vấn đề ôn tập tin sinh

Hoàng Phú Hiệp 2016 Hướng dẫn ôn tập Phân tích liệu thống kê phần mềm excel Từ NCBI tìm một báo xuất năm (2013, 2014, 2015, ) a ứng dụng kỹ thuật chuyển gen ở thực vật b ứng dụng kỹ thuật chuyển gen ở động vật c ứng dụng nuôi cấy mô tế bào thực vật d ứng dụng kỹ thuật chịu hạn ở một loại trồng Từ GenBank, tải phân tích thông tin trình tự gen insulin người, gen htPA người, trình tự gen mã hóa HGH (human growth hormone) người, gen 16S vi khuẩn E Coli O157:H7, gen mã hóa chaperonin lúa, gen matK lúa (7 trình tự), gen DREB2 ở đậu tương (7 trình tự), gen defensin phân lập từ ngô (7 trình tự), Từ GenBank, tìm phân tích thông tin trình tự amino acid insulin lợn, trình tự amino acid protein Cystatin lạc, trình tự amino acid protein dehydrin đậu tương, Cho biết thông tin gen mang mã số FN435626, KC596009, NM001250385, LK936507, KJ469411, LN650983, AF288129, LK936509, LK936508, Cho biết thông tin protein mang mã số NP_000506, AAA52484, CEF82730, ABD14811, CAA01607, Z11546, CCF23313, CCF23312, CBZ41765, Sử dụng phần mềm BioEdit để xác định điểm cắt loại enzyme giới hạn trình tự gen (tìm hiểu thêm thông tin phần mềm sử dụng enzyme cắt giới hạn) Sử dụng Bioedit để chuyển đổi trình tự nucleotide sang trình tự bổ sung, trình tự đảo ngược bổ sung, trình tự ribonucleotide mRNA sang trình tự amino acid ngược lại trình tự Từ trình tự nucleotide (amino acid) (có 3-5 trình tự khác nhau) xác định xem thuộc gen phân lập từ loài sinh vật nào? Ví dụ: ATGGCGCCGTCTCGACGCATGGCGGCTCCCGTCCTCGTCCTCATGCTC CTCCTCGTCGCCACAGAGCTGGGGACGACCAAGGTGGCGGAGGCGA GGCACTGCCTGTCGCAGAGCCACCGGTTCAAGGGCCTGTGCATGAGC AGCAACAACTGCGCCAACGTGTGCCAGACCGAGAACTTCCCCGGCGG CGAGTGCAAGGCGGAGGGCGCCACGCGCAAGTGCTTCTGCAAGAAG ATCTGCTAG MEDAGLGDCCSSNSTITRKSDKRKQQHQQQEKPYRGIRMRKWGKW VAEIREPNKRSRIWLGSYATPVAAARAYDTAVFHLRGPSARLNFPEL LSQDDDVSTQQQGNMSADSIRKKATQVGARVDALQTALQQSSSSHS ANSSHVSSDKPDLNEYPKPED 10 Sử dụng DNAstar, Bioedit, NTSYS xác định hệ số tương đồng, hệ số phân ly, thiết lập sơ đồ hình cây, (phân tích kết thu được) 11 Thiết kế cặp mồi khuếch đại gen (đủ số nucleotide gen) tay phần mềm (NCBI, Primer3, …) Đặc điểm thiết kế mồi