(Luận văn thạc sĩ) phân lập, nghiên cứu đặc điểm sinh học của một số chủng vi sinh vật có khả năng tạo màng sinh vật (biofilm) ở việt nam

THÔNG TIN TÀI LIỆU

Thông tin cơ bản

Định dạng
Số trang	79
Dung lượng	8,39 MB

Nội dung

4-342 Trường Đại học KHTN 68 Luận văn thạc sĩ Sinh học Trần Thúy Hằng PHỤ LỤC Bảng 1: Trình tự gen 16S rDNA chủng M3.8 CTCAGGACGA ACGCTGGCGG CGTGCCTAAT ACATGCAAGT CGAGCGGACC GACGGGAGCT TGCTCCGTTA GGTCAGCGGC GGACGGGTGA GTAACACGTG GGTAACCTGC CTGTAAGACT GGGATAACTC CGGGAAACCG GGGCTAATAC CGGATGCTTG ATTGAACCGC ATGGTTCAAT CATAAAAGGT GGCTTTTAGC TACCACTTAC AGATGGACCC GCGGCGCATT AGCTAGTTGG TGAGGTAACG GCTCACCAAG GCGACGATGC GTAGCCGACC TGAGAGGGTG ATCGGCCACA CTGGGACTGA GACACGGCCC AGACTCCTAC GGGAGGCAGC AGTAGGGAAT CTTCCGCAAT GGACGAAAGT CTGACGGAGC AACGCCGCGT GAGTGATGAA GGTTTTCGGA TCGTAAAACT CTGTTGTTAG GGAAGAACAA GTACCGTTCG AATAGGGCGG TACCTTGACG GTACCTAACC AGAAAGCCAC GGCTAACTAC GTGCCAGCAG CCGCGGTAAT ACGTAGGTGG CAAGCGTTGT CCGGAATTAT TGGGCGTAAA GCGCGCGCAG GCGGTTTCTT AAGTCTGATG TGAAAGCCCC CGGCTCAACC GGGGAGGGTC ATTGGAAACT GGGGAACTTG AGTGCAGAAG AGGAGAGTGG AATTCCACGT GTAGCGGTGA AATGCGTAGA GATGTGGAGG AACACCAGTG GCGAAGGCGA CTCTCTGGTC TGTAACTGAC GCTGAGGCGC GAAAGCGTGG GGAGCGAACA GGATTAGATA CCCTGGTAGT CCACGCCGTA AACGATGAGT GCTAAGTGTT AGAGGGTTTC CGCCCTTTAG TGCTGCAGCA AACGCATTAA GCACTCCGCC TGGGGAGTAC GGTCGCAAGA CTGAAACTCA AAGGAATTGA CGGGGGCCCG CACAAGCGGT GGAGCATGTG GTTTAATTCG AAGCAACGCG AAGAACCTTA CCAGGTCTTG ACATCCTCTG ACAACCCTAG AGATAGGGCT TCCCCTTCGG GGGCAGAGTG ACAGGTGGTG CATGGTTGTC GTCAGCTCGT GTCGTGAGAT GTTGGGTTAA GTCCCGCAAC GAGCGCAACC CTTGATCTTA GTTGCCAGCA TTCAGTTGGG CACTCTAAGG TGACTGCCGG TGACAAACCG GAGGAAGGTG GGGATGACGT CAAATCATCA TGCCCCTTAT GACCTGGGCT ACACACGTGC TACAATGGGC AGAACAAAGG GCAGCGAAGC CGCGAGGCTA AGCCAATCCC ACAAATCTGT TCTCAGTTCG GATCGCAGTC TGCAACTCGA CTGCGTGAAG CTGGAATCGC TAGTAATCGC GGATCAGCAT GCCGCGGTGA ATACGTTCCC GGGCCTTGTA CACACCGCCC GTCACACCAC GAGAGTTTGT AACACCCGAA