Khảo sát tính di truyền của một số gen trong hội chứng lynch ở người trẻ tuổi

BỘ GIÁO DỤC VÀ ĐÀO TẠO BỘ Y TẾ Đ Ạ I HỌ C Y D Ư Ợ C T HÀ N H P HỐ H Ồ C HÍ MI N H T R Ầ N Q U A NG K HA N G K HẢ O SÁ T T Í NH D I T R U Y Ề N C Ủ A M Ộ T SỐ G E N T R O NG HỘ I C HỨ NG L Y NC H Ở NG Ư Ờ I T R Ẻ T U Ổ I L U Ậ N V Ă N T HẠ C SỸ Y HỌ C T HÀ N H P HỐ H Ồ C HÍ MI N H , N ĂM 2 BỘ GIÁO DỤC VÀ ĐÀO TẠO BỘ Y TẾ Đ Ạ I HỌ C Y D Ư Ợ C T HÀ N H P HỐ H Ồ C HÍ MI N H T R Ầ N Q U A N G K H A NG K HẢ O SÁ T T Í NH D I T R U Y Ề N C Ủ A M Ộ T SỐ G E N T R O NG HỘ I C HỨ NG L Y NC H Ở NG Ư Ờ I T R Ẻ T U Ổ I N G À N H: K H O A H Ọ C Y S I N H – M Ô P H Ô I M Ã S Ố : 87 01 L U Ậ N V Ă N T HẠ C SỸ Y HỌ C NGƯ Ờ I HƯ Ớ NG D Ẫ N K HO A HỌ C : P GS.T S.BS HO ÀNG ANH V Ũ T HÀ N H P HỐ H Ồ C HÍ MI N H , N ĂM 2 L Ờ I CAM ĐO AN Luận văn cơng trình nghiên cứu cá nhân tơi, thực hướng dẫn khoa học PGS.Ts.Bs.Hoàng Anh Vũ Các số liệu, kết luận nghiên cứu trình bày luận văn hồn tồn trung thực Tơi xin hồn tồn chịu trách nhiệm lời cam đoan T ác giả lu ận v ăn T r ần Q uan g K han g MỤC L Ụ C Trang LỜI CAM ĐOAN DANH MỤC CÁC CHỮ VIẾT TẮT DANH MỤC CÁC BẢNG DANH MỤC CÁC SƠ ĐỒ, HÌNH MỞ ĐẦU MỤC TIÊU NGHIÊN CỨU CHƯƠNG TỔNG QUAN TÀI LIỆU 1.1 TỔNG QUAN VỀ UNG THƯ ĐẠI TRỰC TRÀNG 1.1.1 Dịch tễ học 1.1.2 Nguyên nhân yếu tố nguy gây UTĐTT người trẻ tuổi 1.1.3 Một số nghiên cứu giới 1.1.4 Một số nghiên cứu nước 1.2 BỆNH HỌC PHÂN TỬ TRONG UNG THƯ 1.3 CƠ CHẾ SỬA LỖI CỦA HỆ THỐNG GEN SỬA LỖI BẮT CẶP SAI DNA (MMR) 11 1.4 HỘI CHỨNG LYNCH 15 1.5 GEN MLH1 19 1.6 GEN MSH2 20 1.7 GEN MSH6 21 1.8 GEN PMS2 22 1.9 GEN EPCAM 23 1.10 SINH HỌC PHÂN TỬ TRONG CHẨN ĐOÁN GEN UNG THƯ 26 CHƯƠNG ĐỐI TƯỢNG VÀ PHƯƠNG PHÁP NGHIÊN CỨU 28 2.1 ĐỐI TƯỢNG NGHIÊN CỨU 28 2.1.1 Dân số mục tiêu 28 2.1.2 Dân số nghiên cứu 28 2.1.3 Tiêu chuẩn chọn mẫu 28 2.2 PHƯƠNG PHÁP NGHIÊN CỨU 28 2.2.1 Thiết kế nghiên cứu 28 2.2.2 Cỡ mẫu 29 2.2.3 Phương pháp chọn mẫu 29 2.2.4 Thời gian địa điểm nghiên cứu 29 2.2.5 Thu thập số liệu 29 2.2.6 Các bước tiến hành nghiên cứu 31 2.2.7 Phương pháp kỹ thuật nghiên cứu 32 2.2.8 Quy trình khảo sát đột biến gen MLH1, MSH2, MSH6, PMS2, EPCAM 34 CHƯƠNG KẾT QUẢ NGHIÊN CỨU 3.1 ĐẶC ĐIỂM DÂN SỐ NGHIÊN CỨU 45 45 3.2 XÁC ĐỊNH CÁC ĐỘT BIẾN MẦM TRÊN CÁC GEN MLH1, MSH2, 47 MSH6, PMS2, EPCAM TRÊN ĐỐI TƯỢNG NGHIÊN CỨU 3.2.1 Tách chiết DNA tổng số 47 3.2.2 Chuẩn bị thông số kỹ thuật cho giải trình tự gen hệ 48 3.2.3 Kết phân tích NGS 50 3.2.4 Kết Sanger xác nhận lại đột biến mầm từ kết NGS 54 3.3 XÁC ĐỊNH TỶ LỆ ĐỘT BIẾN TRONG GIA ĐÌNH BỆNH NHÂN CĨ ĐỘT BIẾN MẦM 57 3.3.1 Tư vấn thu thập mẫu gia đình bệnh nhân 57 3.3.2 Giải trình tự mẫu thân nhân phương pháp Sanger 58 3.3.3 Kết phả hệ gia đình bệnh nhân có đột biến 60 3.4 THIẾT LẬP QUY TRÌNH TƯ VẤN DI TRUYỀN CHO GIA ĐÌNH BỆNH NHÂN MANG HỘI CHỨNG LYNCH 63 3.4.1 Đối tượng cần xét nghiệm di truyền hội chứng Lynch 63 3.4.2 Tư vấn kỹ thuật xét nghiệm sử dụng khảo sát đột biến gen 67 3.4.3 Tư vấn sau xét nghiệm người có nguy