Đánh giá kỹ thuật xpert mtb xdr phát hiện lao kháng thuốc tại viện phổi trung ương

ĐẠI HỌC QUỐC GIA HÀ NỘI TRƯỜNG ĐẠI HỌC Y DƯỢC -o0o - ĐINH THỊ PHƯƠNG THANH ĐÁNH GIÁ KỸ THUẬT XPERT MTB/XDR PHÁT HIỆN LAO KHÁNG THUỐC TẠI VIỆN PHỔI TRUNG ƯƠNG KHÓA LUẬN TỐT NGHIỆP ĐẠI HỌC CHUYÊN NGÀNH KỸ THUẬT XÉT NGHIỆM Y HỌC Hà Nội - 2023 TRƯỜNG ĐẠI HỌC QUỐC GIA HÀ NỘI ĐẠI HỌC Y DƯỢC -o0o - ĐINH THỊ PHƯƠNG THANH ĐÁNH GIÁ KỸ THUẬT XPERT MTB/XDR PHÁT HIỆN LAO KHÁNG THUỐC TẠI VIỆN PHỔI TRUNG ƯƠNG KHÓA LUẬN TỐT NGHIỆP ĐẠI HỌC CHUYÊN NGÀNH KỸ THUẬT XÉT NGHIỆM Y HỌC Khóa: QH.2019.XN Người hướng dẫn: ThS Đinh Thị Hương ThS Nguyễn Thanh Huyền Hà Nội - 2023 LỜI CẢM ƠN Trong trình học tập, nghiên cứu hồn thành khóa luận này, em nhận nhiều giúp đỡ thầy cô bạn bè Với lòng biết ơn sâu sắc, em xin chân thành gửi lời cảm ơn tới: Ban Giám hiệu Trường Đại học Y Dược, thầy cô giáo truyền lửa, trang bị kiến thức, kỹ cho em suốt năm học trường Bộ môn Vi sinh y học kiểm soát nhiễm khuẩn- trường Đại học Y Dược thầy chủ nhiệm môn PGS.TS Nguyễn Văn Hưng tạo điều kiện thuận lợi giúp em hoàn thành tốt khóa luận Ban Giám đốc Bệnh viên Phổi TW; Trưởng khoa Vi sinh Labo lao Chuẩn Quốc gia; thầy cô, anh chị khoa Vi Sinh Labo lao Chuẩn Quốc gia hướng dẫn, giúp đỡ đồng hành em suốt trình nghiên cứu Khoa Em xin tỏ lịng kính trọng biết ơn tới: ThS Nguyễn Thanh Huyền - giảng viên mơn Vi sinh Kiểm sốt nhiễm khuẩn trường Đại học Y Dược, người hướng dẫn trực tiếp cho em hồn thành tốt khóa luận tốt nghiệp ThS Đinh Thị Hương - cán Khoa Vi sinh Labo lao chuẩn Quốc gia, Bệnh viện Phổi TW, giảng viên mơn Vi sinh kiểm sốt nhiễm khuẩn trường Đại học Y Dược, cô ln hết lịng giúp đỡ suốt q trình nghiên cứu làm khóa luận tốt nghiệp Cuối em xin bày tỏ lòng biết ơn tới cha mẹ, anh chị em gia đình, bạn bè động viên, chia sẻ với em suốt trình học tập nghiên cứu Hà Nội, ngày tháng năm 2023 Sinh viên ĐINH THỊ PHƯƠNG THANH LỜI CAM ĐOAN Em Đinh Thị Phương Thanh, sinh viên khóa QH 2019 XN, ngành Kỹ thuật Xét nghiệm Y Học, Trường Đại học Y Dược, Đại học Quốc gia Hà Nội, xin cam đoan: Đây khóa luận thân em trực tiếp thực hướng dẫn ThS Đinh Thị Hương ThS Nguyễn Thanh Huyền Cơng trình khơng trùng lặp với nghiên cứu khác công bố Việt Nam Các số liệu thông tin nghiên cứu hồn tồn xác, trung thực khách quan, xác nhận chấp thuận sở nơi nghiên cứu Em xin hoàn toàn chịu trách nhiệm trước pháp luật cam kết Hà Nội, ngày , tháng , năm 2023 Tác giả ĐINH THỊ PHƯƠNG THANH DANH MỤC TỪ VIẾT TẮT AFB Acid fast bacilli- trực khuẩn kháng acid AIDS AMK Acquired Immuno Deficiency Syndrom - Hội chứng suy giảm miễn dịch mắc phải Amikacin AND Acid deoxyribonucleic BK Bacilie de Koch- trực khuẩn kháng acid CAP Capreomycin CTCLQG Chương trình Chống lao Quốc gia EMB Ethambutol ETH Ethionamide FLQs Fluoroquinolon GC Ống chứng GU Đơn vị sinh trưởng HIV Human Immuno - deficiency Virus - Virus gây suy giảm miễn dịch người INH Isoniazid KAN Kanamycin KSĐ Kháng sinh đồ LFX Levoft oxacin LJ Lowenstein- Jensen LPA (Line Probe