Tổng quan về đa hình gen IL28B và sự ảnh hưởng của đa hình gen tới đáp ứng thuốc

ĐẠI HỌC QUỐC GIA HÀ NỘI KHOA Y DƯỢC TRẦN NHÂN PHAN TỔNG QUAN VỀ ĐA HÌNH GEN IL28B VÀ SỰ ẢNH HƯỞNG CỦA ĐA HÌNH GEN TỚI ĐÁP ỨNG THUỐC KHÓA LUẬN TỐT NGHIỆP ĐẠI HỌC NGÀNH DƯỢC Hà Nội – 2020 ĐẠI HỌC QUỐC GIA HÀ NỘI KHOA Y DƯỢC Người thực hiện: TRẦN NHÂN PHAN TỔNG QUAN VỀ ĐA HÌNH GEN IL28B VÀ SỰ ẢNH HƯỞNG CỦA ĐA HÌNH GEN TỚI ĐÁP ỨNG THUỐC KHĨA LUẬN TỐT NGHIỆP ĐẠI HỌC (NGÀNH DƯỢC) Khóa: QH.2015.Y Người hướng dẫn: ThS PHẠM THỊ HỒNG NHUNG PGS.TS ĐINH ĐOÀN LONG Hà Nội – 2020 LỜI CẢM ƠN Trước tiên, tơi xin bày tỏ lịng biết ơn chân thành sâu sắc tới PGS.TS Đinh Đoàn Long ThS Phạm Thị Hồng Nhung – Giảng viên Khoa Y Dược, Đại học Quốc gia Hà Nội Hai thầy cô ln tận tình hướng dẫn bảo, cho tơi lời khuyên kiến thức chuyên môn để thực nghiên cứu Tôi xin dành lời cảm ơn sâu sắc tới thầy cô Bộ môn Y dược học sở, Khoa Y Dược, Đại học Quốc gia Hà Nội Các thầy cô chia sẻ kinh nghiệm, hỗ trợ nhiều mặt tạo điều kiện thuận lợi cho thời gian thực khóa luận Tơi xin chân thành cảm ơn thầy cô cán hỗ trợ Khoa Y Dược không chỉ bảo kiến thức chuyên ngành mà định hướng nghề nghiệp, truyền lửa đam mê, giúp tơi có thêm động lực, niềm tin khơng học tập mà cịn q trình phát triển nghề nghiệp tương lai Tôi trân trọng cảm ơn tài trợ kinh phí Đại học quốc gia Hà Nội cho đề tài mã số QG.18.60 PGS.TS Đinh Đoàn Long chủ trì để thực nghiên cứu Cuối cùng, tơi xin bày tỏ lịng biết ơn tới gia đình, bạn bè, người yêu quý, dành thời gian động viên, hỗ trợ tơi suốt q trình học tập, thực hồn thành khóa luận Hà Nội, ngày 10 tháng năm 2020 Sinh viên Trần Nhân Phan DANH MỤC CÁC HÌNH Trang Hình 1.1 Phân loại interferon Hình 1.2 Mơ hình liên kết disulfit số interferon Hình 1.3 Trình tự protein số interferon .7 Hình 1.4 Con đường truyền tín hiệu loại interferon 10 Hình 1.5 Vị trí gen mã hóa cho IFN loại I người 11 Hình 1.6 Cấu trúc gen IFN loại 12 Hình 1.7 Gen mã hóa cho IL28B nằm nhiễm sắc thể số 19 .13 Hình 1.8 Các biến thể IFN-λ3 IFN-λ4 nhiễm sắc thể 19 13 Hình 1.9 Vị trí nhiễm sắc thể cấu trúc gen mã hóa cho thành viên họ IFN- λ 14 Hình 2.1 Vị trí đa hình rs12979860 rs8099917 17 Hình 3.1 Các yếu tố ảnh hưởng đến đáp ứng thuốc 20 Hình 3.2 Vai trị rs12979860 dự đốn đáp ứng điều trị HCV kiểu gen Việt Nam 27 DANH MỤC CÁC BẢNG Trang Bảng 1.1 Từ khóa tìm kiếm .3 Bảng 1.2 So sánh đặc điểm loại IFN Bảng 2.1 Tần số alen đa hình thuộc nhóm quần thể khác 16 Bảng 3.1 Bảng thuốc có chứa thông tin dược di truyền liên quan đến IL28B nhãn thuốc 21 Bảng 3.2 Ảnh hưởng đa hình với đáp ứng phác đồ PEG-IFN + RBV điều trị viêm gan C mạn tính .29 Bảng 3.3 Ảnh hưởng số đa hình IL28B khác lên đáp ứng với phác đồ PEG-IFN bệnh nhân HCV mạn tính 31 Bảng 3.4 Ảnh hưởng đa hình gen IL28B tới phác đồ thuốc (PEG-IFN + RBV + DAA) điều trị viêm gan C mạn tính .34 Bảng 3.5 Khuyến cáo với phác đồ chứa IFN dựa kiểu gen IL28B 36 Bảng 3.6 Ảnh hưởng đa hình gen IL28B tới thuốc chống virut tác dụng trực tiếp điều trị viêm gan C mạn tính .39 Bảng 3.7 Ảnh hưởng đa hình IL28B tới phác đồ PEG-IFN bệnh nhân viêm gan C đồng nhiễm HIV .41 Bảng 3.8 Ảnh hưởng đa hình IL28B đến đáp ứng điều trị với IFN bệnh nhân MPN 46 DANH MỤC TỪ VIẾT TẮT Viết tắt Tiếng Anh Tiếng Việt aOR adjusted odds ratios Hệ số OR điều chỉnh APCs Antigen presenting cell ARMSPCR ARN HCV Amplification-refractory mutation system-polymerase chain reaction Hepatitis C virus - Ribonucleic acid Các tế bào trình diện kháng nguyên Hệ thống đột biến chịu nhiệt khuếch đại ARMS-PCR ARN virut viêm gan C BOC Boceprevir Boceprevir cEVR complete EVR Đáp ứng virut sớm toàn phần CPIC Clinical Pharmacogenetics Implementation Consortium Hiệp hội thực dược di truyền học lâm sàng Complete hematologic Tỷ lệ lui bệnh huyết học hoàn remissions toàn DAAs Direct acting antivirals Các thuốc kháng virut trực tiếp DC Dendritic cells Tế bào tua DHPLC Denaturing high performance liquid chromatography Sắc ký lỏng hiệu cao DNA DSV Dasabuvir Dasabuvir EMA European Medicines Agency Cơ quan Dược phẩm Châu Âu EOTVR End of treatment virus response ET Essential thrombocythemia Tăng tiểu cầu tiên phát EVR Early Virological Response Đáp ứng virut sớm FDA Food and Drug Administration GAF IFN-γ activation factor Yếu tố hoạt hóa interferon gamma GAS gamma-activated sequence Trình tự hoạt hóa gamma HBcrAg Hepatitis B core-related antigen CR Đáp ứng virut kết thúc kết thúc điều trị Cục quản lý Thực phẩm Dược phẩm Hoa Kỳ Kháng nguyên liên quan đến lõi virut viêm gan B Kháng nguyên e virut viêm HBeAg Hepatitis B envelope Antigen HBsAg Hepatitis B surface antigen Kháng nguyên bề mặt virut viêm gan B HBV Hepatitis