Cấu trúc của Genome - Genome của sinh vật tiền nhân thường nhỏ, chủ yếu là mạch vòng, thường tồn tại ở 1 hoặc 1 vài NST vòng có thêm DNA vòng nhỏ plasmid - Genome nằm trong tế bào chất -[r]
(1)GENOME CỦA SINH VẬT TIỀN NHÂN GV hướng dẫn: Đồng Huy Giới (2) Nhóm thực hiện: 10 11 12 Nguyễn Thị Thu Nguyễn Thị Như Quỳnh Hoàng Văn Đạt Kim Văn Cần Dương Thị Thanh Huyền Phạm Anh Vân Đặng Phú Hoàng Nguyễn Minh Trang Nguyễn Thị Duyên Ngô Thị Mến Nguyễn Thị Thùy Lê Thị Hồng Thủy (3) Nội dung Khái niệm Cấu trúc genome 2.1 Genome vi khuẩn 2.2 Genome virus và plasmid 2.2.1 Virus 2.2.2 Plasmid 2.2.3 Các dạng plasmid vi khuẩn (4) Khái niệm - Genome là khái niệm dùng để toàn các gen có giao tử đơn bội, có nghĩa là giao tử loài, NST tương đồng có mặt Lượng DNA có tế bào sinh vật bao gồm tất các gen và các đoạn DNA các gen (5) Cấu trúc Genome - Genome sinh vật tiền nhân thường nhỏ, chủ yếu là mạch vòng, thường tồn vài NST vòng có thêm DNA vòng nhỏ (plasmid) - Genome nằm tế bào chất - Số lượng gen ít - Trình tự mã hóa lớn ( >95%) - Các nhóm gen có thể nhóm lại gần mà không có vùng đệm cụm gen gọi là operon, operon điều hòa vùng DNA (6) Cấu trúc Genome - Hầu hết các DNA có trình tự - Nhiều gen chung promotor - Trong gen không có có ít intron, không có tín hiệu poly A và mRNA không có đầu 5’ mang mũ methyl Gppp - Chúng thường phải sống kí sinh vào kí chủ, phụ thuộc vào kí chủ và có khả tự tái độc lập với tế bào kí chủ (7) Cấu trúc kiểu bông hoa này gọi là nucleoid (hình 1.6) Cấu trúc nucleoid giúp genome chiếm thể tích nhỏ tế bào Ngoài ra, cấu trúc không gian này NST trì nhờ các phân tử ARN kích thước nhỏ tương tác với protein Do đó, bị đứt gãy cấu trúc siêu xoắn NST mở cách cục cánh bị tổn thương không xảy trên toàn genome (8) 2.1 Genome vi khuẩn - DNA vi khuẩn nằm NST khai Phần lớn các vi khuẩn có 1NST/1 tế bào - DNA vi khuẩn dạng vòng, chuỗi kép - Trên DNA có chứa các gen mã hóa cho protein đặc thù - Ngoài NST chính, vi khuẩn còn chứa dạng DNA khác gọi là plasmit, có kích thước bé hơn, có khả tự nhân Các plasmit thường chứa số gen có tính đặc thù cao (9) Sơ đồ genome Ecoli : (10) 2.2 Genome virut và plasmit 2.2.1 Virut thường có lượng thông tin di truyền ít nhiều so với sinh vật Eukanfote - Genome vurut có thể là DNA RNA - DNA virut có thể là chuỗi đơn ( thực khuẩn thể) hay chuỗi kép - AND virut có cấu trúc đặc biệt dạng vòng: chuỗi DNA nối cộng hóa trị với tạo thành vòng khép kín liên tục, không có đầu 3’, 5’ - AND virut gồm hàng nghìn đến hàng chục nghìn Nucleotit (11) Bảng: Kích cỡ DNA và thể virus ( viral particle) số thực khuẩn thể Virus Độ lớn DNA virus Chiều dài DNA virus ( nm ) Đường kính chiều dài thể virus ( nm) Φ X174 5.386 1.939 25 T7 39.936 14,377 78 λ 48.502 17.460 (12) 2.2 Genome virut và plasmit 2.2.2 Plasmid - Kích thước Plasmid có thể từ 1-200 kb - Mỗi plasmid có chứa trình tự gốc tái AND ( ORI ) Không có vùng này thì chúng không thể tự nhân lên tế bào kí chủ - Một số plasmid có từ 10-100 fb kí chủ, đây là plasmid có số lượng lớn - Một số plasmid khác chứa từ 1-4 tb và gọi là plasmid có số lượng thấp - Lượng AND plasmid tế bào vi khuẩn ít vượt quá 0,1- % DNA tổng số vi khuẩn (13) 2.2 Genome virut và plasmit 2.2.3 Các dạng plasmid vi khuẩn - F-plasmid or F factor : mang thông tin di truyền giới tính vi khuẩn và có thể chuyển từ tế bào vi khuẩn này sang tế bào vi khuẩn khác thông qua quá trình tiếp hợp - R- plasmid: là plasmid mang đặc tính chống chịu với hay nhiều kháng sinh Chúng gồm thành phần: + Yếu tố truyền tính kháng ( resistant transfer factor, RTF) cần thiết để chuyền plasmid các vi khuẩn + Yếu tố xác định r ( r- determinant): là gen quy định tính kháng kháng sinh, chúng là thành phần yếu tố di động (14) 2.2 Genome virut và plasmit 2.2.3 Các dạng plasmid vi khuẩn - Degradative plasmid: là plasmid phân rã mang các gen đặc hiệu có khả sử dụng các chất trao đổi bất thường - Cryp plasmid: là plasmid tinh thể không mang gen mã hóa bất kì chức nào (15) Thanks for your listening!!! (16)