Sử dụng phương pháp chọn giống nhờ chỉ thị phân tử mas chọn lọc các dòng lúa triển vọng cho năng suất cao mang qtl gen quy định tính trạng tăng số hạt trên bông

ĐẠI HỌC THÁI NGUYÊN TRƢỜNG ĐẠI HỌC KHOA HỌC  ĐỖ NGỌC TUYỀN SỬ DỤNG PHƢƠNG PHÁP CHỌN GIỐNG NHỜ CHỈ THỊ PHÂN TỬ (MAS) CHỌN LỌC CÁC DÒNG LÚA TRIỂN VỌNG CHO NĂNG SUẤT CAO MANG QTL/GEN QUY ĐỊNH TÍNH TRẠNG TĂNG SỐ HẠT TRÊN BÔNG LUẬN VĂN THẠC SĨ CÔNG NGHỆ SINH HỌC THÁI NGUYÊN - 2014 Số hóa Trung tâm Học liệu http://www.lrc-tnu.edu.vn/ ĐẠI HỌC THÁI NGUYÊN TRƢỜNG ĐẠI HỌC KHOA HỌC  ĐỖ NGỌC TUYỀN SỬ DỤNG PHƢƠNG PHÁP CHỌN GIỐNG NHỜ CHỈ THỊ PHÂN TỬ (MAS) CHỌN LỌC CÁC DÒNG LÚA TRIỂN VỌNG CHO NĂNG SUẤT CAO MANG QTL/GEN QUY ĐỊNH TÍNH TRẠNG TĂNG SỐ HẠT TRÊN BƠNG CHUN NGÀNH : CÔNG NGHỆ SINH HỌC MÃ SỐ : 60.42.02.01 NGƢỜI HƢỚNG DẪN KHOA HỌC: TS TRẦN ĐĂNG KHÁNH THÁI NGUYÊN - 2014 Số hóa Trung tâm Học liệu http://www.lrc-tnu.edu.vn/ i LỜI CAM ĐOAN Tôi xin cam đoan trực tiếp thực hầu hết nghiên cứu luận văn Mọi kết thu nguyên bản, không chỉnh sửa chép từ nghiên cứu khác Các số liệu, sơ đồ kết luận văn chưa cơng bố Tơi xin hồn toàn chịu trách nhiệm với lời cam đoan trên! Tác giải luận văn Đỗ Ngọc Tuyền Số hóa Trung tâm Học liệu http://www.lrc-tnu.edu.vn/ ii LỜI CẢM ƠN Để hồn thành luận văn thạc sỹ cơng nghệ sinh học này, xin bày tỏ biết ơn vô sâu sắc tới TS.Trần Đăng Khánh – Phòng sinh học phân tử - Viện di truyên Nông Nghiệp hướng dẫn tận tình, chu đáo bên cạnh kiến thức sinh học bổ ích khác Bên cạnh đó, tơi xin chân thành cảm ơn hướng dẫn, giúp đỡ quý báu, nhiệt tình tập thể cán thuộc: Phịng thí nghiệm Sinh học phân tử - Viện Di truyền Nông nghiệp Khoa Khoa học sống, Đại học Khoa học Thái Nguyên nơi tiến hành luận văn thạc sỹ công nghệ sinh học Luận văn thực với nguồn kinh phí từ Quỹ phát triển Khoa học Công nghệ Quốc gia Tác giả luận văn Đỗ Ngọc Tuyền Số hóa Trung tâm Học liệu http://www.lrc-tnu.edu.vn/ iii MỤC LỤC Trang Lời cam đoan i Lời cảm ơn ii Mục lục iii Danh mục ký hiệu, chữ viết tắt iv Danh mục bảng v Danh mục hình vi MỞ ĐẦU Chƣơng 1: TỔNG QUAN TÀI LIỆU 1.1 Nguồn gốc, phân loại, ý nghĩa lúa 1.2 Chỉ thị phân tử công tác chọn tạo giống 1.2.1 Chỉ thị phân tử 1.2.2 Ứng dụng thị phân tử công tác chọn tạo giống ( Phương pháp Marker assisted selection- MAS) 11 1.3 Tổng quan tình hình nghiên cứu 15 1.3.1 Tổng quan tình hình nghiên cứu quốc tế 15 1.3.2 Tình hình nghiên cứu nước 21 Chƣơng 2: VẬT LIỆU VÀ PHƢƠNG PHÁP NGHIÊN CỨU 24 2.1 Vật liệu nghiên cứu 24 2.1.1.Giống lúa nghiên cứu 24 2.1.2.Các thị phân tử hóa chất thí nghiệm 24 2.1.3 Địa điểm thời gian nghiên cứu 25 2.2 Phương pháp nghiên cứu 25 2.2.1 Phương pháp thí nghiệm đồng ruộng 25 2.2.2 Các phương pháp thí nghiệm phòng 25 2.2.3 Phương pháp phân tích xử lý số liệu 30 Số hóa Trung tâm Học liệu http://www.lrc-tnu.edu.vn/ iv Chƣơng 3: KẾT QỦA NGHIÊN CỨU VÀ THẢO LUẬN 31 3.1 Kết xác định thị phân tử đa hình vị trí QTL/gen Yd7 giống Khang Dân 18 giống KC25 31 3.1.1 Kết tách