Dữ liệu hệ gen liên quan đến BCTPĐ

Một phần của tài liệu Khóa luận Ứng dụng kỹ thuật giải trình tự toàn bộ hệ gen ở một gia đình người bệnh cơ tim phì đại (Trang 33 - 36)

Thông qua WGS, 22 gen nhạy cảm BCTPĐ và 13 gen liên quan đến sao hình

BCTPĐ (Bảng 3.2) đã được phân tích. Kết quả phân tích các gen này cho thấy bệnh nhân và bố mình cùng mang kiểu gen dị hợp tử c.G2308A (p.Asp770Asn) trong exon 22 của gen MYBPC3. Ngoại trừđột biến c.G2308A trên gen MYBPC3, không có đột biến

26

nào được xác định trong 34 gen còn lại ở cả 4 bệnh nhân. Kết quả giải trình tự gen theo nguyên lý Sanger đã xác nhận sự hiện diện của dạng biến thểMYBPC3ở bệnh nhân và bố bệnh nhân (Hình 3.5). Hai phương pháp giải trình tự này cho kết quả tương đồng, chứng tỏphương pháp giải trình tự thế hệ mới trong nghiên cứu này có độ chính xác cao và các biến thể phát hiện được bằng giải trình tự thế hệ mới là đáng tin cậy.

Bảng 3.2. Gen liên quan đến BCTPĐ được phân tích trong nghiên cứu Gen Locus Protein Kết quả Sợi dày

1. MYH7 14q11.2–q12 Chuỗi nặng β-myosin BT

2. MYL2 12q23–q24.3 Chuỗi nhẹ myosin 2 BT

3. MYL3 3p21.2–p21.3 Chuỗi nhẹ myosin 3 BT

4. MYH6 14q11.2–q12 Chuỗi nặng α-myosin BT

5. TTN 2q24.3 Titin BT

Sợi mỏng

6. ACTC 15q14 α-actin cơ tim BT

7. TNNC1 3p21.3–p14.3 Troponin C1 BT

8. TNNI3 19p13.4 Troponin I3 BT

9. TNNT2 1q32 Troponin T2 BT

10. TPM1 15q22.1 α-tropomyosin BT

Sợi trung gian

11. MYBPC3 11p11.2 Protein C liên kết myosin BN và bố BN có biến thể c.G2308A (rs36211723) 12. LMNA 1q22 Lamin BT Đĩa Z 13. ACTN2 1q42–q43 α-actinin 2 BT

14. CSRP3 11p15.1 Protein LIM của tim BT

15. LBD3 10q22.2–q23.3 Miền liên kết LIM 3 BT

16. MYOZ2 4q26–q27 Myozenin 2 BT

27 18. TCAP 17q12–q21.1 Telethonin BT 19. VCL 10q22.1–q23 Vinculin/metavinculin BT Quản lý canxi 20. CASQ2 1p13.1 Calsequestrin 2 BT 21. JPH2 20q12 Junctophilin-2 BT 22. PLN 6q22.1 Phospholamban BT Sao hình BCTPĐ 23. TAZ Xq28 Tafazzin BT 24. DTNA 18q12 α-dystrobrevin BT

25. PRKAG2 7q35–q36.36 Protein kinase hoạt hóa AMP BT

26. LAMP2 Xq24 Protein màng liên kết với

lysosom 2 BT 27. GAA 17q25.2–q25.3 Alpha-1,4-glucosidase BT 28. GLA Xq22 Alpha-galactosidase A BT 29. AGL 1p21 Amylo-1,6-glucosidase BT 30. FXN 9q13 Frataxin BT

31. PTPN11 12q24.1 Tyrosine phosphatase không

thụ thể tuýp 11

BT

32. RAF1 3p25 Protein kinase serin/threonin BT

33. KRAS 12p12.1 GPTase tương đồng gen sinh

ung KRAS

BT

34. SOS1 2p22-p21 Yếu tố trao đổi guanin cho

protein RAS

BT

35. TTR 18q12.1 Transthyretin BT

BN: Bệnh nhân; BT:Bốn đối tượng đều bình thường, không phát hiện đột biến.

Hình 3.1. Kết quả giải trình tự Sanger vùng gen MYBPC3 của bệnh nhân (A) và bố bệnh nhân (B). Mũi tên đỏ chỉ vịtrí đột biến c.G2308A

28

Một phần của tài liệu Khóa luận Ứng dụng kỹ thuật giải trình tự toàn bộ hệ gen ở một gia đình người bệnh cơ tim phì đại (Trang 33 - 36)

Tải bản đầy đủ (PDF)

(63 trang)