ung thư đại trực tràng cao 68 CHƯƠNG 4: BÀN LUẬN 70 4.1 Tỷ lệ đột biến mầm 70 4.2 Tỷ lệ đột biến thân nhân 73 4.3 Tư vấn di truyền 74 4.4 Hạn chế nghiên cứu 75 KẾT LUẬN 77 KIẾN NGHỊ 78 DANH MỤC TÀI LIỆU THAM KHẢO PHỤ LỤC PHỤ LỤC PHIẾU ĐỒNG Ý THAM GIA NGHIÊN CỨU PHỤ LỤC DANH SÁCH ĐỐI TƯỢNG THAM GIA NGHIÊN CỨU PHỤ LỤC KẾT QUẢ GIẢI TRÌNH TỰ THẾ HỆ MỚI D A NH M Ụ C C Á C C H Ữ V IẾ T T Ắ T K ý h iệ u ch ữ viết t Ch ữ viết đ ầy đ ủ G iải ng hĩ a CMMRD Constitutional mismatch repair deficiency COSMIC Catalogue of somatic mutations Danh mục đột biến tế bào sinh dưỡng ung thư in cancer FAP Familial adenomatous polyposis Hội chứng đa polyp tuyến gia đình FISH Fluorescence in situ hybridization Lai huỳnh quang chỗ gDNA genomic deoxyribonucleic acid DNA gen HBV Hepatitis B Virus Siêu vi viêm gan B HNPCC Hereditary colorectal cancer nonpolyposis Ung thư đại trực tràng di truyền không phát sinh polyp HPV Human Papilloma Virus Virus gây u nhú người IBD Inflammatory bowel disease Bệnh viêm loét đại tràng ISH In situ hybridization Lai chỗ MSI Microsatellite Instability Mất ổn định vi vệ tinh MMR Mismatch repair Sửa lỗi bắt cặp sai NCBI The National Center for Biotechnology Information Trung tâm Thông tin Công nghệ Sinh học Quốc gia NGS Next-generation sequencing Giải trình tự gen hệ NST Nhiễm sắc thể Nhiễm sắc thể PCR Polymerase chain reaction Phản ứng chuỗi Polymerase UTĐTT Ung thư đại trực tràng Ung thư đại trực tràng WHO World Health Organization Tổ chức Y tế Thế giới Thiếu hụt yếu tố sửa lỗi bắt cặp sai D A NH MỤ C C Á C B Ả NG Bảng 1.1: Tổng quan protein sửa lỗi sai 13 Bảng 1.2: Tỷ lệ đột biến gen hội chứng Lynch 17 Bảng 1.3: Nguy mắc loại ung thư người mang hội chứng Lynch 19 Bảng 2.1: Định nghĩa liệt kê biến số độc lập 30 Bảng 2.2: Định nghĩa liệt kê biến số phụ thuộc 30 Bảng 2.3: Thành phần hóa chất PCR 40 Bảng 2.4: Chu trình PCR 40 Bảng 2.5: Thành phần phản ứng Sequencing 42 Bảng 2.6: Chu trình luân nhiệt Cycle Sequencing 42 Bảng 3.1: Một số đặc điểm dân số nghiên cứu 45 Bảng 3.2: Kết đột biến mầm hội chứng liên quan 53 Bảng 3.3: Các đột biến VUS ghi nhận 54 Bảng 3.4: Thông tin mồi dùng cho phản ứng PCR khuếch đại vùng đột biến cần xác nhận phương pháp Sanger 55 Bảng 3.5: Các đoạn mồi Sanger dùng để tìm đột biến tương tự gia đình thân nhân 58 Bảng 4.1: Kết dự đoán in silico biến thể VUS phần mềm 72 D A NH MỤ C C Á C SƠ Đ Ồ , H ÌN H Hình 1.1: Tóm tắt chế sửa lỗi hệ thống MMR 15 Hình 1.2: Vị trí gen MLH1 NST số 20 Hình 1.3: Vị trí gen MSH2 nhiễm sắc thể số 21 Hình 1.4: Vị trí gen MSH6 nhiễm sắc thể số 22 Hình 1.5: Vị trí gen PMS2 NST số 23 Hình 1.6: Protein Epcam loại liên kết giúp tế bào liên kết với 24 Hình 1.7: EpICD nội bào giúp chuyển thông tin đến nhân 25 Hình 1.8: Vị trị gen EpCAM nhiễm sắc thể số 25 Hình 2.1: Sơ đồ nghiên cứu 32 Hình 2.2: Tóm tắt quy trình giải trình tự gen hệ 35 Hình 2.3: Tóm tắt quy trình giải trình tự phương pháp Sanger 39 Hình 3.1: Kết điện di 10 mẫu DNA sau tách chiết từ mô FFPF: phân mảnh tạo hình ảnh dải DNA L: Kb Plus DNA ladder 47 Hình 3.2: Kết đo Bioanalyzer 49 Hình 3.3: Độ phủ vùng gen mẫu chứng dương 50 Hình 3.4: Mức tín hiệu đại chuẩn Q30 thông số đạt chuẩn lọc nội máy MiniSeq 51 Hình 3.5: Mật độ tạo cụm lần chạy máy 51 Hình 3.6: Kết giải trình tự Sanger trường hợp phát đột biến NGS 57 Hình 3.7: Kết giải trình tự Sanger gia đình trường hợp có đột biến 59 Hình 3.8: Sơ đồ phả hệ gia đình có đột biến di truyền 61-63 Hình 3.9: Sơ đồ tóm tắt quy trình tư vấn xét nghiệm di truyền cho bệnh nhân nghi ngờ hội chứng Lynch 67 Bản quyền tài liệu thuộc Thư viện Đại học Y Dược TP.Hồ Chí Minh mismatch repair", Embo j, 23, 4134-45 41 Heather Hampel, Wendy L Frankel, Edward Martin cs (2005), "Screening for the Lynch Syndrome (Hereditary Nonpolyposis Colorectal Cancer)", New England Journal of Medicine, 352, 1851-1860 42 Akseli Hemminki, Päivi Peltomäki, Jukka-Pekka Mecklin cs (1994), "Loss of the wild type MLH1 gene is a feature of hereditary nonpolyposis colorectal cancer", Nature genetics, 8, 405-410 43 PM Lynchb HT Lyncha, CL Snydera SJ Lanspac JF Lyncha and CR Boland, "Review of the Lynch syndrome: history, molecular genetics, screening, differential diagnosis, and medicolegal ramifications" 44 A Imran, H Y Qamar, Q Ali cs (2017), "Role of Molecular Biology in Cancer Treatment: A Review Article", Iran J Public Health, 46, 1475-1485 45 M Kasela, M Nyström M Kansikas (2019), "PMS2 expression decrease causes severe problems in mismatch repair", 40, 904-907 46 D S Keller, A Windsor, R Cohen cs (2019), "Colorectal cancer in inflammatory bowel disease: review of the evidence", Tech Coloproctol, 23, 3-13 47 Gruber SB Kohlmann W (2004 Feb [Updated 2018 Apr 12]), "Lynch Syndrome", In: Adam MP, Ardinger HH, Pagon RA, et al., editors GeneReviews® [Internet] 48 R Kolodner (1996), "Biochemistry and genetics of eukaryotic mismatch repair", Genes Dev, 10, 1433-42 49 R P Kuiper, L E Vissers, R Venkatachalam cs (2011), "Recurrence and variability of germline EPCAM deletions in Lynch syndrome", Hum Mutat, 32, 407-14 50 P Kumar, S Henikoff P C Ng (2009), "Predicting the effects of coding non-synonymous variants on protein function using the SIFT algorithm", Nat Protoc, 4, 1073-81 51 Thomas A Kunkel Dorothy A Erie (2005), "DNA MISMATCH REPAIR", Annual Review of Biochemistry, 74, 681-710 52 K Lagerstedt-Robinson, A Rohlin, C Aravidis cs (2016), "Mismatch repair gene mutation spectrum in the Swedish Lynch syndrome population", Oncol Rep, 36, 2823-2835 53 L A Loeb (1991), "Mutator phenotype may be required for multistage carcinogenesis", Cancer Res, 51, 3075-9 54 M Lorans, E Dow, F A Macrae cs (2018), "Update on Hereditary Bản quyền tài liệu thuộc Thư viện Đại học Y Dược TP.Hồ Chí Minh Colorectal Cancer: Improving the Clinical Utility of Multigene Panel Testing", Clin Colorectal Cancer, 17, e293-e305 55 Lynch Syndrome (2020), truy cập ngày, trang web