4. KẾT QUẢ VÀ THẢO LUẬN
4.7. Xác ựịnh khả năng chịu hạn của các dòng, giống lúa bằng chỉ thị phân tử SSR
SSR
Sử dụng các mồi của marker phân tử SSR dò tìm gen kiểm soát tắnh trạng chiều dài và sinh trưởng của rễ lúa liên quan ựến chịu hạn. Kết quả ựiện di sản phẩm PCR chúng tôi nhận thấy trong 4 marker sử dụng thì có 3 marker RM 296 (Tỷ lệ thể tắch
rễ ở ựộ sâu (%) trong ựiều kiện hạn), RM 307 (ựộ sâu tối ựa dưới ựiều kiện có tưới) và RM 471 (sinh trưởng của bộ rễ ở ựộ sâu gây hạn cm) có xuất hiện băng DNA. điều này chứng tỏ các dòng, giống nghiên cứu có mang gen kiểm soát chiều dài và sinh trưởng của rễ liên quan ựến khả năng chịu hạn. Marker RM 296 nhận biết 11 dòng dòng ựiều có biểu hiện tương tự như ựối chứng 1 ở khoảng cách 150 bp. Marker RM 307 cho thấy các dòng giống thắ nghiệm mang gen kiểm soát chiều dài rễ tối ựa của rễ trong ựiều kiện có tưới rõ nét hơn ựối chứng 1
150pb 150bp
Hình 8. Kết quả ựiện di sản phẩm PCR của marker RM 296
Ghi chú: thứ tự từ 1-11 là: 447, 450, 455, 457, 464, 465, 470, 480, 485, 487, đC1
Hình 9. Kết quả ựiện di sản phẩm PCR của marker RM 471
Ghi chú: thứ tự từ 1-11 là: 447, 450, 455, 457, 464, 465, 470, 480, 485, 487, đC1 700bp 600 bp 500bp 400bp 300bp 200bp 100bp M 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 700bp 600 bp 500bp 400bp 300bp 200bp 100bp M 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11
Marker RM 470 nhận biết các dòng, giống thắ nghiệm kiểm soát sinh trưởng của rễ dưới tầng ựất sâu tương ứng như ựối chứng 1. Tắnh trạng số lượng là tắnh trạng phân bố liện tục và ựiều khiển bởi nhiều gen và mỗi gen ảnh hưởng một phần nhỏ ựến tắnh trạng mục tiêu. Trong kết quả nhằm xác ựịnh sự quy tụ gen của tắnh trạng mục tiêu về sự sinh trưởng, phát triển của bộ rễ của các mẫu dòng, giống nghiên cứu. Chúng tôi nhận thấy, các băng ựa hình không thể hiện rõ giữa các cá thể, với chỉ thị SSR của RM 296 và RM 307, các mẫu giống ựều có sản phẩm nhưng kắch thước của sản phẩm khi thực hiện phản ứng PCR lại không giống nhau và không cùng kắch thước với marker mục tiêu. điều này cũng thể hiện ựa hình của tắnh trạng quy ựịnh về tỷ lệ thể tắch rễ ở ựộ sâu trong ựiều kiện gây hạn (RM296), ựộ sâu của rễ tối ựa dưới ựiều kiện nước (RM 307), các tắnh trạng số lượng này biểu hiện khác nhau sẽ cho các giá trị khác nhau với mỗi quần thể nghiên cứu. Các mẫu dòng giống nghiên cứu ựã có tắnh trạng liên quan ựến tắnh chịu hạn.
Marker RM 471 (sinh trưởng của rễ ở ựộ sâu gây hạn), ựã cho các băng ựa hình khác nhau giữa các mẫu dòng, giống. Các mẫu giống xuất hiện băng DNA là mẫu 455, 464, 470, 485, 487, đC1. Trong các mẫu giống xuất hiện băng DNA thể hiện có sự liên kết với tắnh trạng chịu hạn với marker RM471 có 3 mẫu dòng giống là 455, 464, 470, 487 tương ứng với kết quả ựánh giá khả năng chịu hạn thông qua chỉ thị hình thái. Do quá trình lựa chọn marker ựể xác ựịnh các gen mục tiêu trong chọn lọc vật liệu mang tắnh chịu hạn chưa tối ưu, nên chúng tôi chưa thể khẳng ựịnh chỉ thị RM 471 có thể dùng trong chọn lọc MAS (Marker - Assisted Selection). Những những kết quả ghi nhận ựược qua kết quả kiểm tra sự bắt cặp trong phản ứng PCR giữa 3 chỉ thị phân tử và kết quả ựánh giá kiểu hình cũng cho thấy sự tương ựồng tương ựối của gen kiểm soát chiều dài và sinh trưởng của rễ liên quan ựến khả năng chịu hạn.