Xây dựng tài liệu hướng dẫn phân tích và dự báo nhu cầu sử dụng thuốc tại bệnh viện bằng phương pháp phân tích dữ liệu theo thời gian

BỘ GIÁO DỤC VÀ ĐÀO TẠO BỘ Y TẾ ĐẠI HỌC Y DƢỢC TP HỒ CHÍ MINH - CÙ THANH TUYỀN XÂY DỰNG TÀI LIỆU HƢỚNG DẪN PHÂN TÍCH VÀ DỰ BÁO NHU CẦU SỬ DỤNG THUỐC TẠI BỆNH VIỆN BẰNG PHƢƠNG PHÁP PHÂN TÍCH DỮ LIỆU THEO THỜI GIAN LUẬN VĂN THẠC SĨ DƢỢC HỌC THÀNH PHỐ HỒ CHÍ MINH, NĂM 2021 BỘ GIÁO DỤC VÀ ĐÀO TẠO BỘ Y TẾ ĐẠI HỌC Y DƢỢC TP HỒ CHÍ MINH - CÙ THANH TUYỀN XÂY DỰNG TÀI LIỆU HƢỚNG DẪN PHÂN TÍCH VÀ DỰ BÁO NHU CẦU SỬ DỤNG THUỐC TẠI BỆNH VIỆN BẰNG PHƢƠNG PHÁP PHÂN TÍCH DỮ LIỆU THEO THỜI GIAN CHUYÊN NGÀNH: TỔ CHỨC QUẢN LÝ DƢỢC MÃ SỐ: 8720212 LUẬN VĂN THẠC SĨ DƢỢC HỌC NGƢỜI HƢỚNG DẪN KHOA HỌC: PGS.TS HOÀNG THY NHẠC VŨ THÀNH PHỐ HỒ CHÍ MINH, NĂM 2021 ii LỜI CAM ĐOAN Tơi cam đoan cơng trình nghiên cứu Các số liệu, kết nêu luận văn trung thực, xác, chưa khác cơng bố Thành phố Hồ Chí Minh, ngày tháng 11 năm 2021 Người cam đoan Cù Thanh Tuyền iii TÓM TẮT XÂY DỰNG TÀI LIỆU HƢỚNG DẪN PHÂN TÍCH XU HƢỚNG VÀ DỰ BÁO NHU CẦU SỬ DỤNG THUỐC TẠI BỆNH VIỆN BẰNG PHƢƠNG PHÁP PHÂN TÍCH DỮ LIỆU THEO THỜI GIAN Luận văn Thạc sĩ Dƣợc học – Khóa học: 2019 – 2021 Cù Thanh Tuyền Ngƣời hƣớng dẫn khoa học: PGS TS Hoàng Thy Nhạc Vũ Đặt vấn đề: Phương pháp phân tích liệu theo thời gian có ý nghĩa quan trọng việc hỗ trợ lên kế hoạch sử dụng thuốc dự trù mua sắm thuốc bệnh viện Đề tài thực nhằm xây dựng tài liệu hướng dẫn áp dụng phương pháp phân tích liệu theo thời gian phân tích xu hướng dự báo nhu cầu sử dụng thuốc bệnh viện, giúp cho dược sĩ bệnh viện có thêm khoa học để thực tốt công tác quản lý đáp ứng nhu cầu điều trị bệnh người dân Phƣơng pháp nghiên cứu: Đề tài tiến hành xây dựng quy trình thực hiện, sau xác định nội dung hướng dẫn tương ứng bổ sung ví dụ minh họa để chi tiết hóa tài liệu hướng dẫn thực thông qua việc xây dựng áp dụng sở liệu giả định Kết quả: Đề tài xây dựng quy trình thực hiện, bao gồm chuẩn bị liệu đầu vào, phân tích liệu trình bày-báo cáo kết Tương ứng với quy trình này, hướng dẫn thực xây dựng với thông tin mô tả cụ thể cách tiến hành công cụ hỗ trợ bảng kiểm thông tin thu thập, bảng mẫu trình bày kết câu lệnh phân tích Ngồi ra, ví dụ minh họa bổ sung vào tài liệu hướng dẫn, thông qua việc áp dụng quy trình hướng dẫn thực quy trình sở liệu giả định Kết luận: Kết đề tài cung cấp tài liệu hướng dẫn phân tích xu hướng dự báo sử dụng thuốc bệnh viện phương pháp phân tích liệu theo thời gian, có ý nghĩa thực tiễn công tác quản lý dự trù-mua sắm thuốc sở y tế Từ khóa: Phân tích liệu theo thời gian, phân tích xu hướng, dự báo nhu cầu sử dụng thuốc iv ABSTRACT CONTRUCSTION OF THE GUIDELINE OF TREND ANALYSIS AND FORECAST FOR MEDICINE DEMAND IN THE HOSPITAL BY TIME SERIES ANALYSIS Master’s Thesis of Pharmacy – Academic Year: 2019 – 2021 Cu Thanh Tuyen Supervisor: Assoc Prof PhD Hoang Thy Nhac Vu Background: A time series analysis can aid hospitals in planning and procuring drugs The study was conducted in order to develop a guideline for making use of time series analysis in trend analysis and forecasting of drug demand in hospitals, assisting hospital pharmacists to perform well in their management roles and meet