Khảo sát khả năng đối kháng với bốn loại nấm gây bệnh trên thực vật của xạ khuẩn được phân lập từ Vườn Quốc gia Cúc Phương và Ba Bể

9 39 0
Khảo sát khả năng đối kháng với bốn loại nấm gây bệnh trên thực vật của xạ khuẩn được phân lập từ Vườn Quốc gia Cúc Phương và Ba Bể

Đang tải... (xem toàn văn)

Thông tin tài liệu

Trong nghiên cứu này, 70 chủng xạ khuẩn đã được phân lập từ Vườn Quốc gia Cúc Phương và Vườn Quốc gia Ba Bể bằng bốn phương pháp khác nhau. Đặc biệt, trong số này, 29 chủng phân lập được (chiếm 41,4%) thuộc các chi xạ khuẩn hiếm, ít được nghiên cứu ở Việt Nam. Sau đó, 70 chủng xạ khuẩn đã được sử dụng để khảo sát khả năng đối kháng với 4 loại nấm gây bệnh nghiêm trọng trên thực vật, gồm nấm gây bệnh đốm vòng Alternaria sp., nấm gây bệnh thối xám Botrytis cinerea, nấm gây bệnh thán thư Colletotrichum gloeosporioides và nấm gây bệnh thối rễ Phytophthora capsici.