https://www.cancer.net/cancer-types/lynch-syndrome/cilynchsyndromeprinter 56 M G Marinus (1976), "Adenine methylation of Okazaki fragments in Escherichia coli", J Bacteriol, 128, 853-4 57 Juana V Martín-López Richard Fishel (2013), "The mechanism of mismatch repair and the functional analysis of mismatch repair defects in Lynch syndrome", Familial Cancer, 12, 159-168 58 G Mauri, A Sartore-Bianchi, A G Russo cs (2019), "Early-onset colorectal cancer in young individuals", Mol Oncol, 13, 109-131 59 S D McCulloch, L Gu G M Li (2003), "Nick-dependent and independent processing of large DNA loops in human cells", J Biol Chem, 278, 50803-9 60 N Misago Y Narisawa (2000), "Sebaceous neoplasms in Muir-Torre syndrome", Am J Dermatopathol, 22, 155-61 61 MLH1 gene, U.S Nation Library of Medicine, truy cập ngày, trang web https://medlineplus.gov/genetics/gene/mlh1/#resources 62 P Modrich R Lahue (1996), "Mismatch repair in replication fidelity, genetic recombination, and cancer biology", Annu Rev Biochem, 65, 10133 63 Molecule function for MSH2 gene, UniProt, truy cập ngày, trang web https://www.uniprot.org/uniprot/P43246#function 64 M E Mork, Y N You, J Ying cs (2015), "High Prevalence of Hereditary Cancer Syndromes in Adolescents and Young Adults With Colorectal Cancer", J Clin Oncol, 33, 3544-9 65 MSH2 gene, U.S Nation Library of Medicine, truy cập ngày, trang web https://medlineplus.gov/genetics/gene/msh2/ 66 Hidewaki Nakagawa, Janet C Lockman, Wendy L Frankel cs (2004), "Mismatch repair gene PMS2: disease-causing germline mutations are frequent in patients whose tumors stain negative for PMS2 protein, but paralogous genes obscure mutation detection and interpretation", Cancer Research, 64, 4721-4727 67 R C Niessen, R M Hofstra, H Westers cs (2009), "Germline hypermethylation of MLH1 and EPCAM deletions are a frequent cause of Lynch syndrome", Genes Chromosomes Cancer, 48, 737-44 68 R Pearlman, W L Frankel, B Swanson cs (2017), "Prevalence and Bản quyền tài liệu thuộc Thư viện Đại học Y Dược TP.Hồ Chí Minh Spectrum of Germline Cancer Susceptibility Gene Mutations Among Patients With Early-Onset Colorectal Cancer", JAMA Oncol, 3, 464-471 69 P Peltomäki (2016), "Update on Lynch syndrome genomics", Fam Cancer, 15, 385-93 70 M Radman, RE Wagner, BW Glickman cs (1980), "Progress in environmental mutagenesis", M Alecivic Ed, 121-130 71 Dewkoemar Ramsoekh, Anja Wagner, Monique E van Leerdam cs (2009), "Cancer risk in MLH1, MSH2 and MSH6 mutation carriers; different risk profiles may influence clinical management", Hereditary Cancer in Clinical Practice, 7, 17 72 P Rawla, T Sunkara A Barsouk (2019), "Epidemiology of colorectal cancer: incidence, mortality, survival, and risk factors", Prz Gastroenterol, 14, 89-103 73 Richard M Brohet Sanne W ten Broeke, Carli M Tops, Heleen M van der Klift, Mary E Velthuizen,, Gabriel Capellá Munar Inge Bernstein, Encarna Gomez Garcia, Nicoline Hoogerbrugge, Tom G.W Letteboer,, Annika Lindblom