Phân lập vi khuẩn tổng hợp enzyme agarase từ nước biển và xác định hoạt tính của enzyme

9 23 0
Phân lập vi khuẩn tổng hợp enzyme agarase từ nước biển và xác định hoạt tính của enzyme

Đang tải... (xem toàn văn)

Thông tin tài liệu

Nghiên cứu này nhằm mục tiêu phân lập vi khuẩn có khả năng tổng hợp enzyme agarase từ nước biển và xác định hoạt tính của enzyme. Từ 8 mẫu nước biển thu thập tại các địa điểm khác nhau ở tỉnh Bà Rịa – Vũng Tàu. Mời các bạn tham khảo!

50 Trường Đại học Nơng Lâm TP Hồ Chí Minh Isolation of agarase-producing bacteria from seawater and examination of the enzyme activity Lien T H Nguyen, Phong V Nguyen, & Thanh T L Bien∗ Department of Biotechnology, Nong Lam University, Ho Chi Minh City, Vietnam ARTICLE INFO Research Paper Received: September 20, 2019 Revised: December 17, 2019 Accepted: January 16, 2020 Keywords Agarase Agarolytic bacteria Reducing sugar Seaweed Seawater ∗ Corresponding author Bien Thi Lan Thanh Email: bienthilanthanh@hcmuaf.edu.vn ABSTRACT This study aimed to isolate agarase-producing bacteria from seawater, and then determine activity of the agarase Eight coastal surface seawater samples were collected from Ba Ria Vung Tau province Twenty-one bacterial strains that are capable of liquefying agar were isolated These isolates produced disintegration zones around their colonies on agar plates with diameters ranging from 4.0 to 7.0 cm after an incubation period of days at room temperature Five bacterial strains (M1, M5, M7, M62B, and M71) that produced large halos on plates were identified belonging to Vibrio genus with identity > 96% The crude enzyme activities of these strains ranged from 0.15 to 0.22 U/mL in reaction with agarose as substrate Among isolated strains, the strain M71 showed the highest agarase activity, and was used to examine the degradation of seaweed The hydrolysis of dried Gracilaria seaweed by the crude enzyme of M71 at concentration of 5% (v/v) released 915 µM/mL reducing sugar after a 24-h incubation period at 40o C Cited as: Nguyen, L T H., Nguyen, P V., & Bien, T T L (2020) Isolation of agarase-producing bacteria from seawater and examination of the enzyme activity The Journal of Agriculture and Development 19(2), 50-58 Tạp chí Nơng nghiệp Phát triển 19(2) www.jad.hcmuaf.edu.vn 51 Trường Đại học Nơng Lâm TP Hồ Chí Minh Phân lập vi khuẩn tổng hợp enzyme agarase từ nước biển xác định hoạt tính enzyme Nguyễn Thị Hồng Liên, Nguyễn Vũ Phong & Biện Thị Lan Thanh∗ Bộ Môn Công Nghệ Sinh Học, Trường Đại Học Nông Lâm TP.HCM, TP Hồ Chí Minh THƠNG TIN BÀI BÁO TĨM TẮT Bài báo khoa học Nghiên cứu nhằm mục tiêu phân lập vi khuẩn có khả tổng hợp enzyme agarase từ nước biển xác định hoạt tính enzyme Từ mẫu nước biển thu thập địa điểm khác tỉnh Bà Rịa – Vũng Tàu, phân phập 21 chủng vi khuẩn có khả phân giải agar đĩa thạch với đường kính vịng phân giải dao động từ 4,0 đến 7,0 cm sau ngày ủ nhiệt độ phòng Năm chủng vi khuẩn (M1, M5, M7, M62B, M71) tạo đường kính vịng phân giải lớn có hoạt độ enzyme agarase thô xác định khoảng 0,15 – 0,22 U/mL phản ứng với chất agarose, có trình tự 16S rDNA tương đồng (> 96%) với chi Vibrio Trong đó, chủng vi khuẩn M71 có hoạt tính agarase cao dùng để đánh giá khả phân giải rong biển Sự thủy phân rong đỏ Gracilaria dịch enzyme thô chủng M71 nồng độ 5% (v/v) giải phóng 915 µM/mL đường khử sau 24 ủ 40o C Ngày nhận: 20/09/2019 Ngày chỉnh sửa: 17/12/2019 Ngày chấp nhận: 16/01/2020 Từ khóa Agarase Đường khử Nước biển Rong biển Vi khuẩn phân giải agar ∗ Tác giả liên hệ Biện Thị Lan Thanh Email: bienthilanthanh@hcmuaf.edu.vn lên men sản xuất ethanol từ sinh khối rong biển gồm hai giai đoạn chính: thủy phân nguyên liệu Việt Nam có vùng biển nhiệt đới với bờ biển (đường hóa) lên men Thủy phân q trình dài 3.260 