Vật chất di truyền ở ty thể: Ứng dụng nghiên cứu giải trình tự gen ty thể trong giám định hài cốt và huyết thống: 1.. mtDNA là sợi xoắn kép, có cấu trúc vòng, dài khoảng 5μm hoặc c
Trang 1Nghiên c u gen ty th ng d ng vào ứu gen ty thể ứng dụng vào ể ứng dụng vào ứu gen ty thể ứng dụng vào ụng vào Giám đ nh hài c t và huy t th ng ịnh hài cốt và huyết thống ốt và huyết thống ết thống ốt và huyết thống.
Nội dung bài:
Di truyền ty thể:
1 Khái niệm ty thể:
2 Vật chất di truyền ở ty thể:
Ứng dụng nghiên cứu giải trình tự gen ty
thể trong giám định hài cốt và huyết
thống:
1 Quy trình giám định hài cốt:
2 Quy trình giám định mẫu đối chứng
3 Đọc kết quả:
Tên thành viên nhóm thực hiện:
1 Nguyễn Thị Trang
2 Ngô Thị Nhung
3 Đỗ Thị Li Na
4 Trần Thị Vĩnh Trang
Trang 2 Trong cơ thể con người tồn tại song song 2 hệ gen: hệ gen
trong nhân và hệ gen ty thể (di truyền theo dòng mẹ).
Trang 31. Khái niệm ty thể:
hết các tế bào hô hấp hiếu khí
ion kim loại, chất màu…
truyền là DNA, có ribosome,
RNA để tự tổng hợp vật chất di
truyền
Di truy n ty th : ền ty thể: ể:
Trang 42. Vật chất di truyền ty thể:
Trang 5 mtDNA là sợi xoắn kép, có cấu trúc vòng, dài khoảng 5μm hoặc có thể tồn tại ở dạng mạch thẳng μm hoặc có thể tồn tại ở dạng mạch thẳng m hoặc có thể tồn tại ở dạng mạch thẳng
mtDNA chiếm từ 1->5μm hoặc có thể tồn tại ở dạng mạch thẳng % DNA của tế bào
không có intron và hầu như không có khoảng trống
giữa các gen
Các gen có thể phân bố ở vị trí khác nhau mặc dù có cùng chức năng
pol có trong chất nền ty thể và xảy ra ở Interphase của chu kì tế bào
giống với DNA vi khuẩn
Trang 7 Ty thể tự tổng hợp protein cho riêng mình
Ty thể không tự tổng hợp tất cả protein của ty thể vì nó chỉ chứa gen mã hóa cho khoảng 5μm hoặc có thể tồn tại ở dạng mạch thẳng 000aa
Hầu hết được tổng hợp từ mạng lưới nội chất hạt theo mã của các gen trong NST và được vận
chuyển vào ty thể
Trang 8 Chỉ cần một lượng mẫu rất ít thậm chí hầu hết đã bị biến
tính, hư hỏng do điều kiện môi trường vẫn có thể tách chiết
được ADN ty thể và nhân bội đạt kết quả phục vụ giám định
Trong tất cả TB của các mô và
tổ chức cơ thể đều có chứa
ADN ty thể với cấu trúc như ADN ty thể của mẹ
Trang 9Quy trình giám định hài cốt:
Trang 10Quy trình giám định mẫu đối chứng:
Lấy mẫu máu đối chứng
Bổ sung PBS tương
đương với thể tích máu
Mix đều và ly tâm ở
nhiệt độ phòng
(6600v/p) trong 3p
Bỏ dịch nổi, lấy cặn Thêm dung dịch Lysis và ủ ở 5μm hoặc có thể tồn tại ở dạng mạch thẳng 6o C trong 3h
Chiết bằng phenol và
chloroform
Tủa DNA bằng cồn 96 o C
và bảo quản ở -20 o C
Nhân vùng D-loop với cặp
mồi đặc hiệu Giải trình tự vùng
D-loop
Đối chứng với mẫu xương giám định
Trang 11Chúng tôi lấy một lượng nhỏ xương hài cốt để tách chiết ADN ty thể Phòng thí
nghiệm để tách ADN ty thể phải có môi trường rất sạch vì ADN ty thể có khả năng nhiễm cao
H th ng t c y vô trùng Class II đ m b o cho quá trình tách ADN ty th t x ốt và huyết thống ảm bảo cho quá trình tách ADN ty thể từ xương không bị lây ảm bảo cho quá trình tách ADN ty thể từ xương không bị lây ể ứng dụng vào ừ xương không bị lây ương không bị lây ng không b lây ịnh hài cốt và huyết thống.
nhi m ễm
Trang 12Chu kỳ nhân bội vùng D-loop:
35μm hoặc có thể tồn tại ở dạng mạch thẳng X 94
0C/1p 5μm hoặc có thể tồn tại ở dạng mạch thẳng 60C/1p
Sử dụng máy PCR9700 với mỗi chu kỳ thực hiện như sau:
H thốt và huyết thống.ng máy PCR9700 dùng để ứng dụng vào nhân bội ADN ty thể ứng dụng vào
Trang 13Sử dụng máy giải trình tự có công nghệ hiện đại Miseq của hãng Illumina- Mỹ để
giải trình tự ADN vùng D-loop
Trang 14 Giải trình tự theo nguyên tắc của Sanger:
Trang 15 Gi i trình t trên máy t đ ng theo nguyên t c Sanger: ảm bảo cho quá trình tách ADN ty thể từ xương không bị lây ự trên máy tự động theo nguyên tắc Sanger: ự trên máy tự động theo nguyên tắc Sanger: ộ ắc Sanger:
S đ h th ng máy gi i trình t t đ ng ơng không bị lây ồ hệ thống máy giải trình tự tự động ốt và huyết thống ảm bảo cho quá trình tách ADN ty thể từ xương không bị lây ự trên máy tự động theo nguyên tắc Sanger: ự trên máy tự động theo nguyên tắc Sanger: ộ
Trang 16 Trình tự gene sau khi điện di mao quản
Trang 17 Sau khi giải được trình tự ADN ty thể của các mẫu cần giám định, các trình tự này được so sánh với nhau bằng phần mềm SeqScape2.5μm hoặc có thể tồn tại ở dạng mạch thẳng , sự so sánh này đều
thông qua trình tự chuẩn Anderson để tìm ra mối quan hệ huyết thống giữa chúng với nhau
Trang 18Đọc kết quả: