cậy.
- Chuẩn bị kiểm kê: kiểm toán viên cần thu thập kế hoạch kiểm kê của đơn vị, phương thức kiểm kê. Ngoài ra kiểm toán viên yêu cầu khách hàng chuẩn bị một số tài liệu như sổ cái tài khoản liên quan, danh mục các hàng hoá (đối với kiểm kê HTK và CCDC) và tài sản (đối với kiểm kê TSCĐHH).
- Chứng kiến kiểm kê: để đảm bảo kết quả kiểm kê là khách quan, kiểm toán chỉ chứng kiến khách hàng kiểm kê và ghi chép kết quả kiểm kê cùng với nhận xét của mình, tuyệt đối không kiểm kê hộ khách hàng.
o Đối với tiền mặt: trước khi kiểm kê, kiểm toán viên yêu cầu thủ quỹ photo trang sổ quỹ, phiếu thu và phiếu chi cuối cùng của năm tài chính. Ngoài ra kiểm toán viên còn quan sát cách thức cất trữ và bảo quản tiền. Tiền được kiểm kê toàn bộ. Cuối buổi kiểm kê, kiểm toán viên lập biên bản kiểm kê quỹ ghi lại toàn bộ và chi tiết số tiền có thực trong quỹ. Đối chiếu với số dư trên sổ quỹ, nếu có chênh lệch
yêu cầu thủ quỹ giải thích rõ lý do. Biên bản kiểm kê sẽ được cả kiểm toán viên và bên khách hàng kí nhận.
o Đối với kiểm kê HTK và CCDC: trước khi kiểm kê, kiểm toán viên yêu cầu thủ kho photo thẻ kho, phiếu nhập và phiếu xuất kho cuối cùng của năm tài chính. Bên cạnh đó kiểm toán viên sẽ quan sát, đưa ra nhận xét chung về kho hàng, mô tả cách thức bảo quản HTK. Kiểm toán viên thực hiện kiểm kê chọn mẫu với một số mặt hàng. Kết thúc kiểm kê, kiểm toán viên lập biên bản kiểm kê chọn mẫu của mình và yêu cầu đơn vị kí xác nhận. Ngoài ra kiểm toán viên cũng yêu cầu khách hàng gửi báo cáo kiểm kê toàn bộ do khách hàng lập trong thời gian sớm nhất.
o Đối với kiểm kê TSCĐHH: kiểm toán viên tiến hành kiểm kê toàn bộ hoặc thực hiện chọn mẫu. Nếu thực hiện kiểm kê toàn bộ, kiểm toán viên cần ghi nhận cách thức kiểm đếm của khách hàng để tránh kiểm trùng hay bỏ sót. Nếu thực hiện kiểm kê chọn mẫu, kiểm toán viên lập biên bản kiểm kê chọn mẫu có xác nhận của đơn vị. Dù áp dụng hình thức kiểm kê nào, kiểm toán viên cũng cần yêu cầu khách hàng gửi báo cáo kiểm kê toàn bộ trong thời gian sớm nhất.
- Lập báo cáo kiểm kê : kiểm toán viên lập báo cáo kiểm kê theo mẫu của công ty và ghi lại những nhận xét cùng với lưu ý của mình. Với mỗi báo cáo kiểm kê cần chú thích rõ kết quả kiểm kê là đáng tin cậy hay không. Cuối cùng lưu báo cáo kiểm kê và các tài liệu khác thu thập được trong bước chứng kiến kiểm kê vào hồ sơ kiểm toán.