km, diện tích mặt nước khoảng triệu chuyển hóa nguyên liệu thành sản phẩm trung km2 , với đa dạng loài thủy sinh vật Một gian tan oligosaccharide đường nguồn tài nguyên phong phú đa đơn Lên men q trình chuyển hóa sản dạng vùng biển nước ta rong biển Tại Việt phẩm trung gian đường đơn thành ethanol Nam, xác định 800 loài rong biển thuộc nấm men (Yanagisawa & ctv., 2013) ngành: ngành rong đỏ (Rhodophyta) chiếm Thủy phân nguyên liệu bước 400 loài, ngành rong lục (Chlorophyta) chiếm 180 quan trọng sản xuất ethanol Theo truyền loài, ngành rong nâu (Phaeophyta) 140 lồi thống, agar thủy phân nhiệt ngành rong lam (Cyanophyta) gần 100 lồi acid lỗng Tuy nhiên, hai phương pháp (Nguyen & ctv., 1993) Rong biển chứa hàm lượng thường khơng an tồn sử dụng acid nhiệt carbohydrate cao khoảng 50 - 60% khối lượng khô độ cao, không đạt hiệu thủy phân cao không chứa lignin nên dễ thủy phân Phương pháp thủy phân sinh học (sử dụng thành dạng đường đơn dễ lên men (Rioux enzyme agarase) chứng minh an toàn & Turgeon, 2015) Trong đó, agar dạng cho hiệu suất thủy phân cao (Kawaroe & ctv., polysaccharide phổ biến thành phần 2017) rong đỏ Agar có cấu trúc polymer Enzyme agarase chia thành hai nhóm galactose chuyển thành đường galactose α-agarase (E.C 3.2.1.158) β-agarase (E.C 3,6-anhydrogalactose (Usov, 2011) Quá trình 3.2.1.81) dựa vào vị trí phân tách Agarase Đặt Vấn Đề www.jad.hcmuaf.edu.vn Tạp chí Nơng nghiệp Phát triển 19(2) 52 Trường Đại học Nông Lâm TP Hồ Chí Minh ứng dụng rộng rãi cơng nghiệp thực phẩm, mỹ phẩm y học khả tạo oligosaccharides giá trị (Fu & Kim, 2010) Lựa chọn nguồn enzyme agarsase có hoạt tính cao rút ngắn thời gian tăng hiệu thủy phân, làm tăng hiệu suất trình lên men Do đó, đề tài thực nhằm mục đích phân lập, tuyển chọn xác định hoạt tính chủng vi khuẩn có khả sản xuất enzyme agarase từ nước biển để ứng dụng sản xuất ethanol từ rong biển rine broth nhiệt độ phịng Hút 10 µL dịch vi khuẩn nhỏ vào bề mặt môi trường Marine agar ủ nhiệt độ phòng ngày Sau ủ, đĩa nhuộm với dung dịch Lugol iodine 10 phút quan sát vòng phân giải agar (vòng sáng hình thành tối thuốc nhuộm) xung quanh khuẩn lạc (Agbo & Moss, 1979) Vòng phân giải agar (A) xác định theo công thức: A (cm) = D – d, D đường kính vịng sáng d nhỏ đường kính khuẩn lạc Vật Liệu Phương Pháp Nghiên Cứu 2.5 Định danh chủng vi khuẩn có khả phân giải agar mạnh 2.1 Thu mẫu nước biển Tám mẫu nước biển thu địa điểm khác xã Phước Tĩnh (3 mẫu) thị trấn Long Hải (5 mẫu), tỉnh Bà Rịa – Vũng Tàu Mẫu nước biển thu cách bề mặt khoảng cm, chứa chai nhựa sạch, trữ lạnh (< 10o C) phân tích vịng 24 2.2 Tăng sinh vi khuẩn Môi trường tăng sinh sử dụng 100 mL nước biển có bổ sung 0,1% (w/v) agar (Agbo & Moss, 1979) chai thủy tinh 250 mL hấp khử trùng 121o C 15 phút Một mL nước biển mẫu ủ chai mơi trường nhiệt độ phịng ngày 2.3 Phân lập vi khuẩn phân giải agar Các chủng vi khuẩn có đường kính vịng phân giải lớn đĩa thạch chọn để định danh cách giải trình tự vùng gene 16S rRNA DNA tổng số vi khuẩn ly trích với GeneJET Genomic DNA Purification Kit (Thermo Scientific) theo hướng dẫn nhà sản xuất Đoạn gene 16S rRNA khuếch đại PCR với cặp primer 27F (5’ -AGAGTTTGATCCTGGCTCAG-3’ ) 1492R (5’ -GGTTACCTTGTTACGACTT-3’ ) (Lane, 1991) Thành phần phản ứng (50 µL) gồm: µL NH4 Reaction Buffer 10Ö, µL primer 0,5 mM, µL MgCl2 , 0,5 µL dNTP Mix 100 mM, µL BIOTAQ, µL DNA mẫu 36,5 µL nước cất khử trùng PCR thực máy Thermal Cycler 2720 (Applied Biosystems➋ ) với chu trình nhiệt: tiền biến tính 94o C phút, sau 35 chu kì bao gồm 94o C 30 giây, 55o C 30 giây, 72o C phút Sản phẩm PCR (khoảng 1.500 bp) kiểm tra cách điện di gel agarose 1,5% giải tự Công ty Cổ phần Kỹ thuật Sinh học ứng dụng Việt Nam Trình tự 16S rDNA chủng vi khuẩn tuyển chọn sau so sánh độ tương đồng với trình tự biết