Tạp chí Cơng nghệ Sinh học 17(3): 527-535, 2019 KHẢO SÁT KHẢ NĂNG ĐỐI KHÁNG VỚI BỐN LOẠI NẤM GÂY BỆNH TRÊN THỰC VẬT CỦA XẠ KHUẨN ĐƯỢC PHÂN LẬP TỪ VƯỜN QUỐC GIA CÚC PHƯƠNG VÀ BA BỂ Nguyễn Thị Vân, Đinh Thị Ngọc Mai, Lê Thị Hoàng Yến, Nguyễn Hồng Minh, Nguyễn Kim Nữ Thảo* Viện Vi sinh vật Công nghệ sinh học, Đại học Quốc gia Hà Nội * Người chịu trách nhiệm liên lạc E-mail: thaonkn@vnu.edu.vn Ngày nhận bài: 09.5.2018 Ngày nhận đăng: 22.8.2019 TÓM TẮT Các bệnh nấm vấn đề lớn nông nghiệp, gây thiệt hại nghiêm trọng sản lượng trồng hàng năm Để kiểm soát dịch bệnh nấm gây trồng, hướng tiếp cận sử dụng chủng vi sinh vật đối kháng, đặc biệt xạ khuẩn, đánh giá có tiềm an tồn với mơi trường Với lợi mức độ đa dạng sinh học cao, xạ khuẩn Việt Nam nguồn tài ngun q giá để tìm kiếm chủng có khả kiểm soát loại nấm gây bệnh thực vật Trong nghiên cứu này, 70 chủng xạ khuẩn phân lập từ Vườn Quốc gia Cúc Phương Vườn Quốc gia Ba Bể bốn phương pháp khác Đặc biệt, số này, 29 chủng phân lập (chiếm 41,4%) thuộc chi xạ khuẩn hiếm, nghiên cứu Việt Nam Sau đó, 70 chủng xạ khuẩn sử dụng để khảo sát khả đối kháng với loại nấm gây bệnh nghiêm trọng thực vật, gồm nấm gây bệnh đốm vòng Alternaria sp., nấm gây bệnh thối xám Botrytis cinerea, nấm gây bệnh thán thư Colletotrichum gloeosporioides nấm gây bệnh thối rễ Phytophthora capsici Kết nghiên cứu cho thấy 80,5% số chủng thuộc chi Streptomyces 31% số chủng xạ khuẩn có hoạt tính kháng chủng nấm gây bệnh Bốn chủng xạ khuẩn (VTCC-A-828, VTCC-A-671, VTCC-A-605 VTCC-A-69) có khả đối kháng mạnh với chủng nấm xác định, cho thấy tiềm ứng dụng chủng xạ khuẩn Việt Nam lĩnh vực bảo vệ thực vật Từ khóa: Alternaria sp., Botrytis cinerea, Colletotrichum gloeosporioides, kháng nấm gây bệnh thực vật, Phytophthora capsici, xạ khuẩn MỞ ĐẦU Các bệnh vi sinh vật gây trồng mối đe dọa lớn sản xuất nơng nghiệp, ngun nhân nấm chiếm đến 80% (El Hussein et al., 2014) Bệnh nấm gây thực vật dẫn đến thiệt hại kinh tế lên tới 200 tỷ USD (Horbach et al., 2011) Để kiểm soát dịch bệnh nấm gây trồng, phương pháp thường sử dụng bao gồm thay đổi phương pháp canh tác, tạo giống kháng bệnh, sử dụng chất hóa học sử dụng biện pháp sinh học Nhiều loại chất hóa học sử dụng để diệt nấm gây bệnh trồng chất lại thường có hại cho người, vật ni vi sinh vật có lợi khác, dẫn đến nguy ô nhiễm môi trường, đe dọa sức khỏe người gây thiệt hại kinh tế phát sinh chi phí liên quan đến xử lý mơi trường (Nega, 2014) Chính vậy, nhiều nỗ lực thực để tìm kiếm chất kháng nấm an toàn từ vi sinh vật blasticidin S, polyoxin, kasugamycin, validamycin mildiomycin (Wheeler, 2002) Đích tác động chất thường trình tổng hợp protein, tổng hợp thành tế bào nấm, hay mối tương tác trồng nấm gây bệnh Tuy nhiên, ngày xuất nhiều chủng nấm gây bệnh kháng chất này, đồng thời cịn nhiều bệnh chưa tìm thuốc phịng chữa Với tiêu chí canh tác nơng nghiệp hữu nay, biện pháp sinh học sử dụng vi sinh vật đối kháng với nấm gây bệnh quan tâm, nhằm đảm bảo tính an tồn với môi trường, tăng hiệu kinh tế nâng cao chất lượng sản phẩm Chính vậy, nhu cầu tìm kiếm chủng vi sinh vật có tính đối kháng cao với loại nấm gây bệnh trồng tăng cao Xạ khuẩn biết nguồn sinh chất kháng 527 Nguyễn Thị Vân et al sinh chất có hoạt tính sinh học lớn số tất nhóm vi sinh vật Khoảng 45% tổng số chất trao đổi thứ cấp có hoạt tính sinh học tìm thấy từ xạ khuẩn (Berdy, 2005) Streptomycin phân lập từ loài Streptomyces griseus số loại thuốc kháng sinh sử dụng sử dụng phổ biến nông nghiệp Ở Việt Nam, với lợi mức độ đa dạng sinh học cao, nghiên cứu khảo sát khả kháng nấm xạ khuẩn tiến hành nhiều phịng thí nghiệm (Đỗ Thu Hà, 2002; Bùi Thị Việt Hà et al., 2007; Biền Văn Minh, Phạm Quang Chinh, 2009; Đỗ Thị Tuyến et al., 2011) Tuy nhiên, chủng xạ khuẩn nghiên cứu chủ yếu thuộc chi Streptomyces Đồng thời nghiên cứu thực loại nấm phổ biến Aspergillus niger, Fusarium oxysporum, Sclerotinum sp Pyricularia sp Trong đó, số loại nấm khác gây bệnh nghiêm trọng trồng nấm gây bệnh đốm vòng Alternaria sp., nấm gây bệnh thối xám Botrytis cinerea, nấm gây bệnh thán thư Colletotrichum gloeosporioides nấm gây bệnh thối rễ Phytophthora capsici chưa quan tâm nghiên cứu Việt Nam Chính vậy, nghiên cứu này, 70 chủng xạ khuẩn phân lập từ Vườn Quốc gia