GTCGGTGAGG TAACCTTTTG GAGCCAGCCG CC Trường Đại học KHTN 69 Luận văn thạc sĩ Sinh học Trần Thúy Hằng Bảng 2: Trình tự gen 16S rDNA chủng M4.9 CCTGGCTCAG GACGAACGCT GGCGGCGTGC CTAATACATG CAAGTCGAGC GGACCGACGG GAGCTTGCTC CCTTAGGTCA GCGGCGGACG GGTGAGTAAC ACGTGGGTAA CCTGCCTGTA AGACTGGGAT AACTCCGGGA AACCGGGGCT AATACCGGAT GCTTGATTGA ACCGCATGGT TCAATCATAA AAGGTGGCTT TTAGCTACCA CTTACAGATG GACCCGCGGC GCATTAGCTA GTTGGTGAGG TAACGGCTCA CCAAGGCGAC GATGCGTAGC CGACCTGAGA GGGTGATCGG CCACACTGGG ACTGAGACAC GGCCCAGACT CCTACGGGAG GCAGCAGTAG GGAATCTTCC GCAATGGACG AAAGTCTGAC GGAGCAACGC CGCGTGAGTG ATGAAGGTTT TCGGATCGTA AAACTCTGTT GTTAGGGAAG AACAAGTACC GTTCGAATAG GGCGGTACCT TGACGGTACC TAACCAGAAA GCCACGGCTA ACTACGTGCC AGCAGCCGCG GTAATACGTA GGTGGCAAGC GTTGTCCGGA ATTATTGGGC GTAAAGCGCG CGCAGGCGGT TTCTTAAGTC TGATGTGAAA GCCCCCGGCT CAACCGGGGA GGGTCATTGG AAACTGGGGA ACTTGAGTGC AGAAGAGGAG AGTGGAATTC CACGTGTAGC GGTGAAATGC GTAGAGATGT GGAGGAACAC CAGTGGCGAA GGCGACTCTC TGGTCTGTAA CTGACGCTGA GGCGCGAAAG CGTGGGGAGC GAACAGGATT AGATACCCTG GTAGTCCACG CCGTAAACGA TGAGTGCTAA GTGTTAGAGG GTTTCCGCCC TTTAGTGCTG CAGCAAACGC ATTAAGCACT CCGCCTGGGG AGTACGGTCG CAAGACTGAA ACTCAAAGGA ATTGACGGGG GCCCGCACAA GCGGTGGAGC ATGTGGTTTA ATTCGAAGCA ACGCGAAGAA CCTTACCAGG TCTTGACATC CTCTGACAAC CCTAGAGATA GGGCTTCCCC TTCGGGGGCA GAGTGACAGG TGGTGCATGG TTGTCGTCAG CTCGTGTCGT GAGATGTTGG GTTAAGTCCC GCAACGAGCG CAACCCTTGA TCTTAGTTGC CAGCATTCAG TTGGGCACTC TAAGGTGACT GCCGGTGACA AACCGGAGGA AGGTGGGGAT GACGTCAAAT CATCATGCCC CTTATGACCT GGGCTACACA CGTGCTACAA TGGGCAGAAC AAAGGGCAGC GAAGCCGCGA GGCTAAGCCA ATCCCACAAA TCTGTTCTCA GTTCGGATCG CAGTCTGCAA CTCGACTGCG TGAAGCTGGA ATCGCTAGTA ATCGCGGATC AGCATGCCGC GGTGAATACG TTCCCGGGCC TTGTACACAC CGCCCGTCAC ACCACGAGAG TTTGTAACAC CCGAAGTCGG TGAGGTAACC TTTTGGAGCC AGCCGCC Trường Đại học KHTN 70 Luận văn thạc sĩ Sinh học Trần Thúy Hằng Bảng 3: Trình tự gen 16S rDNA chủng U1.3 AGCGGCGGAC GGGTGAGTAA CACGTGGGTA ACCTGCCTGT AAGACTGGGA TAACTCCGGG