Phân loại xạ khuẩn – Phần 1 docx

Phân loại xạ khuẩn – Phần 1 Xạ khuẩn là nhóm vi khuẩn đặc biệt. Chúng có khuẩn lạc khô và đa số có dạng hình phóng xạ (actino-) nhưng khuẩn thể lại có dạng sợi phân nhánh như nấm (myces). Vì xạ khuẩn có cấu trúc nhân nguyên thuỷ như mọi vi khuẩn khác, chiều ngang của sợi cũng nhỏ như vi khuẩn, cho nên có tài liệu gọi chúng là nấm tia là không hợp lý. Xạ khuẩn phân bố rộng rãi trong tự nhiên. Số lượng đơn vị sinh khuẩn lạc (CFU- colony-forming unit) xạ khuẩn trong 1g đất thường đạt tới hàng triệu. Trên môi trường đặc đa số xạ khuẩn có hai koại khuẩn ty: khuẩn ty khí sinh (aerial mycelium) và khuẩn ty cơ chất (substrate mycelium). Nhiều loại chỉ có khuẩn ty cơ chất nhưng cũng có loại (như chi Sporichthya) lại chỉ có khuẩn ty khí sinh. Giữa khuẩn lạc thường thấy có nhiều bào tử màng mỏng gọi là bào tử trần (conidia hay conidiospores). Nếu bào tử nằm trong bào nang (sporangium) thì được gọi là nang bào tử hay bào tử kín (sporangiospores). Bào tử ở xạ khuẩn được sinh ra ở đầu một số khuẩn ty theo kiểu hình thành các vách ngăn (septa). Các chuỗi bào tử trần có thể chỉ là 1 bào tử (như ở Thermoactinomyces, Saccharomonospora, Promicromonospora, Micromonospora, Thermomonosspora ),có thể có 2 bào tử (như ở Microbispora), có thể là chuỗi ngắn (như ở Nocardia, Pseudonocardia, Streptoverticillium, Sporichthya, Actinomadura, Microtetraspora, Streptoalloteichus, Glycomyces, Amycolata, Amycolatopsis, Catellatospora, Microellobosporia ), có thể là chuỗi dài (như ở Streptomyces, Saccharopolyspora, Actinopolyspora, Kibdelosporangium, Kitasatosporia, Saccharothrix, nhiều loài ở Nocardia, Nocardioides, Pseudonocardia, Amycolatopsis, Streptoverticillium ), có thể các bào tử trần nằm trên bó sợi (synnema), tương tự bó sợi của nấm (như ở Actinosynnema, Actinomadura ). Các chuỗi bào tử có thể thẳng, có thể xoắn, có thể ở dạng lượn sóng, có thể mọc đơn hay mọc vòng Các cuống sinh bào tử (sporophore) và cuống sinh nang bào tử (sporangiophorres) có thể riêng rẽ, có thể phân nhánh. Các đặc điểm hình thái này rất quan trọng khi tiến hành định tên xạ khuẩn. Xạ khuẩn thuộc nhóm vi khuẩn Gram dương, thường có tỷ lệ GC trong ADN cao hơn 55%. Trong số khoảng 1000 chi và 5000 loài sinh vật nhân sơ đã công bố có khoảng 100 chi và 1000 loài xạ khuẩn. Xạ khuẩn phân bố chủ yếu trong đất và đóng vai trò rất quan trọng trong chu trình tuần hoàn vật chất trong tự nhiên. Chúng sử dụng acid humic và các chất hữu cơ khó phân giải khác trong đất. Mặc dù xạ khuẩn thuộc nhóm sinh vật nhân sơ nhưng chúng thường sinh trưởng dưới dạng sợi và thường tạo nhiều bào tử. Thậm chí một số loại xạ khuẩn còn hình thành túi bào tử như chi Streptosporangium, Micromonospora và bào tử di động như chi Actinoplanes, Kineosporia. Trước đây, vị trí phân loại của Xạ khuẩn luôn là câu hỏi gây nhiều tranh luận giữa các nhà Vi sinh vật học ,do nó có những đặc điểm vừa giống Vi khuẩn vừa giống Nấm. Tuy nhiên, đến nay, Xạ khuẩn đã được chứng minh là Vi khuẩn với những bằng chứng sau đây: 1. Một số xạ khuẩn như các loài thuộc chi Actinomyces và Nocardia rất giống với các loài vi khuẩn thuộc chi Lactobacillus và Corynebacterium. 