Cúc Phương Vườn Quốc gia Ba Bể khảo sát khả đối kháng loại nấm gây bệnh nghiêm trọng thực vật chưa nghiên cứu nhiều Việt Nam bao gồm P capsici, Alternaria sp., B cinerea C gloeosporioides Các chủng có hoạt tính đối kháng đáng ý vật liệu để phát triển chế phẩm sinh học bảo vệ thực vật, phục vụ cho nông nghiệp hữu Đồng thời, thông tin chung tiềm sở hữu hoạt tính kháng nấm đa dạng lồi xạ khuẩn khác có ý nghĩa tham khảo nghiên cứu lĩnh vực tìm kiếm hoạt tính kháng nấm đối tượng vi sinh vật VẬT LIỆU VÀ PHƯƠNG PHÁP Vật liệu Bốn chủng nấm gây bệnh thực vật P capsici VTCC-F-1701, Alternaria sp VTCC-F-1702, B cinerea VTCC-F-1703 C gloeosporioides VTCC-F-1705 cung cấp từ Bảo tàng Giống chuẩn Vi sinh vật (VTCC) Phương pháp phân lập xạ khuẩn Các chủng xạ khuẩn phân lập từ mẫu đất 528 mục phương pháp: phương pháp RC (Rehydration centrifugation), SDS-YE (Sodium dodecyl sulfate - Yeast extract), DH (Dry heating) pha loãng (Hop et al., 2011) Đối với phương pháp RC để phân lập xạ khuẩn có khả di động, 0,5 g mẫu khô sau nghiền ủ 50 mL đệm phosphate 10 mM 5% cao nấm men (pH 7) 28°C 1,5 h Sau đó, mL lớp dịch phía chuyển sang ống để ly tâm với tốc độ 1500 rpm 20 min, để tĩnh nhiệt độ phòng 30 Cuối cùng, mL lớp dịch chuyển sang ống khác để làm mẫu trải môi trường HV với độ pha loãng 10-2, 10-3, 10-4 Đối với phương pháp SDS-YS để phân lập tất loại xạ khuẩn, g mẫu khô sau nghiền thêm vào 10 mL nước cất vô trùng (10-1) Mẫu (1 mL) tiếp tục pha loãng với mL SDS-YE đệm phosphate (10-2) (SDS 0,05%, cao nấm men 6%, đệm phosphate mM, pH 7,0) Sau đó, mẫu sốc nhiệt 40oC 20 trải mơi trường HV với độ pha lỗng 10-2, 10-3, 10-4 Đối với phương pháp DH để phân lập xạ khuẩn chịu nhiệt chủ yếu thuộc chi Streptomyces, mẫu đất mục sau làm khô tự nhiên 3-5 ngày nghiền nhỏ máy xay Sau đó, mẫu sấy 100oC 30 phút Một lượng mẫu nhỏ rắc lên môi trường HV (Humic acidvitamin agar, Hayakama, Nonomura 1987) Đối với phương pháp pha loãng để phân lập tất loại xạ khuẩn, mẫu đất mục khô nghiền nhỏ pha loãng nước muối 0,9 % trải mơi trường HV với độ pha lỗng 10-2, 10-3, 10-4 Sau nuôi cấy nhiệt độ 28°C 14-21 ngày, khuẩn lạc với hình thái khác nhặt ria lại môi trường HV Cuối cùng, khuẩn lạc khác cấy ria môi trường YS (g/L: tinh bột- 10; cao men- 2; thạch- 16), nuôi cấy nhiệt độ 28°C 7-14 ngày giữ lạnh sâu -80°C Định danh dựa so sánh trình tự 16S rDNA Đoạn 16S rDNA (1300-1400 bp) nhân lên PCR sử dụng mồi 9F 1541R theo phương pháp Tamura, Hatano (1998) sau giải trình tự Trình tự đoạn 16S rDNA so sánh với trình tự khác cơng cụ tìm kiếm BLAST Khảo sát hoạt tính kháng nấm phương pháp thỏi thạch Các chủng xạ khuẩn ni mơi trường Tạp chí Cơng nghệ Sinh học 17(3): 527-535, 2019 thạch YS ngày 28°C Các chủng nấm nuôi môi trường thạch PDA (Himedia) ngày 25°C Thỏi thạch (Φ = mm) chủng nấm đặt vào tâm đĩa petri (Φ = cm) chứa môi trường PDA Sau đó, thỏi thạch (Φ = mm) chủng xạ khuẩn nuôi cấy mơi trường YS đặt vào vị trí cách tâm đĩa cm, ủ đĩa ngày 25ºC Tỉ lệ kháng chủng xạ khuẩn nấm tính theo cơng thức: S = (R-r)/R x 100% Trong đó, S: Phần trăm ức chế, R: Bán kính khuẩn lạc nấm phía đối diện vị trí đặt thỏi thạch xạ khuẩn, r: Bán kính khuẩn lạc nấm phía đặt thỏi thạch xạ khuẩn Mỗi thí nghiệm lặp lại lần KẾT QUẢ VÀ THẢO LUẬN Phân lập định danh xạ khuẩn Trong nghiên cứu này, 70 chủng xạ khuẩn phân lập từ Vườn Quốc gia Cúc Phương Ba Bể phương pháp phân lập khác Vị trí phân loại chủng xác định sơ tới mức độ chi dựa so sánh trình tự 16S rDNA (Bảng 1) Đối với phương pháp pha loãng, 27 chủng xạ khuẩn phân lập, có đến 26 chủng thuộc chi Streptomyces chủng thuộc chi Dactylosporangium Kết hoàn toàn hợp lý phương pháp pha loãng đơn thuần, khuẩn lạc thuộc chi Streptomyces mọc nhanh chiếm ưu đĩa phân lập Đối với phương pháp RC, 31 chủng xạ khuẩn phân lập, có chủng thuộc chi Streptomyces 24 chủng thuộc chi xạ khuẩn Kết cho thấy tính hiệu cao phương pháp RC việc phân lập xạ khuẩn đặc biệt xạ khuẩn có bào tử có khả di động, phù hợp với kết nghiên cứu trước (Hayakawa et al., 2000; Hop et al., 2011) Ngoài ra, chủng xạ khuẩn phân lập phương pháp DH, có chủng thuộc chi Streptomyces chủng xạ khuẩn phân lập phương pháp SDS-YE, có chủng thuộc chi Streptomyces Hình ảnh khuẩn lạc chủng xạ khuẩn đại diện cho chi phân lập