Tài liệu Protein_ Giải mã protein pdf

Protein_ Gi i mãả protein I. Protein: - Là thành ph n c u trúc b t bu c c a tầ ấ ắ ộ ủ ế bào, đ c c u t o t các nguyên t :ượ ấ ạ ừ ố C,H,O,N,P, S … - Là đ i phân t c u t o theo nguyên t cạ ử ấ ạ ắ đa phân g m nhi u đ n phân là các Acidồ ề ơ amin. Có 20 lo i acid amin khác nhau.ạ T 20 lo i này có th c u t o nên vô sừ ạ ể ấ ạ ố các protein khác nhau v thành ph n, sề ầ ố l ng, và trình t các acid amin, đ mượ ự ả b o tính đa d ng và đ c thù c a t ngả ạ ặ ủ ừ lo i protein.ạ - C u t o m i đ n phân g m có3 thànhấ ạ ỗ ơ ồ ph n chính: Nhóm COOH, nhóm NH2 vàầ g c R liên k t v i cacbon trung tâm (ố ế ớ Cả COOH và NH2 , c 1ngt H đ u lk v iả ử ề ớ C - C này g i là C alphaọ ). S khác nhauự v thành ph n c u trúc c a nhóm R chiaề ầ ấ ủ 20 lo i aicd amin làm 4 nhóm: Acid,ạ Bazo, Phân c c, Không phân c c.ự ự C u trúc 4 b c c a phân t Protein:ấ ậ ủ ử B c 1:ậ Các đ n phân acid amin c aơ ủ protein liên k t v i nhau b ng liên k tế ớ ằ ế peptit lo i m t n c, t o thành chu iạ ộ ướ ạ ỗ polipeptit m ch th ng.ạ ẳ B c 2:ậ C u trúc b c 2 là c u trúc vòngấ ậ ấ xo n lò xo đ u đ n ho c g p n p beta,ắ ề ặ ặ ấ ế các n p g p và vòng xo n đ c c đ nhế ấ ắ ượ ố ị b i các liên k t hidro gi a các acid aminở ế ữ g n nhau.ầ B c 3:ậ Chu i xo n cu n x p t o thànhỗ ắ ộ ế ạ c u trúc đ c thù trong không gian 3ấ ặ chi u, t o nên tính đ c tr ng cho t ngề ạ ặ ư ừ lo i protein b ng các liên k t đisunfua,ạ ằ ế liên k t ion, vander_van… tăng tính b nế ề v ng c a phân t proteinữ ủ ử B c 4:ậ 2 hay nhi u chu i cu n x p b cề ỗ ộ ế ậ 3 liên k t v i nhau t o thành ph n phânế ớ ạ ầ t protein hoàn ch nh, có c u hình khôngử ỉ ấ gian đ c tr ng cho t ng lo i protein,ặ ư ừ ạ giúp nó th c hi n đ c ch c năng hoànự ệ ượ ứ ch nh.ỉ II. Vai trò c a ARN trong d ch mã:ủ ị Các lo i ARN tham gia vào quá trìnhạ d ch mã đó là: mARN, rARN, và tARN.ị - mARN: là b n phiên mã t mã g c c aả ừ ố ủ gen ch a đ ng thông tin gi i mã trình t ,ứ ự ả ự s l ng, thành ph n c a các acid aminố ượ ầ ủ trong phân t protein.ử - tARN: là ARN v n chuy n có 2 đ u, 1ậ ể ầ đ u mang b 3 đ i mã và đ u còn l iầ ộ ố ầ ạ mang các acid amin t ng ng làm ch cươ ứ ứ năng v n chuy n các acid amin đ nậ ể ế mARN đ t ng h p protein.ể ổ ợ - rARN: tham gia vào thành ph n c aầ ủ Riboxom, n i t ng h p nên chu iơ ổ ợ ỗ polipeptit. III. D ch mã:ị D ch mã hay còn g i là gi i mã đ cị ọ ả ượ th c hi n ngoài t bào ch t, giúp tự ệ ở ế ấ ế bào t ng h p nên các lo i protein khácổ ợ ạ nhau tham gia vào ch c năng và c u trúcứ ấ t bào.ế Lí thuy t c b n c n n m:ế ơ ả ầ ắ G m 2 giai đo n:ồ ạ Giai đo n 1:ạ T ng h p ARN đ chuy nổ ợ ể ể thông tin di truy n t gen sang s n ph mề ừ ả ẩ prôtêin (xem ph n t ng h p ARN)ầ ổ ợ Giai đo n 2:ạ T ng h p prôtêin t bàoổ ợ ở ế ch t g m 4 b c c b n: (M t s sáchấ ồ ướ ơ ả ộ ố chia là 2 giai đo n: kh i đ u, kéo dài vàạ ở ầ k t thúc)ế + B c 1:ướ Ho t hoá axit amin. Các axitạ amin t do có trong bào ch t đ c ho tự ấ ượ ạ hoá nh g n v i h p ch t giàu năngờ ắ ớ ợ ấ l ng ađenôzintriphôtphat (ATP) d iượ ướ tác d ng c a m t