Ứng dụng trình tự 23s ribosomal dna trong phân biệt vi khuẩn e coli và shigella

33 30 0

Tài liệu hạn chế xem trước, để xem đầy đủ mời bạn chọn Tải xuống

1 / 33 trang

THÔNG TIN TÀI LIỆU

Thông tin cơ bản

Định dạng
Số trang	33
Dung lượng	1,92 MB

Nội dung

Ngày đăng: 28/01/2021, 22:43

Nguồn tham khảo

Tài liệu tham khảo

Loại

Chi tiết

[1] Lan, R., Reeves, P.R. (2002) Escherichia coli in disguise: molecular origins of Shigella. Microbes Infection 4, 1125–1132

Sách, tạp chí

Tiêu đề:	Escherichia coli" in disguise: molecular origins of "Shigella

[17] Trabulsi, L.R., Ewing, W.H. (1962) Sodium acetate medium for the differentiation of Shigella and Escherichia cultures. Public Health Lab. 20, 137-140

Sách, tạp chí

Tiêu đề:	Shigella" and "Escherichia

[18] Ewing, W.H. (1986) Edwards and Ewing’s identification of the Enterobacteriaceae. (Elsevier Science, Amsterdam)

Sách, tạp chí

Tiêu đề:	Enterobacteriaceae

[19] Wang, L., Qu, W., Reeves P.R. (2001) Sequence analysis of four Shigella boydii O- antigen loci: implication for Escherichia coli and Shigella relationships. Infect. Immun. 69, 6923–6930

Sách, tạp chí

Tiêu đề:	Shigella boydii" O-antigen loci: implication for "Escherichia coli" and "Shigella

[20] Cilia, V., Lafay, B., and Christen, R. (1996) Sequence heterogeneities among 16S ribosomal RNA sequences, and their effect on phylogenetic analyses at the species level. Mol.Biol. Evol. 13, 451-461.Tp.HCM, ngày 08 tháng 04 năm 2012 Chủ nhiệm đề tài(Ký và ghi rõ họ tên)

Khác

HÌNH ẢNH LIÊN QUAN

Các trình tự 16S và 23S rDNA của các chủng E. coli và Shigella (Bảng 1) được lấy từ ngân hàng gene NCBI - Ứng dụng trình tự 23s ribosomal dna trong phân biệt vi khuẩn e coli và shigella — c trình tự 16S và 23S rDNA của các chủng E. coli và Shigella (Bảng 1) được lấy từ ngân hàng gene NCBI (Trang 6)

Hình 1 Cây hệ thống biễu diễn mối quan hệ của các chủng vi khuẩn E. coli và Shigella với nhau trên cơ sở các trình tự 16S rDNA - Ứng dụng trình tự 23s ribosomal dna trong phân biệt vi khuẩn e coli và shigella — **Hình 1** Cây hệ thống biễu diễn mối quan hệ của các chủng vi khuẩn E. coli và Shigella với nhau trên cơ sở các trình tự 16S rDNA (Trang 8)

Hình 2 Cây hệ thống biễu diễn mối quan hệ của các chủng vi khuẩn E. coli và Shigella với nhau trên cơ sở các trình tự 23S rDNA - Ứng dụng trình tự 23s ribosomal dna trong phân biệt vi khuẩn e coli và shigella — **Hình 2** Cây hệ thống biễu diễn mối quan hệ của các chủng vi khuẩn E. coli và Shigella với nhau trên cơ sở các trình tự 23S rDNA (Trang 9)

Bảng 2 Tỉ lệ các điểm đột biến trong các trình tự 16S and 23S rDNA của E. coli and Shigella - Ứng dụng trình tự 23s ribosomal dna trong phân biệt vi khuẩn e coli và shigella — **Bảng 2** Tỉ lệ các điểm đột biến trong các trình tự 16S and 23S rDNA của E. coli and Shigella (Trang 9)