Assay) Lai đầu dò LZD Linezolid MDR- TB Lao đa kháng thuốc MFX Moxift oxacin MM (Master mix) Hóa chất nhân gen MOH Bộ Y tế MUT (Mutation probe) Đột biến mẫu dò MTB/M tuberculosis Mycobacterium tuberculosis MTB/XDR XDR – TB Lao siêu kháng NA (Not applicable) Không áp dụng NAAT Xét nghiệm khuếch đại axit nucleic (Nucleic Aicd Amplification Tests) NSP Kế hoạch Chiến lược Quốc gia PCC (Probe check control) Đối chứng kiểm tra mẫu dò PCR Phản ứng nhân gen (Polymerase chain reaction) PZA Pyrazinamid QRDR Kháng quinolone gyr4 gyrB RIF/RR Rifampicin RR - TB Lao kháng Rifampicin RRDW Vùng xác định kháng Rifampicin (rifampicin resistancedetermining region) rRNA Ribosomal ribonucleic acid SLID Thuốc tiêm bậc hai SPC Đối chứng trình xử lý mẫu (Sample processing control) SR Dung dịch xử lý mẫu xét nghiệm GeneXpert STR Streptomycin STRIP Màng lai có gắn mẫu dị chun biệt TBI Phát điều trị nhiễm lao USAID Cơ quan Phát triển Quốc tế Hoa Kỳ USG Chính phủ Hoa Kỳ WT (Wild-type) Chủng hoang dại WHO Tổ chức Y tế Thế giới XN Xét nghiệm DANH MỤC HÌNH ẢNH Hình I.1 Mycobacterium tuberculosis [8] .1 Hình II.1 (a) Cấu trúc strip GenoType MTBDRplus Version (LPA đa kháng); (b) Cấu trúc strip GenoType MTBDRsl Version (LPA siêu kháng) 18 Hình II.2 Hệ thống GeneXpert MTB/XDR 19 Hình II.3 Bộ xét nghiệm Xpert MTB/XDR: (1) Cartridge, (2) Dung dịch xử lý SR 19 Hình II.4 Xử lý mẫu bệnh phẩm đờm 20 Hình II.5 Hình ảnh đặt cartridge vào khoang module 22 DANH MỤC BẢNG BIỂU Bảng II.1 Bảng so sánh kết xét nghiệm tương đương 15 Bảng II.2 Các kết xảy 23 Bảng II.3 Các loại biến đổi xác định loại kháng thuốc 24 Bảng III.1 Bảng so sánh kết kháng INH 26 Bảng III.2 Bảng so sánh kết kháng nhóm thuốc FLQ 26 Bảng III.3 Bảng so sánh kết kháng nhóm thuốc tiêm hàng 27 Bảng III.4 Bảng so sánh kết kháng INH LPA với KSĐ lỏng 27 Bảng III.5 Bảng so sánh kết kháng nhóm thuốc FLQ LPA với KSĐ lỏng .28 Bảng III.6 Bảng so sánh kết kháng nhóm thuốc tiêm hàng 28 Bảng III.7 Bảng tổng hợp độ nhạy độ đặc hiệu .29 Bảng IV.1 Bảng so sánh phương pháp Xpert MTB/XDR, LPA KSĐ lỏng 32 Biểu đồ I.1 Số người toàn cầu báo cáo đăng ký điều trị MDR/RR-TB, 2015–2020 [2] MỤC LỤC CHƯƠNG I TỔNG QUAN TÀI LIỆU .1 Đặc điểm vi khuẩn lao 1.1 Đặc điểm hình thể: 1.2 Tính chất nuôi cấy 1.3 1.4 Sức đề kháng Phân loại 1.5 Khả chế gây bệnh Tổng quan bệnh lao kháng thuốc 2.1 Phân loại bệnh lao kháng thuốc .3 2.2 2.3 2.4 Các loại thuốc kháng lao Tình hình bệnh lao kháng thuốc giới Tình hình bệnh lao kháng thuốc Việt Nam Gen đột biến kháng thuốc Mycobacterium Tuberculosis .7 3.1 Kháng Rifampicin 3.2 3.3 3.4 Kháng Isoniazid .7 Kháng Ethambutol Kháng Pyrazinamid 3.5 3.6 3.7 3.8 3.9 3.10 3.11 Kháng Levofloxacin moxifloxacin .8 Bedaquiline clofazimine .8 Kháng Linezolid Kháng Delamanid Kháng Amikacin Kháng Streptomycin Kháng Ethionamid Các kỹ thuật chẩn đoán lao kháng thuốc 10 4.1 Kỹ thuật Kháng sinh đồ phát lao kháng thuốc môi trường lỏng hệ thống Bactec - MGIT 10 4.2 Kỹ thuật xét nghiệm Xpert MTB/Rif phát lao kháng Rifampicin 