ngân hàng gene (http://blast.ncbi.nlm.nih.gov/Blast.cgi) Dịch tăng sinh vi khuẩn pha loãng thành dãy nồng độ 10−1 đến 10−3 Sau đó, 0,1 mL dung dịch nồng độ cấy trãi đĩa môi trường ZoBell Marine agar (Himedia, India), nồng độ cấy đĩa, ủ nhiệt độ phịng ngày Các khuẩn lạc có khả hóa lỏng (làm mềm) agar đĩa thạch chọn lọc, làm nhuộm Gram quan sát hình dạng tế bào kính hiển vi Các chủng vi khuẩn phân lập bảo quản glycerol 20% trữ -20o C 2.6 Xác định hoạt độ enzyme agarase cho thí nghiệp Hoạt độ enzyme agarase chủng vi 2.4 Khảo sát hoạt tính phân giải agar khuẩn tuyển chọn xác định thông qua lượng chủng vi khuẩn phân lập đường khử giải phóng phản ứng với chất agarose (Faturrahman & ctv., 2011) Vi Khả phân giải agar chủng vi khuẩn tăng sinh ngày môi trường khuẩn phân lập xác định dựa vào đường Marine broth sau ly tâm 8500 Ưg, 4o C kính vịng phân giải agar đĩa thạch Vi khuẩn 20 phút để loại bỏ tế bào Hút mL dịch tăng sinh qua đêm môi trường Ma- sau ly tâm (dịch enzyme thơ) trộn với mL Tạp chí Nơng nghiệp Phát triển 19(2) www.jad.hcmuaf.edu.vn Trường Đại học Nông Lâm TP Hồ Chí Minh dung dịch agarose 0,2% (w/v, pha với dung dịch đệm Tris-HCl 50 mM, pH 7,0) mL dung dịch Tris-HCl 50 mM (pH 7,0), ủ 40o C 15 phút Lượng đường khử giải phóng sau phản ứng xác định phương pháp 3,5dinitrosalicylic acid (DNS) dựa vào đường chuẩn glucose (Miller, 1959) Hoạt độ enzyme agarase (U) xác định lượng enzyme cần thiết để giải phóng µM đường khử phản ứng với chất agarose phút thể với đơn vị U/mL chất 2.7 Đánh giá khả thủy phân rong biển enzyme agarase từ vi khuẩn Chủng vi khuẩn sinh enzyme agarase có hoạt độ cao chọn để đánh giá khả thủy phân rong biển theo phương pháp (Kawaroe & ctv., 2014) Dịch enzyme thô từ vi khuẩn sau ngày tăng sinh môi trường Marine broth thu nhận cách ly tâm loại bỏ tế bào Cơ chất rong đỏ Gracilaria sp khô xay mịn thêm 100 mL dung dịch đệm hấp 121o C 15 phút Sau làm nguội, dung dịch chất bổ sung dịch enzyme agarase thô nồng độ 5%, 10% 15% (v/v) ủ 40o C 24 Lượng đường khử giải phóng sau phản ứng xác định phương pháp DNS với đường chuẩn glucose (Miller, 1959) 53 Hình Các vi khuẩn phân giải agar sau ngày phân lập môi trường Marine agar A: khuẩn lạc vi khuẩn, B: agar xung quanh khuẩn lạc bị hóa lỏng/làm mềm Agar polysaccharide sản xuất hầu hết loại tảo/rong đỏ mơi trường biển, có xuất vi khuẩn phân giải agar (Zhang & Kim, 2008) Vi khuẩn phân giải agar vi khuẩn sử dụng agar nguồn carbon lượng Trước đây, có nhiều nghiên cứu chứng minh vi khuẩn phân giải agar phân lập từ môi trường biển (Oh & ctv., 2010; Thulasidas, 2012; Liu & ctv., 2019) Kết phù hợp với công bố trước Kolhatkar & Sambrani (2018), ba chủng vi khuẩn phân giải agar có khuẩn lạc có màu trắng ngà vàng nhạt, có tế bào hình que dấu phẩy 2.8 Phân tích số liệu phân lập từ mẫu nước biển Arabian Tất thí nghiệm lặp lại ba lần Các chủng vi khuẩn xác định Alvà kết biểu diễn dạng trung bình độ teromonas marina SW-47(T), Vibrio alginolytilệch chuẩn (➧ SD) Các số liệu phân tích cus Pseudomonas stutzeri Tương tự, González phần mềm Minitab 16 Excel 2013 Sự & ctv (2018) phân lập chủng khác biệt trung bình phân tích one- phẩy khuẩn sinh agarase gồm V neocaledonicus way ANOVA trắc nghiệm phân hạng Duncan V azureus từ tảo biển Ulva lactuca mức ý nghĩa α = 0,05 Kết Quả Thảo Luận 3.2 Hoạt tính phân giải agar chủng vi khuẩn phân lập Trên môi trường thạch, vi khuẩn sinh enzyme agarase phân giải agar xung quanh khuẩn lạc thành oligosaccharide đường DHai mươi mốt khuẩn lạc có khả phân hóa galactose Do vùng agar xung quanh khuẩn lạc lỏng/làm mềm agar đĩa thạch (Hình 1) phân lập từ tám mẫu nước biển thu thập bị mềm hóa lỏng lõm xuống, khơng vùng biển xã Phước Tĩnh thị trấn Long bắt màu nâu nhuộm với dung dịch Lugol tạo vùng sáng (Agbo & Moss, 1979) (Hình 