nghiên cứu thể hình Bảng Bảng kết phân loại đến chi 70 chủng xạ khuẩn phân lập Tên chi Số lượng chủng Streptomyces 41 Actinoplanes 21 Micromonospora Acrocarpospora Dactylosporangium Kineosporia Nocardia Nocardiopsis Pseudonocardia Hình Hình ảnh khuẩn lạc đại diện chi xạ khuẩn phân lập A VTCC-A-897 Streptomyces sp., B VTCC-A-304 Actinoplanes sp., C VTCC-A-845 Micromonospora sp., D VTCC-A-421 Acrocarpospora sp., E VTCC-A-185 Dactylosporangium sp., F VTCC-A-342 Kineosporia sp., G VTCC-A-816 Nocardia sp., H VTCC-A-830 Nocardiopsis sp., I VTCC-A-841 Pseudonocardia sp Đơn vị thước đo mm 529 Nguyễn Thị Vân et al Khảo sát chủng xạ khuẩn có khả kháng nấm phương pháp thỏi thạch Hoạt tính đối kháng với loại nấm gây bệnh trồng bao gồm P capsici, Alternaria sp., B cinerea C gloeosporioides khảo sát 70 chủng xạ khuẩn phân lập được, có 41 chủng xạ khuẩn thuộc chi Streptomyces 29 chủng xạ khuẩn thuộc chi xạ khuẩn (Bảng 1) Đây số nghiên cứu Việt Nam khảo sát số lượng lớn xạ khuẩn bên cạnh nghiên cứu Bùi Thị Việt Hà et al., (2007), thực khảo sát 43 chủng xạ khuẩn phân lập từ Trùng Khánh, Cao Bằng Kết khảo sát khả đối kháng 70 chủng xạ khuẩn với loại nấm gây bệnh tóm tắt hình Kết cho thấy 33/41 (80,5%) chủng Streptomyces 9/29 (31%) chủng xạ khuẩn có hoạt tính kháng chủng nấm gây bệnh Kết cho thấy tỷ lệ xạ khuẩn có hoạt tính kháng nấm cao so với nghiên cứu khác giới Như nghiên cứu El Hussein et al., (2014), tỷ lệ chủng xạ khuẩn có hoạt tính kháng bốn chủng nấm gây bệnh sử dụng nghiên cứu đạt 54% tổng số 104 chủng Streptomyces sàng lọc Bên cạnh đó, kết nghiên cứu giống nghiên cứu trước cho thấy khả sinh hoạt chất kháng vi sinh vật loài thuộc chi Streptomyces thường cao loài xạ khuẩn (Heng, Hamzah, 2014; Singh et al., 2016) Tuy vậy, nhà khoa học cho xạ khuẩn nguồn sàng lọc chất có hoạt tính sinh học có triển vọng tốc độ tìm kiếm hoạt chất từ chi Streptomyces giảm đáng kể (Takahashi, Omura, 2003; Tiwari, Gupta, 2012) Trong chủng xạ khuẩn có hoạt tính, chủng có khả kháng loại nấm chủng có khả kháng loại nấm Trong số chủng xạ khuẩn thuộc chi Streptomyces, 10 chủng có khả kháng đồng thời chủng nấm gây bệnh Tuy nhiên, khơng có chủng có khả kháng đồng thời chủng nấm gây bệnh Hình Khả kháng chủng nấm P capsici, Alternaria sp., B cinerea C gloeosporioides 70 chủng xạ khuẩn Hình Tỷ lệ xạ khuẩn khảo sát có hoạt tính đối kháng với chủng nấm gây bệnh 530 Tạp chí Cơng nghệ Sinh học 17(3): 527-535, 2019 Khả đối kháng với chủng nấm gây bệnh 70 chủng xạ khuẩn thể Hình Tỷ lệ cao quan sát trường hợp đối kháng với nấm Alternaria sp với 45,7% chủng xạ khuẩn có hoạt tính Tiếp theo với 32,9% xạ khuẩn có hoạt tính kháng B cinerea 31,4% xạ khuẩn có hoạt tính kháng P capsici Chỉ 7,14% xạ khuẩn khảo sát có hoạt tính kháng C gloeosporioides Tuy nhiên, tỷ lệ cao xét chủng xạ khuẩn thuộc chi Streptomyces, cụ thể tỷ lệ kháng bốn chủng nấm Alternaria sp., B cinerea, P capsici, C gloeosporioides 65,8%, 48,7%, 41,4% 9,7% Đây kết tốt so với nghiên cứu khác, cụ thể 49% tổng số 104 chủng Streptomyces sàng lọc có khả kháng Alternaria alternata Alternaria sesami; 14,1% tổng số 106 chủng xạ khuẩn sàng lọc có khả kháng B cinerea (El Hussein et al., 2014; Ganesan et al., 2017) Kết khảo sát khả ức chế nấm P capsici 70 chủng xạ khuẩn (Hình 4) cho thấy có chủng Streptomyces có khả ức chế 31 32% phát triển P capsici đặc biệt có chủng Streptomyces sp VTCC-A-828 có khả ức chế lên đến 74% (Hình 7A) Chủng xạ khuẩn cịn có khả ức chế sinh trưởng Alternaria sp (23%) B cinerea (30%) Khả ức chế P capsici so sánh ngang với nghiên cứu khác giới nghiên cứu sàng lọc từ 188 chủng xạ khuẩn Kunova et al., (2016), chủng xạ khuẩn có hoạt tính kháng P capsici cao tìm thấy chủng Streptomyces sp MR01W với tỷ lệ ức chế đạt 67,4% P capsici loại nấm điển hình mà thuộc lớp Oomycetes, gây nhiều bệnh nghiêm trọng trồng héo lá, thối rễ ớt, ca cao, cao su, thối rễ họ bầu bí, bệnh chết nhanh hồ tiêu Bệnh P capsici khó kiểm soát khả tồn lâu dài bào tử đất Một số nghiên cứu thực Việt Nam để tìm giải pháp ức chế P capsici, nhiên, nghiên cứu tập trung vào nấm Trichoderma sp vi khuẩn Pseudomonas putida (Trần Thị Thuần et al., 2004; Dương Minh et al., 2006; Tran Thi Thu Ha, 2007) Chính vậy, với khả ức chế 70% sinh trưởng P