Sự lưu hành của Porcine cytomegalovirus gây viêm mũi thể vùi ở các trại lợn phía Bắc Việt Nam

8 47 0
Sự lưu hành của Porcine cytomegalovirus gây viêm mũi thể vùi ở các trại lợn phía Bắc Việt Nam

Đang tải... (xem toàn văn)

Thông tin tài liệu

Nghiên cứu được thực hiện nhằm phát hiện sự có mặt của Porcine Cytomegalovirus (PCMV) trên các trại lợn phía bắc Việt Nam. Tổng số 122 mẫu bệnh phẩm của lợn có các dấu hiệu bệnh lý đường hô hấp đã được tiến hành sàng lọc bằng kỹ thuật PCR và xác định được 59 mẫu dương tính với PCMV, chiếm tỉ lệ 48,36%.

Vietnam J Agri Sci 2020, Vol 18, No 2: 105-112 Tạp chí Khoa học Nơng nghiệp Việt Nam 2020, 18(2): 105-112 www.vnua.edu.vn SỰ LƯU HÀNH CỦA PORCINE CYTOMEGALOVIRUS GÂY VIÊM MŨI THỂ VÙI Ở CÁC TRẠI LỢN PHÍA BẮC VIỆT NAM Nguyễn Thị Hoa*, Nguyễn Thị Lan, Hoàng Thị Phương, Nguyễn Thị Huyên, Nguyễn Thị Thu Hằng, Trương Quang Lâm Khoa Thú y, Học viện Nông nghiệp Việt Nam * Tác giả liên hệ: hoanguyenty@vnua.edu.vn Ngày chấp nhận đăng: 13.04.2020 Ngày nhận bài: 07.03.2020 TÓM TẮT Nghiên cứu thực nhằm phát có mặt Porcine Cytomegalovirus (PCMV) trại lợn phía bắc Việt Nam Tổng số 122 mẫu bệnh phẩm lợn có dấu hiệu bệnh lý đường hô hấp tiến hành sàng lọc kỹ thuật PCR xác định 59 mẫu dương tính với PCMV, chiếm tỉ lệ 48,36% Kết phân tích trình tự nucleotide axit amin gen DPOL chủng PCMV thu thập Thái Bình Hà Nội cho thấy tương đồng trình tự nucleotide axit amin chủng đạt từ 99,22-100% 99,17-100% Kết phân tích phát sinh loài cho thấy chủng PCMV nghiên cứu nằm nhánh phát sinh khác nhau, chủng PCMV1.HN.2018 PCMV3.HN.2019 nằm nhánh phát sinh với chủng Hn0601 phân lập Trung Quốc (mã số ngân hàng gen HQ686081), chủng 489 Đức (AF268042), chủng OF-1 Nhật Bản (AF268041) chủng 55b Tây Ban Nha (AF268040) Trong đó, chủng PCMV2.TB.2019 nằm nhánh phát sinh với chủng FJ01 Trung Quốc (MG696113) Như vậy, PCMV lưu hành đàn lợn nuôi tỉnh phía bắc Việt Nam có nguồn gốc với chủng PCMV từ Trung Quốc Từ khóa: Porcine cytomegalovirus, PCR, giải trình tự gen, gB Prevalence of Porcine Cytomegalovirus Causing Inclusion Body Rhinitis in the Pig Farms of Northern Vietnam ABSTRACT The study was conducted to detect the presence of Porcine Cytomegalovirus (PCMV) in northern Vietnam pig farms Total 122 samples of pigs with respiratory pathological signs were screening by PCR and identified 59 positive samples with PCMV, accounting for 48.36% Results of analyzing the nucleotide (nt) and amino acid (aa) of PCMV virus strains collected in Thai Binh and Ha Noi showed that these strains were closely related to one other, sharing 99.22-100% at nt and 99.17-100% at aa, respectively Phylogenetic tree analysis indicated that the PCMV strains belonged to two different branches, PCMV1.HN.2018 and PCMV3.HN.2019 strains were in the same branch as HN0601 strain isolated in China (accession number HQ686081), the 