10 4.3 Kỹ thuật xét nghiệm Line Probe Assay (LPA) để phát kiểu gen MTB kháng thuốc 11 4.4 Kỹ thuật xét nghiệm Xpert MTB/XDR 12 CHƯƠNG II ĐỐI TƯỢNG VÀ PHƯƠNG PHÁP NGHIÊN CỨU .14 Đối tượng nghiên cứu 14 1.1 Tiêu chuẩn lựa chọn 14 1.2 Tiêu chuẩn loại trừ 14 Địa điểm thời gian nghiên cứu 14 Phương pháp nghiên cứu thu thập số liệu 14 3.1 Thiết kế nghiên cứu .14 3.2 3.3 3.4 Cỡ mẫu phương pháp chọn mẫu nghiên cứu 14 Công cụ thu thập số liệu 14 Các biến số nghiên cứu 15 3.5 Thu thập xử lý số liệu .15 3.6 Nội dung nghiên cứu - kỹ thuật thực .15 3.7 Sơ đồ phương pháp nghiên cứu .25 Đạo đức nghiên cứu 25 CHƯƠNG III KẾT QUẢ 26 Độ nhạy độ đặc hiệu xét nghiệm Xpert MTB/XDR bệnh viện Phổi Trung ương 26 1.1 Độ nhạy độ đặc hiệu xét nghiệm Xpert MTB/XDR tính kháng thuốc Isoniazid 26 1.2 Độ nhạy độ đặc hiệu xét nghiệm Xpert MTB/XDR tính kháng nhóm thuốc Fluoroquinolon 26 1.3 Độ nhạy độ đặc hiệu xét nghiệm Xpert MTB/XDR tính kháng nhóm thuốc tiêm hàng (Amikacin, Capreomycin, Kanamicin) 27 Độ nhạy độ đặc hiệu xét nghiệm MTB siêu kháng LPA so với phương pháp phát kiểu hình Kháng sinh đồ lỏng 27 2.1 Độ nhạy độ đặc hiệu xét nghiệm LPA tính kháng thuốc Isoniazid 27 2.2 Độ nhạy độ đặc hiệu xét nghiệm LPA tính kháng nhóm thuốc Fluoroquinolon 28 2.3 Độ nhạy độ đặc hiệu xét nghiệm LPA tính kháng nhóm thuốc tiêm hàng (Amikacin, Capreomycin, Kanamicin) 28 So sánh độ xác xét nghiệm Xpert MTB/XDR với xét nghiệm MTB siêu kháng LPA 29  Resistance DETECTED: Phát kháng thuốc  Resistance NOT DETECTED: Không phát kháng thuốc  Resistance INDETERMINATE: Kháng không xác định Trong xét nghiệm Xpert MTB/XDR phát kháng thuốc lao nhắm tới gen, vùng codon đột biến nucleotid bao phủ cho gen từ xác định suy tính kháng thuốc, cụ thể bảng sau: Bảng II.3 Các loại biến đổi xác định loại kháng thuốc Loại thuốc Isoniazid Mục tiêu gen Vùng codon Vùng khởi Không áp dụng động gen inhA (Not applicable- Nucleotid -1 đến -32 liên gen NA) Ethionamide Kat G 311 - 319 939 - 957 fabG1 199 - 210 597 - 630 Vùng liên gen oxyR - ahpC NA -5 đến -50 liên gen (hoặc -47 đến -92) Vùng khởi động gen inhA NA -1 đến -32 liên gen 87 - 95 261 - 285 531 - 544 1596 - 1632 Fluoroquinolone gyrA gyrB (hoặc 492-505) Amikacin, Kanamycin, Capreomycin rrs NA 1396 - 1417 Vùng khởi động gen eis NA -6 đến -42 liên gen Trang 24 3.7 Sơ đồ phương pháp nghiên cứu Đạo đức nghiên cứu  Kết xét nghiệm thu thập, không bao gồm thông tin định danh người bệnh Người bệnh mã hóa để đảm bảo tính bảo mật  Số liệu khoa Vi sinh Labo lao chuẩn Quốc gia - Bệnh viện Phổi Trung ương cho phép cơng bố dạng khóa luận Trang 25 CHƯƠNG III KẾT QUẢ Độ nhạy độ đặc hiệu xét nghiệm Xpert MTB/XDR bệnh viện Phổi Trung ương 1.1 Độ nhạy độ đặc hiệu xét nghiệm Xpert MTB/XDR tính kháng thuốc Isoniazid Bảng III.1 Bảng so sánh kết kháng INH xét nghiệm Xpert MTB/XDR với KSĐ lỏng Xét nghiệm KSĐ lỏng Xét nghiệm Xpert MTB/XDR Kháng Kháng Nhạy 33 0 Nhạy Độ nhạy độ đặc hiệu xét nghiệm Xpert MTB/XDR với xét nghiệm KSĐ lỏng thuốc INH sau:  Độ nhạy= [33/ (33+0)] x 100= 100%  Độ đặc hiệu= [7/ (7+ 0)] x 100= 100% 1.2 Độ nhạy độ đặc hiệu xét nghiệm Xpert MTB/XDR tính kháng nhóm thuốc Fluoroquinolon Bảng III.2 Bảng so sánh kết kháng nhóm thuốc FLQ xét nghiệm Xpert MTB/XDR với KSĐ lỏng Xét nghiệm KSĐ lỏng Xét nghiệm Xpert MTB/XDR Kháng Nhạy Kháng Nhạy 33  Độ nhạy= [6/ (6+1)] x 100= 85.7%  Độ đặc hiệu= [33/ (33+ 0)] x 100= 100% Độ nhạy độ đặc hiệu xét nghiệm Xpert MTB/XDR với xét nghiệm KSĐ lỏng nhóm thuốc FLQ 85.7% 100% Trang 26 1.3 Độ nhạy độ đặc hiệu xét nghiệm Xpert MTB/XDR tính kháng nhóm thuốc tiêm hàng (Amikacin, Capreomycin, Kanamicin) Bảng III.3 Bảng so sánh kết kháng nhóm thuốc tiêm hàng xét nghiệm Xpert MTB/XDR với KSĐ lỏng Xét nghiệm KSĐ lỏng Kháng Nhạy Kháng Nhạy 34 Xét nghiệm Xpert MTB/XDR  Độ nhạy= [5/ (5+0)] x 100= 100%  Độ đặc hiệu= [34/ (34+ 1)] x 100= 97.14% Độ nhạy độ đặc hiệu xét nghiệm Xpert MTB/XDR với xét nghiệm KSĐ lỏng nhóm thuốc tiêm hàng 100% 97.14% Độ nhạy độ đặc hiệu xét nghiệm MTB siêu kháng LPA so với phương pháp phát kiểu hình Kháng sinh đồ lỏng 2.1 Độ nhạy độ đặc hiệu xét nghiệm LPA tính kháng thuốc Isoniazid Bảng III.4 Bảng so sánh kết kháng INH LPA với KSĐ lỏng Xét nghiệm KSĐ lỏng Kháng Nhạy Kháng 33 Nhạy Xét nghiệm LPA  Độ nhạy= [33/ (33+0)] x 100= 100%  Độ đặc hiệu= [6/ (6+ 1)] x 100= 85.7% Độ nhạy độ đặc hiệu xét nghiệm LPA với xét nghiệm KSĐ lỏng thuốc INH 100% 85.7% Trang 27 2.2 Độ nhạy độ đặc hiệu xét nghiệm LPA tính kháng nhóm thuốc Fluoroquinolon Bảng III.5 Bảng so sánh kết kháng nhóm thuốc FLQ LPA với KSĐ lỏng Xét nghiệm KSĐ lỏng Kháng Nhạy Kháng Nhạy 32 Xét nghiệm LPA  Độ nhạy= [6/ (6+1)] x 100= 85.7%  Độ đặc hiệu= [32/ (32+ 1)] x 100= 97% Độ nhạy độ đặc hiệu xét nghiệm LPA với xét nghiệm KSĐ lỏng nhóm thuốc FLQ 85.7% 97% 2.3 Độ nhạy độ đặc hiệu xét nghiệm LPA tính kháng nhóm thuốc tiêm hàng (Amikacin, Capreomycin, Kanamicin) Bảng III.6 Bảng so sánh kết kháng nhóm thuốc tiêm hàng LPA với KSĐ lỏng Xét nghiệm KSĐ lỏng Kháng Nhạy Kháng 10 Nhạy 25 Xét nghiệm LPA  Độ nhạy= [5/ (5+0)] x 100= 100%  Độ đặc hiệu= [25/ (25+ 10)] x 100= 71.43% Độ nhạy độ đặc hiệu xét nghiệm LPA với xét nghiệm KSĐ lỏng nhóm thuốc tiêm bậc 100% 71.43% Trang 28 So sánh độ xác xét nghiệm Xpert MTB/XDR với xét nghiệm MTB siêu kháng LPA Bảng III.7 Bảng tổng hợp độ nhạy độ đặc hiệu xét nghiệm Xpert MTB/XDR xét nghiệm LPA với nhóm thuốc Các nhóm thuốc Nhóm thuốc FLQ INH Loại xét nghiệm Nhóm thuốc tiêm hàng (AMK, CAP, KAN) Độ nhạy Độ đặc hiệu Độ nhạy Độ đặc hiệu Độ nhạy Độ đặc hiệu Xpert MTB/XDR 100 100 85.7 100 100 97.14 LPA 100 85.7 85.7 97 100 71.43 Như vậy, độ nhạy kỹ thuật Xpert MTB/XDR hoàn toàn tương đương với xét nghiệm MTB siêu kháng LPA với ỊNH nhóm thuốc FLQ thuốc tiêm hàng Trong độ đặc hiệu kỹ thuật Xpert MTB/XDR ghi nhận cao với thuốc INH nhóm thuốc tiêm hang gần tương đương với nhóm thuốc FLQ Trang 29 CHƯƠNG IV BÀN LUẬN Độ nhạy, độ đặc hiệu xét nghiệm Xpert MTB/XDR viện Phổi Trung ương Độ nhạy xét nghiệm Xpert MTB/XDR sử dụng Kháng sinh đồ lỏng làm tiêu