capsici, chủng Streptomyces sp VTCC-A-828 tiềm giải pháp hữu ích khống chế sinh học P capsici Hình Khả ức chế P capsici chủng xạ khuẩn khảo sát Alternaria chi nấm với nhiều loài gây bệnh trồng quan trọng A solani gây bệnh đốm vòng cà chua, A adwickii gây bệnh đốm vòng hại lúa, A alternata gây bệnh mốc đen Nhiều nghiên cứu giới sử dụng chủng nấm thuộc chi Trichoderma chủng vi khuẩn thuộc chi Bacillus để ức chế Alternaria (Uniyal, Singh, 2017; Arzanlou et al., 2013; Catello, Massimo, 2015) Trong nghiên cứu này, khả đối kháng với chủng Alternaria sp VTCC-F-1702 khảo sát 70 chủng xạ khuẩn (Hình 5), hoạt tính cao phát chủng Streptomyces sp VTCC-A-671 với mức độ ức chế đạt 35% (Hình 7B) Tỷ lệ ức chế tương tự với tỷ lệ ức chế số chủng Trichoderma công bố trước 35% T harzianum 33.4% T viride nghiên cứu Uniyal Singh (2017) Chủng xạ khuẩn đồng thời kháng hai loại nấm gây bệnh khác P capsici (16%) B cinerea 531 Nguyễn Thị Vân et al (8%), cho thấy VTCC-A-671 chủng nên lựa chọn nghiên cứu Tiếp sau Streptomyces sp VTCC-A-671, chủng xạ khuẩn Actinoplanes sp VTCC-A-832 có khả ức chế Alternaria sp tốt (33%), chủng có tiềm ứng dụng thực tế đối tượng cho nghiên cứu sâu hoạt chất kháng nấm để đánh giá tính Hình Khả ức chế Alternaria sp chủng xạ khuẩn khảo sát B cinerea nguyên nhân gây bệnh thối xám 200 loại thực vật khác gây thiệt hại kinh tế nặng nề cho ngành nông nghiệp toàn giới (Williamson, 2007) Ở Việt Nam, B cinerea tìm thấy gây bệnh nhiều loại rau ớt, dâu tây, cà chua, nho Trong nghiên cứu này, khả ức chế nấm B cinerea khảo sát 70 chủng xạ khuẩn (Hình 6) cho kết chủng có khả ức chế tốt Streptomyces sp VTCC-B-605 với tỷ lệ 47% (Hình 7C) Khả ức chế chủng VTCC-B-605 qua bước đầu khảo sát thấp so với hoạt tính chủng Trichoderma (lên đến 75%) công bố trước (Bogumil et al., 2013) Tuy nhiên, hoạt chất sinh chủng VTCCB-605 đáng quan tâm chủng có khả đối kháng đặc hiệu B cinerea mà không ức chế chủng nấm khác Ngoài ra, cần lưu ý rằng, tỷ lệ ức chế nghiên cứu đánh giá phương pháp đặt thỏi thạch Vì vậy, tỷ lệ ức chế cịn cao nhiều so với số liệu ban đầu hoạt tính dịch ni cấy điều kiện tối ưu dịch tách chiết hay chất tinh đánh giá Hình Khả ức chế B cinerea chủng xạ khuẩn khảo sát Trong số 70 chủng xạ khuẩn khảo sát, có chủng có khả ức chế C gloeosporioides, loại nấm gây bệnh thán thư nghiêm trọng hàng trăm lồi thực vật Hoạt tính cao phát chủng Streptomyces sp VTCC-A-69 với khả ức chế 38% (Hình 7D) Chủng xạ khuẩn có khả đối kháng tốt với Alternaria sp 532 (33%) B cinerea (29%) Ngoài ra, chủng có hoạt tính, chủng xạ khuẩn Dactylosporangium aurantiacum VTCC-A-185 có khả ức chế 15% phát triển nấm C gloeosporioides Khả kháng C gloeosporioides chủng xạ khuẩn nghiên cứu chưa cao so với nghiên cứu trước đây, tỷ lệ ức chế Tạp chí Cơng nghệ Sinh học 17(3): 527-535, 2019 đạt đến 82% S noursei 69% S natalensis (Zikovic et al., 2010) Tuy nhiên việc tìm thấy hoạt tính kháng C gloeosporioides sinh từ lồi D aurantiacum phát mới, có tiềm việc nghiên cứu tìm kiếm hoạt chất kháng nấm có ý nghĩa đặc biệt bối cảnh xuất ngày nhiều chủng nấm có khả kháng chất kháng nấm thơng thường Hình Khả ức chế chủng xạ khuẩn VTCC-A-828 P capsici (A), VTCC-A-671 Alternaria sp (B), VTCC-A-605 B cinerea (C) VTCC-A-69 C gloeosporioides (D) Đường đứt đoạn biểu diễn diện tích chủng nấm mọc khơng có mặt xạ khuẩn KẾT LUẬN Trong nghiên cứu này, 70 chủng xạ khuẩn phân lập từ Vườn Quốc gia Cúc Phương Ba Bể, phân loại đến chi khảo sát hoạt tính đối kháng với loại nấm gây bệnh quan trọng P capsici, Alternaria sp., B cinerea C gloeosporioides Kết cho thấy 70 chủng phân lập xếp vào chi, gồm Streptomyces (41 chủng) chi xạ khuẩn hiếm, số lượng chủng cao chi Actinoplanes (21 chủng) Nghiên cứu đánh giá hoạt tính kháng loại nấm gây bệnh cho thấy 80,5% số chủng thuộc chi Streptomyces 31% số chủng xạ khuẩn có hoạt tính kháng chủng nấm gây bệnh, đặc biệt có 10 chủng có khả kháng đồng thời chủng nấm gây bệnh Bốn chủng xạ khuẩn (VTCC-A-828, VTCC-A-671, VTCC-A-605 VTCC-A-69) số 70 chủng khảo sát thể khả đối kháng mạnh với chủng nấm xác định Đây nguồn nguyên liệu quý cần tiếp tục nghiên cứu để phát triển chế phẩm sinh học, ứng dụng thực tiễn Bên cạnh đó, số chủng xạ khuẩn có hoạt tính đối kháng tốt với chủng