489 strain of Germany (AF268042), the OF-1 strain of Japan (AF268041) and the 55b strain of Spain (AF268040) Meanwhile, the PCMV2.TB.2019 strain was located in the same branch as the FJ01 strain isolated in China (MG696113) Thus, it can be concluded that PCMV had circulated among pigs raised in northern Vietnam and had the same origin as the PCMV strains from China Keywords: Porcine cytomegalovirus, PCR, sequencing, DPOL ĐẶT VẤN ĐỀ Porcine Cytomegalovirus (PCMV) gây bệnh viêm müi lợn thuộc họ Herpesvirus họ vĆi virus gây bệnh giâ däi lợn (Pseudovirus - PRV) PCMV cüng tác nhån gõy bnh truyn nhim trờn ln nhỵng khụng gõy triệu chĀng låm sàng điển hình, khơng täo thành dch ln, vờy ớt ỵc quan tõm Tuy khụng ph bin nhỵng PCMV l mt nhng mổm bệnh nguy hiểm lợn sĄ sinh vĆi triệu chng thổn kinh ri cht rỗt 105 S lu hnh Porcine Cytomegalovirus gây viêm mũi thể vùi trại lợn phía bắc Việt Nam nhanh, đặc biệt cịn gây sây thai nái mang virus gây triu chng cờn lõm sng ln trỵng thnh gp cỏc yu t bỗt li (Mueller & cs., 2004, Narita & cs., 1987) PCMV thuộc phân họ Betaherpesvirus có vờt chỗt di truyn l DNA si ụi, kớch thỵc 128.367bp, chĀa 79 khung đọc mć (Open reading frames - ORF) v ỵng kớnh họt virus t 150 n 200nm (Gu & cs., 2014a) PCMV thỵng ng nhim vi cỏc virus gõy bnh c lc cao nhỵ Porcine Reproductive and Respiratory Syndrome virus (PRRS), cỏc virus gõy bnh ỵng hụ hỗp khỏc trờn ln gõy hờu quõ nghiờm trng K thuêt sinh học phân tā PCR vĆi độ đặc hiệu, chớnh xỏc v tin cờy cao ó ỵc s dýng để xác đðnh să có mặt cûa PCMV Báo cáo đỉu tiên sā dýng kỹ tht PCR chèn đốn PCMV lợn ć Canada cûa nhóm tác giâ Hamel & cs (1999) ó xỏc nh 59% mộu dỵng tớnh vi PCMV, 64% cỏc trang trọi ỵc khõo sỏt cho kt quõ dỵng tớnh Bỡng phỵng phỏp ny, PCMV cỹng ó ỵc ghi nhờn nhiu quc gia thuc cỏc chõu lýc trờn khớp th gii nhỵ Nhờt Bõn, chõu u, Bíc Mỹ Trung Quốc vĆi tỷ lệ nhiễm trung bình 90% (Edington & cs., 1988; Gu & cs., 2014b) Phỵng phỏp PCR s dýng cỏc cp mi c hiu ỵc phỏt trin da trờn cỏc gen khỏng nguyờn gõy bnh cỷa virus nhỵ gen glycoprotein B (gB) v gen DNA polymerase (DPOL) Các nghiên cĀu PCMV chû yếu têp trung vào gen DNA polymerase (DPOL) gen glycoprotein B (gB), chợ cú nhỗt mt serotype PCMV ỵc ghi nhờn S a dọng di truyn ỵc ghi nhờn ć gen DPOL gB vĆi chûng PCMV khác dén đến să thay đổi kháng nguyên Trong đò, gB glycoprotein xuyên màng quan trọng, đòng vai trị phân Āng tổng hợp bám dính cûa virus vào màng tế bào chû virus xâm nhêp vào tế bào chuyển giĂa tế bào, mýc tiêu cûa tế bào lympho T gåy độc Theo Liu & cs (2013) nghiên cĀu chûng PCMV täi TĀ Xuyên, Trung Quốc cho kết quâ chỷng cú ngun gc Trung Quc nhỵ chỷng Ninh Ba (FJ870561), chỷng Chit Giang (FJ870563) tỵng ng vi chỷng 55b (AF268040) phõn lờp ỵc t Tõy Ban Nha, chỷng Yamaguchi Nhêt 106 Bân (AB771706) (AF394056) chûng Thýy Điển Täi Việt Nam, vĆi să phát triển cûa ngành