Ngoài ra, Trịnh Tùng sai Trịnh Văn Hải, Nguyễn Thất Lý đem quân thuỷ, bộ đi trấn giữ những nơi hiểm yếu ở các cửa biển, Lê Hoà kiêm coi võ sĩ trong ngoài bốn vệ bảo vệ vua Lê Thế Tông. Quân Nam triều từ Tây Đô đi ra theo đường tây bắc của huyện Thạch Thành[14], qua phủ Thiên quan, đi gấp hơn 10 ngày, đến núi Mã Yên thuộc huyện Quốc Oai thì đóng quân lại.
Chiến tranh Lê-Mạc Chiến 1592-1593 Chiến trận giáp Tết Tháng chạp năm Tân Mão (đầu năm dương lịch 1592), Trịnh Tùng khởi đại quân bắc Quân chia làm đạo: Nguyễn Hữu Liêu Trịnh Ninh đem vạn quân tinh nhuệ làm tiên phong Hoàng Đình Ái, Trịnh Đồng voi ngựa vạn quân Trịnh Đỗ vạn giáp binh, voi, ngựa Trịnh Tùng đích thân đốc suất vạn quân Hà Thọ Lộc Ngô Cảnh Hựu đốc suất quân chở lương làm hậu quân Ngoài ra, Trịnh Tùng sai Trịnh Văn Hải, Nguyễn Thất Lý đem quân thuỷ, trấn giữ nơi hiểm yếu cửa biển, Lê Hoà kiêm coi võ sĩ ngồi bốn vệ bảo vệ vua Lê Thế Tơng Quân Nam triều từ Tây Đô theo đường tây bắc huyện Thạch Thành[14], qua phủ Thiên quan, gấp 10 ngày, đến núi Mã Yên thuộc huyện Quốc Oai đóng qn lại Qn Nam triều khí mạnh mẽ, 10 ngày tiến thẳng đến huyện Yên Sơn, Thạch Thất, Phúc Lộc[15], Tân Phong[16] Ngày 21 tháng chạp, Mạc Mậu Hợp cử hết đại binh, tất 10 vạn người, chia đạo: Mạc Ngọc Liễn đốc suất tướng sĩ binh mã Tây đạo bên phải Nguyễn Quyện đốc suất tướng sĩ binh mã Nam đạo bên trái Ngạn quận công, Thuỷ quận công huy binh mã Đông đạo Đương quận công, Xuyên quận công huy binh mã Bắc đạo Khuông quận công, Tân quận công huy binh mã vệ tiên phong[17] Mạc Mậu Hợp đích thân đốc suất binh mã dinh Ngày 27 tháng chạp, quân Mạc chia đường tiến Đến địa phận xã Phấn Thượng[18], hai bên đối trận với nhau, dàn bày binh mã Mạc Mậu Hợp đích thân đốc chiến Quân hai bên đón đánh giáp cà suốt từ sáng sớm Mão đến Tỵ gần trưa, quân Nam triều chém Khuông Định công Tân quận công Bắc triều trận Quân Mạc không địch nổi, tan vỡ bỏ chạy Quân Nam triều đuổi đến Giang Cao, chém vạn quân Mạc, cướp nhiều khí giới ngựa Mạc Mậu Hợp xuống thuyền vượt sông bỏ chạy Thăng Long Ngày 30 tết âm lịch, Trịnh Tùng tiến quân đến chợ Hoàng Xá, hạ lệnh cho quân dinh vượt sông Cù[19] phá huỷ hào luỹ quân Mạc, san thành đất Trịnh Tùng sai Nguyễn Hữu Liêu đem 5000 quân tinh nhuệ voi tiến đến đóng cầu Cao góc tây bắc thành Thăng Long, thiêu đốt nhà cửa Mạc Mậu Hợp bỏ kinh thành chạy trốn Chiến trận sau Tết Ngày mồng tết, Trịnh Tùng đốc quân vượt sông, Mạc Mậu Hợp vượt sông Nhị Hà đến bến Bồ Đề, Thổ Khối[20], để lại đại