tổ chức dữ liệu trong gis

Thu thập và tổ chức dữ liệu  Gene phục vụ nghiên cứu cây trồng biến đổi di truyền

Thu thập và tổ chức dữ liệu Gene phục vụ nghiên cứu cây trồng biến đổi di truyền

... học dùng trong Bioinformatics. Giai đoạn 2: Xây dựng và tổ chức các dữ liệu.  Tìm kiếm dữ liệu cho đề tài (bài báo khoa học, trình tự).  Tiến hành xây dựng trang tìm kiếm với dữ liệu trình ... lập các mối liên hệ trong dữ liệu, tiến tới quản lý dữ liệu một cách có hệ thống bằng một hệ quản trị cơ sở dữ liệu hoặc nghiên cứu sử dụng công nghệ mới vào quản lý dữ liệu.  Giao diện Web ... + Trong một chƣơng trình có cấu trúc nhiều phần khác nhau có thể truy cập cùng một dữ liệu. Điều này nghĩa là nếu một chƣơng trình cần thay đổi cách tổ chức dữ liệu, ta phải tìm tất cả các chức...

Ngày tải lên: 05/11/2012, 09:12

215 406 2
Thuật toán Quan hệ động và tổ chức dữ liệu

Thuật toán Quan hệ động và tổ chức dữ liệu

... miền nhớ khi ta tổ chức chương trình trực tiếp bằng đệ quy. 2. Tổ chức dữ liệu và chương trình: Tổ chức dữ liệu tính toán dần theo từng bước, nên tìm cách khử đệ quy. Thông thường, trong các bài ... giá trị thẩm mỹ sẽ là: T(i,j-1). Tổng hợp lại ta có giá trị tối ưu khi cắm i bó hoa vào j lọ sẽ là: T(i,j)=max {T(i-1,j-1)+v[i,j], T(i,j-1)}. 2. Tổ chức dữ liệu và chương trình: Nếu dùng mảng ... hoa. Thí dụ: Ngoài ra ta còn cần đặt trong mỗi ô của bảng trên một mảng dữ liệu bao gồm n phần tử để đánh dấu lọ hoa nào được chọn cho mỗi tình huống. Gọi mảng dữ liệu đó là L[i,j], ta dễ thấy là...

Ngày tải lên: 11/09/2012, 15:25

9 834 8
Thu thập nguồn gene và tổ chức dữ liệu gene  1

Thu thập nguồn gene và tổ chức dữ liệu gene 1

... lắp dữ liệu, tổng hợp danh sách tổng hợp 85 II.3.2. Tải trình tự 90 III. Các kết quả thu đƣợc từ quá trình tải trình tự từ Genbank 92 IV. Tổ chức dữ liệu 93 IV.1. Cách thức tổ chức dữ liệu ... xây dựng CSDL 57 II. TÌM KIẾM DỮ LIỆU BÀI BÁO 58 II.1. Tìm kiếm tổng hợp tính trạng 58 II.2. Tổng hợp dữ liệu Primer dùng trong phát hiện GMO 64 III. TÌM KIẾM DỮ LIỆU TRÌNH TỰ 66 III.1. Tìm ... học dùng trong Bioinformatics. Giai đoạn 2: Xây dựng và tổ chức các dữ liệu.  Tìm kiếm dữ liệu cho đề tài (bài báo khoa học, trình tự).  Tiến hành xây dựng trang tìm kiếm với dữ liệu trình...

