TUYẾN TRÙNG KÝ SINH GÂY HẠI TRÊN CÀ RỐT Ở VIỆT NAM VÀ THỬ NGHIỆM BIỆN PHÁP SINH HỌC TRONG PHÒNG TRỪ CHÚNG LUẬN ÁN TIẾN SỸ

BỘ GIÁO DỤC VÀ ĐÀO TẠO VIỆN HÀN LÂM KHOA HỌC VÀ CÔNG NGHỆ VIỆT NAM HỌC VIỆN KHOA HỌC VÀ CÔNG NGHỆ - NGUYỄN THỊ DUYÊN TUYẾN TRÙNG KÝ SINH GÂY HẠI TRÊN CÀ RỐT Ở VIỆT NAM VÀ THỬ NGHIỆM BIỆN PHÁP SINH HỌC TRONG PHÒNG TRỪ CHÚNG Chuyên ngành: Tuyến trùng học Mã số: Thí điểm LUẬN ÁN TIẾN SỸ SINH HỌC Hà Nội – 2018 BỘ GIÁO DỤC VÀ ĐÀO TẠO VIỆN HÀN LÂM KHOA HỌC VÀ CÔNG NGHỆ VIỆT NAM HỌC VIỆN KHOA HỌC VÀ CÔNG NGHỆ - NGUYỄN THỊ DUYÊN TUYẾN TRÙNG KÝ SINH GÂY HẠI TRÊN CÀ RỐT Ở VIỆT NAM VÀ THỬ NGHIỆM BIỆN PHÁP SINH HỌC TRONG PHÒNG TRỪ CHÚNG Chuyên ngành: Tuyến trùng học Mã số: Thí điểm LUẬN ÁN TIẾN SỸ SINH HỌC NGƯỜI HƯỚNG DẪN KHOA HỌC: PGS TS Nguyễn Ngọc Châu TS Trịnh Quang Pháp Hà Nội – 2018 i LỜI CAM ĐOAN Tôi xin cam đoan luận án “TUYẾN TRÙNG KÝ SINH GÂY HẠI TRÊN CÀ RỐT Ở VIỆT NAM VÀ THỬ NGHIỆM BIỆN PHÁP SINH HỌC TRONG PHỊNG TRỪ CHÚNG” cơng trình nghiên cứu thân tơi thực Các trích dẫn tham khảo Luận án theo nguồn công bố đầy đủ, rõ ràng Số liệu, kết nêu Luận án trung thực chưa công bố công bố báo khoa học mà tác giả tác giả đồng tác giả Tác giả luận án NCS Nguyễn Thị Duyên ii LỜI CẢM ƠN Để hồn thành luận án trước tiên, tơi xin gửi lời cảm ơn đặc biệt tới PGS.TS Nguyễn Ngọc Châu TS Trịnh Quang Pháp tận tình hướng dẫn giúp đỡ suốt thời gian tơi thực hồn thành luận án Tơi xin gửi lời cảm ơn TS Vũ Thị Thanh Tâm, TS Nguyễn Thị Ánh Dương, ThS Lê Thị Mai Linh, ThS Nguyễn Hữu Tiền - Viện Sinh thái Tài nguyên sinh vật, PGS.TS Nguyễn Phương Nhuệ - Viện Công nghệ sinh học TS Phạm Thị Hòa - Chi cục Bảo vệ thực vật tỉnh Lâm Đồng hỗ trợ tơi q trình hồn thiện luận án Tơi xin trân trọng cảm ơn ban lãnh đạo Viện Sinh thái Tài nguyên Sinh vật, phòng Tuyến trùng học, phòng Hệ thống học phân tử Di truyền bảo tồn, Học viện Khoa học Công nghệ đồng nghiệp, thầy cô Viện Sinh thái Tài nguyên Sinh vật tạo điều kiện thuận lợi cho học tập, nghiên cứu hoàn thành luận án Xin tỏ lịng biết ơn sâu sắc đến gia đình, bạn bè động viên giúp đỡ tơi q trình thực luận án Tôi xin trân trọng cảm ơn Viện sinh thái Tài nguyên sinh vật (IEBR) đề tài mã số: IEBR.ĐT/04/16-17 Quỹ Phát triển khoa học công nghệ Quốc gia đề tài mã số: 106.12-2012.84 hỗ trợ kinh phí để tơi thực nội dung nghiên cứu Một lần nữa, xin trân trọng cảm ơn! Hà Nội, Ngày tháng năm 2019 Nghiên cứu sinh Nguyễn Thị Duyên iii MỤC LỤC LỜI CAM ĐOAN i LỜI CẢM ƠN ii DANH MỤC BẢNG vi DANH MỤC HÌNH viii MỞ ĐẦU CHƯƠNG 1:TỔNG QUAN 1.1.Cây cà rốt 1.1.1 Nguồn gốc, phân loại, giá trị đặc điểm sinh trưởng phát triển 1.1.2 Tình hình sản xuất cà rốt giới 1.1.3 Tình hình sản xuất cà rốt Việt Nam 1.2 Tình hình nghiên cứu tuyến trùng ký sinh gây hại cà rốt giới 1.2.1 Các nhóm tuyến trùng ký sinh quan trọng cà rốt 1.2.2 Phân loại hình thái phân tử tuyến trùng thực vật 13 1.2.3 Khả phòng trừ sinh học tuyến trùng thực vật nấm đối kháng 17 1.3 Tình hình nghiên cứu tuyến trùng thực vật Việt Nam 22 CHƯƠNG 2: ĐỐI TƯỢNG, ĐỊA ĐIỂM VÀ PHƯƠNG PHÁP NGHIÊN CỨU 26 2.1 Đối tượng, địa điểm thời gian nghiên cứu 26 2.1.1 Đối tượng nghiên cứu 26 2.1.2 Vật liệu nghiên cứu 26 2.1.3 Địa điểm thời gian nghiên cứu 26 2.2 Phương pháp nghiên cứu 27 2.2.1 Phương pháp điều tra, thu mẫu tuyến trùng 27 2.2.2 Phương pháp tách lọc tuyến trùng từ đất mô thực vật 27 2.2.3 Phương pháp nhân nuôi tuyến trùng Meloidogyne spp Pratylenchus spp 28 2.2.4 Phương pháp xử lý, làm làm tiêu tuyến trùng 29 2.2.5 Phương pháp chuẩn bị mẫu chụp ảnh KHV điện tử quét 30 2.2.6 Các số đo hình thái phân loại tuyến trùng 30 2.2.7 Phương pháp phân tích phân tử tuyến trùng 32 2.2.8 Phương pháp thử nghiệm đánh giá hiệu lực phòng trừ tuyến trùng nấm 33 2.2.9 Phân tích số liệu 34 CHƯƠNG 3: KẾT QUẢ NGHIÊN CỨU VÀ THẢO LUẬN 35 3.1 Thành phần loài tuyến trùng ký sinh cà rốt Việt Nam 35 iv 3.2 Đặc điểm hình thái phân tử loài tuyến trùng ký sinh cà rốt 39 3.2.1 Giống Tylenchorhynchus Cobb, 1913 39 3.2.2 Giống Helicotylenchus Steiner, 1945 47 3.2.3 Giống Hoplolaimus Von Daday, 1905 53 3.2.4 Giống Rotylenchulus Linford & Oliveira, 1940 56 3.2.5 Giống Hemicriconemoides Chitwood & Birchfield, 1957 61 3.2.6 Giống Mesocriconema Andrássy, 1965 66 3.2.7 Giống Hemicaloosia Ray & Das, 1978 70 3.2.8 Giống Xiphinema Cobb, 1913 74 3.2.9 Giống Meloidogyne Goeldi, 1892 76 3.2.10 Giống Pratylenchus Filipjev, 1936 94 3.3 Các nhóm tuyến trùng kí sinh