Nguồn nước mặt trên địa bàn xã Pom Lót được cung cấp bởi hệ thống sông Nậm Rốm, suối nhỏ, hồ, ao, kênh mương. Qua quá trình khảo sát thực địa, quan sát và đánh giá theo cảm quan, nguồn nước mặt của xã đang có dấu hiệu ô nhiễm, đặc biệt ở các khu vực trung tâm xã, đông dân cư và có tốc độ phát triển kinh tế cao.
Quan sát đoạn sông Nậm Rốm chảy qua địa bàn xã, nước sông có màu xanh, không có mùi khó chịu nhưng có sự hiện diện của các loài thực vật thủy sinh như
rêu, rong,… Qua đánh giá cảm quan nước vẫn có chất lượng khá tốt nhưng đang có dấu hiệu ô nhiễm. Nguyên nhân do người dân thực hiện các hoạt động chăn nuôi ở
rìa sông như chăn vịt; các hộ dân ở gần sông hầu hết đều dẫn nước thải ra sông cùng với nước thải nông nghiệp.
Các kênh mương: Tại các đoạn kênh mương gần khu vực đông dân cư, nước có màu đen và có mùi khó chịu; tại các đoạn kênh mương ở khu vực có ít dân cư và chảy qua các cánh đồng, nước không có màu và mùi gì lạ, tuy nhiên tại các khu vực này lại chứa nhiều các bao bì thuốc bảo vệ thực vật đã sử dụng, xác thực vật (cỏ
dại),… Tuy tại khu vực này chưa bị ô nhiễm những nếu người dân vẫn tiếp tục thải các bao bì thuốc BVTV, xác thực vật xuống nguồn nước thì chất ô nhiễm sẽ được tích tụ theo thời gian và gây ô nhiễm nguồn nước.
Tại các hồ, ao: Trong các ao trên địa bàn xã, phần lớn trong các ao quan sát
được nước có màu xanh đen, các ao của các hộ gia đình chăn nuôi lợn nước có mùi khó chịu bốc lên. Qua đánh giá cảm quan, nước ao trên địa bàn xã có chất lượng không tốt. Nguyên nhân là do các hộ gia đình hầu hết thải trực tiếp nước thải sinh hoạt, nước thải chăn nuôi chưa qua xử lý xuống ao.
Đánh giá chung: Môi trường nước mặt trên địa bàn xã đã có dấu hiệu bị ô nhiễm, đặc biệt tại các khu vực đông dân cư. Tại các khu vực thưa dân cư, môi trường nước mặt hiện có chất lượng khá tốt. Môi trường nước mặt sẽ bị ô nhiễm và ô nhiễm nặng thêm nếu không được quản lý tốt và có các biện pháp phòng ngừa hợp lý do chất thải sinh hoạt, chăn nuôi, phế phẩm nông nghiệp,… thải vào môi trường khi chưa được xử lý.