AAACCGGGGC TAATACCGGA TGGTTGTTTG AACCGCATGG TTCAAACATA AAAGGTGGCT TCGGCTACCA CTTACAGATG GACCCGCGGC GCATTAGCTA GTTGGTGAGG TAATGGCTCA CCAAGGCAAC GATGCGTAGC CGACCTGAGA GGGTGATCGG CCACACTGGG ACTGAGACAC GGCCCAGACT CCTACGGGAG GCAGCAGTAG GGAATCTTCC GCAATGGACG AAAGTCTGAC GGAGCAACGC CGCGTGAGTG ATGAAGGTTT TCGGATCGTA AAGCTCTGTT GTTAGGGAAG AACAAGTACC GTTCGAATAG GGCGGTACCT TGACGGTACC TAACCAGAAA GCCACGGCTA ACTACGTGCC AGCAGCCGCG GTAATACGTA GGTGGCAAGC GTTGTCCGGA ATTATTGGGC GTAAAGGGCT CGCAGGCGGT TTCTTAAGTC TGATGTGAAA GCCCCCGGCT CAACCGGGGA GGGTCATTGG AAACTGGGGA ACTTGAGTGC AGAAGAGGAG AGTGGAATTC CACGTGTAGC GGTGAAATGC GTAGAGATGT GGAGGAACAC CAGTGGCGAA GGCGACTCTC TGGTCTGTAA CTGACGCTGA GGAGCGAAAG CGTGGGGAGC GAACAGGATT AGATACCCTG GTAGTCCACG CCGTAAACGA TGAGTGCTAA GTGTTAGGGG GTTTCCGCCC CTTAGTGCTG CAGCTAACGC ATTAAGCACT CCGCCTGGGG AGTACGGTCG CAAGACTGAA ACTCAAAGGA ATTGACGGGG GCCCGCACAA GCGGTGGAGC ATGTGGTTTA ATTCGAAGCA ACGCGAAGAA CCTTACCAGG TCTTGACATC CTCTGACAAT CCTAGAGATA GGACGTCCCC TTCGGGGGCA GAGTGACAGG TGGTGCATGG TTGTCGTCAG CTCGTGTCGT GAGATGTTGG GTTAAGTCCC GCAACGAGCG CAACCCTTGA TCTTAGTTGC CAGCATTCAG TTGGGCACTC TAAGGTGACT GCCGGTGACA AACCGGAGGA AGGTGGGGAT GACGTCAAAT CATCATGCCC CTTATGACCT GGGCTACACA CGTGCTACAA TGGACAGAAC AAAGGGCAGC GAAACCGCGA GGTTAAGCCA ATCCCACAAA TCTGTTCTCA GTTCGGATCG CAGTCTGCAA CTCGACTGCG TGAAGCTGGA ATCGCTAGTA ATCGCGGATC AGCATGCCGC GGTGAATACG TTCCCGGGCC TTGTACACAC CGCCCGTCAC ACCACGAGAG TTTGTAACAC CCGAAGTCGT TGAGGTAACC TTTTAGGAGC CAGCCGCCGA AGGTGGGACA GATGATTGGG GTGAAGTCGT Trường Đại học KHTN 71 Luận văn thạc sĩ Sinh học Trần Thúy Hằng Bảng 4: Trình tự gen 16S rDNA chủng U3.7 GCTCAGGACG AACGCTGGCG GCGTGCCTAA TACATGCAAG TCGAGCGGAC AGATGGGAGC TTGCTCCCTG ATGTTAGCGG CGGACGGGTG AGTAACACGT GGGTAACCTG CCTGTAAGAC TGGGATAACT CCGGGAAACC GGGGCTAATA CCGGATGGTT GTCTGAACCG CATGGTTCAG ACATAAAAGG TGGCTTCGGC TACCACTTAC AGATGGACCC GCGGCGCATT AGCTAGTTGG TGAGGTAACG GCTCACCAAG GCGACGATGC GTAGCCGACC TGAGAGGGTG