Fred H Menko, Arjen R Mensenkamp, Pal Moller, Theo A van Os, Nils Rahner, cs (2015), "Lynch Syndrome Caused by Germline PMS2 Mutations: Delineating the Cancer Risk" 74 C D South, H Hampel, I Comeras cs (2008), "The frequency of MuirTorre syndrome among Lynch syndrome families", J Natl Cancer Inst, 100, 277-81 75 M A Sukhai, M Misyura, M Thomas cs (2019), "Somatic Tumor Variant Filtration Strategies to Optimize Tumor-Only Molecular Profiling Using Targeted Next-Generation Sequencing Panels", J Mol Diagn, 21, 261-273 76 J J Sung, J Y Lau, K L Goh cs (2005), "Increasing incidence of colorectal cancer in Asia: implications for screening", Lancet Oncol, 6, 871-6 77 Joseph JY Sung, James YW Lau, KL Goh cs (2005), "Increasing incidence of colorectal cancer in Asia: implications for screening", The lancet oncology, 6, 871-876 78 H Tachiki, R Kato, R Masui cs (1998), "Domain organization and functional analysis of Thermus thermophilus MutS protein", Nucleic Acids Res, 26, 4153-9 79 A Umar, C R Boland, J P Terdiman cs (2004), "Revised Bethesda Guidelines for hereditary nonpolyposis colorectal cancer (Lynch syndrome) and microsatellite instability", J Natl Cancer Inst, 96, 261-8 Tuân thủ Luật sở hữu trí tuệ Quy định truy cập tài liệu điện tử Ghi rõ nguồn tài liệu trích dẫn Bản quyền tài liệu thuộc Thư viện Đại học Y Dược TP.Hồ Chí Minh 80 H F Vasen, A Stormorken, F H Menko cs (2001), "MSH2 mutation carriers are at higher risk of cancer than MLH1 mutation carriers: a study of hereditary nonpolyposis colorectal cancer families", J Clin Oncol, 19, 4074-80 81 H F Vasen, P Watson, J P Mecklin cs (1999), "New clinical criteria for hereditary nonpolyposis colorectal cancer (HNPCC, Lynch syndrome) proposed by the International Collaborative group on HNPCC", Gastroenterology, 116, 1453-6 82 J Wildenberg M Meselson (1975), "Mismatch repair in heteroduplex DNA", Proc Natl Acad Sci U S A, 72, 2202-6 83 K Wimmer J Etzler (2008), "Constitutional mismatch repair-deficiency syndrome: have we so far seen only the tip of an iceberg?", Hum Genet, 124, 105-22 84 Y Wu, M J Berends, R G Mensink cs (1999), "Association of hereditary nonpolyposis colorectal cancer-related tumors displaying low microsatellite instability with MSH6 germline mutations", Am J Hum Genet, 65, 1291-8 85 Y Nancy You, Lucas D Lee, Benjamin W Deschner cs (2020), "Colorectal Cancer in the Adolescent and Young Adult Population", JCO Oncology Practice, 16, 19-27 86 "PMS2 gene", Genetics home reference Tuân thủ Luật sở hữu trí tuệ Quy định truy cập tài liệu điện tử Ghi rõ nguồn tài liệu trích dẫn Bản quyền tài liệu thuộc Thư viện Đại học Y Dược TP.Hồ Chí Minh PHỤ LỤC PHỤ LỤC 1: PHIẾU ĐỒNG Ý THAM GIA NGHIÊN CỨU Sau giải thích nghiên cứu “Khảo sát tính di truyền số gen hội chứng Lynch người trẻ tuổi” Đại học Y Dược Thành phố Hồ Chí Minh chủ trì Tơi tên là: Sinh năm: Địa chỉ: Điện thoại: đồng ý tham gia vào nghiên cứu Tôi đồng ý:  Sử dụng mẫu mô sinh