2) Vịng Hải, tỉnh Bà Rịa – Vũng Tàu Các vi khuẩn phân sáng lớn chứng tỏ khả phân giải agar lập có khuẩn lạc màu trắng đục, trắng ngà vi khuẩn mạnh vàng nhạt, bờ đều, tế bào có hình ovan, que ngắn Sau ngày ủ môi trường Marine agar que cong vi khuẩn Gram âm (Bảng nhuôm với dung dịch Lugol, đường kính vịng 1) 3.1 Kết phân lập vi khuẩn phân giải agar www.jad.hcmuaf.edu.vn Tạp chí Nơng nghiệp Phát triển 19(2) 54 Trường Đại học Nông Lâm TP Hồ Chí Minh Bảng Đặc điểm dòng vi khuẩn phân giải agar phân lập từ nước biển STT 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21 Kí hiệu chủng M1 M2 M3 M4 M5 M6 M7 M8 M9 M10 M11 M12 M13 M14 M61 M62A M62B M71 M72 M82A M82B Nơi phân lập Phước Tĩnh Phước Tĩnh Long Hải Long Hải Phước Tĩnh Long Hải Long Hải Phước Tĩnh Phước Tĩnh Phước Tĩnh Long Hải Long Hải Long Hải Long Hải Phước Tĩnh Phước Tĩnh Phước Tĩnh Long Hải Long Hải Phước Tĩnh Phước Tĩnh Đặc điểm khuẩn lạc Trắng ngà Trắng ngà Trắng ngà Trắng ngà Trắng ngà Trắng ngà Trắng ngà Trắng ngà Trắng ngà Trắng ngà Trắng đục Trắng đục Trắng đục Trắng đục Vàng nhạt Vàng nhạt Vàng nhạt Vàng nhạt Vàng nhạt Vàng nhạt Vàng nhạt Gram - Hình dạng tế bào Hình que cong Hình que cong Hình que cong Hình que Hình que cong Hình que Hình que cong Hình ovan Hình que cong Hình ovan Hình que cong Hình que cong Hình ovan Hình ovan Hình que cong Hình que cong Hình que cong Hình que cong Hình que Hình ovan Hình que cong donicus Vibrio azureus từ rong biển (González & ctv., 2018) Pseudomonas stutzeri từ nước biển (Kolhatkar & Sambrani, 2018) Hình Các vi khuẩn phân giải agar đĩa môi trường trước nhuộm (A) sau nhuộm (B) với dung dịch Lugol a khuẩn lạc vi khuẩn b vòng phân giải agar phân giải agar 21 chủng vi khuẩn phân lập xác định dao động khoảng – cm (Hình 3) Trong đó, chủng vi khuẩn kí hiệu M1, M5, M7, M8, M61, M62B, M71, M72, and M82A có đường kính vịng phân giải agar lớn (7 cm) Việc khảo sát hoạt tính agarase thơng qua vòng phân giải agar đĩa thạch sử dụng trước Vibrio sp F-6 phân lập từ nước biển (Fu & ctv., 2008), Micrococcus sp GNUM-08124 từ rong biển Hình Đường kính vịng phân giải agar 21 (Choi & ctv., 2011), Flammeovirga sp MY04 từ chủng vi khuẩn phân lập sau ngày mơi trường trầm tích biển (Han & ctv., 2012), V neocale- Marine agar Tạp chí Nơng nghiệp Phát triển 19(2) www.jad.hcmuaf.edu.vn Trường Đại học Nông Lâm TP Hồ Chí Minh 55 3.3 Định danh chủng vi khuẩn có hoạt tính phân giải agar mạnh Năm chủng vi khuẩn có hoạt tính phân giải agar mạnh (M1, M5, M7, M62B M71) chọn để định danh cách giải trình tự vùng gene 16S rRNA so sánh độ tương đồng với trình tự biết ngân hàng gene (Bảng 2) Kết cho thấy chủng vi khuẩn phân giải agar tuyển chọn tương đồng > 96% với chi Vibrio Theo Farmer & Hickman-Brenner (1992), vi khuẩn thuôc chi Vibrio vi khuẩn Gram âm, hình que ngắn que cong, có mặt khắp nơi mơi trường biển Mặc dù vi khuẩn Vibrio spp gây bệnh cho người, động vật sinh vật biển; nhiên có giới hạn số lồi V cholerae, V anguillarum, V harveyi V ordali biết gây bệnh phổ biến (Janda & ctv., 2015) Các lồi Vibrio chứng minh sản xuất nhiều hợp chất ngoại bào có hoạt tính sinh học có agarase, ứng dụng cơng nghiệp thực phẩm, dược phẩm, môi trường sản xuất nhiên liệu sinh học (Fu & Kim, 2010; Mansson & ctv., 2011) Đã có nhiều cơng bố diện vi khuẩn Vibrio sinh agarase từ môi trường biển nước biển (Macián & ctv., 2001; Fu & ctv., 2008), trầm tích (Saravanan & ctv., 2015) bề mặt loại rong biển (Lavilla-Pitogo, 1992; González & ctv., 2018) Hình Lượng đường khử tạo phản ứng với agarose (bar) hoạt độ enzyme agarase (line) chủng vi khuẩn tuyển chọn *thể khác biệt có ý nghĩa (P < 0,05) U/mL Zeng & ctv (2016) báo cáo vi khuẩn Thalassospira profundimonas phân lập từ nước biển Trung Quốc sinh enzyme β-agarase có hoạt độ 0,84 U/mL cho phản ứng