ATCGGCCACA CTGGGACTGA GACACGGCCC AGACTCCTAC GGGAGGCAGC AGTAGGGAAT CTTCCGCAAT GGACGAAAGT CTGACGGAGC AACGCCGCGT GAGTGATGAA GGTTTTCGGA TCGTAAAGCT CTGTTGTTAG GGAAGAACAA GTGCCGTTCA AATAGGGCGG CACCTTGACG GTACCTAACC AGAAAGCCAC GGCTAACTAC GTGCCAGCAG CCGCGGTAAT ACGTAGGTGG CAAGCGTTGT CCGGAATTAT TGGGCGTAAA GGGCTCGCAG GCGGTTTCTT AAGTCTGATG TGAAAGCCCC CGGCTCAACC GGGGAGGGTC ATTGGAAACT GGGGAACTTG AGTGCAGAAG AGGAGAGTGG AATTCCACGT GTAGCGGTGA AATGCGTAGA GATGTGGAGG AACACCAGTG GCGAAGGCGA CTCTCTGGTC TGTAACTGAC GCTGAGGAGC GAAAGCGTGG GGAGCGAACA GGATTAGATA CCCTGGTAGT CCACGCCGTA AACGATGAGT GCTAAGTGTT AGGGGGTTTC CGCCCCTTAG TGCTGCAGCT AACGCATTAA GCACTCCGCC TGGGGAGTAC GGTCGCAAGA CTGAAACTCA AAGGAATTGA CGGGGGCCCG CACAAGCGGT GGAGCATGTG GTTTAATTCG AAGCAACGCG AAGAACCTTA CCAGGTCTTG ACATCCTCTG ACAATCCTAG AGATAGGACG TCCCCTTCGG GGGCAGAGTG ACAGGTGGTG CATGGTTGTC GTCAGCTCGT GTCGTGAGAT GTTGGGTTAA GTCCCGCAAC GAGCGCAACC CTTGATCTTA GTTGCCAGCA TTCAGTTGGG CACTCTAAGG TGACTGCCGG TGACAAACCG GAGGAAGGTG GGGATGACGT CAAATCATCA TGCCCCTTAT GACCTGGGCT ACACACGTGC TACAATGGAC AGAACAAAGG GCAGCGAAAC CGCGAGGTTA AGCCAATCCC ACAAATCTGT TCTCAGTTCG GATCGCAGTC TGCAACTCGA CTGCGTGAAG CTGGAATCGC TAGTAATCGC GGATCAGCAT GCCGCGGTGA ATACGTTCCC GGGCCTTGTA CACACCGCCC GTCACACCAC GAGAGTTTGT AACACCCGAA GTCGGTGAGG TAACCTTTAT GGAGCCAGCC GCCGAAGGTG Trường Đại học KHTN 72 ... AACACCCGAA GTCGGTGAGG TAACCTTTTG GAGCCAGCCG CC Trường Đại học KHTN 69 Luận văn thạc sĩ Sinh học Trần Thúy Hằng Bảng 2: Trình tự gen 16S rDNA chủng M4.9 CCTGGCTCAG GACGAACGCT GGCGGCGTGC CTAATACATG... TTTGTAACAC CCGAAGTCGG TGAGGTAACC TTTTGGAGCC AGCCGCC Trường Đại học KHTN 70 Luận văn thạc sĩ Sinh học Trần Thúy Hằng Bảng 3: Trình tự gen 16S rDNA chủng U1.3 AGCGGCGGAC GGGTGAGTAA CACGTGGGTA ACCTGCCTGT... CAGCCGCCGA AGGTGGGACA GATGATTGGG GTGAAGTCGT Trường Đại học KHTN 71 Luận văn thạc sĩ Sinh học Trần Thúy Hằng Bảng 4: Trình tự gen 16S rDNA chủng U3.7 GCTCAGGACG AACGCTGGCG GCGTGCCTAA TACATGCAAG