quan trọng cà rốt Việt Nam 131 3.3.1 Phương thức gây hại tuyến trùng ký sinh cà rốt 131 3.3.2 Triệu chứng gây hại 132 3.3.3 Mật độ tần suất xuất giống tuyến trùng kí sinh cà rốt 136 3.4 Ảnh hưởng loài nấm đối kháng đến tuyến trùng M incognita P penetrans 143 3.4.1 Ảnh hưởng dịch bào tử nấm Paecilomyces sp đến tuyến trùng M incognita P penetrans 143 3.4.2 Ảnh hưởng dịch nhân nuôi nấm L squarrosulus đến tuyến trùng M incognita P penetrans 148 CHƯƠNG 4: KẾT LUẬN VÀ KIẾN NGHỊ 154 4.1 Kết luận 154 4.2 Kiến nghị 155 TÀI LIỆU THAM KHẢO 156 PHỤ LỤC 180 PHỤ LỤC I: 180 PHỤ LỤC II 181 PHỤ LỤC III 182 v DANH MỤC TỪ VIẾT TẮT CDA: Phân tích thống kê dựa phân tích khác biệt chuẩn (Canonical Discriminant Analysis) CT: Công thức DNA: Axit đê ôxi ribonucleic ĐC: Đối chứng IEBR: Viện Sinh thái Tài nguyên sinh vật KHV: Kính hiển vi ML: Maximum Likelihood PL: Phụ lục SEM: Hiển vi điện tử quét vi DANH MỤC BẢNG Bảng 3.1 Thành phần loài tuyến trùng ký sinh cà rốt vùng điều tra 35 Bảng 3.2 Số đo loài T annulatus ký sinh cà rốt so với quần thể khác 41 Bảng 3.3 Số đo loài T mashhoodi ký sinh cà rốt so với quần thể khác 44 Bảng 3.4 Số đo loài H dihystera ký sinh cà rốt so với quần thể khác 48 Bảng 3.5 Số đo loài H indicus ký sinh cà rốt so với quần thể khác 51 Bảng 3.6 Số đo loài H chambus ký sinh cà rốt so với quần thể khác 54 Bảng 3.7 Số đo chưa trưởng thành loài R reniformis ký sinh cà rốt so với quần thể khác 57 Bảng 3.8 Số đo đực chưa trưởng thành loài R reniformis ký sinh cà rốt so với quần thể khác 58 Bảng 3.9 Số đo loài H strictathecatus ký sinh cà rốt so với quần thể khác 62 Bảng 3.10 Số đo loài M sphaerocephalum ký sinh cà rốt so với quần thể khác 67 Bảng 3.11: Số đo loài Hemicaloosia sp ký sinh cà rốt 71 Bảng 3.12 Số đo loài X brevicolle ký sinh cà rốt so với quần thể khác 75 Bảng 3.13 Số đo ấu trùng loài M incognita ký sinh cà rốt so với quần thể khác 78 Bảng 3.14 Số đo đực loài M incognita ký sinh cà rốt so với quần thể khác 79 Bảng 3.15 Số đo loài M incognita ký sinh cà rốt so với quần thể khác 81 Bảng 3.16 Số đo loài M arenaria ký sinh cà rốt so với quần thể khác 86 Bảng 3.17 Số đo loài M graminicola ký sinh cà rốt so với quần thể khác 90 Bảng 3.18 Số đo loài P coffeae ký sinh cà rốt so với quần thể khác 96 Bảng 3.19 Số đo loài P penetrans ký sinh cà rốt so với quần thể khác 102 vii Bảng 3.20 Số đo loài P thornei ký sinh cà rốt so với quần thể khác 105 Bảng 3.21 Số đo loài P zeae ký sinh cà rốt so với quần thể khác 108 Bảng 3.22 Số đo loài P haiduongensis ký sinh cà rốt 112 Bảng 3.23 Số đo loài Pratylenchus sp ký sinh cà rốt 116 Bảng 3.24 Số đo đực loài Pratylenchus sp ký sinh cà rốt 111 Bảng 3.25 Số đo loài Pratylenchus sp ký sinh cà rốt 122 Bảng 3.26 Các số hình thái lượng sử dụng phân tích thống kê dựa phân tích khác biệt chuẩn 126 Bảng 3.27 Tỷ lệ cà rốt bị dấu hiệu gây hại tuyến trùng 134 Bảng 3.28 Mật độ tần suất xuất (%) giống tuyến trùng ký sinh cà rốt vùng điều tra 137 Bảng 3.29 Ảnh hưởng nấm Paecilomyces sp.đến tỷ lệ (%) nở trứng tuyến trùng M incognita 144 Bảng 3.30 Tỷ lệ (%) ấu trùng M incognita chết nấm Paecilomyces sp 145 Bảng 3.31 Tỷ lệ (%) tuyến trùng P penetrans chết nấm Paecilomyces sp 146 Bảng 3.32 Ảnh hưởng nấm L squarrosulus đến tỷ lệ (%) nở trứng tuyến trùng M incognita 149 Bảng 3.33 Tỷ lệ (%) ấu trùng M incognita chết nấm L squarrosulus 150 Bảng 3.34 Tỷ lệ (%) tuyến trùng P penetrans chết nấm L squarrosulus 151 viii DANH MỤC HÌNH Hình 3.1 Ảnh chụp KHV loài T annulatus ký sinh cà rốt 42 Hình 3.2 Ảnh chụp KHV loài T mashhoodi ký sinh cà rốt 45 Hình 3.3 Đặc điểm sai khác loài T annulatus T mashhoodi ký sinh cà rốt 46 Hình 3.4 Ảnh chụp KHV lồi H dihystera ký sinh cà rốt 49 Hình 3.5 Ảnh chụp KHV lồi H indicus ký sinh cà rốt 52 Hình 3.6 Đặc điểm sai khác loài H dihystera H indicus ký sinh cà rốt 53 Hình 3.7 Ảnh chụp KHV lồi H chambus ký sinh cà rốt 55 Hình 3.8 Ảnh chụp KHV trưởng thành non loài R reniformis ký sinh cà rốt 60 Hình 3.9 Ảnh chụp KHV loài H strictathecatus ký sinh cà rốt 63 Hình 3.10 Cây phát sinh chủng loại dạng ML(mơ hình TN93+G) dựa vùng gen D2D3 loài Hemicriconemoides spp 65 Hình 3.11 Ảnh chụp KHV loài M sphaerocephalum ký sinh cà rốt 68 Hình 3.12 Cây phát sinh chủng loại dạng ML (mơ hình TN93+G) dựa vùng gen D2D3 loài Mesocriconema spp 70 Hình 3.13: Ảnh chụp KHV loài Hemicaloosia sp ký sinh cà rốt 73 Hình 3.14 Ảnh chụp KHV lồi X brevicolle ký sinh cà rốt 