với agarose 0,2% 45o C 30 phút Tương tự, hoạt độ agarase vi khuẩn khác phân lập từ môi trường xác định Agarivorans albus YKW-34 (khoảng 1,0 U/mL) (Fu & ctv., 2008), Alteromonas sp SY37-12 (1,8 U/mL) (Wang & ctv., 2006), Vibrio sp QJH-12 (1,72 U/mL) (Wang & ctv., 2004) Như vậy, thấy vi khuẩn phân lập từ nguồn khác nhau, nuôi cấy phản ứng với chất điều kiện 3.4 Hoạt độ enzyme agarase chủng vi khác sinh enzyme agarase có hoạt độ khác khuẩn tuyển chọn Theo Chi & ctv (2012), vi khuẩn sinh enzyme agarase thủy phân chất agarose tạo thành đường đơn Do đó, hoạt tính enzyme agarase định thơng qua lượng đường khử giải phóng cho enzyme phản ứng với chất agarose (Faturrahman & ctv., 2011) Sau phản ứng dịch enzyme thô chủng vi khuẩn tuyển chọn (M1, M5, M7, M62B M71) với agarose 0,2% 15 phút 40o C, lượng đường khử giải phóng dao động khoảng 0,75 – 1,09 µM/mL tương ứng với hoạt độ enzyme 0,15 – 0,22 U/mL (Hình 4) Trong đó, chủng M71 cho enzyme agarase có hoạt độ cao khác biệt có ý nghĩa (P < 0,05) so với chủng lại 3.5 Khả thủy phân rong biển chủng vi khuẩn tuyển chọn Chủng vi khuẩn M71 (V alginolyticus strain YTUY6) có hoạt độ enzyme agarase cao chọn để đánh giá khả thủy phân rong đỏ Gracilaria sp với nồng độ enzyme sử dụng - 15% (v/v) Kết Hình cho thấy, sau 24 ủ 40o C, lượng đường khử giải phóng cao (915 ➭M/mL) với nồng độ enzyme 5% Khi tăng nồng độ enzyme lượng đường khử sinh giảm Kết tương tự với công bố Kawaroe & ctv (2014) sử dụng dịch enzyme agarase thô vi khuẩn Pseudomonas Trước đây, Saravanan & ctv (2015) tinh stutzeri thủy phân rong Gelidium sp Nồng độ ensạch phần enzyme agarase vi khuẩn Vib- zyme thích hợp cho thủy phân xác định rio sp phân lập từ nước biển Pondicherry (Ấn 10% (v/v), tăng nồng độ enzyme lên 15 Độ), cho phản ứng với chất agar 0,5% – 20% lượng đường khử tạo giảm 30 phút 33o C hoạt độ enzyme đạt 29,7 Điều giải thích enzyme www.jad.hcmuaf.edu.vn Tạp chí Nơng nghiệp Phát triển 19(2) 56 Trường Đại học Nông Lâm TP Hồ Chí Minh Bảng Kết định danh chủng vi khuẩn tuyển chọn Kí hiệu vi khuẩn M1 M5 M7 M62B M71 Loài xác định Vibrio Vibrio Vibrio Vibrio Vibrio neocaledonicus strain CGJ02-2 sp strain ZQM2017 alginolyticus strain Xmb044 sp strain 201707CJKOP-Y165 sp TKA 17 chất hoạt động tối ưu nồng độ thích hợp, tăng enzyme chất không làm tăng hiệu mà ức chế phản ứng (Robinson, 2015) Độ tương đồng (%) 97,77 97,43 98,11 97,67 96,01 Số hiệu (Assession number) CP032213.1 MG772935.1 KT986170.1 MG593729.1 LC385612.1 lượng lớn carbohydrate dễ phân hủy sử dụng nguyên liệu sản xuất ethanol sinh học (Kumar & ctv., 2013) Do đó, kết cho thấy chủng vi khuẩn M71 có tiềm phân giải agar thành tế bào rong đỏ Cần tinh enzyme agarase tối ưu điều kiện nuôi cấy phản ứng để tăng hoạt tính enzyme agarase chủng M71 Kết Luận Từ mẫu nước biển thu thập tỉnh Bà Rịa – Vũng Tàu tuyển chọn chủng vi khuẩn phân giải agar mạnh với đường kính vịng phân giải 7,0 cm, có hoạt độ enzyme agarase thơ dao động 0,15 – 0,22 U/mL thuộc chi Vibrio với độ tương đồng > 96% Trong đó, enzyme agarase thơ từ chủng vi khuẩn kí hiệu M71 nồng độ 5% (v/v) có khả thủy phân rong Hình Lượng đường khử giải phóng ủ rong Gracilaria giải phóng 915 µM/mL đường khử sau Gracilaria với dịch enzyme agarase thô chủng vi 24 phản ứng khuẩn M71 *thể khác biệt có ý nghĩa (P < 0,05) Hoạt tính phân giải agar chủng vi khuẩn tuyển chọn thấp so với công bố trước Wang & ctv., (2004) Saravanan & ctv (2015) nghiên cứu sử dụng dịch enzyme agarase dịch nuôi cấy vi khuẩn sau loại bỏ tế bào, chất khống cịn lại dịch ni cấy ảnh hưởng đến hoạt tính enzyme (Yang & ctv., 2019); ngồi enzyme chưa tinh điều kiện phản ứng thủy phân chất enzyme agarase chưa tối ưu nguyên nhân làm giảm hoạt tính enzyme Trong số lồi rong biển xác định Việt Nam ngành rong đỏ (Rhodophyta) có đa dạng