Ngày đăng: 06/12/2020, 11:57

Nguồn tham khảo

Tài liệu tham khảo

Loại

Chi tiết

1. Nguyễn Lân Dũng, Nguyễn Đình Quyến, Phạm Văn Ty (2002), Vi sinh vật học, Nxb Giáo dục, Hà Nội

Sách, tạp chí

Tiêu đề:	Vi sinh vật học
Tác giả:	Nguyễn Lân Dũng, Nguyễn Đình Quyến, Phạm Văn Ty
Nhà XB:	Nxb Giáo dục
Năm:	2002

3. Vũ Thị Minh Đức (2001), Thực tập vi sinh vật học, Nxb Đại học Quốc Gia, Hà Nội.Tài liệu tiếng Anh

Sách, tạp chí

Tiêu đề:	Thực tập vi sinh vật học
Tác giả:	Vũ Thị Minh Đức
Nhà XB:	Nxb Đại học Quốc Gia
Năm:	2001

4. Allison D. G., Gilbert P., Wilson M. (2000), Community ctructure and co-operation in biofilms, Cambridge University Press, Cambridge, England

Sách, tạp chí

Tiêu đề:	Community ctructure and co-operation in biofilms
Tác giả:	Allison D. G., Gilbert P., Wilson M
Năm:	2000

5. Bais H. P., Fall R., Vivanco J. M. (2004), “Biocontrol of Bacillus subtilis against infection of arabidopsis roots by Pseudomonas syringae is facilitated by biofilm formation and surfactin production”, Plant Physiology, 134(1), pp. 307-319

Sách, tạp chí

Tiêu đề:	Biocontrol of "Bacillus subtilis" against infection of arabidopsis roots by "Pseudomonas syringae" is facilitated by biofilm formation and surfactin production”, "Plant Physiology
Tác giả:	Bais H. P., Fall R., Vivanco J. M
Năm:	2004

6. Banat I. M. (1995), “Characterization of biosurfactants and their use in pollution removal-state of the art”, Acta biotechnologica, 15, pp. 251-267

Sách, tạp chí

Tiêu đề:	Characterization of biosurfactants and their use in pollution removal-state of the art”, "Acta biotechnologica
Tác giả:	Banat I. M
Năm:	1995

7. Bendinger B., Rijnaarts H. H. M., Altendorf K., Zehnder A. J. B. (1993), “Physicochemical cell surface and adhesive properties of coryneform bacteria related to the presence and chain length of mycolic acids”, Applied and Environmental Microbiology, 59, pp. 3973-3977

Sách, tạp chí

Tiêu đề:	Physicochemical cell surface and adhesive properties of coryneform bacteria related to the presence and chain length of mycolic acids”, "Applied and Environmental Microbiology
Tác giả:	Bendinger B., Rijnaarts H. H. M., Altendorf K., Zehnder A. J. B
Năm:	1993

8. Beveridge T. J., Makin S. A., Kadurugamuwa J. L., Li Z. (1997), “Interactions between biofilms and the environment”, FEMS Microbiology Reviews, 20, pp. 291-303

Sách, tạp chí

Tiêu đề:	Interactions between biofilms and the environment”, "FEMS Microbiology Reviews
Tác giả:	Beveridge T. J., Makin S. A., Kadurugamuwa J. L., Li Z
Năm:	1997

9. Boyd A., Chakrabarty A. M. (1994), “Role of alginate lyase in cell detachment of Pseudomonas aeruginosa”, Applied and Environmental Microbiology, 60, pp. 2355-2359

Sách, tạp chí

Tiêu đề:	Role of alginate lyase in cell detachment of "Pseudomonas aeruginosa"”, "Applied and Environmental Microbiology
Tác giả:	Boyd A., Chakrabarty A. M
Năm:	1994

10. Brading M. G., Jass J., Lappin-Scott H. M. (1995), “Dynamics of bacterial biofilm formation”, Microbial biofilms, Cambridge University Press, Cambridge, pp. 46-63

Sách, tạp chí

Tiêu đề:	Dynamics of bacterial biofilm formation”, "Microbial biofilms
Tác giả:	Brading M. G., Jass J., Lappin-Scott H. M
Năm:	1995

11. Brooks W., Demuth D. R., Gil S., Lamont R. J. (1997), “Identification of a Streptococcus gordonii SspB domain that mediates adhesion to Porphyromonas gingivalis”, Infection and Immunity, 65, pp. 3753-3758

Sách, tạp chí

Tiêu đề:	Identification of a "Streptococcus gordonii" SspB domain that mediates adhesion to "Porphyromonas gingivalis"”, "Infection and Immunity
Tác giả:	Brooks W., Demuth D. R., Gil S., Lamont R. J
Năm:	1997

12. Characklis W. G. (1990), “Biofilm processes”, Biofilms, Wiley-Interscience, New York, pp. 195-231

Sách, tạp chí

Tiêu đề:	Biofilm processes”, "Biofilms
Tác giả:	Characklis W. G
Năm:	1990

13. Characklis W. G., Marshall K. C. (1990), “Biofilms: a basis for an interdisciplinary approach”, Biofilms, John Wiley & Sons, New York, pp. 3-15