nấm gây bệnh nguồn nguyên liệu tiềm để phát hoạt chất sinh học Lời cảm ơn: Nghiên cứu tài trợ Nhiệm vụ điều tra "Điều tra tiềm hoạt tính sinh học nguồn gen xạ khuẩn Việt Nam nhằm khai thác phục vụ nông nghiệp hữu cơ" TÀI LIỆU THAM KHẢO Arzanlou M, Khodaei S, Narmani A, Babai-Ahari A, Azar AM (2013) Inhibitory effect of Trichoderma isolates on growth of Alternaria alternata, the causal agent of leaf spot disease on sunflower, under laboratory conditions Arch Phytopathology Plant Protect 47(13): 1592–1599 Berdy J (2005) Bioactive microbial metabolites J Antibiot (Tokyo) 58(1): 1–26 Bogumił A, Sas L, Lisek A, Trzcinski P, Harbuzov A (2013) Identification of new Trichoderma strains with antagonistic activity against Botrytis cinerea Folia Hort 25: 123–132 Catello P, Massimo Z (2015) Evaluation of Bacillus strains isolated from solanaceous phylloplane for biocontrol of Alternaria early blight of tomato Biol Control 84: 11–18 El Hussein AA, Alhasan REM, Abdelwahab SA, El Siddig MA (2014) Isolation and identification of Streptomyces rochei strain active against phytopathogenic fungi Br Microbiol Res J 4(10): 1057–1068 533 Nguyễn Thị Vân et al Ganesan P, Reegan AD, David RHA, Gandhi MR, Paulraj MG, Al-Dhabi NA, Ignacimuthu S (2017) Antimicrobial activity of some actinomycetes from Western Ghats of Tamil Nadu, India Alexandria Med J 53(2): 101–110 Bùi Thị Việt Hà, Mai Đàm Linh, Phạm Đức Ngọc (2007) Nghiên cứu đặc điểm sinh học số xạ khuẩn phân lập Việt Nam Hội nghị toàn quốc Nghiên cứu khoa học sống 692–695 Đỗ Thu Hà (2002) Định loại chủng xạ khuẩn Streptomyces ĐN-05 sinh chất kháng sinh có hoạt phổ rộng phân lập từ đất tỉnh Quảng Nam Tạp chí Sinh học 24(1): 59–63 Phytophthora palmivora gây hại sầu riêng Cần Thơ Bến Tre Tạp chí Nghiên cứu Khoa học 6: 154–161 Nega A (2014) Review on concepts in biological control of plant pathogens J Biol Agric and Health 4(27): 33–35 Oerke EC (2006) Crop losses to pests J Agric Sci 144: 31– 43 Singh V, Haque S, Singh H, Verma J, Vibha K, Singh R, Jawed A, Tripathi CK (2016) Isolation, screening, and identification of novel isolates of actinomycetes from India for antimicrobial applications Front Microbiol 7: 1921 Tran Thi Thu Ha (2007) Interaction between biosurfactantproducing Pseudomonas and Phytophthora species Wagaeningen University, the Netherlands Takahashi Y, Omura S (2003) Isolation of new actinomycete strains for the screening of new bioactive compounds J Gen Appl Microbiol 49(3): 141–154 Hayakawa M, Nonomura H (1987) Humic acid-vitamin agar, a new medium for the selective isolation of soil actinomycetes J Ferment Technol 65:501–509 Tamura T, Hayakawa M, Hatano K (1998) A new genus of the order Actinomycetales, Cryptosporangium gen nov., with descriptions of Cryptosporangium arvum sp nov and Cryptosporangium japonicum sp nov Int J Syst Bacteriol 48: 995–1005 Hayakawa M, Otoguro M, Takeuchi T, Yamazaki T, Iimura Y (2000) Application of a method incorporating differential centrifugation for selective isolation of motile actinomycetes in soil and plant litter Antonie Van Leeuwenhoek 78(2): 171–185 Heng JLS, Hamzah H (2014) Biological active compounds from actinomycetes isolated from soil of Langkawi Island, Malaysia Afr J Biotechnol 13(49): 4523–4528 Hop DV, Sakiyama Y, Binh CT, Otoguro M, Hang DT, Miyadoh S, Luong DT, Ando K (2011) Taxonomic and ecological studies of actinomycetes from Vietnam: isolation and genus-level diversity J Antibiot (Tokyo) 64(9): 599–606 Horbach R, Navarro-Quesada AR, Knogge W, Deising HB (2011) When and how to kill a plant cell: infection strategies of plant pathogenic fungi J Plant Physiol 168: 51–62 Kunova A, Bonaldi M, Saracchi M, Pizzatti C, Chen X, Cortesi P (2016) Selection of Streptomyces against soil borne fungal pathogens by a standardized dual culture assay and evaluation of their effects on seed germination and plant growth BMC Microbiol 16: 272–282 Biền Văn Minh, Phạm Quang Chinh (2009) Nghiên cứu đa dạng sinh học xạ khuẩn đất Bình Trị Thiên Hội thảo mơi trường nơng nghiệp - Nông thôn đa dạng sinh học miền Trung Việt Nam Dương Minh, Lê Phước Thạnh, Hồ Văn Thiệt, Lê Bảo Ti, Võ Thị Gương (2006) Tác động chủng nấm đối kháng Trichoderma nội địa việc phòng