Từ 1990, Petrolimex là một trong những cơ quan ứng dụng tin học vào quản lý điều hành sản xuất và kinh doanh sớm nhất Việt Nam. Hệ thống phần mềm kế toán PIS không chỉ được ứng dụng trong toàn ngành xăng dầu mà còn được các công ty phần mềm phát triển thành sản phẩm có doanh số lớn, lợi nhuận cao.
Năm 1995, công ty cổ phần tin học viễn thông Petrolimex (PIACOM) ra đời không chỉ đáp ứng nhu cầu của Petrolimex về công nghệ thông tin, tự động hóa, còn cung ứng cho nhu cầu nhiều công ty ngoài ngành.
Năm 1997, Petrolimex Sài Gòn đã triển khai xây dựng, áp dụng thành công Hệ thống quản lý năng lực phòng thử nghiệm theo Tiêu chuẩn ISO/IEC Guide 25 để kiểm soát chất lượng xăng dầu trong tất cả các khâu nhập khẩu, tồn trữ và xuất phân phối ra thị trường.
Năm 2002, Petrolimex Sài Gòn tiếp tục triển khai xây dựng, áp dụng Hệ thống quản lý chất lượng theo tiêu chuẩn ISO 9001:2000, tiếp cận theo quá trình (MBP) để kiểm soát chất lượng công việc, kết hợp với ứng dụng công nghệ thông tin trong quản lý và điều hành để hoàn thiện hệ thống quản lý, góp phần nâng cao chất lượng dịch vụ, thỏa mãn mọi nhu cầu mong đợi và tiềm ẩn của khách hàng.
Tháng 7/2009, Petrolimex Sài Gòn đã chuyển đổi thành công sang phiên bản ISO 9001:2008 và được Bureau Veritas Certification đánh giá, tái cấp giấy chứng nhận theo phiên bản mới.
Đầu năm 2008, Petrolimex Sài Gòn tiếp tục triển khai áp dụng Hệ thống quản lý an toàn, sức khỏe nghề nghiệp theo Tiêu chuẩn OHSAS 18001 và Hệ thống quản lý môi trường theo Tiêu chuẩn ISO 14001 tại Tổng kho xăng dầu Nhà bè.
Với sự thay đổi từ phương pháp quản lý theo kinh nghiệm sang quản trị hiện đại và chuyên nghiệp, Petrolimex đã từng bước nâng tầm thành công nghệ quản trị doanh nghiệp.