the treatment needs of patients Methods: The study develops implementation procedures, then determines the guideline's content, and provides illustrative examples to detail the implementation manual using a hypothetical data set Results: The study has developed a set of implementation procedures, including input data preparation, data analysis and result presentation Implementation instructions, including detailed descriptions of what to do, checklists, and sample results tables are developed in line with these procedures A hypothetical example was also presented with the guidelines to illustrate how the process and instructions should be applied Conclusion: This study provided guidelines for analyzing trends and forecasting drug use in hospitals using time-series analysis, which could assist in managing and procuring drugs in hospitals Keywords: Time series analysis, trend analysis, forecast for medicine demand v MỤC LỤC LỜI CAM ĐOAN iii MỤC LỤC vi DANH MỤC CHỮ VIẾT TẮT vii DANH MỤC CÁC BẢNG viii DANH MỤC CÁC HÌNH x MỞ ĐẦU Chƣơng TỔNG QUAN 1.1 Quy định hoạt động dự trù mua sắm thuốc sở y tế .3 1.2 Phƣơng pháp phân tích liệu theo thời gian áp dụng nhu cầu dự báo sử dụng thuốc 1.3 Nghiên cứu Việt Nam ứng dụng phƣơng pháp phân tích liệu theo thời gian dự trù thuốc cho bệnh viện .22 Chƣơng ĐỐI TƢỢNG VÀ PHƢƠNG PHÁP NGHIÊN CỨU .31 2.1 Đối tƣợng nghiên cứu 31 2.2 Phƣơng pháp nghiên cứu .31 Chƣơng KẾT QUẢ NGHIÊN CỨU 45 3.1 Quy trình phân tích dự báo nhu cầu sử dụng thuốc bệnh viện phƣơng pháp phân tích liệu theo thời gian 45 3.2 Nội dung tài liệu hƣớng dẫn phân tích dự báo nhu cầu sử dụng thuốc bệnh viện 66 Chƣơng BÀN LUẬN 127 4.1 Bàn luận quy trình phân tích dự báo nhu cầu sử dụng thuốc bệnh viện phƣơng pháp phân tích liệu theo thời gian .127 4.2 Bàn luận nội dung tài liệu hƣớng dẫn phân tích dự báo nhu cầu sử dụng thuốc bệnh viện 130 KẾT LUẬN VÀ KIẾN NGHỊ 133 TÀI LIỆU THAM KHẢO PHỤ LỤC .PL-1 vi DANH MỤC CHỮ VIẾT TẮT Giải nghĩa từ viết tắt Từ viết tắt BDG Biệt dược gốc BHYT Bảo hiểm Y tế BYT Bộ Y tế CP Chi phí thuốc CS Cơ số thuốc ĐVT Đơn vị tính thuốc MAE Mean Absolute Error (Sai số tuyệt độ trung bình) MAPE Mean Absolute Percentage Error (Sai số phần trăm tuyệt đối trung bình) ME Mean Error (Sai số trung bình) MPE Mean Percentage Error (Sai số phần trăm trung bình) MSE Mean Squared Error (Sai số bình phương trung bình) RMSE Root Mean Squared Error (Căn bậc hai sai số bình phương trung bình) vii DANH MỤC CÁC BẢNG Bảng 1.1 Cơ sở pháp lý liên quan đến hoạt động dự trù mua sắm thuốc Việt Nam Bảng 1.2 Kết dự báo số sử dụng thuốc nửa đầu năm 2018 12 hoạt chất thơng dụng Bệnh viện Nguyễn Đình Chiểu tỉnh Bến Tre giai đoạn 2010-2017 25 Bảng 1.3 So sánh số sử dụng dự báo số liệu sử dụng thực tế nửa đầu năm 2018 số biệt dược gốc Bệnh viện Nguyễn Đình Chiểu tỉnh Bến Tre 26 Bảng 1.4 Tóm tắt đặc điểm số nghiên cứu ứng dụng phương pháp phân tích liệu theo thời gian đánh giá xu hướng dự báo nhu cầu sử dụng thuốc .27 Bảng 2.1 Mô tả biến số sở giả định sử dụng cho phân tích mơ tả đặc điểm danh mục thuốc 40 Bảng 2.2 Các minh họa trình bày nội dung hướng dẫn thực phân tích xu hướng dự báo nhu cầu sử dụng thuốc 41 Bảng 2.3 Các gói hỗ trợ cần sử dụng ví dụ minh họa tài liệu hướng dẫn .44 Bảng 3.1 Nguyên tắc nhập liệu vào sở liệu Danh mục thuốc .48 Bảng 3.2 Các biến bảng liệu đầu vào nhằm phân tích đặc điểm danh mục thuốc bệnh viện .55 Bảng 3.3 Minh họa bảng kiểm tóm tắt bước xác định đối tượng thuốc cần phân tích, nguồn liệu thông tin liên quan 68 Bảng 3.4 Mẫu bảng liệu đầu vào để phân tích thống kê mô tả đặc điểm danh mục thuốc 71 Bảng 3.5 Mẫu bảng liệu đầu vào sử dụng phân tích xu hướng dự báo nhu cầu sử dụng thuốc 72 viii Bảng 3.6 Yêu cầu việc phân tích xu hướng dự báo nhu cầu sử dụng thuốc 74 Bảng 3.7 Các hàm phân tích sử dụng đề tài .75 Bảng 3.8 Hướng dẫn trình bày kết mô tả đặc điểm danh mục thuốc bệnh viện .120 Bảng 3.9 Minh họa cách trình bày bảng liệu mơ tả tiêu chí mơ tả 123 Bảng 3.10 Minh họa cách trình bày bảng chéo phân tích đồng thời hai tiêu chí mơ tả Nước sản xuất Nhóm đấu thầu 124 Bảng 3.11 Hướng dẫn trình bày kết phân tích xu hướng dự báo nhu cầu sử dụng thuốc 124 Bảng 3.12 Minh họa cách trình bày kết phân tích xu hướng sử dụng thuốc 125 Bảng 3.13 Minh họa cách trình bày kết dự báo nhu cầu sử dụng thuốc 125 Bảng 3.14 Minh họa biểu mẫu đánh giá kết ứng dụng giá trị dự báo từ mơ hình 126 ix DANH MỤC CÁC HÌNH Hình 1.1 Hình biễu diễn thành phần liệu sau phân tách với phương pháp phân tích liệu theo thời gian .16 Hình 1.2 Hình biểu diễn liệu sử dụng thuốc theo giá trị quan sát thực tế giá trị ước lượng giai đoạn 07 năm 17 Hình 1.3 Biểu đồ mô tả xu hướng sử dụng thuốc năm thu từ số sử dụng thuốc giai đoạn 05 năm 17 Hình 1.4 Kết phân tích xu hướng sử dụng thuốc giai đoạn 2010-2017 Bệnh viện Tâm thần tỉnh Bến Tre 23 Hình 1.5 Kết phân tích xu hướng dự báo nhu cầu thuốc Bệnh viện Phú Nhuận giai đoạn 2017-2018 .24 Hình 2.1 Các bước thực xây dựng tài liệu hướng dẫn phân tích xu hướng dự báo nhu cầu sử dụng thuốc .32 Hình 2.2 Các bước xây dựng quy trình thực nội dung hướng dẫn phân tích xu hướng dự báo nhu cầu sử dụng thuốc bệnh viện .33 Hình 2.3 Quy trình xây dựng mơ hình phân tích liệu theo thời gian nhằm đánh giá xu hướng dự báo nhu cầu sử dụng thuốc 36 Hình 2.4 Các khía cạnh cần xem xét q trình thực phân tích xu hướng dự báo nhu cầu sử dụng thuốc 37 Hình 3.1 Quy trình xây dựng sở liệu sử dụng thuốc bệnh viện 45 Hình 3.2 Minh họa sở liệu thuốc bệnh viện trước (a) sau (b) xử lý mã hóa để sẵn sàng cho việc phân tích đặc điểm danh mục thuốc bệnh viện 51 Hình 3.3 Minh họa sở liệu chuẩn bị cho phân tích xu hướng dự báo nhu cầu sử dụng thuốc 52 Hình 3.4 Quy trình phân tích xu hướng dự báo nhu cầu sử dụng thuốc 53 Hình 3.5 Biểu diễn kết phân tách yếu tố thành phần liệu sử dụng thuốc giai đoạn liên tục 58 x Bản quyền tài liệu thuộc Thư viện Đại học Y Dược TP.Hồ Chí Minh KẾT LUẬN VÀ KIẾN NGHỊ KẾT LUẬN Đề tài thực mục tiêu nghiên cứu đề ra, bao gồm xây dựng quy trình phân tích xu hướng dự báo nhu cầu sử dụng thuốc bệnh viện; xây dựng nội dung hướng dẫn thực phân tích xu hướng dự báo nhu cầu sử dụng thuốc Đối với quy trình phân tích xu hướng dự báo nhu cầu sử dụng thuốc, đề tài xác định thành phần quan trọng góp phần vào q trình phân tích, bao gồm sở liệu, phần mềm hỗ trợ phương pháp phân tích Bên cạnh việc làm rõ vai trò liên hệ thành phần quy trình phân tích chung, đề tài trình bày đặc điểm bước thực cụ thể liên quan đến thành phần Nội dung cốt lõi quy trình nằm phương pháp phân tích, đó, phần đầu tiến hành mô tả đặc điểm danh mục thuốc bệnh viện nhằm cung cấp tranh tổng quan tình hình sử dụng thuốc hoạt động điều trị sở, sau phân tích số sử dụng đối tượng phân tích cụ thể nhằm dự báo nhu cầu xác định số lượng cần mua sắm đối tượng năm Nội dung hướng dẫn thực xác định biên soạn dựa kết khảo sát đạt liên quan đến quy trình phân tích xu hướng dự báo nhu cầu sử dụng thuốc bệnh viện Cấu trúc nội dung hướng liên quan đến ba thành phần chuẩn bị sở liệu, cài đặt môi trường làm việc thông qua phần mềm hỗ trợ tiến hành bước phân tích cụ thể đặc điểm danh mục thuốc xu hướng sử dụng – nhu cầu thuốc sử dụng năm Đề tài tiến hành xây dựng sở liệu giả định nhằm áp dụng quy trình phân tích bổ sung ví dụ minh họa để chi tiết hóa nội dung hướng dẫn Cuối cùng, đề tài đề cập đến cách trình bày giải thích kết đạt áp dụng quy trình phân tích xu hướng dự báo nhu cầu sử dụng thuốc, nhằm giúp cho dược sĩ bệnh viện tiết kiệm thời gian làm báo cáo áp dụng nhanh chóng liệu vào Tuân thủ Luật sở hữu trí tuệ Quy định truy cập tài liệu điện tử Ghi rõ nguồn tài liệu trích dẫn 133 Bản quyền tài liệu thuộc Thư viện Đại học Y Dược TP.Hồ Chí Minh hoạt động dự trù mua sắm thuốc, mục tiêu ban đầu đề tài đề mong muốn thực KIẾN NGHỊ Dựa quy trình phân tích xu hướng dự báo nhu cầu sử dụng thuốc nội dung hướng dẫn xây dựng được, số kiến nghị từ nhóm nghiên cứu đưa sau:  Áp dụng quy trình phân tích nội dung hướng dẫn bệnh viện cụ thể, từ ghi nhận, đánh giá kết từ quy trình tài liệu hướng dẫn xây dựng từ đề tài  Phát triển hồn chỉnh nội dung hướng dẫn thành quy trình thao tác chuẩn (SOP) thực phân tích xu hướng dự báo nhu cầu sử dụng thuốc, đưa vào quy trình xây dựng kế hoạch mua sắm cung ứng thuốc hàng năm bệnh viện  Phát triển phần mềm phân tích dự báo tự động tích hợp vào hệ thống quản lý thuốc bệnh viện, thơng qua việc kết hợp quy trình phân tích xu hướng dự báo nhu cầu sử dụng thuốc với nhà phát triển phần mềm  Trong đề tài này, phần mềm R sử dụng với phiên 3.6.3 Quy trình hướng dẫn phân tích dự báo nhu cầu sử dụng thuốc xây dựng phiên R hơn, cần cập nhật số gói hỗ trợ, thư viện hàm điều chỉnh câu lệnh phân tích cho phù hợp Tuân thủ Luật sở hữu trí tuệ Quy định truy cập tài liệu điện tử Ghi rõ nguồn tài liệu trích dẫn 134 Bản quyền tài liệu thuộc Thư viện Đại học Y Dược TP.Hồ Chí Minh TÀI LIỆU THAM KHẢO Tiếng Việt [1] [2] [3] [4] [5] [6] [7] [8] [9] [10] Bộ Y tế (2011), Thông tư số 22/2011/TT-BYT quy định Tổ chức hoạt động khoa Dược bệnh viện Bộ Y tế (2013), Thông tư 21/2013/TT-BYT quy định tổ chức hoạt động Hội đồng Thuốc điều trị bệnh viện Bộ Y tế (2019), Thông tư số 15/2019/TT-BYT quy định việc đấu thầu thuốc sở y tế công lập Bộ Y tế (2020), Quyết định 5631/QĐ-BYT việc ban hành tài liệu "Hướng dẫn thực quản lý sử dụng kháng sinh bệnh viện" Chính phủ (2020), Nghị định số 131/2020/NĐ-CP quy định tổ chức, hoạt động dược lâm sàng sở khám bệnh, chữa bệnh Đặng Kim Loan, Cù Thanh Tuyền, Hoàng Việt cs (2019), "Ứng dụng phương pháp phân tích liệu theo thời gian hoạt động dự trù mua sắm thuốc: nghiên cứu bệnh viện Nguyễn Đình Chiểu Tỉnh Bến Tre", Tạp chí Y học thành phố Hồ Chí Minh phụ tập 23 (2), tr 367-374 Hoàng Thy Nhạc Vũ Trần Nhật Trường (2017), "Phân tích xu hướng sử dụng kháng sinh Bệnh viện Phú Nhuận giai đoạn 2012- 2018", Tạp chí Y học thành phố Hồ Chí Minh tập 21 (5), tr 9-14 Hoàng Thy Nhạc Vũ, Trần Thị Ngọc Vân, Cù Thanh Tuyền cs (2019), "Ứng dụng mơ hình Holt-Winters phân tích xu hướng sử dụng thuốc: nghiên cứu Bệnh viện Tâm thần tỉnh Bến Tre giai đoạn 2010-2017", Tạp chí Y Dược học Quân số 2, tr.14-20 Quốc Hội (2014), Luật Bảo hiểm y tế sửa đổi số 46/2014/QH13 Quốc Hội (2016), Luật Dược số 105/2016/QH13 Tiếng Anh [11] [12] [13] [14] Antoniou S A et al (2010), "Reflections of the Hippocratic Oath in modern medicine", World J Surg 34 (12), pp 3075-3079 Boulay F et al (1999), "Seasonal variation in chronic heart failure hospitalizations and mortality in France", Circulation 100 (3), pp 280-286 Howard S B., Sean P M., Galit S (2007), "Automated time series forecasting for biosurveillance", Stat Med 26 (22), pp 4202-4218 Arlene M B., Richard E T., Mona G T et al (2008), "Seasonal patterns of controller and rescue medication dispensed in underserved children with asthma", J Asthma 45 (9), pp 800-806 Tuân thủ Luật sở hữu trí tuệ Quy định truy cập tài liệu điện tử Ghi rõ nguồn tài liệu trích dẫn Bản quyền tài liệu thuộc Thư viện Đại học Y Dược TP.Hồ Chí Minh [15] [16] [17] [18] [19] [20] [21] [22] [23] [24] [25] [26] [27] Brian K C., Hawre J., Hideki H et al (2016), "Forecasting Trends in Disability in a Super-Aging Society: Adapting the Future Elderly Model to Japan", J Econ Ageing 8, pp 42-51 Camelia C., Javier S., Monica C et al (2014), "A cluster merging method for time series microarray with production values", Int J Neural Syst 24 (6), pp 1450018 Yevgeniy E., Howard S B (2009), "Development and evaluation of a dataadaptive alerting algorithm for univariate temporal biosurveillance data", Stat Med 28 (26), pp 3226-3248 Massimo G., Benedetta B., Fabio M et al (2011), "Seasonal variation in heart failure hospitalization", Clin Cardiol 34 (6), pp 389-394 Elina H., Misha P., Holly J et al (2015), "Time-series modeling of long-term weight self-monitoring data", Conf Proc IEEE Eng Med Biol Soc 2015, pp 1616-1620 Ranjit C K., Debabrata H (2014), "Effect of seasonal variation on hospital admission due to cardiovascular disease - findings from an observational study in a divisional hospital in Bangladesh", BMC Cardiovasc Disord 14, pp 76 Yan L., Si Z., Yunxia W et al (2019), "Trends of surgical treatment for spinal degenerative disease in China: a cohort of 37,897 inpatients from 2003 to 2016", Clin Interv Aging 14, pp 361-366 Liu Z et al (2015), "Clinical time series prediction: Toward a hierarchical dynamical system framework", Artif Intell Med 65 (1), pp 5-18 Zitao L., Milos H (2007), "Forecasting non-stationary diarrhea, acute respiratory infection, and malaria time-series in Niono, Mali", PLoS One (11), pp e1181 Xue P., Lei H., Mutua S et al (2014), "Evaluation of scaling invariance embedded in short time series", PLoS One (12), pp e116128 Pereira A (2004), "Performance of time-series methods in forecasting the demand for red blood cell