chën ni, kiểm sốt dðch bệnh yếu tố quan trọng Nghiên cĀu PCMV ć Việt Nam cñn chỵa cũ cụng b no Trong ũ, vic nhim chộo PCMV hay cỏc virus khỏc thỵng xõy lợn träng miễn dðch kém, tÿ đị kế phát bệnh nhiễm trùng vi khuèn (Widen & cs., 2001b) PCMV Āc chế chĀc nëng miễn dðch cĄ chế bâo vệ cûa vêt chû, đặc biệt hột động cûa tế bào lympho T bìng cách điều chợnh s biu hin cỷa nhiu cytokine Ging nhỵ virus PRRS, PCMV sā dýng đäi thăc bào phế nang làm tế bào đích, nghiên cĀu cûa Yoon & cs (1996) chỵ việc nhiễm PCMV cị ý nghùa thỳc ốy s xuỗt hin cỷa PRRS Do vờy, PCMV ó ỵc cụng nhờn l mi quan tồm cho ngành chën nuôi lợn Tác động suy giâm miễn dðch cỷa PCMV õnh hỵng khụng nhú n hiu quõ kinh t cỷa ngỵi chởn nuụi Do ũ, nu cỏc vỗn v hụ hỗp v sinh sõn xõy n, PCMV s cổn phõi ỵc phõn bit vi cỏc bệnh sinh sân khác, đặc biệt nhiễm Parvovirus gây bệnh khô thai, Pseudorabies gây bệnh giâ däi hội chng ri loọn hụ hỗp v sinh sõn ln để có biện pháp kiểm sốt thích hợp Vì vêy, nghiờn cu ny ỵc thc hin nhỡm mýc ớch phỏt hin s lỵu hnh cỷa PCMV cỏc trọi ln phớa bớc Vit Nam ng thi cung cỗp cỏc d liệu khoa học ban đæu làm cĄ sć cho việc chèn đốn đề biện pháp phịng, trð bệnh hiệu quâ PHƯƠNG PHÁP NGHIÊN CỨU 2.1 Vật liệu nghiên cứu Trong nghiên cĀu này, méu bệnh phèm ỵc s dýng bao gm mộu họch, mộu phi trờn ln cú bnh lý lõm sng v hụ hỗp nhỵ, ho, khò thć, viêm phổi Nguồn méu thu thêp tÿ trang träi hộ chën ni thuộc tỵnh khu vc phớa bớc Vit Nam Húa chỗt vờt tỵ bao gồm: Kít tách chiết DNA Dneasy Blood & Tisue Kit-69506.250 cûa Qiagen, Mỹ; cồn tuyệt đối (Merk) Sinh phèm, húa chỗt dựng cho phõn ng PCR: Kớt PCR Promega (Mỹ) Cặp mồi đặc hiệu dùng để phát Nguyễn Thị Hoa, Nguyễn Thị Lan, Hoàng Thị Phương, Nguyễn Thị Huyên, Nguyễn Thị Thu Hằng, Trương Quang Lâm giâi trình tă gen PCMV Bộ kít giâi trình tă gen cûa Beckman coulter, kít tinh säch sân phèm PCR cûa Qiagen„ Máy móc, dýng cý phýc vý nghiên cĀu bao gồm: máy PCR (Eppendorf), máy giâi trình tă gen (Beckman Coulter), máy điện di, máy vortex (IKa), máy ly tâm (eppendorf), tû -80C (Sanyo), Pipet đỉu típ lội, ống eppendorf 1,5mL, gëng tay, khèu trang 2.2 Phương pháp nghiên cứu 2.2.1 Tách chiết DNA 2X Go Taq green mastermix; 6,5µL nuclease-free water; 0,5µL mồi xi (PCMVF); 0,5µL mi ngỵc (PCMVR); 5àL DNA mộu ó tỏch chit Chu trình nhiệt giai độn cûa phân Āng PCR bao gm cỏc bỵc: tin bin tớnh 95C/5 phỳt; lp läi 35 chu kỳ gồm: 94C/30 giây, 60C/1 phút, 72C/1 phút; kéo dài cuối ć 72C/5 phút Sân phèm PCR s ỵc kim tra bỡng phỵng phỏp in di gel agarose 1,5% có bổ sung Red gel (Invitrogen, USA) v hin th hỡnh õnh sõn phốm dỵi ỏnh sáng căc tím (UV) hệ thống máy chýp ânh gel Kớt Qiagen ỵc s dýng tỏch chit DNA cỷa virus t mộu bnh phốm, cỏc bỵc tin hnh theo hỵng dộn cỷa nh sõn xuỗt Cý th, lỗy khoõng 100àg mộu bnh phốm ó ỵc ng nhỗt cho vào ống eppendorf, bổ sung 180µL dung dðch ATL, 20µL Protein K sau