76 Hình 3.15 Ảnh chụp KHV lồi M incognita ký sinh cà rốt 83 Hình 3.16 Ảnh chụp KHV loài M arenaria ký sinh cà rốt 88 Hình 3.17 Ảnh chụp KHV loài M graminicola ký sinh cà rốt 91 Hình 3.18 Đặc điểm sai khác ba loài tuyến trùng Meloidogyne spp ký sinh cà rốt 92 Hình 3.19 Cây phát sinh chủng loại dạng ML (mơ hình HKY+G) dựa vùng gen D2D3 lồi Meloidogyne spp 94 Hình 3.20 Ảnh chụp KHV lồi P coffeae ký sinh cà rốt 98 Hình 3.21 Đa dạng cấu trúc loài P coffeae ký sinh cà rốt 99 Hình 3.22 Ảnh chụp KHV lồi P penetrans ký sinh cà rốt 104 Hình 3.23 Ảnh chụp KHV lồi P thornei ký sinh cà rốt 106 Hình 3.24 Ảnh chụp KHV lồi P zeae ký sinh cà rốt 110 169 152 A Haseeb & V Kumar, Management of Meloidogyne incognita-Fusarium solani disease complex in brinjal by biological control agents and organic additives, Annals of Plant Protection Sciences 2006, 14, 519-521 153 V Kumar, A Haseeb & A Sharma, Integrated management of Meloidogyne incognita-Fusarium solani disease complex of brinjal cv, Pusa Kranti Ann Plant Protection Science, 2009, 17, 192-194 154 L.V Lòpez-Llorca, J.G Macia-Vicente & H.B Jansson, Mode of action and interactions of nematophagous fungi, In A Ciancio & K G Mukerji (Eds.), Integrated management and biocontrol of vegetable and grain crops nematodes (pp 51-76), Dordrecht, Springer, 2008 155 G.H Li, K.Q Zhang, J.P Xu, J.Y Dong & Y.J Liu, Nematicidal substances from fungi, Recent Patents on Biotechnology, 2007, 1, 212-233 156 H.Q Xiang & Z.X Feng, The nematicidal toxicity of the fruits bodies of Pleurotus ostreatus, Journal of Shenyang Agricultural University, 2001, 32, 173-175 157 R Heydari, E Pourjam & E.M Goltapeh, Antagonistic effect of some species of Pleurotus on the root-knot nematode Meloidogyne javanica in vitro, Plant Pathol J, 2006, 5, 173-177 158 P Palizi , E.M Goltapeh, E Pourjam & N Safaie, Potential of oyster mushrooms for the biocontrol of sugar beet nematode (Heterodera schachtii), Journal of Plant Protection Research, 2009, 49 (1), 27-33 159 L.J Chen, Y Chen, G.D Zhang & Y.X Duan, Nematicidal activity of extraction and fermentation filtrate of Basidiomycetes collected in liaoning province, China, Chinese Journal of Biological Control, 2010, 26, 467-473 160 B.L Sufiate, F.E de Freitas Soares, S.S Moreira, T.S.A Monteiro, L.G de Freitas & J.H de Queiroz, Nematicidal action of Pleurotus eryngii metabolites, Biocatalysis and Agricultural Biotechnology, 2017, 12, 216-219 161 P.M Kirk, P Cannon, J.C David & J.A Stalpers, Ainsworth and Bisby's dictionary of the fungi (10th ed.), Wallingford, 2008, Oxon: CAB International 162 S.C Karunarathna, Z.L Yang, R.L Zhao, E.C Vellinga, A.H Bahkali & E Chukeatirote, Three new species of Lentinus from northern Thailand, Mycological Progress, 2010, 10, 389-394 170 163 N.A.M Mhd Omar, N Abdullah, U.R Kuppusamy, M.A Abdulla & V Sabaratnam, Nutritional composition, antioxidant capacity and antiulcer potential of Lentinus squarrosulus (Mont.) mycelia extract, Evidenced-Based Complementary and Alternative Medicine, 2011, doi:10.1155/2011/539356 164 D Pegler, The genus Lentinus: a world monograph, London, 1983, Royal Botanic Garderns 165 O.O Osemwegie & J.A Okhuoya, Diversity of macrofungi in oil palm agroforests of Edo state, Nigeria, Journal of Biological Sciences, 2009, 9, 584-593 166 R.G Thorn & G.L Barron, Carnivorous mushrooms, Science, 1984, 224, 76-78 167 L.I Sudirman, A.I Housseini, G Le Febvre, E Kiffer & B Botton, Screening of some basidiomycetes for biocontrol of Rigidoporus lignosus, a parasite of the rubber tree Hevea brasiliensis, Mycological Research, 1992, 96(8), 621-625 168 S.K Bhunia, B Dey, K.K Maity, S Patra, S Mandal, S Maiti, T.K Maiti, S.R Sikdar & S.S Islam, Isolation and characterization of an immunoenhancing glucan from alkaline extract of an edible mushroom, Lentinus squarrosulus (Mont.) Singer, Carbohydrate research, 2011, 346(13), 2039-2044 169 L.I Sudirman, G Lefèbvre, E Kiffer, B Botton, Purification of antibiotics produced by Lentinus squarrosulus and preliminary characterization of a compound active against Rigidoporus lignosus(Article), Current Microbiology, 1994, 29, 1-6 170 D.L.N Mensah, R Duponnois, J Bourillon, F Gressent, Y Prin, Biochemical characterization and efficacy of Pleurotus, Lentinus and Ganoderma parent and hybrid mushroom strains as biofertilizers of attapulgite for wheat and tomato