s lo i enzim. Sau đó,ụ ủ ộ ố ạ nh m t lo i enzim đ c hi u khác, axitờ ộ ạ ặ ệ amin đã đ c ho t hoá l i liên k t v iượ ạ ạ ế ớ tARN t ng ng đ t o nên ph c h pươ ứ ể ạ ứ ợ axit amin – tARN (aa – tARN). + B c 2:ướ M đ u chu i pôlipeptit cóở ầ ỗ s tham gia c a ribôxôm , b ba m đ uự ủ ộ ở ầ AUG(GUG sinh v t nhân s ), tARNở ậ ơ axit amin m đ u ti n vào ribôxôm đ iở ầ ế ố mã c a nó kh p v i mã m đ u trênủ ớ ớ ở ầ mARN theo NTBS. K t thúc giai đo nế ạ m đ uở ầ + B c 3:ướ Kéo dài chu i pôlipeptit,ỗ tARN v n chuy n axit amin th nh tậ ể ứ ấ ti n vào ribôxôm đ i mã c a nó kh pế ố ủ ớ v i mã m đ u c a mARN theo nguyênớ ở ầ ủ t c b sung. aa1 – tARN t i v trí bênắ ổ ớ ị c nh, đ i mã c a nó kh p v i mã c aạ ố ủ ớ ớ ủ axit amin th nh t trên mARN theoứ ấ nguyên t c b sung. Enzim xúc tác t oắ ổ ạ thành liên k t peptit gi a axit amin mế ữ ở đ u và axit amin th nh t. Ribôxôm d chầ ứ ấ ị chuy n đi m t b ba trên mARN (sể ộ ộ ự chuy n v ) làm cho tARN m đ u r iể ị ở ầ ờ kh i ribôxôm. Ti p đó, aa2 – tARN ti nỏ ế ế vào ribôxôm, đ i mã c a nó kh p v i mãố ủ ớ ớ c a axit amin th hai trên mARN theoủ ứ nguyên t c b sung.ắ ổ Liên k t peptit gi a aa1 và aa2 đ c t oế ữ ượ ạ thành. S chuy n v l i x y ra, và cự ể ị ạ ả ứ ti p t c nh v y cho đ n khi ribôxômế ụ ư ậ ế ti p xúc v i b ba ti p giáp v i b baế ớ ộ ế ớ ộ k t thúc phân t chu i polipeptit lúc nàyế ử ỗ có c u trúcấ aaMĐ – aa1 – aa2 aan v n còn g n v iẫ ắ ớ tARN axit amin th n.ứ + B c 4:ướ K t thúc chu i pôlipeptit,ế ỗ Ribôxôm chuy n d ch sang b ba k tể ị ộ ế thúc lúc này ng ng quá trình d ch mã 2ừ ị ti u ph n c a ribôxôm tách nhau raể ầ ủ tARN, axit amin cu i cùng đ c táchố ượ kh i chu i polipeptit. M t enzim khácỏ ỗ ộ lo i b axit amin m đ u gi i phóngạ ỏ ở ầ ả chu i pôlipeptit.ỗ C n l u ý trên m i mARN cùng lúc cóầ ư ỗ th có nhi u ribôxôm tr t qua v iể ề ượ ớ kho ng cách là 51Åả ® 102Å. Nghĩa là trên m i mARN có th t ng h p nhi uỗ ể ổ ợ ề prôtêin cùng lo i.ạ S t ng h p prôtêin góp ph n đ m b oự ổ ợ ầ ả ả cho prôtêin th c hi n ch c năng bi uự ệ ứ ể hi n tính tr ng và cung c p nguyên li uệ ạ ấ ệ c u t o nên các bào quan va` đ m nh nấ ạ ả ậ nhi u ch c năng khác nhau.ề ứ Nh ng đi m c n l u ý:ữ ể ầ ư - D ch mã b t đ u khi ị ắ ầ tARN đ c bi tặ ệ cho kh i sở ự g n v i đ n v nh c aắ ớ ơ ị ỏ ủ roboxom, ph c h p s bám vào các trìnhứ ợ ẽ t nh n bi t đ c bi t c a roboxom ự ậ ế ặ ệ ủ ở đ u 5’ c a mARN phía tr c đo n mãầ ủ ướ ạ hoá cho protein. Nh đó anticodon (b 3ờ ộ đ i mã) c a tARN-methionine kh số ủ ở ự b t c p v i codon(b 3 mã hoá) xu tắ ặ ớ ộ ấ phát AUG trên mARN, đi m P (P-site).ở ể Sau đó các đ n v l n và nh g n vàoơ ị ớ ỏ ắ nhau t o thành roboxom nguyên v n.ạ ẹ - b c k t thúc, mã k t thúc không cóỞ ướ ế ế anticodon. Thay vào đó các nhân tố phóng thích RF làm k t thúc quá trình.ế M ch polipeptit có NH2- và –COOHạ hoàn ch nh s thoát ra ngoài nh nhân tỉ ẽ ờ ố phóng thích đó. Hình nh quá trình d ch mã:ả ị [...]... định, được gọi là mã di truyền Bằng lý thuyết và thực nghiệm, người ta đã chứng minh được rằng cứ 3 Nucleotit trên gen, tương ứng là 3 riboNucleotit trên mARN quy định 1 a.a; ta gọi mã di truyền là mã bộ ba 2.