Ngày tải lên: 01/11/2012, 11:54

22 362 0
Thu thập nguồn gene và tổ chức dữ liệu gene  2

Thu thập nguồn gene và tổ chức dữ liệu gene 2

... DDBJ đã hợp tác với hai ngân hàng dữ liệu thông qua trao đổi dữ liệu và thông tin trên Internet và tổ chức hai cuộc họp, cuộc họp ban cố vấn ngân hàng dữ liệu DNA quốc tế ( the International ... đổi dữ liệu hàng ngày với EMBL/EBI và GenBank/NCBI, nên ba cơ sở dữ liệu này chia sẽ cùng dữ liệu tại bất kỳ thời điểm nào. DDBJ cũng cung cấp nhiều công cụ cho phân tích và lấy ra các dữ liệu ... cứu và tạo ra số Accession number cho dữ liệu trình tự đƣợc gởi tới. DDBJ tập hợp dữ liệu chủ yếu từ các nhà khoa học Nhật, tuy nhiên cũng chấp nhận dữ liệu và tạo Accession number cho các nhà...

Ngày tải lên: 01/11/2012, 11:54

22 459 0
Thu thập nguồn gene và tổ chức dữ liệu gene  3.pdf

Thu thập nguồn gene và tổ chức dữ liệu gene 3.pdf

... + Trong một chƣơng trình có cấu trúc nhiều phần khác nhau có thể truy cập cùng một dữ liệu. Điều này nghĩa là nếu một chƣơng trình cần thay đổi cách tổ chức dữ liệu, ta phải tìm tất cả các chức ... trật tự các dòng phù hợp từ nguồn dữ liệu. Để tạo thuận lợi trong sinh học mới, các nhà sinh học phải làm quen với máy tính. Truy xuất dữ liệu từ trang web dữ liệu sinh học và những công cụ phân ... Biến mảng giống nhƣ biến vô hƣớng, nó đƣợc tạo ra để lƣu dữ liệu. Tuy nhiên dữ liệu là một danh sách (list) (danh sách là một nhóm dữ liệu vô hƣớng đƣợc sắp xếp theo thứ tự). Mở đầu biến mảng...

Ngày tải lên: 01/11/2012, 11:54

22 413 0
Thu thập nguồn gene và tổ chức dữ liệu gene  4.pdf

Thu thập nguồn gene và tổ chức dữ liệu gene 4.pdf

... cơ sở dữ liệu khác trên thế giới. - Thông tin trong các cơ sở dữ liệu này là rất lớn và luôn đƣợc cập nhật thƣờng xuyên (sau mỗi 24 giờ). - Trong phạm vi đề tài tập hợp và tổ chức dữ liệu ... PHƢƠNG PHÁP TIẾN HÀNH – Tìm kiếm dữ liệu trình tự NGUYỄN KỲ TRUNG – LÊ THÀNH TRUNG 72  Choose database: giới hạn phạm vi cơ sở dữ liệu tìm kiếm trong các cơ sở dữ liệu của chƣơng trình BLAST. ... dạng trình tự sinh học đƣợc lƣu trữ phổ biến trong các cơ sở dữ liệu sinh học. Hiện nay, các thông tin này đƣợc lƣu trữ chủ yếu trong các cơ sở dữ liệu lớn trên thế giới nhƣ hệ thống GenBank...

Ngày tải lên: 01/11/2012, 11:54

22 392 0
Thu thập nguồn gene và tổ chức dữ liệu gene  5.pdf

Thu thập nguồn gene và tổ chức dữ liệu gene 5.pdf

... 93 IV. Tổ chức dữ liệu IV.1. Cách thức tổ chức dữ liệu Về khía cạnh công nghệ thông tin, nguyên tắc tổ chức một hệ thống ứng dụng phần mềm nhƣ sau: Sơ đồ 4.1: Mô hình tổ chức một ... TRUNG 94 IV.2. Tiến hành tổ chức, phân loại dữ liệu Nhận xét về dữ liệu mà ta đang có, sẽ có rất nhiều cách để phân loại dữ liệu này, tuy nhiên khi phân tích các dữ liệu ta thấy mỗi trình tự ... cách để phân loại dữ liệu, tuy nhiên việc phân loại dữ liệu cũng phải phụ thuộc vào việc khảo sát dữ liệu có đƣợc. Dữ liệu của ta là các record Genbank, ta thấy khi khảo sát dữ liệu mỗi record,...