trị bệnh 534 Trần Thị Thuần, Nguyễn Thị Ly, Phạm Ngọc Dung (2004) Nghiên cứu sử dụng nấm đối kháng Trichoderma để phịng trừ nhóm nấm tồn đất gây hại trồng Tạp chí Bảo vệ thực vật 4: 15–17 Tiwari K, Gupta RK (2012) Rare actinomycetes: a potential storehouse for novel antibiotics Crit Rev Biotechnol 32(2): 108–132 Đỗ Thị Tuyến, Lương Thị Hương Giang, Đào Thị Hằng, Nguyễn Thị Hương Liên, Vũ Thị Đoan Chính (2011) Hoạt tính kháng sinh xạ khuẩn đất khu vực có hoạt động khai thác khống sản Tạp chí Khoa học Cơng nghệ 86(10): 153–158 Uniyal K, Singh Y (2017) Evaluation of antagonist activity of Trichoderma species against Alternaria alternata isolated from Populus deltoides Int J Sci Res 3: 1070– 1074 Wheeler WB (2002) Role of research and regulation in 50 years of pest management in agriculture J Agric Food Chem 50: 4151–4155 Williamson B, Bettina T, Tudzynski P, Van Kan JaL (2007) Botrytis cinerea: the cause of grey mould disease Mol Plant Pathol 8(5): 561–580 Zikovic S, Stojanovic S, Ivanovic Z, Gavrilovic V, Popovic T, Balaz J (2010) Screening of antagonistic activity of microorganisms agaist Collectotrichum acutatum and Collectotrichum gloeosporioides Arch Biol Sci 62 (3): 611–623 Tạp chí Cơng nghệ Sinh học 17(3): 527-535, 2019 INVESTIGATION OF ANTAGONISTIC ACTIVITIES OF ACTINOMYCETES ISOLATED FROM CUC PHUONG AND BA BE NATIONAL PARKS AGAINST FOUR PLANT PATHOGENIC FUNGI Nguyen Thi Van, Dinh Thi Ngoc Mai, Le Thi Hoang Yen, Nguyen Hong Minh, Nguyen Kim Nu Thao Institute of Microbiology and Biotechnology, Vietnam National University, Hanoi SUMMARY Fungal diseases are a huge problem in agriculture, causing serious damage to annual crop yields worldwide In order to control fungal pathogens in plants, using antagonistic microorganisms is a common approach, especially actinomycetes, as biocontrols considered to be very potential and safe for the environment With the advantage of high levels of biodiversity, Vietnamese actinomycetes are of a valuable resource for finding strains that are capable of biocontrolling fungal pathogens in plants Thus, in this study, 70 actinomycete strains were isolated from Cuc Phuong and Ba Be National Parks by four different isolation methods including rehydration centrifugation, sodium dodecyl sulfate – yeast extract, dry heating and dilution methods Of these, 29 strains (41.4%) belong to rare actinomycete genera including Actinoplanes, Acrocarpospora, Dactylosporangium, Kineosporia, Micromonospora, Nocardia, Nocardiopsis and Pseudonocardia, which are rarely studied in Vietnam Subsequently, 70 actinomycete strains were subjected to antagonistic activity assays against four highly pathogenic fungi in plants including Alternaria sp., Botrytis cinerea, Colletotrichum gloeosporioides and Phytophthora capsici The results showed that 80.5% of Streptomyces and 31% of rare actinomyces could inhibit the growth of at least one of the four pathogenic fungal strains Moreover, ten actinmomycete strains were found to be able to inhibit three types of tested fungal pathogens, simutaneously Especially, four actinomycete strains (VTCC-A-828, VTCC-A-671, VTCC-A-605, and VTCC-A-69), having the highest antagonistic activity against four fungal pathogens Alternaria sp., Botrytis cinerea, Colletotrichum gloeosporioides and Phytophthora capsici, respectively, were selected The results in this study indicate the great potential application for Vietnam's microorganisms in the field of plant protection Keywords: Actinomycetes, Alternaria gloeosporioides, Phytophthora capsici sp., antifungal activities, Botrytis cinerea, Colletotrichum 535 ... cứu này, 70 chủng xạ khuẩn phân lập từ Vườn Quốc gia Cúc Phương Vườn Quốc gia Ba Bể khảo sát khả đối kháng loại nấm gây bệnh nghiêm trọng thực vật chưa nghiên cứu nhiều Việt Nam bao gồm P capsici,... chủng nấm mọc khơng có mặt xạ khuẩn KẾT LUẬN Trong nghiên cứu này, 70 chủng xạ khuẩn phân lập từ Vườn Quốc gia Cúc Phương Ba Bể, phân loại đến chi khảo sát hoạt tính đối kháng với loại nấm gây bệnh. .. Bùi Thị Việt Hà et al., (2007), thực khảo sát 43 chủng xạ khuẩn phân lập từ Trùng Khánh, Cao Bằng Kết khảo sát khả đối kháng 70 chủng xạ khuẩn với loại nấm gây bệnh tóm tắt hình Kết cho thấy 33/41

