BÀI GIẢNG - KIẾN THỨC TỔNG QUÁT TIN SINH HOC

TRƯỜNG ĐH CÔNG NGHIỆP THỰC PHẨM TPHCM KHOA CNSH & KTMT HỆ ĐẠI HỌC Giới thiệu chung Tin sinh học TIN SINH HỌC • Mã học phần • Sớ tín : : 08200018 • Trình đợ: Cho sinh viên năm thứ đại học • Phân bớ thời gian: 30 tiết ─ Lý thuyết: 12 tiết ─ Tiểu luận, kiểm tra lớp: tiết ─ Thực hành, thí nghiệm: 14 tiết ─ Tự học : 60 tiết Nội dung học phần Chương Tên chương - Giới thiệu chung Tin sinh học ứng dụng - Cơ sở liệu tin sinh học (Bioinformatic Databases) - Sắp xếp thẳng hàng trình tự (Sequence Alignment) - Phép phân tích hệ thống phát sinh lồi (Phylogeny) - Giải mã trình tự tồn bộ gen - Phân tích cắt với restriction enzyme online - Thiết kế primer cho phản ứng PCR - Ứng dụng tiện ích tin sinh học nghiên cứu khoa học - Báo cáo tiểu luận Mục tiêu mơn học tin sinh học • Mục tiêu chính:  Khám phá lĩnh vực sinh học  Mở triển vọng có tính chất tồn cầu NC  Thớng hóa ngun tắc, thành tựu khoa học sinh học  Số hóa sở liệu (database) xây dựng cách quản lý CNSH tin học  Xây dựng phát triển chương trình ứng dụng CNSH nhằm giải vấn đề nghiên cứu VD: phát sinh lồi, đợt biến gen… Mục tiêu môn học Sau học xong học phần này, sinh viên có khả năng: ─ Trình bày nguyên tắc phân tích DNA, phân tích Protein, thiết kế mồi oligonucleotide,… ─ Tìm kiếm báo, công trình nghiên cứu & tìm kiếm trình tự DNA, Protein ─ Xử lý Phân tích DNA, Protein & thiết kế oligomer lai phân tử, primer để khuyếch đại DNA ─ Tìm kiếm đồ RE DNA & đăng ký trình tự gene vào ngân hàng gene giới Tiêu chí đánh giá mơn học • Bài tập lớn (Tiểu luận): 30% -Nhóm theo chủ đề lớn GV giao: báo cáo Seminar nhóm + báo cáo chủ đề dạng Report MS Word -Khác: chuyên cần, tập cá nhân… • Thi kết thúc học phần: 70% -Hình thức thi: máy Tài liệu tham khảo • Tiếng Việt -Nguyễn Thị Lang, Bùi Chí Bửu (2008) ‘Giáo trình Tin sinh học–Bioinformatics’, Nhà xuất nơng nghiệp, TP Hồ Chí Minh -Trần Linh Thước cộng (2008) ‘Thực tập Bioinformatics –Lưu hành nội bộ’, Đại học Khoa học Tự nhiên TP.HCM • Tiếng Anh -Baxevanis, A.D and Ouellette, B.F.F (2005) Bioinformatics: A Practical Guide to the Analysis of Genes and Proteins, 3rd edition Wiley New York -Waterman, M.S (1995) Introduction to Computational Biology: Sequences, Maps and Genomes CRC Press -Mount, D.W (2002) Bioinformatics: Sequence and Genome, Cold Spring Harbour Press, New York u cầu chung cho mơn học -Tự chia nhóm nợp cho lớp trưởng tổng hợp (