growth, Biocatalysis and Agricultural Biotechnology, 2018, 16, 63-72 171 M Isaka, M Sappan, P Rachtawee, T Boonpratuang, A tetrahydrobenzofuran derivative from the fermentation broth of Lentinus squarrosulus BCC22366, Phytochemistry Letters, 2011, 4, 106-108 172 J Attarat & R Thamisak, Anticancer PSP and phenolic compounds in Lentinus squarrosulus and Lentinus polychrous, The 5th International Conference on Natural Products for Health and Beauty, 2014, 263-267 173 S.D Ghatr & K.R Sridhar, Bioactive Potential of Lentinus squarrosulus and Termitomyces clypeatus from the Southwestern region of India, Indian Journal of Natural Products and Resources, 2017, Vol 8(2), 120-131 171 174 M Kusano, H Koshino, T Kawano & Y Kimura, Nematicidal alkaloids and related compounds produced by the fungus Penicillium cf Simplicissimum, Bioscience Biotechnology and Biochemistry, 2000, 64, 2559-2568 175 M Stadler, J.Y Fouron, O Sterner & H Anke, 1,2-Dihydroxymintlactone, a new nematicidal monoterpene isolated from the Basidiomycete Cheimonophyllum candidissimum Sing, Zeitschrift fur Naturforschung, 1995, 50c, 473-475 176 M Stadler & O Sterner, Production of bioactive secondary metabolities in the fruit bodies of macrofungi as a response to injury, Phytochemistry, 1998, 49, 1013-1019 177 A.A William, S Rudong, S.T Latchezar & J.H Leonard, Sesquiterpenes from the nematicidal fungus Clitocybula oculus, Phytochemistry, 1998, 49, 589-592 178 Z.X Zhao, Master thesis, laboratory for conservation and utilization of bioresource, Yunnan University, 2004, Kunming, China 179 Y.J Liu, Ph.D thesis, Laboratory for conservation and utilization of bioresource, Yunnan University, 2005, Kunming, China 180 M Kadiri, Toxicological evaluation of Lentinus squarrosulus Mont (Polyporales), an indigenous Nigerian mushroom, International Journal of Medicinal Mushrooms, 2005, 7, 416-417 181 F Borokini, L Lajide, T Olaleye, A Boligon, M Athayde & I Adesina, Chemical profile and antimicrobial activities of two edible mushrooms (Termitomyces robustus and Lentinus squarrosulus), Journal of Microbiology, Biotechnology and Food Sciences, 2016, 5, 416-423 182 Nguyễn Ngọc Châu, Nguyễn Vũ Thanh, Tuyến trùng ký sinh thực vật Việt Nam, NXB KHKT, 2000, Hà Nội 183 Nguyễn Ngọc Châu & Nguyễn Vũ Thanh, Tuyến trùng ký sinh hồ tiêu bệnh chúng gây ra, Tuyển tập cơng trình nghiên cứu ST&TNSV, NXB KHKT, 1993, 260-270 184 Vũ Thị Thanh Tâm, Nguyễn Ngọc Châu & Nguyễn Vũ Thanh, Tuyến trùng ký sinh thuốc số tỉnh phía bắc Việt Nam, Tạp chí sinh học, 1999, 21(2b), 96-103 172 185 Trịnh Quang pháp, Nguyễn Ngọc Châu, Fiona H.L Benyon Lester W Burgess, Tuyến trùng ký sinh vải tỉnh Bắc Giang Hải Dương, Hội thảo quốc gia bệnh sinh học phân tử, lần thứ 4, 2004, 101-105 186 Vũ Anh Tú, Trịnh Quang Pháp, Nguyễn Văn Toàn, Tuyến trùng đất bazan tái canh cà phê mối quan hệ tuyến trùng với triệu chứng vàng cà phê Gia Lai, Tạp chí Nơng nghiệp Phát triển Nơng nghiệp, 2014, 23, 36-43 187 Tạ Thị Mai Anh Nguyễn Ngọc Châu, Dẫn liệu tuyến trùng ký sinh lạc Hưng Yên, Hội nghị khoa học toàn quốc sinh thái Tài nguyên sinh vật lần thứ 6, 2015, 11-16 188 Nguyễn Hữu Tiền, Nguyễn Thị Duyên, Lê Thị Mai Linh, Trịnh Quang Pháp Bước đầu khảo sát tuyến trùng ký sinh thực vật số dược liệu Đông Triều- Quảng Ninh, Hội nghị khoa học toàn quốc sinh thái Tài nguyên Sinh vật lần thứ 6, 2015, 928-933 189 Trịnh Quang Pháp, Nguyễn Thị Thảo, Trần Thị Tuyết Thu, Nguyễn Hữu Tiền, Đặc điểm phân bố tuyến trùng ký sinh thực vật đất trồng cam Cao Phong, Hịa Bình, Tạp chí khoa học đại học quốc gia Hà Nội, 2016, 32(1S), 301-308 190 Nguyễn Thị Duyên, Nguyễn Hữu Tiền, Lê Thị Mai Linh, Trịnh Quang Pháp, Khảo sát tuyến trùng ký sinh thực vật vùng trồng rau Xuân Hồng (Xuân Trường, Nam Định, Hội thảo quốc gia bệnh hại thực vật Việt Nam lần thứ 16 NXB Nông nghiệp, 2017, 292-29 191 Nguyen B Khuong, Plant Parasitic Nematodes of South Vietnam, Journal of Nematology, 1983, 15, 319-323 192 Ngô Thị Xuyên, Nghiên cứu mức độ thiệt hại tuyến trùng nốt sưng số giống thuốc lá, Tạp chí BVTV, 1995, 2, 55-59 193 Ngơ Thị Xun, Nguyễn Tài Đạt, Nguyễn Thị Mai Hương & Nguyễn Trung Đức, Nghiên cứu tuyến trùng nốt sưng ( Meloidogyne spp.) hại lúa Việt Nam, Tạp chí BVTV, 2012, 1, 25-29 194 Nguyễn Ngọc Châu, Thành phần sâu bệnh hại hồ tiêu Nông trường Tân Lâm, Quảng Trị, Tạp chí BVTV, 1995, 1(139), 14-18 195 Lê Ðức Khánh, L.Q Khải, Đ.T Hằng, P.S Hoạt, T.T.T Hằng, T.T Toàn, Đ.