B Virus Virut viêm gan B HCC Hepatocellular carcinoma Ung thư tế bào gan HCSC Health Canada (Santé Canada) Hệ thống Y tế Canada HCV Hepatitis C Virus Virut viêm gan C HIV Human Immunodeficiency Virus Virut suy giảm miễn dịch người IFN Interferon Interferon IL Interleukin Interleukin IL10R interleukin-10 receptor Thụ thể interleukin 10 IRF9 IFN-regulatory factor Yếu tố điều hòa interferon IRS Insulin receptor substrate Chất thụ thể insulin ISG IFN-stimulated gene Gen kích thích Interferon ISGF3 IFN-stimulated gene factor Yếu tố gen kích thích IFN IFN-stimulated response Các yếu tố đáp ứng kích elements thích IFN JAK1 Janus kinase Janus kinase mDCs Myeloid dendritic cells Các tế bào tua myeloid MF Myelofibrosis Xơ hóa tủy xương MPN Myeloproliferative neoplasms Tăng sinh tủy ác tính NR Null Response Khơng đáp ứng với điều trị pDCs Plasmacytoid dendritic cells Các tế bào tua plasmacytoid PEG-IFN Pegylated Interferon Pegylated Interferon pEVR partial EVR Pharmaceuticals and Medical Devices Agency, Japan Đáp ứng virut sớm phần Cơ quan Dược phẩm Thiết bị Y tế Nhật Bản PV Polycythemia vera Bệnh đa hồng cầu nguyên phát RBV Ribavirin Ribavirin Restriction fragment length Đa hình độ dài đoạn cắt giới hạn ISRE PMDA RFLP RNA polymorphism Ribonucleic acid gan B Axit Ribonucleic Ribonuclease L- Một loại enzym RNase L Ribonuclease L kích hoạt tạo interferon RVR Rapid Virological Response Đáp ứng virut nhanh Single nucleotide Đa hình đơn nucleotit SNP SVR STAT polymorphism Sustained virological response Đáp ứng virut bền vững Signal transducer and Activator Protein chuyển đổi tín hiệu of transcription kích hoạt phiên mã Swissmedic Swiss Agency of Therapeutic Products Cơ quan quản lý dược phẩm Thụy Sĩ TPR Telaprevir Telaprevir TYK2 Tyrosine kinase Tyrosine kinase MỤC LỤC Trang ĐẶT VẤN ĐỀ ĐỐI TƯỢNG VÀ PHƯƠNG PHÁP NGHIÊN CỨU Đối tượng nghiên cứu Phương pháp nghiên cứu CHƯƠNG TỔNG QUAN VỀ INTERFERON VÀ GEN IL28B 1.1 Giới thiệu chung interferon 1.1.1 Cytokin 1.1.2 Interferon 1.1.3 Phân loại danh pháp interferon 1.1.4 Con đường truyền tín hiệu interferon 1.2 Cấu trúc vị trí gen mã hóa cho IFN 11 1.2.1 IFN loại I 11 1.2.2 IFN loại II .11 1.2.3 IFN loại III 12 CHƯƠNG TỔNG QUAN VỀ ĐA HÌNH GEN IL28B 15 2.1 Các đa hình gen IL28B 15 2.2 Tần số phân bố alen tỷ lệ kiểu gen IL28B 15 2.3 Các đa hình quan trọng IL28B 16 2.4 Các cách xác định kiểu gen IL28B 17 CHƯƠNG TỔNG QUAN VỀ ẢNH HƯỞNG CỦA ĐA HÌNH GEN IL28B TỚI ĐÁP ỨNG THUỐC 19 3.1 Các yếu tố ảnh hưởng đến đáp ứng thuốc 19 3.2 Đáp ứng thuốc ảnh hưởng IL28B 20 3.2.1 Thuốc điều trị viêm gan C mạn tính .21 3.2.1.1 HCV không đồng nhiễm HIV 23 3.2.1.1.1 Phác đồ PEG-IFN-α 23 3.2.1.1.2 Phác đồ PEG-IFN-λ 36 3.2.1.1.3 Phác đồ không IFN 37 3.2.1.2 HCV đồng nhiễm HIV .40 3.2.2 Thuốc điều trị viêm gan B 41 3.2.2.1 Phác đồ PEG-IFN 42 3.2.2.2 Phác đồ PEG-IFN + adefovir 44 3.2.3 Thuốc điều trị tăng sinh tủy ác tính 44 KẾT LUẬN VÀ ĐỀ XUẤT 47 TÀI LIỆU THAM KHẢO Bảng 3.8 Ảnh hưởng đa hình IL28B đến đáp ứng điều trị với IFN bệnh nhân MPN PV: Bệnh đa hồng cầu nguyên phát ET: Tăng tiểu cầu tiên phát Đa hình Nhóm bệnh nhân rs12979860 PV + ET Ảnh hưởng đa hình Kiểu gen CC liên quan đến đạt tỷ lệ CR cao so với kiểu gen không CC PV Kiểu gen CC liên quan đến đạt tỷ lệ CR cao so với kiểu gen không CC ET Liên quan đa hình với tỷ lệ CR khơng có ý nghĩa thống kê rs12980275 PV + ET PV Kiểu gen AA liên quan đến đạt tỷ lệ CR cao so với kiểu gen không AA Kiểu gen AA liên quan đến đạt tỷ lệ CR cao so với kiểu gen không AA ET Liên quan đa hình với tỷ lệ CR khơng có ý nghĩa thống kê rs8099917 PV + ET, PV, Liên quan đa hình với tỷ lệ CR khơng có ý nghĩa ET thống kê 46 KẾT LUẬN VÀ ĐỀ XUẤT 3.1 Kết luận Sau tổng quan đa hình gen IL28B ảnh hưởng đa hình gen đến đáp ứng thuốc, rút số kết luận sau: Về gen đa hình gen IL28B: - IL28B gen nằm nhiễm sắc thể 19, mã hóa cho IFN-λ-3, phối tử liên kết với phức hợp thụ thể cytokin loại II, kích hoạt đường truyền tín hiệu JAK/STAT, hoạt hóa gen kích thích biểu IFN, có vai trị bảo vệ thể chống lại xâm nhiễm virut - Có 12 đa hình gen IL28B liên quan đến đáp ứng thuốc: rs12979860, rs8099917, rs12980275, rs4803217, rs11881222, rs7248668, rs8105790, rs28416813, rs8103142, rs4803219, rs10853728, rs8113007 Tần số alen đột biến có khác biệt nhóm dân tộc khác nhau, sở giải thích cho khác biệt đáp ứng thuốc nhóm dân tộc - Hai đa hình IL28B nghiên cứu phổ biến rs12979860 rs8099917 Hai đa hình liên kết chặt với nhau, mức độ liên kết bị ảnh hưởng nhóm dân tộc: liên kết chặt người da trắng người châu Á, liên kết yếu người châu Phi Khi so sánh xét nghiệm loại đa hình đa hình, khác biệt khả dự đốn đáp ứng lâm sàng chưa rõ ràng Với đa hình rs12979860, tần số alen đột biến T (alen cho đáp ứng kém) tất quần thể 0,356, cao người châu Phi (0,669) thấp người Đông Á (0,08) Ở người Việt Nam, tần số alen T thấp (0,091), có tương đồng với quần thể người Đơng Á Với đa hình rs8099917, tần số alen đột biến G (alen cho đáp ứng kém) tất quần thể 0,131, cao người châu Âu (0,168) thấp người châu Phi (0,042) Ở Việt Nam, tần số alen G 0,076, tương đồng với quần thể Đông Á (0,076) Về ảnh hưởng đa hình gen đến đáp ứng thuốc: - Đa hình gen IL28B ảnh hưởng đến đáp ứng nhóm thuốc: Thuốc chứa IFN (gồm PEG-IFN-α (2a/2b) PEG-IFN-λ) thuốc chống virut tác dụng trực tiếp (DAA) Những cá thể mang kiểu gen không thuận lợi (thường kiểu gen alen đột biến) cho đáp ứng điều trị so với kiểu gen thuận lợi Các nhóm thuốc liên quan đến điều trị bệnh lý viêm gan C mạn tính (có khơng đồng 47 nhiễm HIV), viêm gan B tăng sinh tủy ác tính Trong đó, mối liên quan đa hình IL28B đáp ứng điều trị phổ biến bệnh nhân viêm gan C mạn tính, đặc biệt với phác đồ có chứa IFN - Hiện có 14 thuốc có chứa thơng tin liên quan đến đa hình gen IL28B nhãn thuốc, phê duyệt Cơ quan Quản lý Thực phẩm Dược phẩm Hoa Kỳ (FDA), Cơ quan Dược phẩm Châu Âu (EMA), Cơ quan Điều trị Sản phẩm Thụy Sĩ (Swissmedic), Cơ quan Dược phẩm Thiết bị Y tế, Nhật Bản (PMDA) Y tế Canada (HCSC) - Hiện chưa có khuyến cáo liên quan đến điều chỉnh liều dựa kiểu gen IL28B Kiểu gen IL28B có ý nghĩa việc dự đoán đáp ứng thuốc trước điều trị, sở để lựa chọn chiến lược điều trị phù hợp (bao gồm thành phần phác đồ thời gian trị liệu) - Phối hợp thuốc chống virut tác dụng trực tiếp với phác đồ PEG-IFN + RBV cho hiệu đáp ứng tốt so với phác đồ PEG-IFN + RBV đơn thuần, không phụ thuộc kiểu gen IL28B hay kiểu gen virut Với phác đồ: phác đồ tiêu chuẩn PEG-IFN + RBV, phác đồ tiêu chuẩn phối hợp DAA (3 thuốc hay thuốc), phác đồ không IFN (chỉ chứa thuốc kháng virut trực tiếp), vai trị dự đốn đáp ứng kiểu gen IL28B giảm dần Thêm DAA vào phác đồ khiến vai trị dự đốn đáp ứng kiểu gen IL28B giảm đi, tạo điều kiện thuận lợi cho việc rút ngắn thời gian điều trị Điều có ý nghĩa lớn, giúp bệnh nhân giảm bớt gánh nặng chi phí hạn chế nguy tác dụng phụ - Kiểu gen virut ảnh hưởng đến khả dự đốn đáp ứng đa hình IL28B Đặc biệt phác đồ tiêu chuẩn PEG-IFN + RBV, vai trò kiểu gen IL28B người nhiễm HCV kiểu gen 1, rõ ràng so với HCV kiểu gen 2, 3.2 Đề xuất - Tiến hành thêm nghiên cứu để làm rõ ảnh hưởng đa hình IL28B đối tượng viêm gan B mạn tính tăng sinh tủy ác tính - Cần tiến hành nghiên cứu lâm sàng ảnh hưởng đa hình IL28B phác đồ điều trị viêm gan C mạn tính kiểu gen virut phổ biến người Việt Nam 48 TÀI LIỆU THAM KHẢO TIẾNG VIỆT Bộ Y Tế (2019), Hướng dẫn chẩn đoán, điều trị bệnh viêm gan vi rút B, Bộ Y Tế, Hà Nội Bộ Y Tế (2016), Hướng dẫn chẩn đoán, điều trị bệnh viêm gan vi rút C, Bộ Y Tế, Hà Nội Nguyễn Ngọc Lanh, Văn Đình Hoa (2006), Miễn dịch học, Nhà xuất Y học, Hà Nội Phạm Thị Thu Thủy (2014), "Ảnh hưởng khác IL28B điều trị bệnh nhân Việt Nam viêm gan siêu vi C kiểu gen 6", Tạp chí gan mật Việt Nam, 29, 108 – 109 Phạm Thị Thu Thủy, Hồ Tấn Đạt (2013), "Ảnh hưởng đa dạng đơn nucleotid rs12979860 vùng IL28B đáp ứng điều trị bền vững bệnh nhân Việt Nam viêm gan siêu vi C kiểu gen 6", Tạp chí Gan mật Việt Nam, 23 Lê Bảo Trân, Phạm Hoàng Phiệt cộng (2012), "Đa dạng đơn nucleotide (NSP=Single Nucleotide Polymorphism) rs 12979860 rs 8099917 vùng IL28B bệnh nhân nhiễm HCV phía nam Việt Nam", Tạp chí Gan Mật Việt Nam, 21, 9-16 TIẾNG ANH 10 About Frédégonde, Tiphaine Oudot-Mellakh, Jonathan Niay cộng (2015), "Impact of IL28B, APOH and ITPA polymorphisms on efficacy and safety of TVR-or BOC-based triple therapy in treatment-experienced HCV-1 patients with compensated cirrhosis from the ANRS CO20-CUPIC Study", PloS one, 10(12) Ahmed Hussien, Abdelrahman Ibrahim Abushouk, Amr Menshawy cộng (2018), "Meta-analysis of grazoprevir plus elbasvir for treatment of hepatitis C virus genotype infection", Annals of hepatology, 17(1), 18-32 Akkarathamrongsin Srunthron, Sunchai Payungporn, Vo Duy Thong cộng (2014), "Early viral kinetics during hepatitis C virus genotype treatment according to IL28B polymorphisms", World Journal of Gastroenterology: WJG, 20(30), 10599 Akuta Norio, Hitomi Sezaki, Fumitaka Suzuki cộng (2017), "Retreatment efficacy and predictors of ledipasvir plus sofosbuvir to HCV genotype in Japan", Journal of medical virology, 89(2), 284-290 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21 Antaki Nabil, Stéphanie Bibert, Kamel Kebbewar cộng (2012), "IL28B polymorphisms not predict response to therapy in chronic hepatitis C with HCV genotype 5", Gut, 61(11), 1640-1641 Asselah Tarik, Simon De Muynck, Philippe Broët cộng (2012), "IL28B polymorphism is associated with treatment response in patients with genotype chronic hepatitis C", Journal of hepatology, 56(3), 527-532 Boglione Lucio, Jessica Cusato, Sarah Allegra cộng (2014), "Role of IL28-B polymorphisms in the treatment of chronic hepatitis B HBeAgnegative patients with peginterferon", Antiviral research, 102, 35-43 Bucci Cristina, Annette von Delft, Annabel Christian cộng (2013), "‘Favourable’IL28B polymorphisms are associated with a marked increase in baseline viral load in hepatitis C virus subtype 3a infection and not predict a sustained virological response after 24 weeks of therapy", Journal of General Virology, 94(6), 1259-1265 C S Graham L R Baden, E Yu, J M Mrus, J Carnie, T Heeren, M J Koziel (2001), "Influence of Human Immunodeficiency Virus Infection on the Course of Hepatitis C Virus Infection: A Meta-Analysis", Clinical Infectious Diseases, 33(4), 562–569 Calisti Giorgio, Amanda Tavares, Malcolm J Macartney cộng (2015), "IL28B genotype predicts response to chronic hepatitis C triple therapy with telaprevir or boceprevir in treatment naïve and treatmentexperienced patients other than prior partial-and null-responders", Springerplus, 4(1), 357 Campbell P J A R Green (2006), "The myeloproliferative disorders", N Engl J Med, 355(23), 2452-66 Cariani E, L Roli, G Missale cộng (2016), "Interleukin 28B polymorphisms as predictors of sustained virological response in chronic hepatitis C: systematic review and meta-analysis", The pharmacogenomics journal, 16(1), 18-29 Chan Henry Lik-Yuen, Nancy Wai-Yee Leung, Alex Yui Hui cộng (2005), "A randomized, controlled trial of combination therapy for chronic hepatitis B: comparing pegylated interferon-α2b and lamivudine with lamivudine alone", Annals of internal medicine, 142(4), 240-250 Chen JY, CY Lin, CM Wang cộng (2011), "IL28B genetic variations are associated with high sustained virological response (SVR) of interferon-α plus ribavirin therapy in Taiwanese chronic HCV infection", Genes Immunity, 12(4), 300-309 De Castellarnau Montserrat, Ester Aparicio, Mariona Parera cộng (2012), "Deciphering the interleukin 28B variants that better predict response 22 23 24 25 26 27 28 29 30 31 32 to pegylated interferon-α and ribavirin therapy in HCV/HIV-1 coinfected patients", PloS one, 7(2) De Nicola Stella, Alessio Aghemo, Maria Grazia Rumi cộng (2012), "Interleukin 28B polymorphism predicts pegylated interferon plus ribavirin treatment outcome in chronic hepatitis C genotype 4", Hepatology, 55(2), 336-342 De Niet A, RB Takkenberg, R Benayed cộng (2012), "Genetic variation in IL28B and treatment outcome in HBeAg-positive and-negative chronic hepatitis B patients treated with Peg interferon alfa-2a and adefovir", Scandinavian journal of gastroenterology, 47(4), 475-481 Delvaux Nathália, Vanessa Duarte da Costa, Maristella Matos da Costa cộng (2015), "Comparison of four methods of genotyping IL28B polymorphisms in chronic hepatitis C patients", Journal of virological methods, 220, 1-4 Derbala Moutaz, Nasser Rizk, Fatima Shebl cộng (2012), "Interleukin-28 and hepatitis C virus genotype-4: treatment-induced clearance and liver fibrosis", World Journal of Gastroenterology: WJG, 18(47), 7003 Dieterich Douglas, Jürgen Kurt Rockstroh, Chloe Orkin cộng (2014), "Simeprevir (TMC435) with pegylated interferon/ribavirin in patients coinfected with HCV genotype and HIV-1: a phase study", Clinical infectious diseases, 59(11), 1579-1587 Donnelly Raymond P Sergei V Kotenko (2010), "Interferon-lambda: a new addition to an old family", Journal of Interferon Cytokine Research, 30(8), 555-564 Evans William E Howard L McLeod (2003), "Pharmacogenomics—drug disposition, drug targets, and side effects", New England Journal of Medicine, 348(6), 538-549 Feld Jordan J Jay H Hoofnagle (2005), "Mechanism of action of interferon and ribavirin in treatment of hepatitis C", Nature genetics, 436(7053), 967972 Feld Jordan J, Kris V Kowdley, Eoin Coakley cộng (2014), "Treatment of HCV with ABT-450/r–ombitasvir and dasabuvir with ribavirin", New England Journal of Medicine, 370(17), 1594-1603 Finter Norman B (1973), "Interferons and interferon inducers", Interferons interferon inducers Fischer Janett, Stephan Böhm, Markus Scholz cộng (2012), "Combined effects of different interleukin‐28B gene variants on the outcome of dual combination therapy in chronic hepatitis C virus type infection", Hepatology, 55(6), 1700-1710 33 34 35 36 37 38 39 40 41 42 43 44 Forns Xavier, Eric