tướng chia giữ cửa thành Ngày mồng tết, Trịnh Tùng đốc quân qua sông Tô Lịch đến cầu Nhân Mục, đóng quân núi Xạ Đôi[21] dàn binh bố trận Mạc Mậu Hợp sai Mạc Ngọc Liễn đem quân đạo cố thủ từ cửa Bảo Khánh phía tây đến phường Nhật Chiêu; Bùi Văn Khuê, Trần Bách Niên đem quân bốn vệ giữ cửa Cầu Dừa, qua cửa Cầu Muống đến thẳng cửa Cầu Dền, ngày đêm đóng cửa cố thủ thành Đại La; Nguyễn Quyện đem quân giữ từ Mạc Xá trở đông, ứng cứu quân đạo Mạc Mậu Hợp tự đốc suất thuỷ quân, dàn 100 thuyền giữ sông Nhị Hà để làm viện Nguyễn Quyện đặt quân phục cửa Cầu Dền để đợi, dàn súng lớn Bách Tử thứ hoả khí để phịng bị Trịnh Tùng lệnh tiến đánh Hai bên giao chiến từ sáng Tỵ đến Mùi (qua trưa) chưa phân thắng bại Sau Văn Khuê, Bách Niên tự liệu sức không chống nổi, quân tự tan vỡ tháo chạy Mạc Ngọc Liễn thấy cánh quân bị thua bỏ chạy theo Quân Nam triều đuổi tràn đến tận sơng, phóng lửa đốt cung điện nhà cửa thành Sau Trịnh Tùng thúc voi ngựa quân lính đánh phá cửa Cầu Dền Quân Mạc tan vỡ, quân mai phục Nguyễn Quyện chưa kịp dậy, bị chết hết cửa Cầu Dền Nguyễn Quyện kế, định chạy trốn, khơng cịn đường nào, ngồi vị vây cửa luỹ lại bị lấp Các Nguyễn Quyện Bảo Trung, Nghĩa Trạch thủ hạ cố sức đánh, bị tử trận Nguyễn Quyện kiệt sức chạy dinh, bị quân Nam triều bắt sống[22] Tổng số quân Mạc bị chết vài ngàn người, tướng Mạc bị chết đến chục viên[23] Mạc Mậu Hợp thu nhặt tàn quân giữ sông Cái để cố thủ Trịnh Tùng đem qn đến bờ sơng, dừng lại đóng doanh trại Nguyễn Quyện bị bắt, trá hàng Trịnh Tùng, xui Tùng điều quân phá luỹ đất mà quân Bắc triều đắp thành Đại La năm trước để làm kế hoãn binh, kéo dài thời gian cho vua Mạc chuẩn bị lực lượng phịng thủ bên sơng[23] Trịnh Tùng làm theo, ngày rằm tháng giêng sai quân Nam triều san luỹ đất, phát hết bụi rậm gai góc, cày lấp hào rãnh Tháng âm lịch năm 1592, Trịnh Tùng tiến quân đến huyện Chương Đức, chia quân đánh huyện Thanh Trì, Thượng Phúc, Phú Xuyên, tự đốc quân đánh dẹp huyện Từ Liêm, Đan Phượng, Phúc Lộc, Tiên Phong, Ma Nghĩa, Yên Sơn, Thạch Thất Sau quân Nam triều rút Thanh Hóa Chiến trận tháng 10 Có sơng Hồng ngăn trở, qn Nam triều chưa qua sông Mạc Mậu Hợp lại khơng lo phịng giữ, sa vào tửu sắc Vợ tướng Bùi Văn Khuê Nguyễn Thị Niên có chị ruột hoàng hậu Mậu Hợp[24], thường vào cung Mậu Hợp thấy Thị Niên đẹp, liền ngầm mưu dụ giết Văn Khuê để cướp lấy vợ Bùi Văn Khuê biết chuyện, tháng 10 năm liền sai Bùi Văn Nguyên chạy đến xin hàng Lê Trịnh Tùng nghe sai Hồng Đình Ái trước cứu Văn Khuê