đị trộn huyễn dðch bìng máy vortex û ć 56C méu tan hồn tồn dung dðch ATL, bổ sung 200µL dung dðch AL, û ć 56C 10 phút Bổ sung 200àL dung dch cn 100, vortex tỗt cõ huyn dch 15 giây Chuyển toàn méu ống eppendorf sang cột lọc, ly tâm 13.000 vòng/phút phút, rāa lỉn vĆi 500µL dung dðch rāa AW1, ly tâm 13.000 vịng/phút phút, rāa lỉn bìng 500µL dung dðch rāa AW2, ly tâm 14.000 vđng/phút phỳt Bỵc cui cựng thu DNA bỡng 100 àL dung dðch AE, û phút ć nhiệt độ phòng ly tâm 14.000 vòng/phút phút Méu DNA thu ỵc ỏy ng eppendorf bõo quõn iu kiện -20C 2.2.3 Giải trình tự phân tích trình tự gen 2.2.2 Phản ứng PCR phát PCMV Trong nghiên cĀu này, tiến hành kiểm tra phỏt hin PCMV trờn 122 mộu bnh phốm ln ỵc thu thêp tÿ số tỵnh khu văc phía bíc Việt Nam nëm 2018 2019 bìng kỹ thuờt PCR Kt quõ ỵc tng hp v trỡnh by ć bâng hình Phân Āng PCR dùng để chèn đoán PCMV sā dýng cặp mồi PCMVF/PCMVR khuếch đäi đoän gen DPOL cûa PCMV (Hamel & cs., 1999) trỡnh t mi v kớch thỵc sõn phốm theo mụ tâ ć bâng Thành phæn phân Āng PCR bao gm: 12,5àL Sõn phốm PCR ỵc tinh sọch v giõi trỡnh t theo hai chiu (xuụi v ngỵc) bỡng phỵng phỏp Sanger ỵc thc hin tọi phũng Thớ nghim trng điểm Cơng nghệ sinh học Thú y Trình tă nucleotide thu ỵc s ỵc x lý v BLAST trờn ngồn hng gen theo a chợ http://ncmi.nlm.nih.gov Trỡnh t thu ỵc sau ũ tip týc ỵc phõn tớch bỡng phổn mm tin sinh hc BioEdit xỏc nh tỵng ng nucleotide axit amin Xây dăng phát sinh loài cĄ sć trình tă gen cûa chûng virus thu nhên bìng phỉn mềm MEGA (Molecular Evolutionary Genetics Analysis) version 6.0 S dýng phỵng phỏp test Maximum likehood vi giỏ tr bootstrap 1.000 đĄn vð KẾT QUẢ VÀ THẢO LUẬN 3.1 Kết quâ khâo sát lưu hành PCMV số tỉnh phía bắc Việt Nam Bâng Trình tự nucleotide cặp mồi sử dụng phát PCMV Primer Sequence (5’ - 3’) PCMVF CCCTGATCTTAAATGACGAGGACGTGAC PCMVR ACCGTCTGAGAGAGACTGAACTTCTCTGACAC Size (bp) 413 107 Sự lưu hành Porcine Cytomegalovirus gây viêm mũi thể vùi trại lợn phía bắc Việt Nam Bâng Kết quâ phát PCMV số tỉnh phía bắc Việt Nam Tỉnh/thành phố Số mẫu kiểm tra Số mẫu dương tính Tỷ lệ (%) Bắc Giang 14 02 14,29 Hà Nam 12 06 50,00 Hà Nội 18 10 55,56 Hải Dương 12 06 50,00 Hịa Bình 04 02 50,00 Hưng n 34 20 58,82 Thái Bình 10 03 30,00 Thái Nguyên 18 10 55,56 Tổng 122 59 48,36 Ghi chú: M thang DNA chuẩn (100bp DNA ladder-Cleaver-Anh); Giếng đến giếng sản phẩm PCR mẫu bệnh phẩm từ lợn nghi mắc PCMV ; Giếng 6: Đối chứng âm (nước tinh khiết) Giếng 7: Đối chứng dương (Chủng PCMV cung cấp ATCC mã ATCC VR-1499) Hình Kết quâ điện di sân phẩm PCR phát PCMV Kết quâ xác đðnh PCMV bìng kỹ thuêt PCR ỵc th hin bõng cho thỗy t l dỵng tớnh vi PCMV cỏc mộu bnh phốm thu thêp chiếm trung bình 48,36% Ở tỵnh phía bíc Vit Nam u phỏt hin thỗy s lỵu hnh cỷa PCMV, tợ l dỵng tớnh trung bỡnh cỏc mộu bệnh phèm tÿ tỵnh dao động tÿ 14,29% đến 58,82%, chợ riờng tợnh Bớc Giang, tợ l dỵng tớnh thỗp hn