Lawitz, Stefan Zeuzem cộng (2014), "Simeprevir with peginterferon and ribavirin leads to high rates of SVR in patients with HCV genotype who relapsed after previous therapy: a phase trial", Gastroenterology, 146(7), 1669-1679 Gane E J., C A Stedman, R H Hyland cộng (2014), "Efficacy of nucleotide polymerase inhibitor sofosbuvir plus the NS5A inhibitor ledipasvir or the NS5B non-nucleoside inhibitor GS-9669 against HCV genotype infection", Gastroenterology, 146(3), 736-743 Gane Edward J, Catherine A Stedman, Robert H Hyland cộng (2014), "Efficacy of nucleotide polymerase inhibitor sofosbuvir plus the NS5A inhibitor ledipasvir or the NS5B non-nucleoside inhibitor GS-9669 against HCV genotype infection", Gastroenterology, 146(3), 736-743 e1 Ge Dongliang, Jacques Fellay, Alexander J Thompson cộng (2009), "Genetic variation in IL28B predicts hepatitis C treatment-induced viral clearance", Nature genetics, 461(7262), 399-401 Ge Dongliang, Jacques Fellay, Alexander J Thompson cộng (2009), "Genetic variation in IL28B predicts hepatitis C treatment-induced viral clearance", Nature genetics, 461(7262), 399-401 Hézode Christophe, Gideon M Hirschfield, Wayne Ghesquiere cộng (2015), "Daclatasvir plus peginterferon alfa and ribavirin for treatmentnaive chronic hepatitis C genotype or infection: a randomised study", Gut, 64(6), 948-956 Holmes Jacinta A, Tin Nguyen, Dilip Ratnam cộng (2013), "IL 28 B genotype is not useful for predicting treatment outcome in A sian chronic hepatitis B patients treated with pegylated interferon‐α", Journal of gastroenterology hepatology, 28(5), 861-866 Huang Tao, Yang Shu Yu-Dong Cai (2015), "Genetic differences among ethnic groups", BMC genomics, 16(1), 1093 J Sorich Michael Ross A McKinnon (2012), "Personalized medicine: potential, barriers and contemporary issues", Current drug metabolism, 13(7), 1000-1006 Jacobson I M., J G McHutchison, G Dusheiko cộng (2011), "Telaprevir for previously untreated chronic hepatitis C virus infection", N Engl J Med, 364(25), 2405-16 Janssen Harry LA, Monika van Zonneveld, Hakan Senturk cộng (2005), "Pegylated interferon alfa-2b alone or in combination with lamivudine for HBeAg-positive chronic hepatitis B: a randomised trial", The Lancet, 365(9454), 123-129 Jazwinski Alison Andrew Muir (2012), "IL28B: Implications for Clinical Practice", Current Hepatitis Reports, 11(1), 15-22 45 46 47 48 49 50 51 52 53 54 55 Jia Zhifang, Yanhua Ding, Suyan Tian cộng (2012), "Test of IL28B polymorphisms in chronic hepatitis C patients treated with PegIFN and ribavirin depends on HCV genotypes: results from a meta-analysis", PLoS one, 7(9) Kalow WBKL, BK Tang L Endrenyi (1998), "Hypothesis: comparisons of inter-and intra-individual variations can substitute for twin studies in drug research", Pharmacogenetics, 8(4), 283-290 Kotenko Sergei V, Grant Gallagher, Vitaliy V Baurin cộng (2003), "IFN-λs mediate antiviral protection through a distinct class II cytokine receptor complex", Nature immunology, 4(1), 69-77 Kowdley Kris V, Eric Lawitz, Israel Crespo cộng (2013), "Sofosbuvir with pegylated interferon alfa-2a and ribavirin for treatmentnaive patients with hepatitis C genotype-1 infection (ATOMIC): an openlabel, randomised, multicentre phase trial", The Lancet, 381(9883), 21002107 Khan Anwar Jamal, Vivek Aanand Saraswat, Prabhat Ranjan cộng (2019), "Polymorphism in interferon λ3/interleukin‐28B gene and risk to noncirrhotic chronic hepatitis C genotype virus infection and its effect on the response to combined daclatasvir and sofosbuvir therapy", Journal of medical virology, 91(4), 659-667 Lampertico Pietro, Mauro Viganò, Cristina Cheroni cộng (2013), "IL28B polymorphisms predict interferon‐related hepatitis B surface antigen seroclearance in genotype D hepatitis B e antigen–negative patients with chronic hepatitis B", Hepatology, 57(3), 890-896 Lange Christian M Stefan Zeuzem (2011), "IL28B single nucleotide polymorphisms in the treatment of hepatitis C", Journal of hepatology, 55(3), 692-701 Lau George KK, Teerha Piratvisuth, Kang Xian Luo cộng (2005), "Peginterferon Alfa-2a, lamivudine, and the combination for HBeAg-positive chronic hepatitis B", New England Journal of Medicine, 352(26), 2682-2695 Lauschke Volker M Magnus Ingelman-Sundberg (2016), "The importance of patient-specific factors for hepatic drug response and toxicity", International journal of molecular sciences, 17(10), 1714 Lawitz Eric, Alessandra Mangia, David Wyles cộng (2013), "Sofosbuvir for previously untreated chronic hepatitis C infection", New England Journal of Medicine, 368(20), 1878-1887 Lawitz Eric, Fred