Bộ máy kế toán tại Công ty khá gọn nhẹ, hoạt động hiệu quả, tuy nhiên vẫn còn có những tồn tại cần khắc phục để công tác kế toán được hoàn thiện hơn:
- Về việc quản lý vật liệu
Công tác quản lý vật liệu hiện nay ở Công ty Cổ phần Nông nghiệp Thiên Tân Việt Nam về mặt hiện vật vẫn còn lỏng lẻo, ở phòng kế toán không tổ chức theo dõi các nguyên vật liệu đã xuất dùng về mặt hiện vật mà giao cho nhà máy sử dụng NVL theo dõi. Như vậy công ty không quản lý tình hình hiện có của NVL đang sử dụng.
- Về việc lập dự phòng giảm giá hàng tồn kho. Mặc dù rất thận trọng về việc kinh doanh nhưng Công ty Cổ phần Nông nghiệp Thiên Tân Việt Nam lại không hề lập bất cứ một khoản dự phòng nào, kể cả với hàng tồn kho. Việc lập dự phòng là rất cần thiết đối với nền doanh nghiệp kinh tế thị trường, nó giúp doanh nghiệp có bước chuẩn bị trước cho những rủi ro có thể xảy ra.
- Về việc lập định mức dự trữ NVL. Công ty không tiến hành phân tích tình hình dự trữ NVL trong đơn vị, mặc dù có xác định loại hình dự trữ là dự
trữ theo thời vụ. Như đã trình bày ở trên, tồn kho dự trữ nguyên vật liệu rất quan trọng trong các doanh nghiệp sản xuất.
- Về việc theo dõi hạch toán phế liệu thu hồi. Tại Công ty, phế liệu thu hồi không làm thủ tục nhập kho. Trong kho tất cả các phế liệu thu hồi của Công ty đều có thể tận dụng được, tuy nhiên phế liệu thu hồi ở Công ty chỉ được để vào kho, không được phản ánh trên giấy tờ sổ sách về số lượng cũng như giá trị. Điều đó có thể dẫn đến tình trạng hao hụt, mất mát phế liệu làm thất thoát nguồn thu của Công ty.
- Hiện nay, trình độ khoa học ngày càng phát triển, việc áp dụng công nghệ thông tin ngày càng nhiều song việc áp dụng công nghệ thông tin ở Công ty vẫn còn hạn chế, công tác kế toán của Công ty chủ yếu là thủ công và phần mềm kế toán tự thiết kế chưa được hoàn chỉnh, khối lượng công việc tương đối nhiều, việc cung cấp báo cáo số liệu có lúc bị hạn chế.