Đ Thắng, N.N Châu, T.Q Pháp; N.V Vấn, Đ.T.L Hoa, L.Đ Khoa, Thành 173 phần Tuyến trùng Ký sinh Thực vật cà phê, hồ tiêu số vùng trồng tập trung Tây Nguyên, Tạp chí bảo vệ thực vật 6, 2013, 24-30 196 Bùi Thị Thu Nga, Hoàng Thị Loan, Ngô Xuân Quảng, Dương Đức Hiếu, Đa dạng quần xã tuyến trùng đất hệ sinh thái nông nghiệp hồ tiêu tỉnh Đồng Nai, Tạp chí Cơng nghệ Sinh học, 2015, 13(4A), 1359-1367 197 P.Q Trinh, E de la Peña, C.N Nguyen, H.X Nguyen & M Moens, Plant- parasitic nematodes associated with coffee in Vietnam, Russian journal of Nematology, 2009, 17(1), 73-82 198 P.Q Trinh, T.K.D Pham & N.C Nguyen, Emerging Meloidogyne species (root-knot nematodes) threats to coffee in the Western Highlands in Vietnam, In Proceedings of the 2nd VAST–KAST workshop on biodiversity and bop– active compounds, 2013, 313-318 199 P.Q Trinh, C.N Nguyen, L Waeyenberge, S.A Subbotin, G Karssen & M Moens, Radopholus arabocoffeae sp n (Nematoda : Pratylenchidae), a nematode pathogenic to Coffea arabica in Vietnam, and additional data on R Duriophilus, Nematology, 2004, 6, 681-693 200 Q.P Trinh, T.M.L Le, T.D Nguyen, H.T Nguyen, G Liebanas & T.A.D Nguyen, Meloidogyne daklakensis n sp.(Nematoda: Meloidogynidae), a new root-knot nematode associated with Robusta coffee (Coffea canephora Pierre ex A Froehner) in the Western Highlands, Vietnam, Journal of Helminthology, 2018, 1-13 201 Nguyễn Ngọc Châu Nguyễn Thị Kỳ, Kết bước đầu nghiên cứu sử dụng chế phẩm thảo mộc cho phòng trừ tuyến trùng hồ tiêu, Tuyển tập cơng trình nghiên cứu Sinh thái Tài nguyên sinh vật, 1995, 213-219 202 Nguyễn Ngọc Châu Và Trịnh Quang Pháp, Hiệu lực thuốc thảo mộc “Sơng lam ND50” số nhóm tuyến trùng ký sinh thực vật, Tạp chí sinh học, 2005, 27 (3A), 83-86 203 Vũ Thị Thanh Tâm Nguyễn Kiều Hậu, Ảnh hưởng nấm nội sinh không gây bệnh Fusarium oxysporum đến phát triển tuyến trùng sần rễ Meloidogyne incognita cà chua, Hội thảo quốc gia bệnh sinh học phân tử lần thứ 7, 2008, 93-97 174 204 Vũ Thị Thanh Tâm Nguyễn Thị Ánh Dương, Ảnh hưởng nấm nội sinh không gây bệnh Fusarium oxysporum đến tuyến trùng sần rễ Meloidogyne incognita lúa, Hội thảo quốc gia bệnh sinh học phân tử lần thứ 7, 2008, 98-104 205 Nguyễn Văn Dũng, Phạm Thị Vượng, Đặng Thị Lan Anh, Phạm Văn Sơn, Hà Thị Kim Thoa, Kết ứng dụng số chế phẩm sinh học phòng chống tuyến trùng hại cà rốt, Hội thảo quốc gia Khoa học trồng lần thứ 2, 2016, 948-954 206 Lê Thị Mai Linh, Nguyễn Thị Duyên, Trịnh Quang Pháp, Nguyễn Thị Phương Anh, Phạm Văn Ty, Nghiên cứu khả ức chế tuyến trùng Meloidogyne incognita cà phê nấm paecilomyces javanicus, Tạp chí Cơng nghệ Sinh học, 2015, 13(4): 1025-1029 207 X Gao, H Zhou, H Zhang, C Chen, & S Deng, Effical of the MCWA18 strain of Paecilomyces lilacinus on Meloidogyne inognita, Chinese Journal of Biological Control, 1998, 14(4), 163-166 208 Nguyễn Ngọc Châu, Nguyễn Vũ Thanh, Phương pháp tách tuyến trùng từ đất mô thực vật, Những thành tựu KHKT áp dụng vào sản xuất, 1993, 41-45 209 J.A López Pérez, M Escuer, M.A Díez Rojo, L Robertson, A Piedra-Buena, J López Cepero & A Bello Pérez, Host range of Meloidogyne arenaria (Neal, 1889) Chitwood, 1949 (Nematoda: Meloidogynidae) in Spain, Nematropica 41, 2011, 130-140 210 R.S Hussey & K.R Barker, Comparison of methods for collecting inocula of Meloidogyne spp including a new technique, Plant Disease Reporter, 1973, 57, 1025-1028 211 D.L Coyne, O Adewuyi & E Mbiru, Protocol for in vitro culturing of lesion nematodes: Radopholus similis and Pratylenchus spp on carrot discs, International Institute of Tropical Agriculture (IITA), Ibadan, Nigeria, 2014, 15 212 W.D Courtney, D Polley & V.L Miller, TAF, an improved fixative in nematode technique, Plant Disease Reporter, 1955, 39(7), 570-571 213 K.M Hartman & J.N Sasser, Identification of Meloidogyne species on the basis of differential host test and perineal-pattern morphology, An Advanced 175 Treatise on Meloidogyne Volume II: Methodology In: Barker KR, Carter CC, Sasser JN, editors, North Carolina State University Graphics; 1985, pp 69-77 214 J Abolafia, A low–cost technique to manufacture a container to process meiofauna for scanning electron microscopy, Microscopy Research and Technique, 2015, 78, 771-776 215 I.P Kazachenko and T.I Mukhina, Root-knot nematodes of genus Meloidogyne Goeldi (Tylenchida: Meloidogynidae) of the