F Poordad, Phillip S Pang cộng (2014), "Sofosbuvir and ledipasvir fixed-dose combination with and without ribavirin in treatment-naive and previously treated patients with genotype hepatitis C 56 57 58 59 60 61 62 63 64 65 66 virus infection (LONESTAR): an open-label, randomised, phase trial", The Lancet, 383(9916), 515-523 Li Wanyu, Yanfang Jiang, Qinglong Jin cộng (2011), "Expression and gene polymorphisms of interleukin 28B and hepatitis B virus infection in a Chinese Han population", Liver International, 31(8), 1118-1126 Lindgren Marie (2012), "Influence of interferon-alfa treatment outcome in polycythemia vera and essential thrombocythemia by genetic polymorphism in IL28B", Journal of Hematological Malignancies, Lindgren Marie, Jan Samuelsson, Lars Nilsson cộng (2014), "A Retrospective Cohort Study of Interferon-α Therapy in Myeloproliferative Neoplasms; Adverse Events, Thromboembolic Incidence and Causes of Termination of Therapy", Blood, 124, 1861-1861 Lindgren Marie, Jan Samuelsson, Lars Nilsson cộng (2018), "Genetic variation in IL 28B (IFNL 3) and response to interferon‐alpha treatment in myeloproliferative neoplasms", European journal of haematology, 100(5), 419-425 Luo Yueqiu, Caixia Jin, Zongxin Ling cộng (2013), "Association study of IL28B: rs12979860 and rs8099917 polymorphisms with SVR in patients infected with chronic HCV genotype to PEG-INF/RBV therapy using systematic meta-analysis", Gene, 513(2), 292-296 Manns Michael, Patrick Marcellin, Fred Poordad cộng (2014), "Simeprevir with pegylated interferon alfa 2a or 2b plus ribavirin in treatmentnaive patients with chronic hepatitis C virus genotype infection (QUEST2): a randomised, double-blind, placebo-controlled phase trial", The Lancet, 384(9941), 414-426 Manns Michael P, John G McHutchison, Stuart C Gordon cộng (2001), "Peginterferon alfa-2b plus ribavirin compared with interferon alfa2b plus ribavirin for initial treatment of chronic hepatitis C: a randomised trial", The Lancet, 358(9286), 958-965 Mangia Alessandra, Alexander J Thompson, Rosanna Santoro cộng (2010), "An IL28B polymorphism determines treatment response of hepatitis C virus genotype or patients who not achieve a rapid virologic response", Gastroenterology, 139(3), 821-827 Martin Maureen P, Ying Qi, James J Goedert cộng (2010), "IL28B polymorphism does not determine outcomes of hepatitis B virus or HIV infection", The Journal of infectious diseases, 202(11), 1749-1753 Meager Anthony (2006), The interferons: characterization and application, John Wiley & Sons Mini Enrico Stefania Nobili (2009), "Pharmacogenetics: implementing personalized medicine", Clinical cases in mineral bone metabolism, 6(1), 17 67 68 69 70 71 72 73 74 75 76 77 78 Moghaddam Amir, Espen Melum, Nils Reinton cộng (2011), "IL28B genetic variation and treatment response in patients with hepatitis C virus genotype infection", Hepatology, 53(3), 746-754 Mohammed Eslam, Leung Reynold, Manuel Romero Gomez cộng sự., "IFNL3 polymorphisms predict response to therapy in chronic hepatitis C genotype 2/3 infection", Journal of hepatology Muir AJ, L Gong, SG Johnson cộng (2014), "Clinical pharmacogenetics implementation consortium (CPIC) guidelines for IFNL3 (IL28B) genotype and PEG interferon‐α–based regimens", Clinical Pharmacology Therapeutics, 95(2), 141-146 Nakayama Masahiko, Hisanori Kobayashi, Koji Fukushima cộng (2016), "Predictive factors for 24 weeks sustained virologic response (SVR24) and viral relapse in patients treated with simeprevir plus peginterferon and ribavirin", Hepatology international, 10(1), 158-168 O'Brien Thomas R, Shyam Kottilil, Jordan J Feld cộng (2017), "Race or genetic makeup for hepatitis C virus treatment decisions?", Hepatology, 65(6), 2124-2125 O'Brien Thomas R, Ludmila Prokunina-Olsson Raymond P Donnelly (2014), "IFN-λ4: the paradoxical new member of the interferon lambda family", Journal of Interferon Cytokine Research, 34(11), 829-838 O'Brien Thomas R., Krystle A Lang Kuhs Ruth M Pfeiffer (2014), "Subgroup Differences in Response to Weeks of Ledipasvir/Sofosbuvir for Chronic Hepatitis C", Open Forum Infectious Diseases, 1(3) O’Brien Thomas R, Shyam Kottilil Ruth M Pfeiffer (2017), "IFNL4 genotype is associated with virologic relapse after 8-week treatment with sofosbuvir, velpatasvir, and voxilaprevir", Gastroenterology, 153(6), 16941695 Osinusi Anu Susanna Naggie (2012), "The Role of IL28B Genotype Testing in the Era of Direct Acting Antiviral Agents", European gastroenterology hepatology review, 1(2), 33 Padmanabhan Sandosh (2014), Handbook of Pharmacogenomics and Stratified