chuẩn tham chiếu đạt 100% với thuốc INH nhóm thuốc tiêm hàng (AMK, CAP, KAN) Trong độ nhạy xét nghiệm Xpert MTB/XDR với nhóm thuốc FLQ đạt đạt 85.7% (bảng III.2), ghi nhận trường hợp người bệnh kháng FLQ làm XN KSĐ lỏng lại nhạy XN Xpert MTB/XDR Có thể giải thích cho trường hợp bất đồng đột biến gene quy định tính kháng FLQ biểu thành kiểu hình nhiên đột biến không thuộc vùng gene khuếch đại phát xét nghiệm Xpert MTB/XDR Độ đặc hiệu xét nghiệm Xpert MTB/XDR sử dụng Kháng sinh đồ lỏng làm tiêu chuẩn tham chiếu đạt 100% với thuốc INH nhóm thuốc FLQ Trong độ đặc hiệu nhóm thuốc tiêm bậc xét nghiệm Xpert MTB/XDR đạt 97.14% (bảng III.3) Đây nghiên cứu Việt Nam đánh giá độ nhạy độ đặc hiệu xét nghiệm Xpert MTB/XDR Trên Thế giới có số cơng trình nghiên cứu đánh giá độ nhạy độ đặc hiệu Xpert MTB/XDR cho kết tương đương với kết phân tích khóa luận Với nghiên cứu năm 2020 tác giả A Penn-Nicholson cộng cho kết đánh giá phát tính kháng loại thuốc INH, FLQ, thuốc tiêm bậc độ nhạy đạt 94%, 94%, 61% - 86% độ đặc hiệu đạt 100%, 99%, 98% - 100% [15], [16] Hay đánh độ nhạy, độ đặc hiệu xét nghiệm Xpert MTB/XDR, tác giả Yuan Cao thực so sánh kết phương pháp kháng sinh đồ lỏng giải trình tự gen, kết so sánh với phương pháp kháng sinh đồ lỏng đạt 91%, cụ thể độ nhạy độ đặc hiệu 98,3% 95% kháng thuốc INH; 91.4% 98.5% kháng nhóm thuốc FLQ [17] Và nghiên cứu tác giả Rehan R Syed cộng cho kết tương đồng với kết nghiên cứu chúng tôi, thực mẫu đờm trực tiếp từ 566 người tham gia Moldova năm độ nhạy độ nhạy độ đặc hiệu so với phương pháp kháng sinh đồ lỏng với thuốc INH đạt 100%; nhóm thuốc FLQ 84.8% 99.1%; thuốc tiêm bậc 54.3% - 87% 84.1% 100% [18] Như độ nhạy, độ đặc hiệu Xpert MTB/XDR thuốc INH nghiên cứu gần 94% độ nhạy 95% độ đặc hiệu; Trang 30 nhóm thuốc FLQ 84% độ nhạy, 98% độ đặc hiệu, phù hợp với kết nghiên cứu khóa luận thực Bệnh viện Phổi TW (độ nhạy 85% độ đặc hiệu 99%) Mặc dù kết ghi nhận 100% độ đặc hiệu với INH, không ghi nhận trường hợp mẫu nhạy giả, nhiên có nghiên cứu Xpert XDR có nguy nhạy giả với thuốc INH có codon dừng katG (W135 E607) không xác định xét nghiệm Xpert MTB/XDR [15] Như vậy, xét nghiệm Xpert MTB/XDR với thời gian thực nhanh vòng 90 phút cho kết quả, thao tác đơn giản độ nhạy cao, độ đặc hiệu xét nghiệm có giá trị so với xét nghiệm KSĐ lỏng giai đoạn ban đầu chẩn đoán, giúp người bệnh kịp thời điều trị bệnh So sánh độ nhạy, độ đặc hiệu xét nghiệm Xpert MTB/XDR với kỹ thuật phân tử MTB LPA Dựa vào kết xét nghiệm thực trên quần thể 40 mẫu bệnh phẩm kháng thuốc khóa luận này, sau phân tích số liệu cho thấy độ nhạy xét nghiệm Xpert MTB/XDR xét nghiệm LPA tương đương sử dụng phương pháp tham chiếu xét nghiệm KSĐ lỏng Vì XN Xpert MTB/XDR XN LPA theo nguyên lý phát kiểu gen, kỹ thuật KSĐ lỏng phát kháng thuốc dựa phát kiểu hình nên có tương đồng xét nghiệm so sánh Độ đặc hiệu xét nghiệm Xpert MTB/XDR xét nghiệm LPA gần tương đương nhau, nhiên tất loại thuốc xét nghiệm Xpert MTB/XDR cao xét nghiệm LPA, cụ thể thuốc INH