Sách, tạp chí

Tiêu đề:	Biofilms: a basis for an interdisciplinary approach”, "Biofilms
Tác giả:	Characklis W. G., Marshall K. C
Năm:	1990

14. Costerton J. W., Geesey G. G., Cheng K. J. (1978), “How bacteria stick”, Scientific American, 238(1), pp. 86-95

Sách, tạp chí

Tiêu đề:	How bacteria stick”, "Scientific American
Tác giả:	Costerton J. W., Geesey G. G., Cheng K. J
Năm:	1978

15. Costerton J. W., Ingram J. M., Cheng K. J. (1974), “Structure and function of the cell envelope of gram-negative bacteria”, Bacteriological Reviews, 38(1), pp. 87-110

Sách, tạp chí

Tiêu đề:	Structure and function of the cell envelope of gram-negative bacteria”, "Bacteriological Reviews
Tác giả:	Costerton J. W., Ingram J. M., Cheng K. J
Năm:	1974

16. Costerton J. W., Lewandowski Z., Caldwell D. E., Korber D. R., Lappin-Scott H. M. (1995), “Microbial biofilms”, Annual Review of Microbiology, 49, pp. 711-745

Sách, tạp chí

Tiêu đề:	Microbial biofilms”, "Annual Review of Microbiology
Tác giả:	Costerton J. W., Lewandowski Z., Caldwell D. E., Korber D. R., Lappin-Scott H. M
Năm:	1995

17. Cowan M. M., Warren T. M., Fletcher M. (1991), “Mixed species colonization of solid surfaces in laboratory biofilms”, Biofouling, 3, pp. 23-34

Sách, tạp chí

Tiêu đề:	Mixed species colonization of solid surfaces in laboratory biofilms”, "Biofouling
Tác giả:	Cowan M. M., Warren T. M., Fletcher M
Năm:	1991

18. Czaczyk K., Myszka K. (2007), “Biosynthesis of extracellular polymeric substances (EPS) and its role in microbial biofilm formation”, Polish Journal of Environmental Studies, 16(6), pp. 799-806

Sách, tạp chí

Tiêu đề:	Biosynthesis of extracellular polymeric substances (EPS) and its role in microbial biofilm formation”, "Polish Journal of Environmental Studies
Tác giả:	Czaczyk K., Myszka K
Năm:	2007

19. Davey M. E., O'toole G. A. (2000), “Microbial biofilms: from ecology to molecular genetics”, Microbiology and Molecular Biology Reviews, 64(B), pp. 847-867

Sách, tạp chí

Tiêu đề:	Microbial biofilms: from ecology to molecular genetics”, "Microbiology and Molecular Biology Reviews
Tác giả:	Davey M. E., O'toole G. A
Năm:	2000

20. Davies D. G., Parsek M. R., Pearson J. P., Iglewski B. H., Costerton J. W., Greenberg E. P. (1998), “The involvement of cell-to-cell signals in the development of a bacterial biofilm”, Science, 280, pp. 295-298

Sách, tạp chí

Tiêu đề:	The involvement of cell-to-cell signals in the development of a bacterial biofilm”, "Science
Tác giả:	Davies D. G., Parsek M. R., Pearson J. P., Iglewski B. H., Costerton J. W., Greenberg E. P
Năm:	1998

21. De Angelis M., Siragusa S., Berloco M., Caputo L., Settanni L., Alfonsi G., Amerio M., Grandi A., Gobbetti M. (2006), “Selection of potential probiotic lactobacilli from pig feces to be used as additives in pelleted feeding”, Research in Microbiology, 157, pp. 792-801

Sách, tạp chí

Tiêu đề:	Selection of potential probiotic" lactobacilli" from pig feces to be used as additives in pelleted feeding”, "Research in Microbiology
Tác giả:	De Angelis M., Siragusa S., Berloco M., Caputo L., Settanni L., Alfonsi G., Amerio M., Grandi A., Gobbetti M
Năm:	2006