Medicine, Elsevier, London Poordad Fred, Jean–Pierre Bronowicki, Stuart C Gordon cộng (2012), "Factors that predict response of patients with hepatitis C virus infection to boceprevir", Gastroenterology, 143(3), 608-618 Prokunina-Olsson Ludmila, Brian Muchmore, Wei Tang cộng (2013), "A variant upstream of IFNL3 (IL28B) creating a new interferon gene IFNL4 is associated with impaired clearance of hepatitis C virus", Nature genetics, 45(2), 164-171 79 80 81 82 83 84 85 86 87 88 89 Prokunina-Olsson Ludmila, Brian Muchmore, Wei Tang cộng (2013), "A variant upstream of IFNL3 (IL28B) creating a new interferon gene IFNL4 is associated with impaired clearance of hepatitis C virus", Nature genetics, 45(2), 164-171 Rafique Ghazala, Allah Bukhsh, Asif Gul cộng (2017), "Hematologic adverse effects and efficacy monitoring in chronic Hepatitis C patients treated with interferon and ribavirin combination therapy", Pakistan journal of pharmaceutical sciences, 30(1) Regierer Babette, Valeria Zazzu, Ralf Sudbrak cộng (2013), "Future of medicine: models in predictive diagnostics and personalized medicine", Molecular Diagnostics, Springer, tr 15-33 Riva E, C Scagnolari, O Turriziani cộng (2014), "Hepatitis C virus and interferon type III (interferon-λ3/interleukin-28B and interferon-λ4): genetic basis of susceptibility to infection and response to antiviral treatment", Clinical Microbiology Infection, 20(12), 1237-1245 Rosen Hugo R (2011), "Chronic hepatitis C infection", New England Journal of Medicine, 364(25), 2429-2438 Samuel C E (2001), "Antiviral actions of interferons", Clin Microbiol Rev, 14(4), 778-809, table of contents Scherzer Thomas-Matthias, Harald Hofer, Albert Friedrich Staettermayer cộng (2011), "Early virologic response and IL28B polymorphisms in patients with chronic hepatitis C genotype treated with peginterferon alfa2a and ribavirin", Journal of hepatology, 54(5), 866-871 Seto W‐K, OT‐Y Tsang, K Liu cộng (2013), "Role of IL 28B and inosine triphosphatase polymorphisms in the treatment of chronic hepatitis C virus genotype infection", Journal of viral hepatitis, 20(7), 470-477 Shaker Olfat G Nermin AH Sadik (2012), "Polymorphisms in interleukin‐ 10 and interleukin‐28 B genes in E gyptian patients with chronic hepatitis C virus genotype and their effect on the response to pegylated interferon/ribavirin‐therapy", Journal of gastroenterology hepatology, 27(12), 1842-1849 Sheppard Paul, Wayne Kindsvogel, Wenfeng Xu cộng (2003), "IL28, IL-29 and their class II cytokine receptor IL-28R", Nature immunology, 4(1), 63-68 Shimoyama Yu, Akito Nozaki, Manabu Morimoto cộng (2013), "Effects of IL‐28B gene polymorphism on response to peginterferon plus ribavirin combination therapy for genotype chronic hepatitis C", Hepatology Research, 43(9), 919-924 90 Silver R T., J J Kiladjian H C Hasselbalch (2013), "Interferon and the treatment of polycythemia vera, essential thrombocythemia and myelofibrosis", Expert Rev Hematol, 6(1), 49-58 91 Silver R T., K Vandris J J Goldman (2011), "Recombinant interferonalpha may retard progression of early primary myelofibrosis: a preliminary report", Blood, 117(24), 6669-72 92 Sonneveld Milan J, Vincent W–S Wong, Andrea M Woltman cộng (2012), "Polymorphisms near IL28B and serologic response to peginterferon in HBeAg-positive patients with chronic hepatitis B", Gastroenterology, 142(3), 513-520 93 Spear Brian B, Margo Heath-Chiozzi Jeffrey Huff (2001), "Clinical application of pharmacogenetics", Trends in molecular medicine, 7(5), 201204 94 Stenkvist J, A Sönnerborg O Weiland (2013), "HCV RNA decline in chronic HCV genotype and during standard of care treatment according to IL 28B polymorphism", ournal of viral hepatitis, 20(3), 193-199 95 Susser Simone, Eva Herrmann, Christian Lange cộng (2014), "Predictive value of interferon-lambda gene polymorphisms for treatment response in chronic hepatitis C", PloS one, 9(11) 96 Tanaka Yasuhito, Nao Nishida, Masaya Sugiyama cộng (2009), "Genome-wide association of IL28B with response to pegylated interferon-α and ribavirin therapy for chronic hepatitis C", Nature genetics, 41(10), 1105 97 Tsubota Akihito, Noritomo Shimada, Masanori Atsukawa cộng (2014), "Impact of IL28B polymorphisms on 24‐week telaprevir‐based combination therapy for A sian chronic hepatitis C patients with hepatitis C virus genotype 1b", Journal of gastroenterology hepatology, 29(1), 144-150 98 Thompson A Han S, Shiffman M, Rossaro L, Ghalib R, Beavers K, et al (2013), "GS-5885 + GS-9451 + Peginterferon and ribavrin (pr) for six or 12 weeks achieves a high SVR12 In treatment naïve genotype