cỏc tợnh cũn lọi (14,29%) Kt quõ khõo sỏt cho thỗy t l mang trựng PCMV phớa bớc Vit Nam tỵng i cao, nhiờn vộn chỵa cao bỡng tợ l lỵu hnh ó ỵc cụng b ć số quốc gia giĆi Cüng bìng kỹ thuêt PCR, Liu & cs (2013) tiến hành điều tra tỷ lệ míc PCMV 1025 méu thu thêp tÿ khíp 14 huyện thuộc tỵnh TĀ Xun, Trung Quc cho kt quõ 84,4% mộu dỵng tớnh vi PCMV Trong đò, tỷ lệ nhiễm PCMV lợn cao nhỗt 91,6%, ln s sinh 88% v ln nỏi 80,4%, t l mớc trờn ln c thỗp nhỗt 108 46,7% (Liu & cs., 2013) Cüng nghiên cĀu này, lổn ổu tiờn PCMV ỵc tỡm thỗy tinh dch cûa lợn đăc giống Theo Yoon & Edington (2006), 90% ln Anh cú huyt dỵng tớnh vi PCMV, cỏc dỗu hiu lõm sng ỵc quan sỏt nỏi nhiễm virus giai đoän cuối cûa thai kỳ vĆi biểu sốt Trong nghiên cĀu cûa Liu & cs (2013) tỷ lệ nhiễm PCMV ć lợn nái tÿ mt trang trọi l rỗt cao, vỡ vờy nguy c lồy lan qua hoọt ng sinh sõn l rỗt ln nên cæn thăc tốt biện pháp kiểm dðch Nhóm tác giâ cüng nhên đðnh, lợn nhiễm PCMV cị nguy cĄ cao nhiễm PRRS, virus gây bệnh giâ däi, ngồi nhiễm trùng Streptococcus Haemophilus parasuis Nhỵ vờy, kt quõ ny cỷa chỳng tụi mi chợ nhĂng khâo sát ban đæu tỷ lệ mang trùng PCMV lợn ć số tỵnh khu văc phía bíc Việt Nam, cỉn thiết phâi thăc nhĂng khâo sát cý thể hĄn nĂa tác nhån đồng nhiễm để Nguyễn Thị Hoa, Nguyễn Thị Lan, Hoàng Thị Phương, Nguyễn Thị Huyên, Nguyễn Thị Thu Hằng, Trương Quang Lâm có nhên đðnh đỉy đû vai trị cỷa cỏc tỏc nhõn gõy bnh trờn ỵng hụ hỗp cỷa ln cũ nh hỵng phự hp cụng tác phịng, chống bệnh 3.2 Kết q phân tích trình tự gen DPOL chủng PCMV nghiên cứu Tÿ kt quõ phỏt hin PCMV dỵng tớnh bỡng PCR, chỳng tụi la chn 03 mộu dỵng tớnh thu thờp tọi Hà Nội (01 méu nëm 2018 01 méu nëm 2019) Thái Bình (01 méu nëm 2018) để tiến hnh giõi trỡnh t Chui nucleotide thu ỵc sau giõi trỡnh t ỵc x lý bỡng cỏc phổn mm tin sinh học Kết quâ so sánh trình tă nucleotide axit amin gen DPOL cûa chûng PCMV nghiên cu ỵc trỡnh by hỡnh 2, v bõng Ghi chú: Các vị trí nucleotide giống biểu thị dấu (.); vị trí có sai khác biểu thị nucleotide tương ứng chủng virus Hình So sánh trình tự nucleotide gen DPOL chủng PCMV nghiên cứu chủng tham chiếu khác 109 Sự lưu hành Porcine Cytomegalovirus gây viêm mũi thể vùi trại lợn phía bắc Việt Nam Ghi chú: Các vị trí axit amin giống biểu thị dấu (.); vị trí có sai khác biểu thị axit amin tương ứng chủng virus Hình So sánh trình tự axit amin gen DPOL chủng PCMV nghiên cứu chủng tham chiếu khác Bâng So sánh tương đồng nucleotide axit amin gen DPOL chủng PCMV nghiên cứu chủng tham chiếu khác Chủng virus PCMV1.HN.2018 100,00 99,17 100,00 98,33 100,00 99,17 98,33 100,00 99,17 PCMV2.TB.2018 99,22 100,00 99,17 97,49 99,17 98,33 97,49 99,17 100,00 PCMV3.HN.2019 100,00 99,22 100,00 98,33 100,00 99,17 98,33 100,00 99,17 AF268039.England.2001 99,22 98,97 99,22 100,00 98,33 97,49 100,00 98,33 97,49 AF268040.Spain.2000 99,74 98,96 99,74 98,96 100,00 