chiết DNA tổng số 31 3.1.2 Kết xác định thị phân tử đa hình vị trí QTL/gen Yd7 31 3.2 Kết lai tạo hệ F1 tổ hợp Khang Dân 18 KC25 32 3.3 Kết xác định cá thể mang QTL/gen Yd7 quần thể F1 tổ hợp lai Khang Dân 18 KC25 33 3.4 Kết xác định cá thể mang QTL/gen Yd7 quần thể F2 tổ hợp lai Khang Dân 18 KC25 34 3.5 Kết xác định cá thể quần thể F3 tổ hợp Khang Dân 18 KC25 mang QTL/gen quy định tính trạng tăng số hạt/bơng 37 3.6 Kết xác định dòng lúa triển vọng mang QTL/gen Yd7 cho suất cao 40 Chƣơng 4: KẾT LUẬN VÀ KIẾN NGHỊ 42 4.1 Kết luận 42 4.2 Kiến nghị 42 TÀI LIỆU THAM KHẢO 43 PHỤ LỤC Số hóa Trung tâm Học liệu http://www.lrc-tnu.edu.vn/ iv DANH MỤC CÁC KÝ HIỆU, CÁC CHỮ VIẾT TẮT DNA : Deoxyribonucleic Acid AFLP : Amplified Fragment Length Polymorphism - Đa hình chiều dài đoạn nhân chọn lọc Bp : Base pair – Cặp bazơ nitơ Cs : Cộng dNTP : Deoxynucleotide triphosphate MAS : Marker Assisted Selection – Chọn lọc nhờ thị phân tử PCR : Polymerase Chain Reaction - Phản ứng chuỗi trùng hợp QTL/QTLs : Quantitative Trait Loci(s) - Locus kiểm sốt tính trạng số lượng RAPD : Random Amplification of Polymorphic DNA - Đa hình ADN nhân ngẫu nhiên RFLP : Restriction Fragment Length Polymorphism – Đa hình chiều dài mảnh phân cắt giới hạn SSR : Simple Sequence Repeat - Sự lặp lại trình tự đơn giản TBE : Tris-Boric Acid-EDTA Số hóa Trung tâm Học liệu http://www.lrc-tnu.edu.vn/ v DANH MỤC BẢNG Trang Bảng 2.1: Thông tin cặp mồi sử dụng nghiên cứu 24 Bảng 2.2: Thành phần phản ứng PCR 27 Bảng 2.3: Chu trình nhiệt phản ứng PCR 27 Bảng 3.1: Bảng thống kê kết thí nghiệm 40 Số hóa Trung tâm Học liệu http://www.lrc-tnu.edu.vn/ vi DANH MỤC HÌNH Trang Hình 2.1: Minh họa QTL/gen Yd7………….……………………………… 26 Hình 3.1: Kết tách DNA tổng số gel agarose 0,8% …… ….… …31 Hình 3.2: Sản phẩm điện di với thị gel agarose 2,5% .… …32 Hình 3.3: Kết lai tổ hợp Khang dân 18 KC25……………….……… 33 Hình 3.4: Kết điện di gel agarose 2,5% với chị thị RM500 33 Hình 3.5: Kết điện di gel agarose 2,5% với chị thị RM21615 34 Hình 3.6 : Kết điện di kiểm tra quần thể F2 với thị RM21615 35 Hình 3.7: Kết điện di kiểm tra quần thể F2 với thị RM500 36 Hình 3.8: Kết điện di kiểm tra quần thể F3 với thị RM500 38 Hình 3.9: Kết điện di kiểm tra quần thể F3 với thị RM445 39 Số hóa Trung tâm Học liệu http://www.lrc-tnu.edu.vn/ MỞ ĐẦU Đặt vấn đề Lúa (Oryza sativa) lương thực quan trọng, với diện tích trồng khoảng 148,4 triệu hecta tồn giới (trong châu Á chiếm 135 triệu hecta) Lúa gạo trồng cung cấp nguồn lương thực quan trọng nhất, lúa có ảnh hưởng đến đời sống 65% dân số giới Châu Á chiếm 90% diện tích đất trồng lúa giới với sản lượng 651 triệu chiếm 92% tổng sản lượng lúa gạo giới (Bộ Nông nghiệp Phát triển Nơng thơn, 2010), khoảng 75% diện tích lúa trồng điều kiện ruộng ngập nước, 19% diện tích lúa trồng điều kiện ruộng thấp nhờ nước trời khoảng 4% diện tích lúa trồng điều kiện ruộng cạn, không chủ động nước Việt Nam có 4,36 triệu hecta trồng lúa, sản lượng đạt 34,4 triệu tấn, suất bình quân 4,67tấn/hecta, xuất 44 triệu gạo.