Thực hiện công cuộc cải cách và hiện đại hóa ngành thuế nói chung và công tác kiểm tra, thanh tra thuế nói riêng. Năm 2004 hoạt động kiểm tra, thanh tra thực hiện theo quy trình 1322/TCT-HTQT, năm 2005-2006 theo quy trình 1166/QĐ-TCT.Đến năm 2007 Luật quản lý thuế có hiệu lực từ ngày 1/7/2007 đã chi phối quy trình thực hiện kiểm tra, thanh tra thuế năm 2007.Các quy định về kiểm tra, thanh tra thuế của Tổng cục thuế trong giai đoạn này bao gồm công văn 530/TCT-TTr ngày 23/01/2007, Quyết định 528/QĐ- TCT ngày 29.5.2008 và quyết định 460/QĐ-TCT ngày 5/5/2009.Ngày 27/1/2014 Tổng cục thuế đã ban hành Quyết đinh số 74/QĐ- TCT thay thế quyết định 460/QĐ-TCT ngày 05/05/2009 về quy trình thanh tra thuế.
Qua thực hiện kiểm tra, thanh tra thuế theo cơ chế tự khai tự nộp tại Cục thuế Hà Tĩnh đã có những chuyển biến tích cực so với cơ chế chuyên quản khép kín trƣớc đây, cụ thế:
- Quy định rõ ràng hơn từng bƣớc công việc gắn với trách nhiệm của từng bộ phận, từng ngƣời tham gia quy trình đã tạo nên sự chuyên môn hóa
66
trong công việc và phù hợp với trình độ của từng cán bộ.
- Áp dụng kỹ thuật thu thập thông tin, dữ liệu, phân tích, đánh giá rủi ro để lựa chọn chính xác hơn đối tƣợng cần kiểm tra, thanh tra thuế, chuẩn bị trƣớc khi tiến hành kiểm tra, thanh tra nhằm đảo bảo việc kiểm tra, thanh tra tại cơ sở kinh doanh mất ít thời gian, nguồn lực nhất và hiệu quả nhất.
- Chuyển đổi từ cơ chế kiểm tra, thanh tra nhằm vào tất cả các ĐTNT sang cơ chế kiểm tra, thanh tra theo mức độ vi phạm về thuế, gian lận về thuế.
- Chuyển từ việc thanh tra theo diện rộng sang thanh tra theo hệ thống tiêu thức lựa chọn đi vào chiều sâu mức độ vi phạm.
- Chuyển từ hoạt động kiểm tra, thanh tra chủ yếu tiến hành tại cơ sở kinh doanh sang kiểm tra, thanh tra chủ yếu tại cơ quan thuế nên đã hạn chế trình trạng gây phiền hà cho ĐTNT so với cơ chế chuyên quản khép kín trƣớc đây.
- Chuyển từ kiểm tra, thanh tra toàn diện sang kiểm tra, thanh tra theo chuyên đề, nội dung vi phạm.
Tuy nhiên thực hiện quy trình tại Cục thuế Hà Tĩnh Lực lƣợng cán bộ chƣa đủ, việc sắp xếp cân đối lực lƣợng so với yêu cầu đặt ra, trong đó về lực lƣợng để thực hiện thanh tra chuyên đề còn rất thiếu và yếu.Nội dung thực hiện còn chƣa trọng tâm theo kế hoạch phân tích dẫn tới còn kéo dài thời gian theo kế hoạch. Công tác kiểm tra tại các chi cục đạt số lƣợng còn thấp, số thuế truy thu bình quân trên một đối tƣợng còn thấp, chƣa kể đến đạt mức huy động theo yêu cầu của ngành.