với 400 lồi (Nguyen & ctv., 1993) Trong đó, Gracilaria spp lồi rong đỏ có diện tích ni cao 10.000 ha, sản lượng khoảng 4.000 - 5.000 khô/năm (Huynh, 2004) Sinh khối Gracilaria spp có chứa hàm Tạp chí Nơng nghiệp Phát triển 19(2) Lời Cảm Ơn Nghiên cứu phần đề tài khoa học công nghệ cấp sở mã số CS-CB18CNSH-01 cấp kinh phí Trường Đại học Nơng Lâm TP Hồ Chí Minh Tài Liệu Tham Khảo (References) Agbo, J A C., & Moss M O (1979) The isolation and characterization of agarolityc bacteria from a Lowland river Journal of General Microbiology 115, 355-368 Chi, W J., Chang, Y K., & Hong, S K (2012) Agar degradation by microorganisms and agar-degrading enzymes Applied Microbiology and Biotechnology 94(4), 917–930 Choi, H J., Hong, J B., Park, J J., Chi, W J., Kim, M C., Chang, Y K., & Hong S K (2011) Production of agarase from a novel Micrococcus sp GNUM-08124 strain isolated from the east sea of Korea Biotechnology and Bioprocess Engineering 16, 81-88 www.jad.hcmuaf.edu.vn Trường Đại học Nơng Lâm TP Hồ Chí Minh Farmer, J J., & Hickman-Brenner F W (1992) The genera vibrio and photobacterium In Balows, A., Truper, H G., Dworkin, M., Harder W., & Schleifer K H (Eds.) The Prokaryotes (2nd ed., 2952-2301) New York, USA: Springer Verlag Faturrahman, Meryandini, A., Junior, M Z., & Rusmana, I (2011) Isolation and identification of an agarliquefying marine bacterium and some properties of its extracellular agarases Biodiversitas 12, 192-197 Fu, X T., & Kim, S M (2010) Agarase: review of major sources, categories, purification method, enzyme characteristics and applications Marine drugs 8(1), 200218 Fu, X T., Lin, H., & Kim, S M (2008) Purification and characterization of a novel β-agarase, AgaA34, from Agarivorans albus YKW-34 Applied Microbiology and Biotechnology 78, 265-273 González, N C., Hoyos, M L R., Kleine, L L., & Casta˜ no D M (2018) Production of enzymes and siderophores by epiphytic bacteria isolated from the marine macroalga Ulva lactuca Aquatic Biology 27, 107-118 Han, W., Gu, J., Yan, Q., Li, J., Wu, Z., Gu, Q., & Li, Y (2012) A polysaccharide-degrading marine bacterium Flammeovirga sp MY04 and its extracellular agarase system Journal of Ocean University of China 11, 375382 Huynh, Q N (2004) Results of investigation and and production of seaweed in Vietnam, and future orientations Proceedings of National Conference on research and application of science and technology in aquaculture (559-569) Ha Noi, Vietnam Janda, J M., Newton, A E., & Bopp, C A (2015) Vibriosis Clinics in Laboratory Medicine 35, 273-288 Kawaroe, M., Pratiwi, I., & Sunudin, A (2017) Isolation and characterization of marine bacteria from macroalgae Gracilaria salicornia and Gelidium latifolium on agarolitic activity for bioethanol production IOP Conference Series: Earth and Environmental Science 65, 012025 Kawaroe, M., Rusmana, I., & Nurafni (2014) Production of bioethanol from macroalgae Gelidium sp using agarase enzymes of marine bacteria International Journal of Environment and Bioenergy 9(3), 243-251 Kolhatkar, N., & Sambrani, S (2018) Isolation and identification of agar degrading bacteria from marine environment IOSR Journal of Pharmacy and Biological Sciences 13(3), 1-7 Kumar, S., Gupta, R., Kumar, G., Sahoo, D., & Kuhad, R C (2013) Bioethanol production from Gracilaria verrucosa, a red alga, in a biorefinery approach Bioresource Technology 135, 150-156 Lane, D J (1991) 16S/23S rRNA sequencing In Stackebrandt, E., and Goodfellow, M (Eds.) Nucleic acid techniques in bacterial systematics (115-176) New York, NY: John Wiley www.jad.hcmuaf.edu.vn 57 Lavilla-Pitogo, C R (1992) Agar-digesting bacteria associated with ‘rotten thallus syndrome’ of Gracilaria sp Aquaculture 102(1-2), 1-7 Liu, Y., Tian, X., Peng, C., & Du, Z (2019) Isolation and characterization of an eosinophilic GH 16 β-agarase (AgaDL6) from an agar-degrading marine bacterium Flammeovirga sp HQM9 Journal of Microbiology and Biotechnology 29(2), 235-243 Macián, M C., Ludwig, W., Schleifer, K H., Pujalte, M J., & Garay, E (2001) Vibrio agarivorans sp nov., a novel agarolytic marine bacterium International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology 51, 2031-2036 Mansson, M., Gram, L., & Larsen, T O (2011) Production of bioactive secondary metabolites by marine Vibrionaceae Marine Drugs 9, 1440-1468 Miller, G L (1959) Use of dinitrosalicylic acid reagent for determination of reducing sugar Analytical Chemistry 31(3), 426-428 Nguyen, H D., Huynh, Q N., Tran N B., & Nguyen, V T (1993) Marine algae of North Vietnam Ha Noi, Vietnam: Science and Technics Publishing House Oh, C., Nikapitiya, C., Lee, Y., Whang, I., Kang, D H., Heo, S J., Choi, Y U., & Lee, J (2010) Molecular cloning, characterization and enzymatic properties of a novel β-agarase from a marine isolate Pseudoalteromonas sp Ag52 Brazilian Journal of Microbiology 41, 876-889 Rioux, L E., & Turgeon, S L (2015) Seaweed carbohydrates In Tiwari, B K., & Troy D J (Eds.) Seaweed sustainability: Food and non-food applications (141192) Massachusetts, USA: Academic Press Robinson, P K (2015) Enzymes: principles and biotechnological applications Essays in biochemistry 59, 1-41 Saravanan, D., Kumar, V S., & Radhakrishnan, M (2015) Isolation and optimization of agarase producing bacteria from marine sediments International Journal of ChemTech Research 8(4), 1701-1705 Thulasidas, S (2012) Isolation and characterization of agarolytic microorganisms and purification of an extracellular enzyme agarase International Journal of Pharmaceutical & Biological Archives 3(4), 965-968 Usov, A I (2011) Polysaccharides of the red algae Advances in Carbohydrate Chemistry and Biochemistry 65, 115-217 Wang, J., Jiang, X., Mou, H., & Guan, H (2004) Antioxidation of agar oligosaccharides produced by agarase from a marine bacterium Journal of Applied Phycology 16, 333-340 Wang, J X., Mou, H J., Jiang, X L., & Guan, H S (2006) Characterization of a novel β-agarase from marine Alteromonas sp SY37–12 and its degrading products Applied Microbiology and Biotechnology 71, 833839 Tạp chí Nơng nghiệp Phát triển 19(2) 58 Trường Đại học Nơng Lâm TP Hồ Chí Minh Yanagisawa, M., Kawai, S., & Murata, K (2013) Production of high concentrations of bioethanol from seaweeds Bioengineered 4, 224-235 Zhang, C., & Kim, S K (2008) Research and application of marine microbial enzymes: Status and prospects Marine Drugs 8, 1920-1934 Yang, Z., Liao, Y., Fu, X., Zaporski, J., Peters, S., Jamison, M., Liu, Y., Wullschleger, S D., Graham, D E., & Gu, B (2019) Temperature sensitivity of mineral-enzyme interactions on the hydrolysis of cellobiose and indican by β-glucosidase Science of The Total Environment 686, 1194-1201 Zeng, C., Zhang, L., Miao, S., Zhang, Y., Zeng, S., & Zheng, B (2016) Preliminary characterization of a novel β-agarase from Thalassospira profundimonas SpringerPlus 5(1), 1-8 Tạp chí Nơng nghiệp Phát triển 19(2) www.jad.hcmuaf.edu.vn ... tiêu phân lập vi khuẩn có khả tổng hợp enzyme agarase từ nước biển xác định hoạt tính enzyme Từ mẫu nước biển thu thập địa điểm khác tỉnh Bà Rịa – Vũng Tàu, phân phập 21 chủng vi khuẩn có khả phân. ..51 Trường Đại học Nơng Lâm TP Hồ Chí Minh Phân lập vi khuẩn tổng hợp enzyme agarase từ nước biển xác định hoạt tính enzyme Nguyễn Thị Hồng Liên, Nguyễn Vũ Phong & Biện Thị Lan... Xác định hoạt độ enzyme agarase cho thí nghiệp Hoạt độ enzyme agarase chủng vi 2.4 Khảo sát hoạt tính phân giải agar khuẩn tuyển chọn xác định thông qua lượng chủng vi khuẩn phân lập đường khử giải