2. Xạ khuẩn giống vi khuẩn ở chỗ không có nhân thật, chúng chỉ chứa nhiễm sắc chất phân bố dọc theo các sợi hoặc các tế bào. 3. Đường kính của sợi xạ khuẩn và bào tử giống với ở vi khuẩn. Đồng thời sợi xạ khuẩn thường không chứa vách ngăn. 4. Xạ khuẩn là đích tấn công của các thực khuẩn thể giống như vi khuẩn, trong khi đó, nấm không bị tấn công bởi thực khuẩn thể. 5. Xạ khuẩn thường nhạy cảm với các kháng sinh có tác dụng lên vi khuẩn, nhưng lại thường kháng với những kháng sinh tác dụng lên nấm như các polyen. 6. Xạ khuẩn không chứa chitin, chất có mặt trong sợi và bào tử của nhiều nấm, mà không có ở vi khuẩn. Đồng thời giống như phần lớn vi khuẩn, xạ khuẩn không chứa cellulose. 7. Tương tự với vi khuẩn, xạ khuẩn nhạy cảm với phản ứng acid của môi trường, đặc điểm này không có ở nấm. 8. Các đặc điểm về sợi và nang bào tử kín(sporangium) của chi Actinoplanes cho thấy có thể chi này là cầu nối giữa vi khuẩn và các nấm bậc thấp. Xạ khuẩn thuộc về lớp Actinobacteria, bộ Actinomycetales, bao gồm 10 dưới bộ, 35 họ, 110 chi và 1000 loài. Hiện nay, 478 loài đã được công bố thuộc chi Streptomyces và hơn 500 loài thuộc tất cả các chi còn lại và được xếp vào nhóm xạ khuẩn hiếm. Khuẩn lạc xạ khuẩn Khuẩn ty xạ khuẩn và bào tử Chuỗi bào tử trên cuống sinh bào tử dạng xoắn Bào tử xạ khuẩn Sự hình thành hai loại khuẩn ty sau khi bào tử xạ khuẩn nẩy mầm Sợi bào tử và chuỗi bào tử trần Một số dạng bào tử ở xạ khuẩn (SV tự chú thích từng hình) Một số dạng nang bào và nang bào tử ở xạ khuẩn [...]... A - 51- 1b 10 ,11 67 65- 72 63IV A A1γ + 1b 9(H2) Gordonia PII 69 64- Williamsia IV A + 1b 9(H2) PII 65 Skermania IV A + 1b 8(H4) PII 68 Dietzia IV A + PII 73 8(H2) 62IV A A1γ + Mycobacterium 9(H2) PII 70 64- IV A A1γ + 1b 8(H4) Nocardia PII 72 8(H2), IV A A1γ + 1b Rhodococcus 60PII 9(H2) 69 66- IV A A1γ + Tsukamurella 9 PII 73 Họ Micromonosporaceae 9(H4.6), Micromonospora II D A1γ’ - 3b 71PII 10 (H4,6)... g bão 14 /16 /1 hiệu hòa 15 /17 -15 /17 8 a +++ +++ - - b +++ +++ - c +++ +++ 2 Cyclopropan Methyl Methyl hòa 1 10- e -17 -18 - - - - - - - ++ - - - - - - ++ a ++ + +++ + (+) - - - b (+) + ++ +++ + - - - c+ +++ + - - - (v) +++ d+ +++ +++ +++ - - - a +++ ++ +++ (+) (+) (+) +++ - b+ + +++ +++ ++ ++ (+) - c+ + ++ + + +++ (+) - d+ 3 + + +++ ++ +++ (+) +++ - (v): ít hơn 5% Thành phần menaquinone: Xạ khuẩn chỉ... 10 (H4,6) 72 9(H4,6), Actinoplanes II D A1γ’ - 3b 72PII 10 (H4,6) 9(H4,6), Cattelatospora II D 73 71- - PII 10 (H8,6) 10 (H4), Catenuloplanes 73 71- VI D A3α - PIII 11 (H4) 73 69- Couchioplanes VI D A3α - 9(H4) PII 72 69- Dactylosporangium II D A1γ - 3b 9(H4,6,8) PII 73 Pilimelia II D A1γ - 2d 9(H4,2) PII 71 Spirilliplanes II PII 69 Verrucosispora II - 2d 10 (H4) A1γ’ - 2b 9(H4) PII 70 Họ Propionibacteriaceae... A1γ - 9(H4,6) PII 71 Actinokineospora III C A1γ - 9(H4) PII 73 Kutzneria 9(H4) PII 70- III C - 71 9(H4), III C A1γ - Saccharothrix 70PII 10 (H4) 76 Họ Streptosporangiaceae 69Streptosporangium III B A1γ - 3c 9(H0,2,4) PIV 71 PIV/ 68- Acrocarpospora III B A1γ - 9(H2,4) PII Herbidospora III B - 10 (H4,6) 69 PIV 71 67- Microbispora III B A1γ - 3c 9(H0,2,4) PIV 74 Microtetraspora III B A1γ - 3c 9(H0,2,4) PIV...Một số dạng chuỗi bào tử ở xạ khuẩn (SV tự chú thích từng hình) Đặc điểm của khuẩn ty khí sinh và khuẩn ty cơ chất được trình bày trong sơ đồ sau đây: Để phân loại xạ khuẩn người ta sử dụng các tiêu chuẩn như trình tự rADN 16 S, lai ADN, hình thái, sinh lý sinh hóa và hóa phân loại Hiện nay, đại đa số các nhà khoa học đồng ý với quan niệm hai chủng được... giữa hai trình tự rADN 16 S là 98.6% thì xác suất để mức độ giống nhau trong phép lai ADN thấp hơn 70% sẽ là 99% Vì thế giá trị tương đồng 98.6% của trình tự rADN 16 S được coi là ngưỡng để phân biệt hai loài khác nhau Tuy nhiên, cũng có nhiều nhà khoa học lấy giá trị này là 98% Đặc biệt hóa phân loại là rất quan trọng trong việc phân loại xạ khuẩn Chúng rất có ích trong phân loại ở mức độ đến chi Đó... đường, loại acetyl, acid mycolic trong thành tế bào, menaquinone, phospholipid, acid béo và tỷ lệ GC trong ADN 1= Chi; 2 =Loại thành tế bào ; 3=Thành phần đường ; 4 =Loại peptido glycan ; 5=Acid mycolic 6=Thành phần acid béo ; 7=Mena quinon chủ yếu ; 8 =Loại phospholipid ; 9=Tỷ lệ mol GC trong ADN (%) 1 2 3 4 5 6 7 8 9 Họ Corynebacteriaceae và một số họ liên quan 8(H2), Corynebacterium IV A A1γ + 1a PI... 9(H6,8) Actinomadura PI 70 69- III B A1γ - 3e 9(H4,6) Spirillospora PI 71 Họ Glycomycetaceae 10 (H4), Glycomyces II - 2c 71PI 11 (H4) 73 Họ Streptomycetaceae 69Streptomyces I A3γ - 2c 9(H6,8) PII 78 66A3γ - Kitasatospora I/III 9(H6,8) PII 73 Họ Frankiaceae và một số họ liên quan 66Frankia III - 1 9(H4,6,8) PI 71 73- Geodermatophilus III - 2b 9(H4) PII 76 Microsphaera A1γ - III Cryptosporangium II Sporichthya... Nonomuraea III B A1γ - 3c 9(H0,2,4) PIV 69 70- Planobispora III B A1γ - 3c 9(H0,2,4) PIV 71 Planomonospora III B A1γ - 3c 9(H0,2,4) PIV 72 Planotetrespora III B PIV - 3c Họ Nocardiopsaceae 64Nocardiopsis III C A1γ - 3d 10 (H2,4,6) PIII 69 Thermobifida III C - 3c 10 (H6,8) PII Họ Thermomonosporaceae Thermomonospora III B A1γ - 3e 9(H6,8) PI Actinocollaria PII 73 III - 3e 9(H4,6) 66III B A1γ - 3a 9(H6,8)... Actinobispora IV A A1γ - PIV 71 9(H2) 9(H4), Actinopolyspora IV A A1γ - 2c 64PIII 10 (H4) 68 66- Amycolatopsis III A A1γ - 9(H2,4,6) PII 69 Kibdelosporangium III A - 3c 9(H4) PII 66 67- Prauserella IV A - 3f 9(H2,4) PII 69 69- Saccharomonospora III A A1γ - 2a 9(H4) PII 74 70- Saccharopolyspora IV A A1γ - 2c 9(H4) PIII 77 69- Thermocrispum III C - 9(H4) PII 73 Họ Actinosynnemataceae 69Actinosynnema III C A1γ - 9(H4,6) . Phân loại xạ khuẩn – Phần 1 Xạ khuẩn là nhóm vi khuẩn đặc biệt. Chúng có khuẩn lạc khô và đa số có dạng hình phóng xạ (actino-) nhưng khuẩn thể lại có dạng sợi phân nhánh như. xếp vào nhóm xạ khuẩn hiếm. Khuẩn lạc xạ khuẩn Khuẩn ty xạ khuẩn và bào tử Chuỗi bào tử trên cuống sinh bào tử dạng xoắn Bào tử xạ khuẩn Sự hình thành hai loại khuẩn ty sau. (%) 1 2 3 4 5 6 7 8 9 Họ Corynebacteriaceae và một số họ liên quan Corynebacterium IV A A1γ + 1a 8(H 2 ), 9(H 2 ) PI 51- 67 Turicella IV A - 1b 10 ,11 65- 72 Gordonia IV A A1γ + 1b 9(H 2 )