Ở Việt Nam lúa gạo sản phẩm xuất chủ lực nông nghiệp nguồn lương thực 86 triệu dân nước Do trình thị hóa, cơng nghiêp hóa diễn nhanh chóng, diện tích đất dành cho việc trồng lúa ngày bị thu hẹp, chịu ảnh hưởng tiêu cực từ biến đổi khí hậu làm suất lúa bị sụt giảm rõ rệt, với áp lực dân số ngày tăng đòi hỏi nguồn cung lương thực ngày lớn Vì vậy, đáp ứng sản lượng lương thực cần thiết Việc phát triển nguồn giống cải tiến cho suất cao, chất lượng tốt yếu tố quan trọng cho việc đảm bảo hệ thống sản lượng lúa Chọn tạo giống lúa có khả năng suất cao cần thiết, cấp bách có ý nghĩa cho an tồn lương thực tăng thu nhập nông dân.Trong công tác chọn giống trồng, tính trạng khảo nghiệm tính trạng liên quan đến suất, phẩm chất sản phẩm Số hóa Trung tâm Học liệu http://www.lrc-tnu.edu.vn/ 45 21 Botstein D., White R L., Skolnick.M., Davis R.W (1980) “Construc tion of a genetic linkage mapin man using restriction fragement length polymorphisms” Amer J Hum Genet, 32: 314 - 331 22 Brondani C., Rangel PHN., Brondani R P V., Ferreira M E (2002), “QTL mapping and introgression of yield-related traits from Oryza glumaepatula to cultivated rice (Oryza sativa) using microsatellite markers”, Theor Appl Genet, 104: 1192–1203 23 Caldo R.A., Sebastian L.S (1998), “Molecular diversity of philippine improved rice varieties and their progenitors using RAPD and SSR markers”, Agricultural biotechnology, 72: 79 – 81 24 Collard (2005), “An introduction to markers, quantitative trait loci (QTL) mapping and marker-assisted selection for crop improvement: The basis concepts”, Euphytica, 142: 169 – 196 25 Cui K H., Peng S B., Xing Y Z., Yu S B and Xu CG (2002), “Genetic analysis of the panicle traits related to yield sink size of rice”, Acta genetica Sinica, 29: 144-152 26 Guo W Z., Wang W., Zhou B L., Zhang T Z (2006), “Cross-species transferability of G-arboreum-derived EST-SSRs in the diploid species of Gossypium”, Theoretical and Applied Genetics, 112: 1573–1581 27 Hamada H., Kakunaga T (1982), “Potential Z-DNA forming sequences are highly dispersed in Human genome”, Natural, 298: 396 – 398 28 Hittalmani S., Huang N., Courtois B., Venuprasad R., Shashidhar H E., Zhuang J Y., Zheng K L., Liu G F., Wang G C., Sidhu J S, Srivantaneeyakul S., Singh V P., Bagali P G., Prasanna H C., McLaren G and Khush G S (2003), “Identification of QTL for growthand grain yield-related traits in rice across nine locations of Asia”, Theor Appl Genet, 107: 679-690 Số hóa Trung tâm Học liệu http://www.lrc-tnu.edu.vn/ 46 29 Hua J P., Xing Y Z., Xu C G., Sun X L., Yu S B and Zhang Q (2002), “Genetic dissection of an elite rice hybrid revealed that heterozygotes are not always advantageous for performance”, Genetics, 162: 1885-1895 30 Hua J., Xing Y., Wu W., Xu C., Sun X., Yu S and Zhang Q (2003), “Single-locus heterotic effects and dominance by