thiết từ phương pháp phẫu thuật/thủ thuật để thực xét nghiệm  Lấy mL máu tĩnh mạch làm xét nghiệm  Cung cấp thông tin theo yêu cầu Tôi đề nghị:  Các thông tin cá nhân kết xét nghiệm phải giữ kín  Thơng báo kết tư vấn cho tơi cần Tn thủ Luật sở hữu trí tuệ Quy định truy cập tài liệu điện tử Ghi rõ nguồn tài liệu trích dẫn Bản quyền tài liệu thuộc Thư viện Đại học Y Dược TP.Hồ Chí Minh Ngày tháng năm 20 Ký tên PHỤ LỤC DANH SÁCH ĐỐI TƯỢNG THAM GIA NGHIÊN CỨU STT 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21 22 23 Mã số YCRC-1 YCRC-2 YCRC-3 (T) YCRC-4 YCRC-5 YCRC-6 YCRC-7 YCRC-8 YCRC-9 (T) YCRC-10 YCRC-11 YCRC-12 YCRC-13 YCRC-14 YCRC-15 YCRC-16 YCRC-17 YCRC-18 YCRC-19 YCRC-20 YCRC-21 YCRC-22 YCRC-23 Họ tên Huỳnh Hồng N Đặng Minh H Thị T Nguyễn Thị H Nguyễn Thị Ngọc O ĐNL Lê Minh Tiến E Đỗ Thị Tuyết T TCT NGUYỄN THỊ H NGUYỄN MINH T LÊ THỊ MAI A VŨ VĂN B LÊ MINH P NGUYỄN CHÍ H HOÀNG THỊ T PHAN THỊ THẢO T NGUYỄN DUY L ĐOÀN NGỌC XUÂN O NGUYỄN TẤN Q NGUYỄN TẤN H PHẠM THỊ LỆ H NQT Tuân thủ Luật sở hữu trí tuệ Quy định truy cập tài liệu điện tử Ghi rõ nguồn tài liệu trích dẫn Năm sinh 1984 1981 1987 1992 1981 1986 1991 1993 1997 1989 1987 1986 2001 1981 1982 1993 1992 1986 1989 1984 1981 1981 1983 Giới tính Nữ Nam Nữ Nữ Nữ Nam Nam Nữ Nam Nữ Nam Nữ Nam Nam Nam Nữ Nữ Nam Nữ Nam Nam Nữ Nam Bản quyền tài liệu thuộc Thư viện Đại học Y Dược TP.Hồ Chí Minh 24 YCRC-24 T Nguyễn Thị Thanh T Tuân thủ Luật sở hữu trí tuệ Quy định truy cập tài liệu điện tử Ghi rõ nguồn tài liệu trích dẫn 1984 Nữ Bản quyền tài liệu thuộc Thư viện Đại học Y Dược TP.Hồ Chí Minh 25 26 27 28 29 30 31 32 33 34 35 36 37 38 39 40 41 42 43 44 45 46 47 48 49 50 51 52 53 54 55 YCRC-25 T YCRC-26 YCRC-27 YCRC-29 YCRC-30 YCRC-31 YCRC-32 YCRC-33 YCRC-34 YCRC-36 YCRC-38 YCRC-40 YCRC-43 YCRC-45 YCRC-50 YCRC-52 YCRC-53 YCRC-54 YCRC-55 YCRC-56 YCRC-57 YCRC-59 YCRC-60 YCRC-61 YCRC-62 YCRC-63 YCRC-64 YCRC-65 YCRC-66 YCRC-67 YCRC-68 Đam văn T Ngô Thị Thùy N Nguyễn Thị Anh T Lý Thị Thanh N Quách Mỹ L Trần Chí P Nguyễn Thị Thùy L Trần Hào H Cáp Thị Tuyết N Nguyễn Thị Phúc M Hồ Kim P Nguyễn Lê Phương T Đào Thị Sương M Lê Thị Ánh H Nguyễn Đình L Nguyễn Bá P Nguyễn Anh D Đặng Thị Bích H Quách Thị Bé T Nguyễn Xuân H Ngô Đăng H Lê Trung D Kiên Bi S Trần Văn Đ NTK TH Nguyễn Thị H ĐTHA Nguyễn Mạnh H Đặng Hoàng Hữu Đ Nguyễn Thị Thu H Tuân thủ Luật sở hữu trí tuệ Quy định truy cập tài liệu điện tử Ghi rõ nguồn tài liệu trích dẫn 1987 1983 1984 1984 1979 1984 1979 1982 1979 1991 1979 1996 1990 1983 1980 1991 1981 1979 1985 1986 1980 1988 1991 1986 1989 1981 1981 1989 1987 1987 1984 Nam Nữ Nữ Nữ Nữ Nam Nữ Nam Nữ Nữ Nữ Nam Nữ Nữ Nam Nam Nam Nữ Nữ Nam Nam Nam Nam Nam Nam Nam Nữ Nữ   Nam Nữ Bản quyền tài liệu thuộc Thư viện Đại học Y Dược TP.Hồ Chí Minh 56 57 58 59 60 61 62 63 64 65 66 67 68 69 70 71 72 73 74 75 76 77 78 79 80 81 82 83 84 85 86 YCRC-69 YCRC-70 YCRC-71 YCRC-72 YCRC-73 YCRC-74 YCRC-75 YCRC-76 YCRC-78 YCRC-79 YCRC-80 YCRC-81 YCRC-82 YCRC-83 