99,17 98,33 100,00 99,17 AF268041.Japan.2001 99,48 98,70 99,48 98,70 99,74 100,00 97,49 99,17 98,33 AJ222640.England.1999 99,22 98,97 99,22 100,00 98,96 98,70 100,00 98,33 97,49 HQ686081.China.2010 99,74 98,96 99,74 98,96 100,00 99,74 98,96 100,00 99,17 MG696113.China.2016 99,22 100,00 99,22 98,97 98,96 98,70 98,97 98,96 100,00 Ghi chú: Tương đồng nucleotide hiển thị phía bên trái đường chéo 100 Tương đồng axit amin hiển thị phía bên phải đường chéo 100 Kết quâ so sánh trình tă nucleotide gen DPOL cûa 03 chûng PCMV nghiên cĀu cho thỗy tợ l tỵng ng cao t 99,22-100% gia cỏc chỷng Trong ũ chỷng PCMV1.HN.2018 tỵng ng 100% vi chỷng PCMV.HN.2019 Chỷng PCMV2.TB.2018 tỵng ng 99,22% v trỡnh t nucleotide vĆi chûng cịn läi So sánh trình tă nucleotide gen DPOL vĆi số chûng PCMV tham chiếu khác trờn th gii thỗy rỡng mc tỵng ng v nucleotide cûa chûng 110 PCMV täi Việt Nam so vĆi chûng giĆi tÿ 98,70-100%, đặc biệt chỷng PCMV2 TB.2018 tỵng ng 100% v nucleotide vi chỷng Hn0601 cûa Trung Quốc (mã số ngân hàng gen HQ686081) Kết quâ so sánh trình tă axit amin gen DPOL cho thỗy chỷng PCMV2.TB.2018 sai khỏc 01 v trớ axit amin thĀ 24 (S↔L) so vĆi chûng PCMV1.HN.2018 v PCMV.HN.2019 Tợ l tỵng ng v axit amin cỷa chûng so vĆi Nguyễn Thị Hoa, Nguyễn Thị Lan, Hoàng Thị Phương, Nguyễn Thị Huyên, Nguyễn Thị Thu Hằng, Trương Quang Lâm chûng cịn läi đät 99,17% (Hình 3) So sánh trình tă axit amin cûa chûng PCMV nghiờn cu vi cỏc chỷng tham chiu ỵc thu thờp trờn ngõn hng gen thỗy mc tỵng ng axit amin t 97,49-100% (Bõng 3) Trong ũ, tỵng ng cao vĆi chûng Hn0601 chûng FJ01 cûa Trung Quốc (mó s ngõn hng gen lổn lỵt HQ686081, MG696113) v chỷng 55b cỷa Tõy Ban Nha (AF268040) tợ l tỵng ng t 99,17-100% Tợ l tỵng ng thỗp hn vi chûng cûa B6 cûa Anh (AF268039) chûng OF-1 cûa Nhờt Bõn (AF268041) tợ l tỵng ng t 97,49-99,17% Kt quâ phân tích nguồn gốc phát sinh dăa phỏt sinh loi cỷa cỏc chỷng PCMV nghiờn cu ỵc thể qua hình Tÿ kết q phân tích nguồn gốc phát sinh lồi dăa trình tă nuclecotide gene DPOL cho thỗy: 03 chỷng PCMV nghiờn cu nỡm nhánh phát sinh khác Chûng PCMV1.HN.2018 PCMV3.HN.2019 nỡm cựng nhỏnh phỏt sinh vi chỷng Hn0601ỵc phõn lêp ć Trung Quốc (mã số ngân hàng gen HQ686081), chûng 489 cûa ĐĀc (AF268042), chûng OF-1 cûa Nhêt Bân (AF268041) chûng 55b cûa Tây Ban Nha (AF268040) Trong đị, chûng PCMV2.TB.2019 nìm nhánh phát sinh vĆi chỷng FJ01 cỷa Trung Quc (MG696113) Nhỵ vờy cỏc chỷng PCMV nghiên cĀu có nguồn gốc phát sinh vĆi chûng PCMV cûa Trung Quốc KẾT LUẬN Nghiên cĀu xác đðnh să có mặt cûa PCMV ln ỵc nuụi tọi tợnh phớa bớc Vit Nam bìng kỹ tht PCR vĆi tỵ lệ nhiễm trung bình 48,36% Trình tă gen DPOL cûa chûng virus PCMV thu thờp ỵc tọi H Ni v Thỏi Bỡnh cú mc tỵng ng cao v nucleotide v axit amin lổn lỵt ọt t 99,22-100% v 99,17-100% Kt quõ dng cõy phỏt sinh loi cho thỗy cỏc chỷng PCMV nghiên cĀu nìm hai nhánh phát sinh khác