dominance interactions can adequately explain the genetic basis of heterosis in an elite rice hybrid”, Proc Natl Acad Sci USA, 100: 2574-2579 31 Huyen L T N., Quang V D (2002), “Mapping of a brown planthoper resistance gene in CR203 rice variety”, Genetics App, 4: 50-55 32 Ishimaru K., Yano M., Aoki N., Ono K., Hirose T., Lin S Y., Monna L., Sasaki T and Ohsugi R (2001), “Toward the mapping of physiological and agronomic characters on a rice function map: QTL analysis and comparison between QTLs and expressed sequence tags”, Theor Appl Genet, 102: 793-800 33 Joshi S P., Ranjekar P K., (1999), “Molecular markers in plant genome analysis”, Current science 34 Kim N S., Armstrong K C., Fedak G., Ho K., & Park N I (2002), “A microsatellite sequence from the rice blast fungus (Magnaporthe grisea) distinguishes between the centromeres of Hordeum vulgare and H-bulbosum in hybrid plants”, Genome, 45: 165–174 35 Knapp S J (1998), “Marker-assisted selection as a strategy forincreasing the probability of selecting superior genotypes”, Crop Sci, 38: 1164–1174 36 Kobayashi S., Fukuta Y., Sato T., Osaki M and Khush G S (2003), “Molecular marker dissection of rice (Oryza sativa L.) plant architecture under temperate and tropical climates”, Theor Appl Genet, 107: 1350-1356 Số hóa Trung tâm Học liệu http://www.lrc-tnu.edu.vn/ 47 37 Lang N T., Yanagihara S., Buu B.C (2001), “A microsatellite marker for a gene conferring salt tolerance on rice at the vegetative and reproductive stages”, Sabrao, 33: 1-10 38 Li J M., Thomson M and McCouch S R (2004), “Fine mapping of a grain weight quantitative trait locus in the pericentromeric region of rice chromosomes 3”, Genetics, 168: 2187-2195 39 Li Z K., Pinson S R., Park W D., Paterson A H and Stansel J W (1997), “Epistasis for three grain yield components in rice (Oryza sativa L.)”, Genetics, 145: 453-465 40 Liao C Y., Wu P., Hu B and Yi K K (2001), “Effects of genetic background and environment on QTLs and epistasis for rice (Oryza sativa L.) panicle number”, Theor Appl Genet, 103: 104-111 41 Lin H X., Qian H R., Zhuang J Y., Lu J., Min S K., Xiong Z M., Huang N and Zheng K L (1996), “RFLP mapping of QTLs for yield and related characters in rice (Oryza sativa L.)”, Theor Appl Genet, 92: 920 - 927 42 Linh L H., Hang N T., Kang K H., Lee Y T., Kwon S J., Ahn S N (2008), “Introgression of a quantitative trait locus for spikelets per panicle from Oryza minuta to the O.sativa cultivar Hwaseongbyeo”, Plant Bred, 127: 262-267 43 Litt M., & Luty J A (1989), “A hypervariable microsatellite revealed by in vitro amplification of a dinucleotide repeat within the cardiac-muscle actin gene”, American Journal of Human Genetics, 44: 397–401 44 Lu C F., Shen L H., Tan Z B., Xu Y B., He P., Chen Y and Zhu L H (1997), “Comparative mapping of QTLs for agronomic traits of rice Số hóa Trung tâm Học liệu http://www.lrc-tnu.edu.vn/ 48 across environments by using