Theo phõn cụng, phõn cấp của Chớnh phủ, Thủ tướng Chớnh phủ trực tiếp thực hiện quyền và nghĩa vụ của chủ sở hữu đối với cỏc tập đoàn, tổng cụng ty nhà nước cú vai trũ đặc biệt quan trọng. Cỏc Bộ, Chủ tịch ủy ban nhõn dõn cấp tỉnh là đại diện chủ sở hữu vốn nhà nước tại cỏc doanh nghiệp do Bộ, Ủy ban nhõn dõn cấp tỉnh quyết định thành lập; Bộ Tài chớnh thực hiện một số quyền, nghĩa vụ của đại diện chủ sở hữu trong doanh nghiệp nhà nước.
Tuy nhiờn, việc phõn cụng, phõn cấp thực hiện quyền và nghĩa vụ chủ sở hữu nhà nước đối với doanh nghiệp do nhà nước nắm giữ vốn cũn những điểm chưa hợp lý, chưa rừ ràng, cũn phõn tỏn vai trũ và trỏch nhiệm của cỏc bộ, ngành, Ủy ban nhõn dõn trong quản lý, giỏm sỏt việc sử dụng vốn, tài sản tại doanh nghiệp này. Do đú, để nõng cao hiệu quả, hiệu lực quản lý đối với loại hỡnh doanh nghiệp này, Chớnh phủ cần sớm ban hành quy định làm rừ trỏch nhiệm, nghĩa vụ của tổ chức, cỏ nhõn được giao thực hiện quyền, nghĩa vụ của chủ sở hữu, cụ thể là ai, cơ quan nào chịu trỏch nhiệm chớnh trong việc thực hiện nhiệm vụ giỏm sỏt hoạt động sử dụng vốn trong doanh nghiệp 100% vốn nhà nước và trỏch nhiệm đú đến đõu.
Mặt khỏc, việc thực hiện chức năng quyền chủ sở hữu chưa được tỏch biệt triệt để với chức năng quản lý hành chớnh nhà nước theo quy định của Luật doanh nghiệp. Cơ quan quản lý hành chớnh nhà nước vẫn đồng thời là cơ quan thực hiện quyền và nghĩa vụ chủ sở hữu nhà nước đối với doanh nghiệp nhà nước. Do đú, để phõn tỏch hai chức năng này của Chớnh phủ, Chớnh phủ cần thống nhất thực hiện quyền, nghĩa vụ chủ sở hữu nhà nước thụng qua cơ quan chuyờn trỏch thực hiện quyền, nghĩa vụ chủ sở hữu nhà nước. Cơ quan này sẽ thực hiện quyền, nghĩa vụ chủ sở hữu nhà nước với cụng ty trỏch nhiệm hữu hạn một thành viờn do nhà nước làm chủ sở hữu. Với phương ỏn này, cơ quan thực hiện quyền, nghĩa vụ chủ sở hữu nhà nước khụng phải là cơ quan hành chớnh nhà nước và khụng thực hiện chức năng quản lý nhà nước như cỏc cơ quan hành chớnh nhà nước khỏc. Mục tiờu tỏch bạch quản lý nhà nước và quản lý doanh nghiệp của chủ sở hữu được thực hiện.