Ngày tải lên: 07/07/2014, 05:20
Thu thập và tổ chức dữ liệu Gene phục vụ nghiên cứu cây trồng biến đổi di truyền
... lập các mối liên hệ trong dữ liệu, tiến tới quản lý dữ liệu một cách có hệ thống bằng một hệ quản trị cơ sở dữ liệu hoặc nghiên cứu sử dụng công nghệ mới vào quản lý dữ liệu. Giao diện Web ... học dùng trong Bioinformatics. Giai đoạn 2: Xây dựng và tổ chức các dữ liệu. Tìm kiếm dữ liệu cho đề tài (bài báo khoa học, trình tự). Tiến hành xây dựng trang tìm kiếm với dữ liệu trình ... + Trong một chƣơng trình có cấu trúc nhiều phần khác nhau có thể truy cập cùng một dữ liệu. Điều này nghĩa là nếu một chƣơng trình cần thay đổi cách tổ chức dữ liệu, ta phải tìm tất cả các chức...
Ngày tải lên: 05/11/2012, 09:12
Thuật toán Quan hệ động và tổ chức dữ liệu
... miền nhớ khi ta tổ chức chương trình trực tiếp bằng đệ quy. 2. Tổ chức dữ liệu và chương trình: Tổ chức dữ liệu tính toán dần theo từng bước, nên tìm cách khử đệ quy. Thông thường, trong các bài ... trị thẩm mỹ khi cắm hoa đó vào lọ j, v[i,j]. Các số liệu đều là số tự nhiên và được ghi cách nhau bởi dấu cách trên mỗi dòng. Dữ liệu vào ghi trong tệp văn bản HOA.INP: dòng đầu tiên là hai trị ... giá trị thẩm mỹ sẽ là: T(i,j-1). Tổng hợp lại ta có giá trị tối ưu khi cắm i bó hoa vào j lọ sẽ là: T(i,j)=max {T(i-1,j-1)+v[i,j], T(i,j-1)}. 2. Tổ chức dữ liệu và chương trình: Nếu dùng mảng...
Ngày tải lên: 11/09/2012, 15:25
Thu thập nguồn gene và tổ chức dữ liệu gene 1
... lắp dữ liệu, tổng hợp danh sách tổng hợp 85 II.3.2. Tải trình tự 90 III. Các kết quả thu đƣợc từ quá trình tải trình tự từ Genbank 92 IV. Tổ chức dữ liệu 93 IV.1. Cách thức tổ chức dữ liệu ... lập các mối liên hệ trong dữ liệu, tiến tới quản lý dữ liệu một cách có hệ thống bằng một hệ quản trị cơ sở dữ liệu hoặc nghiên cứu sử dụng công nghệ mới vào quản lý dữ liệu. Giao diện Web ... học dùng trong Bioinformatics. Giai đoạn 2: Xây dựng và tổ chức các dữ liệu. Tìm kiếm dữ liệu cho đề tài (bài báo khoa học, trình tự). Tiến hành xây dựng trang tìm kiếm với dữ liệu trình...
Ngày tải lên: 01/11/2012, 11:54
Thu thập nguồn gene và tổ chức dữ liệu gene 2
... DDBJ đã hợp tác với hai ngân hàng dữ liệu thông qua trao đổi dữ liệu và thông tin trên Internet và tổ chức hai cuộc họp, cuộc họp ban cố vấn ngân hàng dữ liệu DNA quốc tế ( the International ... đổi dữ liệu hàng ngày với EMBL/EBI và GenBank/NCBI, nên ba cơ sở dữ liệu này chia sẽ cùng dữ liệu tại bất kỳ thời điểm nào. DDBJ cũng cung cấp nhiều công cụ cho phân tích và lấy ra các dữ liệu ... cứu và tạo ra số Accession number cho dữ liệu trình tự đƣợc gởi tới. DDBJ tập hợp dữ liệu chủ yếu từ các nhà khoa học Nhật, tuy nhiên cũng chấp nhận dữ liệu và tạo Accession number cho các nhà...
Ngày tải lên: 01/11/2012, 11:54
Thu thập nguồn gene và tổ chức dữ liệu gene 3.pdf
... + Trong một chƣơng trình có cấu trúc nhiều phần khác nhau có thể truy cập cùng một dữ liệu. Điều này nghĩa là nếu một chƣơng trình cần thay đổi cách tổ chức dữ liệu, ta phải tìm tất cả các chức ... danh sách dữ liệu vô hƣớng tƣơng tự nhƣ mảng. Tuy nhiên, các phần tử trong mảng đƣợc chỉ mục (index) tự động còn trong Hash thì không đƣợc tạo chỉ mục một cách tự động. Các phần tử trong Hash ... Đây là cách tiếp cận truyền thống, tƣơng tự nhƣ nhiều ngôn ngữ khác, chẳng hạn nhƣ Perl. Chƣơng trình sẽ nhìn dữ liệu trên các dòng và cột của bảng cơ sở dữ liệu, chứ không cho ta một cách nhìn...