a doubled-haploid population”, Theor Appl Genet, 94: 145-150 45 Mei H W., Luo L J., Ying C S., Wang Y P., Yu X Q., Guo L B., Paterson A H and Li Z K (2003), “Gene actions of QTLs affecting several agronomic traits resolved in a recombinant inbred rice population and two testcross populations”, Theor Appl Genet, 107: 89-101 46 Moncada P., Martínez C P., Borrero J., Chatel M., Gauch H., Guimaraes E., Tohme J and McCouch S R (2001), “Quantitative trait loci for yield and yield components in an Oryza sativa X Oryza rufipogon BC2F2 population evaluated in an upland environment”, Theor Appl Genet, 102: 41-52 47 Nagata K., Fukuta Y., Shimizu H., Yagi T and Terao T (2002), “Quantitative Trait Loci for Sink Size and Ripening Traits in Rice (Oryza sativa L.)”, Breed Sci, 52: 259-273 48 Olson M., Hood L., Cantor C., Bostein D (1989), “A common languague for physical mapping of the human genome”, Science, 29: 1434-1435 49 Saghai-Maroof M A., Soliman K M., Jorgensen R A., Allard R W (1984), “Ribosomal DNA spacer-length polymorphisms in barley: Mendelian inheritance, chromosomal location, and population dynamics”, Proc Natl Acad Sci USA, 81: 8014-8018 50 Septiningsih E M., Prasetiyono J., Lubis E., Tai T H., Tjubaryat T., Moeljopawiro S and McCouch S R (2003), “Identification of quantitative trait loci for yield and yield components in an advanced backcross population derived from the Oryza sativa variety IR64 and the wild relative O rufipogon”, Theor Appl Genet, 107: 1419-1432 51 Scascitelli M., Whitney K D., Randell R A., King M., Buerkle C A., Rieseberg L H (2010), “Genome scan of hybridizing sunflowers from Số hóa Trung tâm Học liệu http://www.lrc-tnu.edu.vn/ 49 Texas (Helianthus annuus and H debilis) reveals asymmetric patterns of introgression and small islands of genomic differentiation”, Molecular Ecology, 19: 521–541 52 Temnykh S (2011), “The map-based sequence of the rice genome”, Nature, 2005 53 Thomson M J., Tai T H., McClung A M., Lai X H., Hinga M E., Lobos K B., Xu Y., Martinez C P and McCouch S R (2003), “Mapping quantitative trait loci for yield components and morphological traits in an advanced backcross population between Oryza rufipogon and the Oryza sativa cultivar Jefferson”, Theor Apll Genet, 107: 479-493 54 Vos P., Hogers R., Bleeker M., Reijans M., Van de Lee T., Hornes M., Frijters A., Pot J., Peleman J., Kuiper M., Zabeau M (1995), “AFLP: a new technique for DNA fingerprinting”, Nucleic Acids Res, 11: 4407–4414 55 Weising K., Nybom H (2005), “DNA Fingerprinting in plant: Principles, methods and application – 2nd Edition”, CRC Press – Taylor & Francis Group 56 Williams J G (1990), "DNA polymorphisms amplified by arbitrary primers are useful as genetic marker", Nucleic Acid Research, 18: 6531-6535 57 Xing Y Z., Zhang Q (2010), “Genetic and molecular bases of rice yield”, Annu Rev Plant Biol, 61: 421–442 58 Xing Z., Tan F., Hua P., Sun L., Xu G., Zhang