Microsatellite là một kỹ thuật phân tử thông thường được sử dụng để đánh giá sự đa dạng di truyền cũng như mối quan hệ di truyền trong hoặc giữa các quần thể (Hillel et al., 2003). Nghiên cứu hiện tại sử dụng kỹ thuật microsatellite để đánh giá sự đa dạng di truyền giữa 18 cá thể gà mái thuộc dòng Bến Tre. Bằng phương pháp PCR với cặp mồi chuyên biệt kết hợp chu trình nhiệt phù hợp, nghiên cứu đã khuếch đại thành công đoạn gen trên nhiễm sắc thể số 8 ở vị trí ADL0278 của gà thí nghiệm với kích thước dao động ở khoảng 114-126 bp. Sản phẩm PCR được điện di trên gel aragose 4% ở hiệu điện thế 50V trong thời gian 120 phút (Hình 4.11). Kết quả cho thấy các cá thể gà 1, 12, 20, 64, 3, 29, 62, 41, 28, 63 cho một băng khi điện di trên gel. Bên cạnh đó, các cá thể 8, 27, 60 cho cả hai băng trên gel. Hai băng này không tách biệt rõ rệt do kích thước chênh lệch giữa hai đoạn chỉ là 12 nucleotide, do đó sự khác biệt (nếu có) về số lượng alen trên nhiễm sắc thể số 8 sẽ khó phát hiện qua băng điện di trên gel agarose.
Khi so sánh với các nghiên cứu khác, kết quả nghiên cứu hiện tại giống với nghiên cứu của Tadano et al. (2007) trên giống gà đuôi dài của Nhật Bản. Tác giả này cũng tìm thấy 3 alen trên vị trí microsatellite ADL0278. Đối với giống gà của Ấn Độ, Nasrollah Pirany et al. (2007) đã tìm thấy 7 alen trên cùng vị trí này. Sự khác biệt về số lượng alen trên vị trí này cũng được tìm thấy trên các giống gà Praduhangdam (9 alen), Loenghangkhao (8 alen), Brioler lai (8 alen), Commercial Layer (11 alen) trong nghiên cứu của Chatchawan Singhapol (2003). Nghiên cứu này cũng cho thấy không có sự khác biệt về số alen giữa con trống và con mái.
Tóm Lại, kết quả hiện tại cung cấp bằng chứng về khả năng khuếch đại cặp mồi ADL0278 trên gà Nòi Bến Tre và tìm được 3 sự khác biệt về đặc điểm di truyền alen microsatellite ở dòng gà này. Qua đó cũng cho thấy giữa các cá thể gà khác nhau trong cùng một dòng có thể mang những alen khác nhau, và giữa các dòng gà khác nhau sẽ thể hiện số lượng alen khác nhau trên cùng một vị trí. Chính điều này đã góp phần hình thành nên sự đa dạng di truyền của các giống gà.
Hình 4.11. Khuếch đại AND gà Nòi ở Bến Tre bằng cặp mồi ADL0278 trên nhiễm sắc thể số 8
1. Marker; 2. Đối chứng âm; 3. Mẫu 1; 4. Mẫu 12; 5.Mẫu 3; 6. Mẫu 8; 7. Mẫu 4; 9. Mẫu 5; 10. Mẫu 27; 11. Mẫu 29; 12. Mẫu 60; 13. Mẫu 20; 14. Mẫu 68; 15. Mẫu 62; 16. Mẫu 60; 17. Mẫu 64; 18. Mẫu
41; 19. Mẫu 48; 20. Mẫu 63 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 100b p 114b p 126bp