có nguồn gốc vĆi chûng PCMV tÿ Trung Quốc LỜI CẢM ƠN Nhóm tác giâ xin gāi ląi câm Ąn tĆi Dă án Việt - Bỵ tài trợ kinh phí cho đề tài: “Nghiên cĀu să lỵu hnh cỷa Porcine cytomegalovirus trờn ln tọi mt s tỵnh phía bíc Việt Nam” để chúng tơi cị điều kiện thăc nghiên cĀu Ghi chú: : Là chủng PCMV nghiên cứu Hình Cây phát sinh loài chủng PCMV nghiên cứu chủng tham chiếu 111 Sự lưu hành Porcine Cytomegalovirus gây viêm mũi thể vùi trại lợn phía bắc Việt Nam TÀI LIỆU THAM KHẢO Edington N., Wrathall A.E & Done J.T (1988) Porcine cytomegalovirus (PCMV) in early gestation Veterinary microbiology 17(2): 117-128 Gu W., Zeng N., Zhou L., Ge X., Guo X & Yang H (2014a) Genomic organization and molecular characterization of porcine cytomegalovirus Virology 460: 165-172 Gu W., Zeng N., Zhou L., Ge X., Guo X & Yang H (2014b) Genomic organization and molecular characterization of porcine cytomegalovirus Virology 460-461: 165-172 Hamel A.L., Lin L., Sachvie C., Grudeski E & Nayar G.P (1999) PCR assay for detecting porcine cytomegalovirus Journal of clinical microbiology 37(11): 3767-3768 Narita M., Kawamura H., Shirai J & Haritani M (1987) Morphologic study of inclusions in tissues from pigs inoculated with cytomegalovirus American journal of veterinary research 48(9): 1398-1402 112 Mueller N.J., Livingston C., Knosalla C., Barth R.N., Yamamoto S., Gollackner B., Dor F J., Buhler L., Sachs D.H & Yamada K (2004) Activation of porcine cytomegalovirus, but not porcine lymphotropic herpesvirus, in pig-to-baboon xenotransplantation The Journal of infectious diseases 189: 1628-1633 Liu X., Liao S., Zhu L., Xu Z & Zhou Y (2013) Molecular epidemiology of porcine cytomegalovirus (PCMV) in Sichuan Province, China: 2010-2012 PloS one 8(6) Widen F., Goltz M., Wittenbrink N., Ehlers B., Banks M & Belak S (2001b) Identification and sequence analysis of the glycoprotein B gene of porcine cytomegalovirus Virus genes 23: 339-346 Yoon K.J & Edington N.W (2006) Cytomegalovirus In Straw BE, Allaire SD, Mengeling WL, editors Diseases of swine Oxford: Blackwell Publishing pp 323-329 Yoon K.J., Henry S.C., Zimmerman J.J & Platt K.B (1996) Isolation of porcine cytomegalovirus from a swine herd with PRRS Veterinary medicine (1985) (USA) ... ACCGTCTGAGAGAGACTGAACTTCTCTGACAC Size (bp) 413 107 Sự lưu hành Porcine Cytomegalovirus gây viêm mũi thể vùi trại lợn phía bắc Việt Nam Bâng Kết quâ phát PCMV số tỉnh phía bắc Việt Nam Tỉnh/thành phố Số mẫu kiểm tra Số.. .Sự lưu hành Porcine Cytomegalovirus gây viêm mũi thể vùi trại lợn phía bắc Việt Nam nhanh, đặc biệt gây sây thai nái mang virus gây triệu chĀng cên lâm sàng ć lợn trỵng thnh gp... chủng tham chiếu 111 Sự lưu hành Porcine Cytomegalovirus gây viêm mũi thể vùi trại lợn phía bắc Việt Nam TÀI LIỆU THAM KHẢO Edington N., Wrathall A.E & Done J.T (1988) Porcine cytomegalovirus (PCMV)