Q (2001), “Characterization of the main effects, epistatic effects and their environmental interactions of QTLs on the genetic basis of yield traits in rice”, Theor Appl Genet, 105: 248-257 59 Xiao J., Li J., Yuan L., Tanksley S D (1996), “Identification of QTLs affecting traits of agronomic importance in a recombinant inbred Số hóa Trung tâm Học liệu http://www.lrc-tnu.edu.vn/ 50 population derived from a subspecific rice cross”, Theor Appl Genet, 92: 230–244 60 Xiao J., Li J M., Grandillo S., Ahn S N., Yuan L P., Tanksley S D and McCouch S R (1998), “Identification of trait-improving quantitative trait loci alleles from a wild rice relative, Oryza rufipogon”, Genetics, 150: 899-909 61 Xu Y., Crouch J H (2008), “Marker-assisted selection in plant breeding: from publications to practice”, Crop Sci, 48: 391–407 62 Xu J L., Xue Q Z., Luo L J and Li Z K (2001), “QTL dissection of panicle number per plant and spikelet number per panicle in rice (Oryza sativa L.)”, Acta genetica Sinica, 28: 752-759 63 Yang W., de Oliveira A C., Godwin I., Schertz K., and Bennetzen J L., (1996), “Comparison of DNA marker technologies in characterizing plant genome diversity: Variability in Chinese sorghums”, Crop Sci, 36: 1669 – 1676 64 Yu S B., Li J X., Xu C G., Tan Y F., Gao Y J., Li X H., Zhang Q and Maroof M A (1997), “Importance of epistasis as the genetic basis of heterosis in an elite rice hybrid’, Proc Natl Acad Sci USA, 94: 9226-9231 65 Zhang J., Li X., Jiang G., Xu Y., He Y (2006), “Pyramiding of Xa7 and Xa21 for the improvement of disease resistance to bacterial blight in hybrid rice”, Plant Breed, 125(6): 600–605 66 Zhao X P and Kochert G (1993), ”Phylogenetic distribution and genetic-mapping of a (GGC) (N) microsatellite from rice (Oryza-sativa L)”, Plant Molecular Biology, 21: 607–614 67 Zheng K (1995), “PCR-based marker assisted selection in rice breeding”, Geological Publishing House Số hóa Trung tâm Học liệu http://www.lrc-tnu.edu.vn/ 51 68 Zietkiewicz E., Rafalski A., and Labuda D., (1994), “Genome fingerprinting by simple sequence repeat (SSR) – anchored polymerase chain reaction amplification”, Genomics, 20: 176 – 183 69 Zhuang J Y., Lin H X., Lu J., Qian H R., Hittalmani S., Huang N and Zheng K L (1997), “Analysis of QTL x environment interaction for yield components and plant height in rice”, Theor Appl Genet, 95: 799-808 70 Zhuang J Y., Fan Y Y., Rao Z M., Wu J L., Xia Y W and Zheng K L (2002), “Analysis on additive effects and additive-by-additive epistatic effects of QTLs for yield traits in a recombinant inbred line population of rice”, Theor Appl Genet, 105: 1137-1145 Số hóa Trung tâm Học liệu http://www.lrc-tnu.edu.vn/ PHỤ LỤC Phụ lục 1: Danh mục hóa chất thiết bị sử dụng nghiên cứu Hóa chất:   Hóa chất tách chiết ADN: STT Hóa chất Nồng độ gốc Nồng độ làm việc NaOH 1M 0,25M TrisHCl 1M 0,1 M Nước cất Hóa chất thực phản ứng PCR: Hóa chất STT  Nồng độ làm việc