Ngày tải lên: 01/11/2012, 11:54
Thu thập nguồn gene và tổ chức dữ liệu gene 4.pdf
... cơ sở dữ liệu khác trên thế giới. - Thông tin trong các cơ sở dữ liệu này là rất lớn và luôn đƣợc cập nhật thƣờng xuyên (sau mỗi 24 giờ). - Trong phạm vi đề tài tập hợp và tổ chức dữ liệu ... PHƢƠNG PHÁP TIẾN HÀNH – Tìm kiếm dữ liệu trình tự NGUYỄN KỲ TRUNG – LÊ THÀNH TRUNG 72 Choose database: giới hạn phạm vi cơ sở dữ liệu tìm kiếm trong các cơ sở dữ liệu của chƣơng trình BLAST. ... theo yêu cầu. - Mục đích của ta là lấy trình tự trong cơ sở dữ liệu. Trƣớc khi tìm kiếm ta phải tìm hiểu cấu trúc của loại dữ liệu này, và cách thức tìm chúng. (Xem phụ lục B) * Các bƣớc thực...
Ngày tải lên: 01/11/2012, 11:54
Thu thập nguồn gene và tổ chức dữ liệu gene 5.pdf
... 93 IV. Tổ chức dữ liệu IV.1. Cách thức tổ chức dữ liệu Về khía cạnh công nghệ thông tin, nguyên tắc tổ chức một hệ thống ứng dụng phần mềm nhƣ sau: Sơ đồ 4.1: Mô hình tổ chức một ... TRUNG 94 IV.2. Tiến hành tổ chức, phân loại dữ liệu Nhận xét về dữ liệu mà ta đang có, sẽ có rất nhiều cách để phân loại dữ liệu này, tuy nhiên khi phân tích các dữ liệu ta thấy mỗi trình tự ... nhiều cách để phân loại dữ liệu, tuy nhiên việc phân loại dữ liệu cũng phải phụ thuộc vào việc khảo sát dữ liệu có đƣợc. Dữ liệu của ta là các record Genbank, ta thấy khi khảo sát dữ liệu mỗi...
Ngày tải lên: 01/11/2012, 11:54
Thu thập nguồn gene và tổ chức dữ liệu gene 6.pdf
... toán tử AND, OR, NOT. Theo mặc định keywords đƣợc tìm kiếm trong cơ sở dữ liệu NLBI (Nông Lâm Bioinformatics Group). Các cơ sở dữ liệu Genbank, EMBL, DDBJ hiện tại chƣa tích hợp đƣợc. Ta ... dùng chọn lựa khi submit. Tại lớp Controller đầu tiên sẽ nhận vào cơ sở dữ liệu cần tìm, đọc nội dung trong folder dữ liệu và lần lƣợt lấy hết các tham số cần thiết cho việc tìm kiếm nhƣ: nội ... kết nối giữa thế giới đối tƣợng trong lập trình Java và CSDL quan hệ nhƣng thời gian qua nhóm nghiên cứu đã phải tự tìm tài liệu để học Perl, học cách xử lý dữ liệu sinh học bằng Perl, đánh giá...
Ngày tải lên: 01/11/2012, 11:54
Thu thập nguồn gene và tổ chức dữ liệu gene 7.pdf
... NGHỊ 1. Có biện pháp lọc dữ liệu tốt hơn và tổ chức dữ liệu hợp lý hơn Hiện tại chúng tôi chƣa đƣa ra đƣợc phƣơng án hoàn hảo cho việc chọn lọc thông tin, vì thế dữ liệu hiện nay của chúng ... thêm các cơ sở dữ liệu khác cũng liên quan đến cây trồng biến đổi di truyền nhƣ: o Cơ sở dữ liệu các vector dùng trong chuyển gene vào thực vật. o Cơ sở dữ liệu primer dùng trong chẩn đoán ... GMO. o Xây dựng cơ sở dữ liệu cho tất cả các gene chỉ thị (Marker Genes) dùng trong quá trình chuyển gene. 3. Vấn đề quan tâm khác Trong quá trình tìm hiểu các cơ sở dữ liệu trình tự GenBank/EMBL/DDBJ...