Như trình bày trong Bảng 2, Shigella có tỉ lệ các điểm đột biến trong các trình tự 16S và 23S thấp hơn nhiều so với E - Ứng dụng trình tự 23s ribosomal dna trong phân biệt vi khuẩn e coli và shigella — h ư trình bày trong Bảng 2, Shigella có tỉ lệ các điểm đột biến trong các trình tự 16S và 23S thấp hơn nhiều so với E (Trang 10)

Hình 4 Sự phân bố của các vị trí đột biến trong các trình tự 23S rDNA của E. coli và Shigella - Ứng dụng trình tự 23s ribosomal dna trong phân biệt vi khuẩn e coli và shigella — **Hình 4** Sự phân bố của các vị trí đột biến trong các trình tự 23S rDNA của E. coli và Shigella (Trang 11)

Bảng 3 Đột biến riêng biệt ở các trình tự 16S và 23S rDNA của E. coli. - Ứng dụng trình tự 23s ribosomal dna trong phân biệt vi khuẩn e coli và shigella — **Bảng 3** Đột biến riêng biệt ở các trình tự 16S và 23S rDNA của E. coli (Trang 12)

* Đột biến được chú thích như trong các bảng phụ 1 và 3. - Ứng dụng trình tự 23s ribosomal dna trong phân biệt vi khuẩn e coli và shigella — t biến được chú thích như trong các bảng phụ 1 và 3 (Trang 13)

Hình 5 Sự tương đồng nucleotide ở hai đầu các trình tự 23S rDNA. Các operon rDNA đầu tiên của ba chủng E - Ứng dụng trình tự 23s ribosomal dna trong phân biệt vi khuẩn e coli và shigella — **Hình 5** Sự tương đồng nucleotide ở hai đầu các trình tự 23S rDNA. Các operon rDNA đầu tiên của ba chủng E (Trang 14)

Bảng phụ 1 Tình trạng đột biến trong các trình tự 16S rDNA của vi khuẩn E. coli. Dòng đầu tiên là số RefSeq accession của các bộ gene E - Ứng dụng trình tự 23s ribosomal dna trong phân biệt vi khuẩn e coli và shigella — **Bảng ph** ụ 1 Tình trạng đột biến trong các trình tự 16S rDNA của vi khuẩn E. coli. Dòng đầu tiên là số RefSeq accession của các bộ gene E (Trang 15)

Hình 3. Các con số với các ký hiệu † và ‡ở phía trên bên phải tương ứng là khoảng cách gần nhất giữa một nhóm chỉ chứa các trình tự của - Ứng dụng trình tự 23s ribosomal dna trong phân biệt vi khuẩn e coli và shigella — **Hình 3.** Các con số với các ký hiệu † và ‡ở phía trên bên phải tương ứng là khoảng cách gần nhất giữa một nhóm chỉ chứa các trình tự của (Trang 27)

Bảng phụ 7 Khoảng cách giữa các trình tự 16S rDNA trong nhóm Gp16_2 ở Hình 3. Các chữ số E và S đứng trước số RefSeq accession tương - Ứng dụng trình tự 23s ribosomal dna trong phân biệt vi khuẩn e coli và shigella — **Bảng ph** ụ 7 Khoảng cách giữa các trình tự 16S rDNA trong nhóm Gp16_2 ở Hình 3. Các chữ số E và S đứng trước số RefSeq accession tương (Trang 29)

tự 23S trong Hình 4. Các nhóm Gp23_2, Gp23_3, Gp23_4 hay Gp23_7 chỉ chứa các trình tự của các vi khuẩn E - Ứng dụng trình tự 23s ribosomal dna trong phân biệt vi khuẩn e coli và shigella — t ự 23S trong Hình 4. Các nhóm Gp23_2, Gp23_3, Gp23_4 hay Gp23_7 chỉ chứa các trình tự của các vi khuẩn E (Trang 31)

TỪ KHÓA LIÊN QUAN