Ngày tải lên: 01/11/2012, 11:54

22 360 0
Thu thập nguồn gene và tổ chức dữ liệu gene  6.pdf

Thu thập nguồn gene và tổ chức dữ liệu gene 6.pdf

... toán tử AND, OR, NOT. Theo mặc định keywords đƣợc tìm kiếm trong cơ sở dữ liệu NLBI (Nông Lâm Bioinformatics Group). Các cơ sở dữ liệu Genbank, EMBL, DDBJ hiện tại chƣa tích hợp đƣợc. Ta ... dùng chọn lựa khi submit.  Tại lớp Controller đầu tiên sẽ nhận vào cơ sở dữ liệu cần tìm, đọc nội dung trong folder dữ liệu và lần lƣợt lấy hết các tham số cần thiết cho việc tìm kiếm nhƣ: nội ... sẽ lấy nội dung “/translation=” trong CDS và thực hiện in tuần tự mỗi hàng 60 ký tự. VI. Kết quả giao diện tìm kiếm với dữ liệu tập hợp đƣợc Sau khi xử lý dữ liệu với Java Servlet và thiết...

Ngày tải lên: 01/11/2012, 11:54

22 326 0
Thu thập nguồn gene và tổ chức dữ liệu gene  7.pdf

Thu thập nguồn gene và tổ chức dữ liệu gene 7.pdf

... NGHỊ 1. Có biện pháp lọc dữ liệu tốt hơn và tổ chức dữ liệu hợp lý hơn  Hiện tại chúng tôi chƣa đƣa ra đƣợc phƣơng án hoàn hảo cho việc chọn lọc thông tin, vì thế dữ liệu hiện nay của chúng ... thêm các cơ sở dữ liệu khác cũng liên quan đến cây trồng biến đổi di truyền nhƣ: o Cơ sở dữ liệu các vector dùng trong chuyển gene vào thực vật. o Cơ sở dữ liệu primer dùng trong chẩn đoán ... GMO. o Xây dựng cơ sở dữ liệu cho tất cả các gene chỉ thị (Marker Genes) dùng trong quá trình chuyển gene. 3. Vấn đề quan tâm khác Trong quá trình tìm hiểu các cơ sở dữ liệu trình tự GenBank/EMBL/DDBJ...

Ngày tải lên: 01/11/2012, 11:54

22 332 0
Thu thập nguồn gene và tổ chức dữ liệu gene  8.pdf

Thu thập nguồn gene và tổ chức dữ liệu gene 8.pdf

... trƣng trong cơ sở dữ liệu GenBank. Số xác định này thƣờng đƣợc định dạng accession.version theo qui ƣớc của GenBank/EMBL/DDBJ vào tháng 2 năm 1999. Nếu bạn có bất kỳ thay đổi trong dữ liệu ... khu vực trong GenBank (GenBank Division). GenBank phân chia record một trong các trƣờng thể hiện ngắn gọn thuộc bẳng 3 ký tự tóm tắt. Trongdụ trên GenBank Division là PLN. Cơ sở dữ liệu GenBank ... đã đƣợc kết nối với cơ sở dữ liệu NCBI Taxonomy, nơi chứa những tham khảo giữa tên thông thƣờng, tên đặc biệt và những sinh vật tƣơng đồng đã đƣợc giữ trong cơ sở dữ liệu trình tự. Organism...

Ngày tải lên: 01/11/2012, 11:54

22 597 1
Thu thập nguồn gene và tổ chức dữ liệu gene  9.pdf

Thu thập nguồn gene và tổ chức dữ liệu gene 9.pdf

... cả đường dẫn tới các file text # trong đường dẫn. return @filetext; } Các thành phần trong chương trình con và chức năng của từng thành phần Các phần chính trong chƣơng trình gồm: Phần phụ ... %hash); close FH; } } 4) Nhiệm vụ 4: Tổng hợp thành 1 file chƣơng trình hoàn chỉnh, với đầy đủ cả 3 chức năng trên và tạo thành một file kết quả tổng hợp. (lƣu file tên là hashloc.pl) #!usr/bin/perl ... $!"; Chức năng di chuyển hay sao chép một file tới thƣ mục đƣợc chỉ ra.  Module File::Path; Cú pháp: mkpath(["$dir/$foldername"],1, 0711); Chức năng tạo một thƣ mục trong một...

Ngày tải lên: 01/11/2012, 11:54

22 484 1
Tổ chức dữ liệu vật lý

Tổ chức dữ liệu vật lý

... sở dữ liệu Vũ Tuyết Trinh, b/m Hệ thống thông tin, Khoa CNTT, ĐHBKHN 4 Nội dung 9 Tổng quan về tổ chứcbộ nhớ ngoài { Tổ chứctệp đống { Tổ chứctệpbăm { Tổ chứctệpchỉ dẫn { Cây cân bằng Tổ chứctệp ... sở dữ liệu Vũ Tuyết Trinh, b/m Hệ thống thông tin, Khoa CNTT, ĐHBKHN 9 Tổ chứctệpchỉ dẫn(Index File) { Tệp chỉ dẫn theo khoá được chọn trong bản ghi { Tệp chỉ dẫn bao gồm các cặp (k,d), trong ... sở dữ liệu Vũ Tuyết Trinh, b/m Hệ thống thông tin, Khoa CNTT, ĐHBKHN 12 Các phép toán { Tìm kiếm1 bản ghi { Thêm 1 bản ghi { Xoá 1 bản ghi { Sửa đổimộtbản ghi So sánh các cách tổ chức dữ liệu { Tệp...

Ngày tải lên: 12/03/2013, 17:00

13 704 2
Tổ chức dữ liệu vật lý

Tổ chức dữ liệu vật lý

... 79 Tổ chức tệp băm (Hash File)  Tổ chức tệp dữ liệu  Phân chia các bản ghi vào các cụm  Mỗi cụm gồm một hoặc nhiều khối  Mỗi khối chứa số lượng bản ghi cố định  Tổ chức lữu trữ dữ liệu trong ... phần nhỏ các bản ghi trong một tệp dữ liệu hay một vài trường (đặc biệt là các trường khoá) của các bản ghi dữ liệu.  Xác định các yêu cầu này cho phép thiết kế dữ liệu vật lý hiệu quả thông ... bản ghi  Tìm kiếm + đánh dấu xóa  hệ thống cần tổ chức lại đĩa theo định kỳ  Sửa đổi một bản ghi:  Tìm kiếm và sửa các trường 9 Tổ chức dữ liệu vật lý ...

Ngày tải lên: 12/03/2013, 17:18

33 734 1
TỔ CHỨC DỮ LIỆU

TỔ CHỨC DỮ LIỆU

... := d; end; Dĩ nhiên trong bài này phương pháp thứ nhất sẽ hiệu quả hơn, tuy nhiên ta thực hiện cả hai phương pháp vì hàm Dem là một tiện ích trong loại hình tổ chức dữ liệu theo tiếp cận Find-Union. ... MC; id: MI; Sáng tạo trong Thuật toán và Lập trình Tập I 94 cây khung, xác định thành phần liên thông, xác định chu trình… sẽ phải vận dụng cách tổ chức dữ liệu tương tự như thuật ... Như vậy, tập A có phần tử đại diện là 3 và tập B có phần tử đại diện là 2. Dữ liệu của tập A khi đó sẽ được tổ chức như sau: A = {3  3, 4  3, 7  3}. Như vậy 3 là phần tử đại diện của tập...

Ngày tải lên: 03/10/2013, 02:20

41 371 0
w