Ngày tải lên: 01/11/2012, 11:54
Thu thập nguồn gene và tổ chức dữ liệu gene 8.pdf
... trƣng trong cơ sở dữ liệu GenBank. Số xác định này thƣờng đƣợc định dạng accession.version theo qui ƣớc của GenBank/EMBL/DDBJ vào tháng 2 năm 1999. Nếu bạn có bất kỳ thay đổi trong dữ liệu ... nối với cơ sở dữ liệu NCBI Taxonomy, nơi chứa những tham khảo giữa tên thông thƣờng, tên đặc biệt và những sinh vật tƣơng đồng đã đƣợc giữ trong cơ sở dữ liệu trình tự. Organism Cách tìm kiếm: ... ID đƣợc ấn định cho mỗi phân loại (loài, giống, họ, …) trong cơ sở dữ liệu NCBI. Cách tìm kiếm: Số ID phân loại thì không thể tìm kiếm trong trƣờng Organism của trang Entrez nhƣng có thể tìm...
Ngày tải lên: 01/11/2012, 11:54
Thu thập nguồn gene và tổ chức dữ liệu gene 9.pdf
... cả đường dẫn tới các file text # trong đường dẫn. return @filetext; } Các thành phần trong chương trình con và chức năng của từng thành phần Các phần chính trong chƣơng trình gồm: Phần phụ ... %hash); close FH; } } 4) Nhiệm vụ 4: Tổng hợp thành 1 file chƣơng trình hoàn chỉnh, với đầy đủ cả 3 chức năng trên và tạo thành một file kết quả tổng hợp. (lƣu file tên là hashloc.pl) #!usr/bin/perl ... $!"; Chức năng di chuyển hay sao chép một file tới thƣ mục đƣợc chỉ ra. Module File::Path; Cú pháp: mkpath(["$dir/$foldername"],1, 0711); Chức năng tạo một thƣ mục trong một...
Ngày tải lên: 01/11/2012, 11:54
Tổ chức dữ liệu vật lý
... sở dữ liệu Vũ Tuyết Trinh, b/m Hệ thống thông tin, Khoa CNTT, ĐHBKHN 4 Nội dung 9 Tổng quan về tổ chứcbộ nhớ ngoài { Tổ chứctệp đống { Tổ chứctệpbăm { Tổ chứctệpchỉ dẫn { Cây cân bằng Tổ chứctệp ... sở dữ liệu Vũ Tuyết Trinh, b/m Hệ thống thông tin, Khoa CNTT, ĐHBKHN 12 Các phép toán { Tìm kiếm1 bản ghi { Thêm 1 bản ghi { Xoá 1 bản ghi { Sửa đổimộtbản ghi So sánh các cách tổ chức dữ liệu { Tệp ... sở dữ liệu Vũ Tuyết Trinh, b/m Hệ thống thông tin, Khoa CNTT, ĐHBKHN 9 Tổ chứctệpchỉ dẫn(Index File) { Tệp chỉ dẫn theo khoá được chọn trong bản ghi { Tệp chỉ dẫn bao gồm các cặp (k,d), trong...
Ngày tải lên: 12/03/2013, 17:00
Tổ chức dữ liệu vật lý
... 79 Tổ chức tệp băm (Hash File) Tổ chức tệp dữ liệu Phân chia các bản ghi vào các cụm Mỗi cụm gồm một hoặc nhiều khối Mỗi khối chứa số lượng bản ghi cố định Tổ chức lữu trữ dữ liệu trong ... phần nhỏ các bản ghi trong một tệp dữ liệu hay một vài trường (đặc biệt là các trường khoá) của các bản ghi dữ liệu. Xác định các yêu cầu này cho phép thiết kế dữ liệu vật lý hiệu quả thông ... bản ghi Tìm kiếm + đánh dấu xóa hệ thống cần tổ chức lại đĩa theo định kỳ Sửa đổi một bản ghi: Tìm kiếm và sửa các trường 9 Tổ chức dữ liệu vật lý ...
Ngày tải lên: 12/03/2013, 17:18
TỔ CHỨC DỮ LIỆU
... MC; id: MI; Sáng tạo trong Thuật toán và Lập trình Tập I 94 cây khung, xác định thành phần liên thông, xác định chu trình… sẽ phải vận dụng cách tổ chức dữ liệu tương tự như thuật ... := d; end; Dĩ nhiên trong bài này phương pháp thứ nhất sẽ hiệu quả hơn, tuy nhiên ta thực hiện cả hai phương pháp vì hàm Dem là một tiện ích trong loại hình tổ chức dữ liệu theo tiếp cận Find-Union. ... tài cung cấp. Các số trên cùng một dòng cách nhau qua dấu cách. Dữ liệu ra: Hiển thị trên màn hình số lượng người còn có bài trên tay. Thí dụ: Dữ liệu vào: BAIGOP.INP Kết quả hiển thị trên...
Ngày tải lên: 03/10/2013, 02:20
Bạn có muốn tìm thêm với từ khóa: