Cấy.
Nhuộm Gram, soi trực tiếp.
Tìm kháng nguyên của vi khuẩn bằng phương pháp điện di miễn dịch hay miễn dịch huỳnh quang.
1.5.3.1. Cấy máu
Là “tiêu chuẩn vàng” để chẩn đoán nhiễm khuẩn máu và nên thực hiện ở tất cả trẻ sơ sinh nghi ngờ mắc nhiễm khuẩn trước khi điều trị kháng sinh. Kết quả cấy máu phụ thuộc vào nhiều yếu tố: số vi khuẩn trong máu lúc lấy máu cấy, kỹ thuật lấy máu xét nghiệm, thể tích máu lấy và việc sử dụng kháng sinh trong đẻ. Không lấy máu làm xét nghiệm nuôi cấy từ các vị trí đường truyền tĩnh mạch có sẵn (ví dụ catherter TM rốn) vì không đảm bảo tính chính xác. Kết quả cấy máu từ 12-72 giờ tùy thuộc vào kỹ thuật của từng cơ sở xét nghiệm. Các nghiên cứu cho thấy tỷ lệ cấy máu dương tính khác nhau ở trẻ mắc NKSS sớm, theo Nguyễn Thanh Hà nghiên cứu lâm sàng nhiễm khuẩn sơ sinh sớm và một số yếu tố liên quan từ tháng 1 đến 9/2003 có 163 trường hợp mắc NKSS sớm nhưng chỉ có 1 trường hợp cấy máu dương tính . Kết quả của Phan Thị Huệ tỷ lệ cấy máu dương tính của trẻ NKSS sớm tại bệnh viện Phụ Sản Hà Nội năm 2005 là 5,8%. Nghiên cứu của Shrestha S và cộng sự tại Nepal từ tháng 1/2011 đến tháng 1/2012 trong 192 trường hợp NKSS sớm có tới 82 trường hợp chiếm 42,7% cấy máu dương tính. Cũng có đến 40% trường hợp trẻ nhiễm khuẩn kết quả cấy máu âm tính.
1.5.3.2. Xét nghiệm dịch não tủy
Biến đổi dịch não tủy là “tiêu chuẩn vàng” cho chẩn đoán viêm màng não, tuy nhiên kết quả chọc dò dịch não tủy phụ thuộc vào nhiều yếu tố và việc phiên giải kết quả tế bào dịch não tủy cũng khác nhau phụ thuộc vào ngày tuổi của trẻ sau đẻ. Giới hạn bình thường một số thành phần của dịch não tủy ở trẻ đủ tháng như sau .
Phân tích dịch não tủy Trẻ ≤ 7 ngày tuổi Trẻ >7 ngày tuổi
Số lượng BC (/mm3) ≤ 23 ≤ 32
Glucose (mg/dL) ≥ 35 ≥ 38
Protein (mg/dL) ≤ 137 ≤ 158
Theo kết quả nghiên cứu của O.A. Ajayi và cộng sự tại Nigeria từ năm 1988 đến 1990 trên 506 trẻ sơ sinh có biểu hiện lâm sàng của NKSS sớm với các triệu chứng nặng nề, được chọc dò tủy sống nhưng không có trường hợp viêm màng não.
Thực tế các nghiên cứu cho thấy tỷ lệ tìm thấy được vi khuẩn dịch não tủy là rất hiếm, kết quả nghiên cứu của Shrestha S và cộng sự tại Nepal từ tháng 1/2011 đến tháng 1/2012 cho thấy có 24 trường hợp biến đổi dịch não tủy trong số 192 trường hợp NKSS sớm nhưng không có trường hợp nào tìm thấy vi khuẩn trong dịch não tủy.
1.5.3.3. Soi, cấy dịch ngoại biên:
Soi dịch dạ dày, dịch ống tai…:cho phép xác định các vi khuẩn chứa trong dịch ối, ngoài ra có thể là các vi khuẩn mắc phải chứa trong đường sinh dục hoặc trong phân của bà mẹ khi trẻ sơ sinh đi qua đường sinh dục mẹ . Soi, cấy dịch ngoại biên được thực hiện khi trẻ có yếu tố nguy cơ nhiễm khuẩn hoặc có triệu chứng lâm sàng nghi ngờ nhiễm khuẩn ngay sau đẻ. Kết
quả vi khuẩn dịch ngoại biên có thể gợi ý đến vi khuẩn gây bệnh ở trẻ nghi ngờ nhiễm khuẩn trong trường hợp các kết quả cấy âm tính.
1.5.3.4. Cấy nước tiểu
Ở trẻ sơ sinh có dấu hiệu nhiễm khuẩn, cấy nước tiểu thường không khuyến cao thực hiện vì không giống như các bệnh nhiễm khuẩn tiết niệu ở trẻ lớn hơn thường do nhiễm khuẩn ngược dòng, ở trẻ sơ sinh giai đoạn sớm thường NKTN nằm trong bệnh cảnh NK huyết toàn thân. Do kết quả cấy nước tiểu ở trẻ NKSS sớm là rất thấp và rất khó khăn trong việc lấy bệnh phẩm nên thực tế người ta ít thực hiện xét nghiệm này trong chẩn đoán NKSS sớm .