YCRC-84 YCRC-85 YCRC-86 YCRC-87 YCRC-88 YCRC-89 YCRC-90 YCRC-91 YCRC-92 YCRC-93 YCRC-94 YCRC-95 YCRC-96 YCRC-97 YCRC-98 YCRC-99 YCRC-100 NNKV Phạm Thị P Nguyễn Thị Diệu H Nguyễn Ngọc TH Nguyễn Hồng H NTTĐ PVC NTS Lê Thị C Đỗ Thị Ch Cao Thái H Nguyễn Thị Kiều O Bùi Văn N Trần Thị Kim T Ngô Thị M Nguyễn Thị Diễm T Đặng Ngọc L Phan Quốc M Nguyễn Thị L Bùi Thị D Lê Thị Phương H Phạm Quốc T Hồng Đình D NguyễnViếtT NguyễnThịMỹL Nguyễn Minh T Nguyễn Đức M Võ Thanh L Phạm Thanh S Nguyễn Huy L Nguyễn Văn T Tuân thủ Luật sở hữu trí tuệ Quy định truy cập tài liệu điện tử Ghi rõ nguồn tài liệu trích dẫn 1988 1984 1985 1983 1980 1980 1982 1989 1980 1990 1984 1979 1976 1976 1970 1970 1976 1972 1972 1977 1974 1974 1976 1976 1971 1970 1977 1974 1971 1974 1970 Nữ Nữ Nữ Nam Nam Nữ Nam Nữ Nữ Nữ Nam Nữ Nam Nữ Nữ Nữ Nữ Nam Nữ Nữ Nữ Nam Nam Nam Nữ Nam Nam Nam Nam Nam Nam Bản quyền tài liệu thuộc Thư viện Đại học Y Dược TP.Hồ Chí Minh 87 88 89 90 91 92 93 94 95 96 97 98 99 100 101 YCRC-101 YCRC-102 YCRC-104 YCRC-105 YCRC-106 YCRC-107 YCRC-108 YCRC-109 YCRC-110 YCRC-111 YCRC-112 YCRC-113 YCRC-114 YCRC-115 YCRC-116 TTT PTT TTT TVT NT CBT LTP ĐTNT NVH HLĐ NVC HVH NVB ĐVC Đinh Ngọc T 1972 1971 1976 1973 1971 1972 1970 1970 1975 1975 1970 1971 1974 1974 1990 Xác nhận môn Giải phẫu bệnh Tuân thủ Luật sở hữu trí tuệ Quy định truy cập tài liệu điện tử Ghi rõ nguồn tài liệu trích dẫn Nữ Nữ Nam Nam Nam Nữ Nữ Nữ Nam Nam Nam Nam Nam Nam Nam Bản quyền tài liệu thuộc Thư viện Đại học Y Dược TP.Hồ Chí Minh PHỤ LỤC KẾT QUẢ GIẢI TRÌNH TỰ THẾ HỆ MỚI STT YCRC-1 YCRC-2 (VUS) MLH1 WT WT MSH2 WT WT MSH6 WT WT PMS2 WT c.2206C>A (E736X) 16% EPCAM WT WT YCRC-3 (T) WT WT WT WT YCRC-4 YCRC-5 YCRC-6 YCRC-7 YCRC-8 YCRC-9 (T) WT WT WT WT WT WT WT WT WT WT WT WT WT WT WT WT WT WT c.341_348del (50%, Germline) WT WT WT WT WT WT YCRC-10 YCRC-11 YCRC-12 YCRC-13 WT WT WT WT WT WT WT WT WT WT WT WT WT WT WT WT WT WT WT WT 14 YCRC-14 WT WT WT WT 15 YCRC-15 WT WT WT c.1333A>T (K445*) Sanger + (Somatic) WT 16 YCRC-16 c.790+1G>A WT WT WT WT 18 19 20 21 22 WT WT WT WT WT WT WT WT WT WT c.670G>T (p.E224*) c.3996_3999d up(R1334fsX1 341) Sanger + WT WT WT WT WT WT 17 YCRC-17 c.1570C>T (p.R524C) WT WT WT WT WT WT WT WT WT WT WT 10 11 12 13 YCRC-18 YCRC-19 YCRC-20 YCRC-21 YCRC-22 Tuân thủ Luật sở hữu trí tuệ Quy định truy cập tài liệu điện tử Ghi rõ nguồn tài liệu trích dẫn WT WT WT WT WT WT WT Bản quyền tài liệu thuộc Thư viện Đại học Y Dược TP.Hồ Chí Minh 23 YCRC-23 WT WT WT WT WT 24 YCRC-24 T (VUS) WT WT WT WT WT 25 YCRC-25 T WT WT WT WT WT 26 YCRC-26 WT WT WT WT 27 YCRC-27 c.37G>T (p.Glu13Ter)-40% (SANGER -) WT WT WT WT WT WT WT COSM318604 4: c.4068_4071d up (p.K1358Dfs* 2), 49.1% WT WT WT WT WT WT WT WT WT WT WT WT WT WT WT WT WT WT WT WT WT WT WT WT WT WT WT WT WT WT WT WT WT WT WT WT WT WT c.2203A>G: Ile735Val GERMLINE/VUS WT WT WT WT WT WT WT WT WT WT WT WT WT WT WT WT WT WT WT WT WT WT WT WT WT WT 28 29 30 31 32 33 YCRC-29 YCRC-30 YCRC-31 YCRC-32 