Ngày đăng: 01/11/2020, 17:55

Hình ảnh liên quan

Hình 1. Kết quâ điện di sân phẩm PCR phát hiện PCMV - Sự lưu hành của Porcine cytomegalovirus gây viêm mũi thể vùi ở các trại lợn phía Bắc Việt Nam

Hình 1..

Kết quâ điện di sân phẩm PCR phát hiện PCMV Xem tại trang 4 của tài liệu.
Hình 2. So sánh trình tự nucleotide gen DPOL của các chủng PCMV nghiên cứu và các chủng tham chiếu khác  - Sự lưu hành của Porcine cytomegalovirus gây viêm mũi thể vùi ở các trại lợn phía Bắc Việt Nam

Hình 2..

So sánh trình tự nucleotide gen DPOL của các chủng PCMV nghiên cứu và các chủng tham chiếu khác Xem tại trang 5 của tài liệu.
Hình 3. So sánh trình tự axit amin gen DPOL của các chủng PCMV nghiên cứu và các chủng tham chiếu khác  - Sự lưu hành của Porcine cytomegalovirus gây viêm mũi thể vùi ở các trại lợn phía Bắc Việt Nam

Hình 3..

So sánh trình tự axit amin gen DPOL của các chủng PCMV nghiên cứu và các chủng tham chiếu khác Xem tại trang 6 của tài liệu.
2 chûng cịn läi đät 99,17% (Hình 3). So sánh trình tă axit amin cûa các chûng PCMV nghiên  cĀu  vĆi  các  chûng  tham  chiếu  đþợc  thu  thêp  trên  ngân  hàng  gen  thçy  mĀc  độ  tþĄng  đồng  axit  amin  tÿ  97,49-100%  (Bâng  3) - Sự lưu hành của Porcine cytomegalovirus gây viêm mũi thể vùi ở các trại lợn phía Bắc Việt Nam

2.

chûng cịn läi đät 99,17% (Hình 3). So sánh trình tă axit amin cûa các chûng PCMV nghiên cĀu vĆi các chûng tham chiếu đþợc thu thêp trên ngân hàng gen thçy mĀc độ tþĄng đồng axit amin tÿ 97,49-100% (Bâng 3) Xem tại trang 7 của tài liệu.

Tài liệu cùng người dùng

Tài liệu liên quan