world, Vladivostok, Russia, Institute of Biology and Soil Sciences, 2013, 306 pp 216 E Geraert, The Dolichoodoridae of the world - Identification of the family Dolichodoridae (Nematoda: Tylenchida), Gent, Academia Press, 2011, 520 217 E Geraert, The Criconematidae of the world: identification of the family Criconematidae (Nematoda), Ghent, Belgium, Academia Press, 2010 218 J.J Chitambar & S.A Subbotin, Systematics of the sheath nematodes of the superfamily Hemicycliophoroidea, 2014, Brill 219 P De Ley, M.A Felix, L.M Frisse, S.A Nadler, P.W Sternberg & W.K Thomas, Molecular and morphological characterisation of two reproductively isolated species with mirror-image anatomy (Nematoda: Cephalobidae), Nematology, 1999, 1(6), 591 220 R.W Payne, D.A Murray, S.A Harding, D.B Baird & D.M Soutar, GenStat for Windows 12th Edition, 2009, VSN International, Hemel Hempstead 221 T.A Hall, BioEdit: a user-friendly biological sequence alignment editor and analysis program for Windows 95/98/NT, Nucleic acids symposium series, 1999, Vol 41, No 41, 95-98 222 K Tamura, J Dudley, M Nei & S Kumar, MEGA4: Molecular Evolutionary Genetics Analysis (MEGA) software version 4.0, Molecular Biology and Evolution, 2007, 24, 1596-1599 223 D.J Hunt, Aphelenchida, Longidoridae and Trichodoridae: Their Sistematics and Bionomics, CAB International, UK, 1993, 352 pp 224 D.T Buangsuwon, G Rujirachoon, A.J Brawn & A.L Taylor, Rice diseases and pests of Thailand, Thailand: Rice Protection Research Centre, Ministry of Agriculture, 1971, 61-67 176 225 W Birchfield, Host parasite relations and host range studies of a new Meloidogyne species in southern USA, Phytopathology, 1965, 55, 1359-1361 226 Y.S Rao, P Israel & H Biswas, Weed and rotation crop plants as hosts for the rice rootknot nematode, Meloidogyne graminicola (Golden and Birchfield), Oryza, 1970, 7(2), 137-142 227 A.K Roy, Weed hosts of Meloidogyne graminicola, Indian Journal of Nematology, 1977, 7(2), 160-163 228 C.P Yik & W Birchfield, Host studies and reactions of rice cultivars to Meloidogyne graminicola, Phytopathology, 1979, 69(5), 497-499 229 Y.Y Myint, Country report on rootknot nematode in Burma, Proceedings of the 3rd Research Planning Conference on rootknot nematodes, Meloidogyne spp., Region VI, 20-July 1981, Jakarta, Indonesia, North Carolina State University, Raleigh, NC USA, 1981, 163-170 230 S.R Siciliano, L.C.C.B Ferraz & A.R Monteiro, Host range of Meloidogyne graminicola in Brazil: primary study, Nematologia Brasileira, 1990, 14,121-130 231 M.R Siddiqi & M.A Basir, On some plant parasitic nematodes occurring in South India with description of two new species of the genus Tylenchorhynchus Cobb, 1913, Proceeding 46 th Indian Science Congress Part IV, 1959, 35 232 S.A Sher, Revision of the Hoplolaiminae (Nematoda)VI Helicotylenchus Steiner, 1945, Nematologica, 1966, 12, 1-56 233 M.R Siddiqi, Two new species of the genus Helicotylenchus Steiner, 1945 (Nematoda: Hoplolaiminae), Z Parasitenkunde, 1963, 3, 239-244 234 M.S Jairajpuri & Baqri, Nematodes of high altitudes in India I Four new species of Tylenchida, Nematologica 1973, 19, 19-30 235 D.R Dasgupta, D.J Raski & S.A Sher, A revision of the genus Rotylenchulus Linford and Oliveira, 1940, (Nematoda: Tyllenchidae), Proc Helm Soc Wash 1968, 35, 169-192 236 R.P Esser, Three additional species in the genus Hemicriconemoides Chitwood & Birchfield, 1957 (Nemata: Tylenchida), Nematologica, 1960, 5, 64-71 237 D.R Dasgupta, D.J Raski & D Van Gundy, Revision of the genus Hemicriconemoides Chitwood & Birchfield, 1957 (Nematoda: Criconematidae), Journal of Nematology, 1969, 1, 126-145 177 238 M.R Siddiqi, Hemicriconemoides mangiferae, CIH Descriptions of plant- parasitic nematodes, Commonwealth Institute of Helminthology, 1977, 7, 99 239 W Decraemer & E Geraert, Description of Hemicriconemoides parataiwanensis sp n (Criconematidae) and four other Hemicriconemoides species from Papua New Guinea with a consideration of variability in the genus, Nematologica, 1992, 38, 267-295 240 W Decraemer, & E Geraert, On the taxonomic status of Hemicriconemoides mangiferae Siddiqi, 1961 and H strictathecatus Esser, 1960 (Nematoda: Criconematidae), Fundamental and Applied Nematology, 1996, 19, 608 241 R Crozzoli & F Lamberti, Species of Criconemoides Taylor, 1936, Discocriconemellade Grisse & Loof, 1965 and Hemicriconemoides Chitwood & Birchfield, 1957 occurring in Venezuela, with descriptions of Criconemoides tiaraensis sp n (Nematoda: Criconematidae), Russian Journal of Nematology, 2003, 11, 67-79 242 C Dhanachand & M.S JaiRaipuri, Hemicriconemoides neobrachyurus sp.n and Hemicaloosia luci sp n (nematoda: Criconematoidea) From Manipur, Indian, India Journal of Nematology,1979, 9, 111-116 243 M Luc & A Coomans, Les Nematodes phytoparasites du genre Xiphinema (Longidoridae) en Guyane et en Martinique Belg, J Zool 1992, 122, 147-183 244 B.G Chitwwood, Root-knot nematodes-Part A revision of the genus Meloidogyne Goeldi, 1887, Proc Helminth Soc Wash, 1949, 16, 90-104 245 A.M Golden & W Birchfield, Meloidogyne graminicola (Heteroderidae) a new species of Root-knot nematodes from grass, Proc Helminth Soc Wash, 1965, 32: 228-231 246 S.A Sher & M.W Allen, Revision of the genus Pratylenchus (Nematoda: Tylenchidae), University of California Publications in Zoology, 1953, 57, 441-447 247 A.Y Ryss, World fauna of the root parasitic nematodes of the family Pratylenchidae (Tylenchida), Leningrad, USSR, 1988, 367 pp 248 P.A.A Loof, Taxonomic studies on the genus Pratylenchus(Nematoda), Tijdschrift ober Plantenziekten66, 1960, 29-90 178 249 N Vovlas & A Troccoli, Histopathology of broad bean roots infected by the lesion nematode Pratylenchus penetrans, Nematologia Mediterranea, 1990, 18, 239-242 250 T.W Graham, Nematode root rot of tobacco and other plants, Bulletin 390, South Carolina Agricultural Experiment Station, Clemson Agricultural College, 1951, 25 pp 251 H Wang, K Zhuo, W Ye & J Liao, Morphological and molecular charaterisation of Pratylenchus parazeaen sp (Nematoda: Pratylenchidae) parasitizing sugarcane in China, European Journal of Plant Pathology, 2015, 143, 173-191 252 M Hernández, R Jordana, A Goldaracena & J Pinochet, SEM observations of nine species of the genus Pratylenchus Filipjev, 1936 (Nematoda: Pratylenchidae), Journal of Nematode Morphology and Systematics, 2000, 3(2), 165-174 253 N.T Tuyet, A Elsen, H.H Nhi & D De Waele, Effect of temperature on the in vitro reproductive fitness of Pratylenchus coffeae populations from Vietnam, Archives of Phytopathology and Plant Protection, 2013, 46, 1-13 254 D De Waele & A Elsen, Challenges in tropical plant nematology, Annu Rev Phytopathol, 2007, 45, 457-485 255 G.S Abawi, J.W Ludwig & L Fusco, Symptoms and damage of the northern root knot nematode on carrots in New York, Phytopathology 1997, 87, S1 256 C.S Huang & J.M Charchar, Preplanting inoculum densities of root-knot nematode related to carrot yield in greenhouse, Plant Disease, 1982, 66, 1064-1066 257 B Weischer & D.J.F Brown, An introduction to nematodes, General nematology a students textbook, Pensoft, Sofia Moscow, 2000, p 49 258 T.C Vrain, G Belair & P Martel, Nonfumigant nematicides for control of root-knot nematode to protect carrot root growth in organic soils, Journal of Nematology, 1979, 11, 328-333 259 L.A Slinger & G.W Bird, Ontogeny of Daucus carota infected with Meloidogyne hapla, Journal of Nematology, 1978, 10, 188-194 260 G Belair & L.E Parent, Using crop rotation to control Meloidogyne hapla Chitwood and improve marketable carrot yield, HortScience, 1996, 31,106-108 179 261 G Stirling, J Nicol & F Reay, Advisory services for nematode pests - operational guidelines, Rural Industries Research and Development Corporation Publication, 1999, 99/41 262 G.S Abawi, J.W Ludwig, J Carroll & T Widmer, Management of leaf blight diseases and rootknot nematode on carrots in New York Pp 71-72 In: RC Brook (Ed.) Great Lakes Expo Fruit, Vegetable and Farm Market Education Session Abstracts, 2001 Michingan State University Extension 263 T.C Vrain, Relationship between Meloidogyne hapla density and damage to carrots in organic soils, Journal of Nematology 1982, 14, 50-57 264 J.L Liao, Y.Q Yin, X.Y Bing & H.J, Zhou, Disease caused by reniform nematodes in carrot and its control with nematicides, Journal of Huazhong Agricultural University, 1999, 18, 335-338 265 G.J.W Janssen, The relevance of races in Ditylenchus dipsaci(Kuhn) Filipjev the stem Nematode, Fundamental and Applied Nematology, 1994, 17, 469-473 266 A Tunlid & S Jansson, Proteases and their involvement in the infection and immobilization of nematodes by nematophagous fungus Arthrobotrys oligospora, Appl Environ Microbiol, 1991, 57, 