YCRC-33 YCRC-34 34 35 36 37 38 39 YCRC-36 YCRC-38 YCRC-40 YCRC-43 YCRC-45 YCRC-50 (VUS) 40 YCRC-52 (VUS) 41 YCRC-53 c.2173C>T (R725C) GERMLINE/ VUS WT 42 YCRC-54 WT WT WT WT WT 43 YCRC-55 44 YCRC-56 45 YCRC-57 WT WT WT WT WT WT WT WT WT WT WT WT WT WT WT Tuân thủ Luật sở hữu trí tuệ Quy định truy cập tài liệu điện tử Ghi rõ nguồn tài liệu trích dẫn Bản quyền tài liệu thuộc Thư viện Đại học Y Dược TP.Hồ Chí Minh 46 YCRC-59 WT WT WT WT WT c.1738A>T (p.Lys580Ter ): Germline WT 47 YCRC-60 (VUS) c.37G>T (p.E13X) (29.2%) Sanger + WT 48 YCRC-61 49 YCRC-62 WT WT WT WT WT WT WT WT WT WT 50 YCRC-63 WT WT WT WT 51 YCRC-64 (VUS) WT WT WT 52 YCRC-65 53 YCRC-66 WT WT c.73G>T (p.Gly25Cys) GERMLINE/VUS WT WT c.1242G>A (Trp414X) c.3261delC (Phe1088fs) WT WT WT WT WT WT WT 54 55 56 57 YCRC-67 YCRC-68 YCRC-69 YCRC-70 WT WT WT WT WT WT WT WT WT WT WT WT WT WT WT WT WT WT WT WT YCRC-71 YCRC-72 YCRC-73 YCRC-74 YCRC-75 (VUS) 63 YCRC-76 (VUS) WT WT WT WT WT WT WT WT WT WT WT WT WT WT WT WT WT WT WT WT WT WT WT WT WT NP_000240.1:c.1 487C>G (p.P496R) GERMLINE/VUS WT WT c.737C>G (p.P246R) WT WT WT WT WT 58 59 60 61 62 64 YCRC-78 65 YCRC-79 Tuân thủ Luật sở hữu trí tuệ Quy định truy cập tài liệu điện tử Ghi rõ nguồn tài liệu trích dẫn WT WT GERMLINE/V US WT c.1271A>C (p.F424C) WT WT WT Bản quyền tài liệu thuộc Thư viện Đại học Y Dược TP.Hồ Chí Minh 66 YCRC-80 67 YCRC-81 68 YCRC-82 WT WT WT WT WT c.1386+1G>A WT WT WT 7%? WT WT WT 69 YCRC-83 WT WT WT WT WT 70 YCRC-84 WT WT WT WT WT 71 YCRC-85 72 YCRC-86 WT WT WT WT WT WT WT WT WT WT 73 YCRC-87 WT WT WT WT 74 YCRC-88 (VUS) WT WT WT 75 YCRC-89 c.649C>T (p.R217C) GERMLINE/VUS WT c.1165C>T (p.R389X) GERMLINE WT WT WT WT WT 76 YCRC-90 WT WT WT WT WT 77 YCRC-91 WT WT WT c.3261delC (p.F1088fsX1 089) WT WT 78 YCRC-92 c.2038C>T (p.R680X) GERMLINE WT WT WT 79 YCRC-93 WT WT WT WT WT 80 YCRC-94 81 YCRC-95 82 YCRC-96 WT WT WT WT WT WT WT WT WT WT WT WT 83 YCRC-97 WT WT c.649C>T (p.R217C) GERMLINE/VUS WT WT WT WT WT 84 YCRC-98 85 YCRC-99 86 YCRC-100 WT WT WT WT WT WT WT WT c.394_395del CA (p.Gln132fs) GERMLINE WT WT WT WT WT WT Tuân thủ Luật sở hữu trí tuệ Quy định truy cập tài liệu điện tử Ghi rõ nguồn tài liệu trích dẫn WT WT WT Bản quyền tài liệu thuộc Thư viện Đại học Y Dược TP.Hồ Chí Minh 87 YCRC-101 88 YCRC-102 89 YCRC-103 c.1975C>T (p.R659*) GERMLINE WT WT WT WT WT WT WT c.1165C>T (p.R389X) GERMLINE WT WT WT WT WT WT WT WT WT WT WT WT WT WT 90 YCRC-104 91 YCRC-105 WT c.1615delG (p.A539fsX590)/ Exon 14 (35.6%) Sanger + 92 YCRC-106 93 YCRC-107 WT WT WT WT WT WT WT WT WT WT 94 YCRC-108 WT WT WT WT WT 95 YCRC-109 96 YCRC-110 WT WT WT WT WT WT WT WT 97 YCRC-111 WT WT WT c.1572_1573d elCA (p.Y524X) GERMLINE WT WT WT 98 YCRC-112 99 YCRC-113 WT WT WT WT WT WT WT WT WT WT 100 YCRC-114 101 YCRC-115 102 YCRC-116 WT WT WT WT WT WT WT WT WT WT WT WT WT WT Tuân thủ Luật sở hữu trí tuệ Quy định truy cập tài liệu điện tử Ghi rõ nguồn tài liệu trích dẫn c.4001+1_4001 +2insTAAC (rs587782538)