IL28B CC PATIENTS", 8th annual meeting of the European association for the study of the liver, abstract 64 99 Vadwai Viral Bibhu Ranjan Das (2014), "IL28B Genotyping: A Step towards HCV-Personalized Therapy" 100 van der Meer Adriaan J, Bart J Veldt, Jordan J Feld cộng (2012), "Association between sustained virological response and all-cause mortality among patients with chronic hepatitis C and advanced hepatic fibrosis", Jama, 308(24), 2584-2593 101 van Zonneveld Monika, HJ Flink, E Verhey cộng (2005), "The safety of pegylated interferon alpha‐2b in the treatment of chronic hepatitis B: 102 103 104 105 106 107 108 109 110 111 112 113 predictive factors for dose reduction and treatment discontinuation", Alimentary pharmacology therapeutics, 21(9), 1163-1171 Vasanthakumar Aparna, Justin W Davis, Manal Abunimeh cộng (2018), "Reduced ITPase activity and favorable IL28B genetic variant protect against ribavirin-induced anemia in interferon-free regimens", PloS one, 13(5) Vesell Elliot S (1989), "Pharmacogenetic perspectives gained from twin and family studies", Pharmacology therapeutics, 41(3), 535-552 Vesell ES VESELL ES (1972), "Genetic and environmental factors affecting drug response in man" Vincent Soriano Massimo Puoti, Mark Sulkowski, Antonietta Cargnel, Yves Benhamou, Marion Peters, Stefan Mauss, Norbert Bräu, Angelos Hatzakis, Stanislas Pol, Juergen Rockstroh (2007), "Care of Patients Coinfected With HIV and Hepatitis C Virus: 2007 Updated Recommendations From the HCVHIV International Panel", Aids, 21(9), 1073-1089 Wang Huaiyuan, Haijun Hu Kangjian Zhang (2017), "Overview of interferon: characteristics, signaling and anti-cancer effect", Arch Biotechnol Biomed, 1, 1-16 Wheelock E Frederick (1965), "Interferon-like virus-inhibitor induced in human leukocytes by phytohemagglutinin", Science, 149(3681), 310-311 Yano Yoshihiko, Yasushi Seo, Hiroki Hayashi cộng (2017), "Factors associated with the decrease in hepatitis B surface antigen titers following interferon therapy in patients with chronic hepatitis B: Is interferon and adefovir combination therapy effective?", Biomedical reports, 7(3), 257262 Yu Ming‐Lung, Chung‐Feng Huang, Jee‐Fu Huang cộng (2011), "Role of interleukin‐28B polymorphisms in the treatment of hepatitis C virus genotype infection in Asian patients", Hepatology, 53(1), 7-13 Zeuzem S, S Arora, B Bacon cộng (2011), "Pegylated interferonlambda (PegIFN-λ) shows superior viral response with improved safety and tolerability versus pegIFN-α-2a in HCV patients (G1/2/3/4): EMERGE phase IIb through week 12", Hepatology, 54(Suppl 1), S538 Zeuzem Stefan, Ira M Jacobson, Tolga Baykal cộng (2014), "Retreatment of HCV with ABT-450/r–ombitasvir and dasabuvir with ribavirin", New England Journal of Medicine, 370(17), 1604-1614 Zeuzem Stefan, Vincent Soriano, Tarik Asselah cộng (2013), "Faldaprevir and Deleobuvir for HCV Genotype Infection", The New England Journal of Medicine 369(7), 630-639 Zhao Zhongyi, Zhen Qin, Linlin Zhou cộng (2019), "The impact of IFNL3 genotype on interferon treatment outcome in patients chronically 114 115 116 117 infected with hepatitis B virus: A meta-analysis", Microbial pathogenesis, 134, 103598 Zheng Hao, Man Li, Bing Chi cộng (2015), "IL28B rs12980275 variant as a predictor of sustained virologic response to pegylated-interferon and ribavirin in chronic hepatitis C patients: a systematic review and metaanalysis", Clinics research in hepatology gastroenterology, 39(5), 576-583 (PharmGKB) The Pharmacogenomics Knowledgebase Drug Label Annotations, PharmGKB, truy cập ngày 10/4/2020, trang web https://www.pharmgkb.org/gene/PA134952671/labelAnnotation Explore this variant (2020), truy cập ngày 20/4/2020, trang web https://asia.ensembl.org/index.html Variant table Ensembl, Ensembl, truy cập ngày 20/4/2020, trang web https://asia.ensembl.org/Homo_sapiens/Gene/Variation_Gene/Table?db=cor e;g=ENSG00000197110;r=19:39243553-39245129 Phụ lục Điều trị viêm gan C mạn tính phác đồ chứa boceprevir/telaprevir dựa kiểu gen IL28B ... cứu ảnh hưởng đa hình gen IL28B (mã hóa IFN-λ ) tới đáp ứng thuốc chưa nhiều Từ lý trên, thực đề tài ? ?Tổng quan đa hình gen IL28B ảnh hưởng đa hình gen tới đáp ứng thuốc? ?? với nội dung chính: Tổng. .. tài liệu, giáo trình,… gen, đa hình gen IL28B, ảnh hưởng đa hình IL28B tới đáp ứng thuốc - Các guideline hướng dẫn thuốc có ảnh hưởng IL28B ảnh hưởng đa hình gen tới đáp ứng lâm sàng - Các báo,... tỷ lệ kiểu gen IL28B 15 2.3 Các đa hình quan trọng IL28B 16 2.4 Các cách xác định kiểu gen IL28B 17 CHƯƠNG TỔNG QUAN VỀ ẢNH HƯỞNG CỦA ĐA HÌNH GEN IL28B TỚI ĐÁP ỨNG THUỐC