Mạc Mậu Hợp biết Văn Khuê đầu hàng, lại có qn đến cứu, liền lui giữ sơng Thiên Phái[25] Ngày 28 tháng 10, Trịnh Tùng mang quân phủ Trường Yên Mạc Mậu Hợp sai Nghĩa quốc cơng đóng qn sơng Thiên Phái, đắp luỹ đất bờ sông chống cự, thả chông tre hai bên bờ sông Trịnh Tùng sai Bùi Văn Khuê ngầm kéo theo thuyền cửa sông để đánh thượng lưu, sai bắn súng ven sông để đánh hạ lưu; sai voi ngựa, qn lính qua sơng đánh mạnh vào trung lưu để thu lấy thuyền quân Mạc sông Nghĩa quốc công trở tay không kịp, bỏ thuyền chạy trốn, quân lính tan vỡ tháo chạy Quân Nam triều thu 70 thuyền Nghĩa quốc công thu nhặt tàn quân trở Thăng Long Tướng Mạc Trần Bách Niên đem quân tới hàng Lê Đoạn kết Bắc triều Ngày 14 tháng 11, quân Nam triều cửa sông Hát tiến theo hai đường thuỷ, Tướng Mạc Mạc Ngọc Liễn dàn thuyền để chống cự, cắm cọc gỗ cửa sông Hát, đắp luỹ đất bờ sông làm hiểm vững Quân Nam triều tiến đánh phá tan, Ngọc Liễn quân lính bỏ thuyền lên chạy đến chân núi Tam Đảo Quân Nam triều đuổi đến tận cửa Nam thành Thăng Long, đóng quân bến Sa Thảo[26] Đêm 14 tháng 11, Mạc Mậu Hợp tông tộc trốn chạy huyện Kim Thành, trấn Hải Dương Các tướng Mạc nhiều người đến hàng Nam triều Ngày 25 tháng 11, Trịnh Tùng tiến quân đến Hải Dương Mạc Mậu Hợp bỏ thành chạy trốn, cánh quân không tiếp ứng nhau, bỏ hết thuyền bè chạy trốn Mạc Mậu Hợp lập Mạc Toàn làm vua, tự làm tướng đốc quân Tháng chạp năm Nhâm Thìn (đầu năm 1593 dương lịch), Trịnh Tùng chia quân phá tơng thất nhà Mạc Mạc Kính Chỉ xã Tân Mỹ, huyện Thanh Hà (Hải Dương) Các cánh quân Mạc bị thua lớn, tan rã Mạc Mậu Hợp bỏ thuyền bộ, đến chùa huyện Phượng Nhãn ẩn nấp, giả làm sư Được 11 ngày, qn Nam triều truy kích đến nơi, có người thôn dẫn đường đưa vào chùa bắt Mạc Mậu Hợp Mậu Hợp bị đưa dinh quân Trịnh Tùng, hành hình bến Bồ Đề Khơng lâu sau Vũ An Đế Mạc Toàn bị quân Nam triều bắt giết chết Kể từ Bắc triều chấm dứt ... tiên phong[17] Mạc Mậu Hợp đích thân đốc suất binh mã dinh Ngày 27 tháng chạp, quân Mạc chia đường tiến Đến địa phận xã Phấn Thượng[18], hai bên đối trận với nhau, dàn bày binh mã Mạc Mậu Hợp đích... quân Mạc, san thành đất Trịnh Tùng sai Nguyễn Hữu Liêu đem 5000 quân tinh nhuệ voi tiến đến đóng cầu Cao góc tây bắc thành Thăng Long, thiêu đốt nhà cửa Mạc Mậu Hợp bỏ kinh thành chạy trốn Chiến. .. kiệt sức chạy dinh, bị quân Nam triều bắt sống[22] Tổng số quân Mạc bị chết vài ngàn người, tướng Mạc bị chết đến chục viên[23] Mạc Mậu Hợp thu nhặt tàn quân giữ sông Cái để cố thủ Trịnh Tùng