Đặc điểm của mã di truyền: Mã di truyền là mã bộ ba, nghĩa là cứ 3 Nu kế tiếp mã hoá cho 1 a.a Mã di truyền được đọc từ 1 điểm xác định và liên tục (không chồng gối lên nhau) Mã di truyền có tính...Quá trình dịch mã Ở sinh vật nhân thực, sau khi mARN được tổng hợp, hoàn thiện, nó sẽ rời khỏi nhân, ra ngoài tế bào chất, làm khuôn mẫu cho quá trình dịch mã Ở sinh vật nhân sơ, vì không có màng nhân, nên quá trình phiên mã và dịch mã xảy ra gần như đồng thời Trong quá trình dịch mã, mARN liên kết với riboxom Quá trình dịch mã được thực hiện theo 3 bước: Hoạt hoá a.a... (không chồng gối lên nhau) Mã di truyền có tính đặc hiệu, tức là 1 bộ ba chỉ mã hoá cho 1 a.a Mã di truyền có tính thoái hoá (dư thửa) nghĩa là có nhiều bộ ba khác nhau có thể cùng mã hoá cho 1 a.a Mã di truyền có tính phổ biến, trừ 1 vài ngoại lệ, hầu hết các loài đều dùng chung 1 bộ mã di truyền Trong 64 bộ ba, có 3 bộ ba không mã hoá a.a: UAA, UAG, UGA - bộ ba kết thúc Bộ ba mở đầu là AUG, quy định... chất tương tự với mã bộ ba) Dịch mã và hình thành chuỗi polipeptit Tiểu phần bé của riboxom liên kết với mARN, sau đó phân tử tARN mang a.a mở đầu (Met ở nhân thực, f-Met ở nhân sơ) đến Bộ ba đối mã trên phân tử tARN sẽ liên kết theo nguyên tắc bổ sung với bộ ba mã hoá trên phân tử mARN Sau đó, tiểu phần lớn của riboxom sẽ liên kết, tạo thành phức hệ mARN-riboxom, bắt đầu quá trình dịch mã Quá trình này... vào liên kết với bộ ba mã hoá kế tiếp trên mARN Cứ như thế, liên kết peptit được hình thành giữa các a.a theo thứ tự nhất định Quá trình tiếp tục cho tới khi gặp bộ ba kết thúc thì dừng lại Các tiểu phần riboxom tách nhau và rời khỏi mARN, giải phóng chuỗi polipeptit mới được tổng hợp Axit amin mở đầu rời khỏi chuỗi Chuỗi polipeptit tiếp tục được hoàn thiện và tạo thành phân tử protein hoàn chỉnh Poliriboxom:... polipeptit giống nhau Nhờ đó, trong 1 khoảng thời gian ngắn, 1 lượng lớn protein có thể được hình thành, đáp ứng nhu cầu của tế bào Các riboxom, tARN được tái sử dụng nhiều lần, dùng để tổng hợp nên mọi loại protein trong cơ thể Còn các mARN sau khi sử dụng thường sẽ bị phân huỷ Đời sống của 1 mARN cũng là 1 cơ chế điều hoà hoạt động gen IV Mã di truyền 1 Giới thiệu Trình tự các Nu trên gen, tương ứng với... bắt đầu quá trình dịch mã Quá trình này còn có sự tham gia của các yếu tố khác (If-I, If-II…) tARN mang a.a thứ nhất tới vị trí A (tARN mang Met ở vị trí P có sẵn), trong đó bộ ba đối mã của nó liên kết bổ sung với bộ ba mã hoá tiếp theo (sau vị trí mở đầu) trên mARN Enzim xúc tác hình thành liên kết peptit giữa a.a mở đầu và a.a thứ nhất Tiếp đó, riboxom dịch chuyển 1 nấc trên mARN, khiến các tARN dịch . ta g i mã di truy n là mã b ba.ọ ề ộ 2.Đ c đi m c a mã di truy n:ặ ể ủ ề Mã di truy n là mã b ba, nghĩa là c 3ề ộ ứ Nu k ti p mã hoá cho 1 a.a. Mã diế. trò c a ARN trong d ch mã: ủ ị Các lo i ARN tham gia vào quá trìnhạ d ch mã đó là: mARN, rARN, và tARN.ị - mARN: là b n phiên mã t mã g c c aả ừ ố ủ gen