Buffer 10X MgCl2 25 mM dNTPs 2,5 mM Taq Takara : 50 Primer 15 ng/µl Nước cất Hóa chất điện di agarose - Hóa chất pha TBE 10X (V = 1000 ml): Hóa chất STT Khối lƣợng Tris base 108 gram EDTA 0,5 M pH 8,0 20 ml Axit boric 55 gram Nước cất Đong đủ 1000 ml Số hóa Trung tâm Học liệu http://www.lrc-tnu.edu.vn/ - Agarose SFR - Ethidium bromide 10 mg/ ml - Nước cất - Thang ADN chuẩn (50 bp X174HindIII) Dụng cụ thiết bị: - Máy nghiền mẫu Retsch Mixer mill MM200 - Máy ly tâm lạnh Mikro Zentrifugen - Máy khuấy từ gia nhiệt Fisher Scientific- Mỹ - Máy vortex Julabo Paramix - Máy PCR Vertiti 96 wells Applied Biosystems - Bộ điện di ngang Owl A2-BP Large Gel Electrophoresis System - Bộ nguồn Power Supply Thermo Scientific EC 3000XL - Hệ thống đèn UV soi gel - Tủ sấy Memmert Paraffin Oven UNE 500PA - Pipet loại (1 kênh, kênh, 12 kênh, pipet điện tử) - Các thiết bị khác (lị vi sóng, nồi khử trùng, máy cất nước ) Số hóa Trung tâm Học liệu http://www.lrc-tnu.edu.vn/ Phụ lục 2: Một số hình ảnh thí nghiệm Thực phản ứng PCR Chạy gel Polyacrylamid Chạy sản phẩm máy PCR Soi gel Đọc kết Số hóa Trung tâm Học liệu http://www.lrc-tnu.edu.vn/ Phụ lục 3: kết xử lí phần mềm IRRISTAT5.0 BALANCED ANOVA FOR VARIATE S? BôNG FILE BOOK1 19/ 5/** 15:26 PAGE Thi nghiem bo tri theo kieu CRB VARIATE V003 S? BôNG LN SOURCE OF VARIATION SQUARES DF SUMS OF MEAN SQUARES F RATIO PROB ER LN ============================================================================= CT$ 3.46667 N.LAI 266667 * RESIDUAL 385185 1.86 0.126 133333 18 3.73333 0.64 0.542 207407 * TOTAL (CORRECTED) 29 7.46667 257471 - BALANCED ANOVA FOR VARIATE TR?C/ Bô FILE BOOK1 19/ 5/** 15:26 PAGE Thi nghiem bo tri theo kieu CRB VARIATE V004 TR?C/ Bô LN SOURCE OF VARIATION SQUARES DF SUMS OF MEAN SQUARES F RATIO PROB ER LN ============================================================================= CT$ 7744.30 N.LAI 232.867 * RESIDUAL 860.478 10.01 0.000 116.433 18 1547.80 1.35 0.283 85.9889 * TOTAL (CORRECTED) 29 9524.97 328.447 - Số hóa Trung tâm Học liệu http://www.lrc-tnu.edu.vn/ BALANCED ANOVA FOR VARIATE P1000 FILE BOOK1 19/ 5/** 15:26 PAGE Thi nghiem bo tri theo kieu CRB VARIATE V005 P1000 LN SOURCE OF VARIATION SQUARES DF SUMS OF MEAN SQUARES F RATIO PROB ER LN ============================================================================= CT$ 1.72700 N.LAI 191889 19.85 0.000 526667E-01 263333E-01 2.72 0.091 * RESIDUAL 18 174000 966668E-02 * TOTAL (CORRECTED) 29 1.95367 673678E-01 - BALANCED ANOVA FOR VARIATE NSTT FILE BOOK1 19/ 5/** 15:26 PAGE Thi nghiem bo tri theo kieu CRB VARIATE V006 NSTT LN SOURCE OF VARIATION SQUARES DF SUMS OF MEAN SQUARES F RATIO PROB ER LN ============================================================================= CT$ 1033.58 N.LAI 1.70082 * RESIDUAL 114.842 17.02 0.000 850409 18 121.489 0.13 0.882 6.74938 * TOTAL (CORRECTED) 29 1156.77 39.8885 - Số hóa Trung tâm Học liệu http://www.lrc-tnu.edu.vn/ BALANCED