2868-2872 267 A Evans, Soil dwelling free-living nematodes as pests of crops, Scottish Agricultural College Technical Note (TN603) ISBN, 2007, 1854828959 268 M.H Sun, L Gao, Y.X Shi, B.J Li & X.Z Liu, Fungi and actinomycetes associated with Meloidogyne spp eggs and females in China and their biocontrol potential, Journal of Invertebrate Pathology, 2006, 93(1), 22-28 180 PHỤ LỤC PHỤ LỤC I: Danh sách quần thể tuyến trùng thực vật ký sinh cà rốt Việt Nam sử dụng luận án TT Ký hiệu mã số quần thể lưu IEBR Địa điểm thu mẫu Tên lồi T4855 Đơng Anh - Hà Nội T annulatus T4708 Cẩm Giàng - Hải Dương T annulatus T4862 Đà Lạt - Lâm Đồng T annulatus T4351 Nam Sách - Hải Dương T mashhoodi T4910 Văn Giang - Hưng Yên T mashhoodi H3657 Nam Sách - Hải Dương H dihytera H4857 Đông Anh - Hà Nội H indicus H4925 Văn Giang - Hưng Yên H indicus H5197 Đơn Dương - Lâm Đồng H indicus 10 H4356 Nam Sách - Hải Dương H chambus 11 R4857 Đông Anh - Hà Nội R reniformis 12 R4691 Cẩm Giàng - Hải Dương R reniformis 13 R4923 Văn Giang - Hưng Yên R reniformis 14 R5265 Đơn Dương - Lâm Đồng R reniformis 15 H4359 Nam Sách - Hải Dương H strictathecatus 16 H4923 Văn Giang - Hưng Yên H strictathecatus 17 M4854 Đông Anh - Hà Nội M sphaerocephalum 18 M4694 Cẩm Giàng - Hải Dương M sphaerocephalum 18 H4999 Đà Lạt – Lâm Đồng Hemicaloosia sp 20 X5271 Đơn Dương - Lâm Đồng X brevicolle 21 M3656 Nam Sách - Hải Dương M incognita 22 M4859 Đông Anh - Hà Nội M incognita 23 M4907 Văn Giang - Hưng Yên M incognita 24 M5269 Đơn Dương - Lâm Đồng M incognita 25 M4806 Cẩm Giàng - Hải Dương M arenaria 26 M4854 Đông Anh - Hà Nội M graminicola 27 P4922 Văn Giang - Hưng Yên P coffeae 181 28 P4996 Đà Lạt - Lâm Đồng P penetrans 29 P4358 Nam Sách - Hải Dương P thornei 30 P4854 Đông Anh - Hà Nội P zeae 31 P3656 Nam Sách - Hải Dương P zeae 32 P3655 Nam Sách - Hải Dương P haiduongensis 33 P3658 Nam Sách - Hải Dương P haiduongensis 34 P4728 Cẩm Giàng - Hải Dương P haiduongensis 35 P4861 Đà Lạt - Lâm Đồng Pratylenchus sp 36 P4981 Đà Lạt - Lâm Đồng Pratylenchus sp 37 P5189 Đà Lạt - Lâm Đồng Pratylenchus sp 38 P5208 Đà Lạt - Lâm Đồng Pratylenchus sp 39 P3130 Đơn Dương - Lâm Đồng Pratylenchus sp PHỤ LỤC II Danh sách quần thể tuyên trùng thực vật ký sinh cà rốt Việt Nam đăng ký trình tự DNA Genbank Ký hiệu mã số quần thể TT lưu IEBR Địa điểm thu mẫu Tên loài Mã số Genbank H strictathecatus MK026627 H4359 Nam Sách - Hải Dương M4694 Cẩm Giàng - Hải Dương M sphaerocephalum MK026627 M3656 Nam Sách - Hải Dương M incognita MH359157 M4859 Đông Anh - Hà Nội M incognita MH359153 M4907 Văn Giang - Hưng Yên M incognita MH359154 M5269 Đơn Dương - Lâm Đồng M incognita MH359155 M4806 Cẩm Giàng - Hải Dương M arenaria MH359158 M4854 Đông Anh - Hà Nội M graminicola MH359152 P4922 Văn Giang - Hưng Yên P coffeae MH359161 10 P4996 Đà Lạt - Lâm Đồng P penetrans MH359162 11 P4358 Nam Sách - Hải Dương P thornei MH359160 12 P4854 Đông Anh - Hà Nội P zeae MH359159 13 P3655 Nam Sách - Hải Dương P haiduongensis MF429813 14 P3658 Nam Sách - Hải Dương P haiduongensis MF429812 182 15 P4728 Cẩm Giàng - Hải Dương P haiduongensis MF429811 16 P4861 Đà Lạt - Lâm Đồng Pratylenchus sp MH359166 17 P4981 Đà Lạt - Lâm Đồng Pratylenchus sp MH359165 18 P5189 Đà Lạt - Lâm Đồng Pratylenchus sp MH359164 19 P5208 Đà Lạt - Lâm Đồng Pratylenchus sp MH359163 PHỤ LỤC III Các đặc điểm hình thái sử dụng để phân loại lồi Pratylenchus spp khóa định loại dạng bảng (Matrixcode) khóa định loại lưỡng phân theo Castillo & Vovlas (2007)[63] A) Vịng đầu: Nhóm 1: vịng cutin Nhóm 2: vịng cutin Nhóm 3: vịng cutin B) Con đực: Nhóm 1: khơng có đực Nhóm 2: có đực C) Chiều dài kim hút: Nhóm 1: Chiều dài kim hút 20μm D) Hình dạng túi chứa tinh: Nhóm 1: khơng có túi chứa tinh túi chứa tinh tiêu giảm Nhóm 2: túi chứa tinh hình trịn hình cầu Nhóm 3: túi chứa tinh hình oval Nhóm 4: túi chứa tinh hình chữ nhật E) Tỷ lệ chiều dài từ đầu đến vulva/ chiều dài thể (V): Nhóm 1: V85% F) Chiều dài tử cung sau (PUS): Nhóm 1: Chiều dài tử cung sau 35μm G) Hình dạng cái: Nhóm 1: Hình trụ Nhóm 2: Gần hình trụ Nhóm 3: Hình chóp H) Mút cái: Nhóm 1: Nhẵn (mịn) Nhóm 2: Xẻ thùy Nhóm 3: Nhọn Nhóm 4: Có nhú phía bụng I) Chiều dài thực quản tuyến: Nhóm 1: Chiều dài thực quản tuyến 50μm J) Đường bên vulval: Nhóm 1: có đường bên Nhóm 2: có đường bên Nhóm 3: có đường bên K) Cấu trúc vùng bên vị trí vulva: Nhóm 1: Các dải nhẵn Nhóm 2: có cấu trúc areolation