Ngày đăng: 17/11/2020, 09:21

Mục lục

  • Ðt Vn Ð

  • C S Lý Lun và Phng Pháp Nghiên Cu

    • Tng quan tài liu

    • Ngun s liu

      • Phng pháp phân tích và x lý s liu

        • Kt Qua và Thao Lun

          • Mt s c im v nhân khu hoc và xã hi hoc cua h iu tra

            • Phân tích các yu t anh hng n kha nang tham gia thng mai công bng cua nông h trong san xut cà phê

              • Nhn thc cua nông h v li ích cua thng mai công bng trong canh tác cà phê

              • Mô hình hi quy các yu t anh hng n kha nang tham gia thng mai công bng trong san xut cà phê

              • Ð xut mt s giai pháp nhm nâng cao kha nang tham gia liên kt

              • Kt Lun

              • Ðt Vn Ð

              • C S Lý Lun và Phng Pháp Nghiên Cu

                • C s lý thuyt

                • Phng pháp nghiên cu

                  • Kt Qua và Thao Lun

                    • Mu nghiên cu

                      • Kim inh thang o

                        • Kim inh mô hình nghiên cu và các gia thuyt

                        • Kt Lun

                        • Ðt Vn Ð

                        • Vt Liu và Phng Pháp Nghiên Cu

                          • Khao sát chi tiêu hat, nang sut hat và li trích DNA dùng cho phan ng PCR-ISSR

                          • Phân nhóm di truyn

                            • Kt Qua và Thao Lun

                              • Khao sát chi tiêu v hat và nang sut hat cua các ging iu tai tinh Bình Phc

                                • Phân nhóm các mu ging iu da vào c im hat và nang sut hat

                                  • Ðánh giá s phân nhóm di truyn cua 100 mu ging iu da vào chi thi ISSR

                                  • Kt qua phân nhóm di truyn cua các mu ging iu da trên chi thi ISSR

                                    • Kt Lun

                                    • Ðt Vn Ð

                                    • Vt Liu và Phng Pháp Nghiên Cu

                                      • Thi gian và ia im nghiên cu

                                      • Phng pháp nghiên cu

                                        • B trí thí nghim

                                        • Khu phn thc an hng ngày và phng pháp cho an

                                        • Phng pháp thu thp và phân tích mu

                                        • Các chi tiêu theo dõi

                                          • Phng pháp x lý s liu

Tài liệu cùng người dùng

  • Đang cập nhật ...

Tài liệu liên quan