ANOVA FOR VARIATE NSLT FILE BOOK1 19/ 5/** 15:26 PAGE Thi nghiem bo tri theo kieu CRB VARIATE V007 NSLT LN SOURCE OF VARIATION SQUARES DF SUMS OF MEAN SQUARES F RATIO PROB ER LN ============================================================================= CT$ 2109.33 N.LAI 3.47269 * RESIDUAL 234.370 17.01 0.000 1.73635 18 247.962 0.13 0.882 13.7756 * TOTAL (CORRECTED) 29 2360.76 81.4056 - Số hóa Trung tâm Học liệu http://www.lrc-tnu.edu.vn/ TABLE OF MEANS FOR FACTORIAL EFFECTS FILE BOOK1 19/ 5/** 15:26 PAGE Thi nghiem bo tri theo kieu CRB MEANS FOR EFFECT CT$ CT$ NOS S? BôNG TR?C/ Bô P1000 NSTT ÐC 6.00000 146.333 19.6667 50.7670 C1-16-11 6.66667 150.667 19.9333 58.6823 C1-16-50 7.00000 138.333 19.6000 55.8020 C1-16-55 6.66667 132.667 20.2333 52.4240 C1-16-63 6.66667 141.333 20.1333 55.5667 C1-16-88 6.66667 134.000 20.0667 52.4747 C1-16-90 7.00000 157.000 20.4000 65.9060 C1-16-94 6.33333 179.667 20.1667 67.1340 C1-16-99 6.33333 177.667 20.2000 66.6137 C1-16-109 6.00000 162.000 20.1667 57.6277 SE(N= 3) 5%LSD 18DF 0.262937 5.35378 0.567647E-01 1.49993 0.781224 15.9069 0.168656 4.45651 CT$ NOS NSLT ÐC 72.5240 C1-16-11 83.8320 C1-16-50 79.7170 C1-16-55 74.8917 C1-16-63 79.3813 C1-16-88 74.9633 C1-16-90 94.1513 C1-16-94 95.9057 C1-16-99 95.1620 C1-16-109 82.3247 SE(N= 3) 2.14287 5%LSD 18DF 6.36677 MEANS FOR EFFECT N.LAI N.LAI NOS S? BôNG TR?C/ Bô P1000 NSTT 10 6.60000 149.800 20.1000 58.2022 10 6.60000 150.200 20.0000 58.0695 10 6.40000 155.900 20.0700 58.6277 SE(N= 10) 5%LSD 18DF N.LAI 0.144016 2.93239 0.310913E-01 0.821546 0.427894 8.71255 0.923768E-01 2.44093 NOS NSLT 10 83.1460 10 82.9561 10 83.7538 SE(N= 10) 1.17370 5%LSD 18DF 3.48723 - Số hóa Trung tâm Học liệu http://www.lrc-tnu.edu.vn/ ANALYSIS OF VARIANCE SUMMARY TABLE FILE BOOK1 19/ 5/** 15:26 PAGE Thi nghiem bo tri theo kieu CRB F-PROBABLIITY VALUES FOR EACH EFFECT IN THE MODEL SECTION - VARIATE GRAND MEAN STANDARD DEVIATION C OF V |CT$ (N= 30) SD/MEAN | | | NO BASED ON BASED ON % | | | OBS TOTAL SS RESID SS | | | S? BôNG 30 6.5333 0.50742 0.45542 7.0 0.1258 0.5419 TR?C/ Bô 30 151.97 18.123 9.2730 6.1 0.0000 0.2831 P1000 30 20.057 0.25955 0.98319E-01 0.5 0.0000 0.0911 NSTT 30 58.300 6.3157 2.5980 4.5 0.0000 0.8823 NSLT 30 83.285 9.0225 3.7116 4.5 0.0000 0.8823 Số hóa Trung tâm Học liệu |N.LAI | http://www.lrc-tnu.edu.vn/ ... ĐỖ NGỌC TUYỀN SỬ DỤNG PHƢƠNG PHÁP CHỌN GIỐNG NHỜ CHỈ THỊ PHÂN TỬ (MAS) CHỌN LỌC CÁC DÒNG LÚA TRIỂN VỌNG CHO NĂNG SUẤT CAO MANG QTL/ GEN QUY ĐỊNH TÍNH TRẠNG TĂNG SỐ HẠT TRÊN BÔNG CHUYÊN NGÀNH... tài: ? ?Sử dụng phương pháp chọn giống nhờ thị phân tử (MAS) chọn lọc dòng lúa triển vọng cho suất caomang QTL/ gen quy định tính trạng tăng số hạt bông? ??với mục tiêu thông qua phương pháp MAS (Marker... đến vấn đề chọn giống nhờ thị phân tử Trong chọn giống nhờ thị phân tử, trình chọn lọc dựa sở thị phân tử liên kết với gen quy định tính trạng cần quan tâm Chọn lọc nhờ thị phân tử chọn giống trở