nhóm thuốc tiêm hàng cao từ 14% - 26%, nhóm thuốc FLQ cao 3% Do mức độ phức tạp cao xét nghiệm MTB LPA, nên xét nghiệm thực phịng xét nghiệm an toàn sinh học cấp 2+ kỹ thuật viên có chun mơn cao Trong nghiên cứu tác giả G Gunther cộng đánh giá độ nhạy độ đặc hiệu phương pháp LPA đối chiếu với phương pháp kháng sinh đồ lỏng cho kết tương đương Cụ thể độ nhạy, độ đặc hiệu thuốc INH 89.7% 91.7%; thuốc FLQ độ nhạy 85.7% độ đặc hiệu 94.7%; thuốc tiêm bậc đạt 75% độ nhạy 87.5% độ đặc hiệu [19] Như độ xác LPA tương đối cao thấp so với xét nghiệm Xpert MTB/XDR Điểm vượt trội xét nghiệm Xpert MTB/XDR so với LPA khả Trang 31 phát kháng thuốc INH, xét nghiệm Xpert MTB/XDR phát mục tiêu gen fabG1 ahpC -oxyR mà LPA không phát Tuy độ nhạy, độ đặc hiệu Xpert MTB/XDR tương đối cao so với phương pháp kháng sinh đồ lỏng mẫu nhạy giả Xpert MTB/XDR với nhóm thuốc INH theo nghiên cứu có kiểu hình kháng với thuốc INH mà khơng có đột biến kháng thuốc có độ tin cậy cao vùng gen bao phủ bới xét nghiệm Xpert MTB/XDR [15] Như độ đặc hiệu phương pháp Xpert MTB/XDR cao phương pháp LPA thuốc INH nhóm thuốc tiêm hàng cao từ 14% - 26%, nhóm thuốc FLQ cao 3% Cịn độ nhạy Xpert MTB/XDR LPA đạt 100% loại thuốc trừ nhóm thuốc FLQ (chỉ đạt 85.7%), độ nhạy phương pháp ngưỡng chấp nhận xét nghiệm Ngoài so sánh đặc điểm kỹ thuật triển khai Xpert MTB/XDR, LPA kháng sinh đồ lỏng, ta so sánh thời gian, thao tác thực hay sở vật chất, cụ thể bảng sau [20]: Bảng IV.1 Bảng so sánh phương pháp Xpert MTB/XDR, LPA KSĐ lỏng Loại XN Tiêu chí so sánh Xpert MTB/XDR LPA Kháng sinh đồ lỏng hàng 1, hàng Tương đối nhanh Lâu (6 tuần) (24 - 48h) PXN ATSH cấp PXN ATSH cấp PXN ATSH cấp Cơ sở vật chất 2+ 2+ Đơn giản, sai Phức tạp, yêu cầu Phức tạp, u cầu Thao tác thực sót độ xác cao độ xác cao Như vậy, xét chung ưu nhược điểm xét nghiệm xét nghiệm Xpert MTB/XDR xét nghiệm có giá trị giai đoạn đầu chẩn đoán lao kháng thuốc để kịp thời đưa bệnh nhân vào điều trị Xét nghiệm Kháng sinh đồ lỏng có giá trị xác nhận lại tính kháng thuốc trường hợp có bất đồng Thời gian Nhanh (90 phút) lâm sàng kết xét nghiệm vi sinh giai đoạn theo dõi điều trị kháng thuốc Đối với xét nghiệm LPA, yêu cầu sở vật chất, trang thiết bị tiên tiến, nhân lực có chun mơn cao nên hệ thống xét nghiệm CTCLQG có tỉnh thành thực xét nghiệm LPA phòng xét nghiệm Hà Nội, Cần Thơ, Đà Nẵng Hồ Chí Minh Đối với tỉnh khác cần vận chuyển Trang 32 mẫu xét nghiệm LPA tới đơn vị phòng xét nghiệm có định chẩn đốn lao kháng thuốc Chính dù xét nghiệm LPA cải thiện mặt thời gian so với kháng sinh đồ lỏng 24 - 48h thêm thời gian vận chuyển mẫu dẫn tới tăng thời gian trả kết giảm khả tiếp cận dịch vụ chẩn đoán lao kháng thuốc phương pháp sinh học phân tử người bệnh Với kỹ thuật Xpert MTB/XDR đưa vào triển khai nay, khơng u cầu sở vật chất, cần phịng xét nghiệm an toàn sinh học cấp hay kỹ thuật viên có chun mơn cao, triển khai rộng khắp sở y tế tuyến tỉnh tuyến quận huyện đầu tư để triển khai kỹ thuật Xpert MTB/XDR Do người bệnh có nhiều khả tiếp cận dịch vụ xét nghiệm lao kháng thuốc, kết xác, thời gian ngắn, giá hợp lý cho người bệnh [20] Chính vậy, CTCLQG triển khai chiến lược mở rộng điểm xét nghiệm Xpert MTB/XDR 63 tỉnh thành có sở xét nghiệm Xpert MTB/XDR tỉnh thành phố Tất trường hợp chẩn đoán lao xét nghiệm lao kháng thuốc đạt tỷ lệ điều trị thành công ca bệnh lao lao kháng thuốc cao Theo kế hoạch đặt ra, CTCLQG đưa mục tiêu Việt Nam chấm dứt bệnh lao vào năm 2035 [13] Ý nghĩa thực tiễn nghiên cứu Bài luận nghiên cứu Việt Nam độ xác xét nghiệm Xpert MTB/XDR Bài luận đưa chứng độ nhạy, độ đặc hiệu ưu điểm vượt trội xét nghiệm Xpert MTB/XDR để phát lao kháng thuốc Từ tạo tiền đề cho việc đưa xét nghiệm Xpert MTB/XDR vào sử dụng rộng rãi sở y tế nước Xét nghiệm Xpert MTB/XDR khắc phục hầu hết nhược điểm mà phương pháp thường quy sử dụng để xét nghiệm lao kháng thuốc thời gian, thao tác thực hiện, sở vật chất, nhân lực Cụ thể:  Thời gian xét nghiệm vịng 90 phút, việc có lợi ích lớn việc chẩn đoán sớm lao kháng thuốc Khi chẩn đốn sớm, xác lao kháng thuốc người bệnh kịp thời điều trị phác đồ, tăng khả điều trị thành công hạn chế tối đa lây lan lao kháng thuốc cho cộng đồng  Thao tác thực đơn giản, phù hợp với điều kiện phịng xét nghiệm khơng u cầu tay nghề cao sở hạ tầng tiên tiến  Kỹ thuật viên không yêu cầu chuyên môn cao Trang 33 KẾT LUẬN Qua nghiên cứu độ xác Xpert MTB/XDR so sánh giá trị kỹ thuật với xét nghiệm MTB siêu kháng LPA cỡ mẫu 40 bệnh nhân MDR - TB, tơi có số kết luận sau: Độ nhạy, độ đặc hiệu xét nghiệm Xpert MTB/XDR lấy phương pháp kháng sinh đồ lỏng làm phương pháp đối chiếu Độ nhạy phương pháp Xpert MTB/XDR với loại thuốc Isoniazid, nhóm thuốc tiêm hàng đạt 100%, riêng nhóm thuốc Fluoroquinolon đạt 85.7% Độ đặc hiệu phương pháp Xpert MTB/XDR với loại thuốc Isoniazid, nhóm thuốc Fluoroquinolon đạt 100%, riêng nhóm thuốc tiêm bậc đạt 97.14% Như độ nhạy, độ đặc hiệu phương pháp Xpert MTB/XDR gần tương đương với phương pháp coi tiêu chuẩn vàng để phát lao kháng thuốc (Kháng sinh đồ lỏng) Tuy nhiên phương pháp Xpert MTB/XDR vượt trội hẳn mặt thời gian với 90 phút cho kết quả, giảm tối đa thời gian chờ đợi kết xét nghiệm kháng thuốc bệnh nhân Trong xét nghiệm kháng sinh đồ - 12 tuần bao gồm thời gian chờ đợi nuôi cấy vi khuẩn lao, ngăn cản bệnh nhân điều trị phác đồ thuốc xác từ bắt đầu điều trị, tăng nguy gánh nặng bệnh tật cho bệnh nhân Phương pháp Xpert MTB/XDR đáp ứng tiêu chí độ nhạy, độ đặc hiệu, thời gian chẩn đốn nhanh chóng, giá thành hợp lí, triển khai kỹ thuật đơn giản cần đưa vào chẩn đoán thường quy ban đầu cho lao kháng thuốc So sánh độ nhạy, độ đặc hiệu xét nghiệm Xpert MTB/XDR so với phương pháp MTB LPA Độ nhạy phương pháp Xpert MTB/XDR so với phương pháp LPA lấy phương pháp kháng sinh đồ lỏng làm phương pháp đối chiếu cho kết tương đương Cụ thể với loại thuốc Isoniazid, nhóm thuốc tiêm bậc đạt 100%, nhóm thuốc Fluoroquinolon đạt 85.7% Độ đặc hiệu phương pháp Xpert MTB/XDR cao phương pháp LPA lấy phương pháp kháng sinh đồ lỏng làm phương pháp đối chiếu Cụ thể độ đặc hiệu Xpert MTB/XDR xét nghiệm MTB LPA với thuốc INH 100% 85.7%; với nhóm thuốc Fluoroquinolon 100%, 97%; với nhóm Trang 34 thuốc tiêm bậc 97.14 % 71.43% Như độ đặc hiệu phương pháp Xpert MTB/XDR cao phương pháp LPA thuốc INH nhóm thuốc tiêm hàng cao từ 14% - 26%, nhóm thuốc FLQ cao 3% Trang 35 KIẾN NGHỊ Xét nghiệm Xpert MTB/XDR nên triển khai rộng rãi sở y tế, bệnh viện; đưa vào xét nghiệm thường quy ban đầu để chẩn đoán lao kháng thuốc Trang 36 TÀI LIỆU THAM KHẢO [1] “Tổ chức Y tế Thế giới (2021), Báo cáo bệnh lao toàn cầu” [2] “World Health Organisation (2022), GLOBAL TUBERCULOSIS REPORT 2021” [3] “World Health Organisation (2022), WHO consolidated guidelines on tuberculosis.” [4] “World Health Oranisation, Practical considerations for implementation of the Cepheid Xpert MTB/XDR test” [5] “Cepheid Xpert MTB/XDR, (2021), [website], (https://www.cepheid.com/en/tests/ Critical-Infectious-Diseases/Xpert-MTB- XDR).” [6] "Trần Văn Hưng (2010), Vi Sinh Y Học, NXB Giáo dục Việt Nam" [7] “Lê Huy Chính, Vi sinh Y học, NXB Y Học” [8] Benh.vn, (2017), “Chẩn đoán bệnh lao phổi”, website https://benh.vn/chandoan-benh-lao-phoi-2418/ (truy cập 14 Tháng Mười-Một 2022) [9] "Đoàn Thị Nguyệt, Vi Sinh Vật, NXB giáo dục Việt Nam'' [10] “Bộ Y Tế, (2009), Hướng dẫn quản lý điều trị bệnh lao kháng đa thuốc NXB Y học” [11] “Bộ Y Tế, (2021), Hướng dẫn điều trị lao kháng thuốc” [12] “Vietnam Tuberculosis Roadmap Overview, Fiscal Year (2022)” website: https://www.usaid.gov/sites/default/files/documents/Vietnam_TBRM22_TB_DIAH _508c.pdf [13] “Vietnam Tuberculosis Roadmap Overview, Fiscal Year (2021)” [14] “World Health Organisation (2021), Catalogue of mutations in Mycobacterium tuberculosis complex and their association with drug resistance.” [15] A Penn-Nicholson c.s., (2021), “Clinical evaluation of the Xpert MTB/XDR assay for rapid detection of isoniazid, fluoroquinolone, ethionamide and second-line drug resistance: A cross-sectional multicentre diagnostic accuracy study” [16] A Penn-Nicholson c.s., (2022), “Detection of isoniazid, fluoroquinolone, ethionamide, amikacin, kanamycin, and capreomycin resistance by the Xpert MTB/XDR assay: a cross-sectional multicentre diagnostic accuracy study”, Trang 37 [17] Y Cao c.s., (2021), “Xpert MTB/XDR: a 10-Color Reflex Assay Suitable for Point-of-Care Settings To Detect Isoniazid, Fluoroquinolone, and Second-LineInjectable-Drug Resistance Directly from Mycobacterium tuberculosis-Positive Sputum” [18] R R Syed c.s., (2023), “Clinical Evaluation of the XDR-LFC Assay for the Molecular Detection of Isoniazid, Rifampin, Fluoroquinolone, Kanamycin, Capreomycin, and Amikacin Drug Resistance in a Prospective Cohort” [19] G Günther c.s., (2022), “Clinical Evaluation of a Line-Probe Assay for Tuberculosis Detection and Drug-Resistance Prediction in Namibia” [20] Bộ y tế, Chương trình chống lao quốc gia (2018), Quy trình thực hành chuẩn xét nghiệm vi khuẩn lao Trang 38