Ngày đăng: 02/12/2021, 09:33

Hình ảnh liên quan

Hình 1. Hình ảnh khuẩn lạc đại diện của 9 chi xạ khuẩn phân lập được. A. VTCC-A-897 Streptomyces sp., B - Khảo sát khả năng đối kháng với bốn loại nấm gây bệnh trên thực vật của xạ khuẩn được phân lập từ Vườn Quốc gia Cúc Phương và Ba Bể

Hình 1..

Hình ảnh khuẩn lạc đại diện của 9 chi xạ khuẩn phân lập được. A. VTCC-A-897 Streptomyces sp., B Xem tại trang 3 của tài liệu.
Bảng 1. Bảng kết quả phân loại đến chi của 70 chủng xạ khuẩn phân lập được.   - Khảo sát khả năng đối kháng với bốn loại nấm gây bệnh trên thực vật của xạ khuẩn được phân lập từ Vườn Quốc gia Cúc Phương và Ba Bể

Bảng 1..

Bảng kết quả phân loại đến chi của 70 chủng xạ khuẩn phân lập được. Xem tại trang 3 của tài liệu.
Hình 3. Tỷ lệ xạ khuẩn được khảo sát có hoạt tính đối kháng với 4 chủng nấm gây bệnh. - Khảo sát khả năng đối kháng với bốn loại nấm gây bệnh trên thực vật của xạ khuẩn được phân lập từ Vườn Quốc gia Cúc Phương và Ba Bể

Hình 3..

Tỷ lệ xạ khuẩn được khảo sát có hoạt tính đối kháng với 4 chủng nấm gây bệnh Xem tại trang 4 của tài liệu.
chủng xạ khuẩn thuộc các chi xạ khuẩn hiếm (Bảng 1). Đây cũng là một trong số ít các nghiên cứu ở Việt  Nam khảo sát một số lượng lớn xạ khuẩn hiếm bên  cạnh nghiên cứu của Bùi Thị Việt Hà et al., (2007),  thực hiện khảo sát trên 43 chủng xạ khuẩn hiếm ph - Khảo sát khả năng đối kháng với bốn loại nấm gây bệnh trên thực vật của xạ khuẩn được phân lập từ Vườn Quốc gia Cúc Phương và Ba Bể

ch.

ủng xạ khuẩn thuộc các chi xạ khuẩn hiếm (Bảng 1). Đây cũng là một trong số ít các nghiên cứu ở Việt Nam khảo sát một số lượng lớn xạ khuẩn hiếm bên cạnh nghiên cứu của Bùi Thị Việt Hà et al., (2007), thực hiện khảo sát trên 43 chủng xạ khuẩn hiếm ph Xem tại trang 4 của tài liệu.
ức chế lên đến 74% (Hình 7A). Chủng xạ khuẩn này  còn  có  khả  năng ức  chế  sự  sinh  trưởng  của  - Khảo sát khả năng đối kháng với bốn loại nấm gây bệnh trên thực vật của xạ khuẩn được phân lập từ Vườn Quốc gia Cúc Phương và Ba Bể

c.

chế lên đến 74% (Hình 7A). Chủng xạ khuẩn này còn có khả năng ức chế sự sinh trưởng của Xem tại trang 5 của tài liệu.
Hình 6. Khả năng ức chế B. cinerea của các chủng xạ khuẩn được khảo sát. - Khảo sát khả năng đối kháng với bốn loại nấm gây bệnh trên thực vật của xạ khuẩn được phân lập từ Vườn Quốc gia Cúc Phương và Ba Bể

Hình 6..

Khả năng ức chế B. cinerea của các chủng xạ khuẩn được khảo sát Xem tại trang 6 của tài liệu.
Hình 5. Khả năng ức chế Alternaria sp. của các chủng xạ khuẩn được khảo sát. - Khảo sát khả năng đối kháng với bốn loại nấm gây bệnh trên thực vật của xạ khuẩn được phân lập từ Vườn Quốc gia Cúc Phương và Ba Bể

Hình 5..

Khả năng ức chế Alternaria sp. của các chủng xạ khuẩn được khảo sát Xem tại trang 6 của tài liệu.
Hình 7. Khả năng ức chế của chủng xạ khuẩn VTCC-A-828 đối với P. capsici (A), VTCC-A-671 đối với Alternaria sp - Khảo sát khả năng đối kháng với bốn loại nấm gây bệnh trên thực vật của xạ khuẩn được phân lập từ Vườn Quốc gia Cúc Phương và Ba Bể

Hình 7..

Khả năng ức chế của chủng xạ khuẩn VTCC-A-828 đối với P. capsici (A), VTCC-A-671 đối với Alternaria sp Xem tại trang 7 của tài liệu.

Từ khóa liên quan

Tài liệu cùng người dùng

Tài liệu liên quan