transfusion", Transfusion 44 (5), pp 739-746 Santori G., Andorno E., Morelli N et al (2009), "A 20-year period of orthotopic liver transplantation activity in a single center: a time series analysis performed using the R Statistical Software", Transplant Proc 41 (4), pp 1286-1289 Santori G., Fontana I., Bertocchi M et al (2010), "A time series analysis performed on a 25-year period of kidney transplantation activity in a single center", Transplant Proc 42 (4), pp 1080-1083 Tuân thủ Luật sở hữu trí tuệ Quy định truy cập tài liệu điện tử Ghi rõ nguồn tài liệu trích dẫn Bản quyền tài liệu thuộc Thư viện Đại học Y Dược TP.Hồ Chí Minh [28] [29] [30] [31] [32] [33] [34] [35] [36] [37] [38] [39] [40] [41] Sauerborn R et al (1996), "Seasonal variations of household costs of illness in Burkina Faso", Soc Sci Med 43 (3), pp 281-290 Sauerborn R., Nougtara A., Hien M et al (2003), "Cost of illness of atopic asthma and seasonal allergic rhinitis in Germany: 1-yr retrospective study", Eur Respir J 21 (1), pp 116-122 Masha F S., James R G B., Farshid V et al (2007), "Economic burden of malaria in rural Tanzania: variations by socioeconomic status and season", Trop Med Int Health 12 (10), pp 1139-1147 Simon S., Kate M., Simon C et al (2002), "Heart failure in a cold climate Seasonal variation in heart failure-related morbidity and mortality", J Am Coll Cardiol 39 (5), pp 760-766 Kristen B V D., Arlene S S., Kathleen N et al (2009), "Seasonal patterns in health care use and pharmaceutical claims for asthma prescriptions for preschool- and school-aged children", Ann Allergy Asthma Immunol 102 (3), pp 198-204 Qinqin X., Runzi L., Yafei L et al (2017), "Forecasting the Incidence of Mumps in Zibo City Based on a SARIMA Model", Int J Environ Res Public Health 14 (8) Satoshi Y., Sayaka O., Ryusaku K et al (2017), "Seasonal variation in occurrence of ischemic colitis: a retrospective study", J Int Med Res 45 (1), pp 340-351 Yun-ping S., Jia-qi M (2010), "Application of exponential smoothing method in prediction and warning of epidemic mumps", Zhongguo Yi Miao He Mian Yi 16 (3), pp 233-237 Booth E G., Mount J F and Viers J H (2006), "Hydrologic Variability of the Cosumnes River Floodplain", San Francisco Estuary and Watershed Science (2) Meal A G., Pringle M., Hammersley V (2000), "Time changes in new cases of ischaemic heart disease", Fam Pract, 17(5): 394-400 Barnett A et al (2009), Analysing seasonal health data, Heidelberg: Springer Justin B., Melanie J., Julia C et al (2012), "Predicting emergency department admissions", Emerg Med J 29 (5), pp 358-365 Chatfield C (2004), The analysis of time series: an introduction, sixth, Chapman & Hall/CRC Maria G., Parida O & Pieter v B (2010), "Estimating and forecasting Costs of Illness in the Netherlands" Tuân thủ Luật sở hữu trí tuệ Quy định truy cập tài liệu điện tử Ghi rõ nguồn tài liệu trích dẫn Bản quyền tài liệu thuộc Thư viện Đại học Y Dược TP.Hồ Chí Minh [42] [43] [44] [45] [46] [47] [48] [49] [50] [51] [52] [53] Israel G., Donna Z., Dan A et al (2011), "Seasonal Variation in Hospital Admission in Patients with Heart Failure and Its Effect on Prognosis", Cardiology, 117(4): 268-274 Ihaka R (2005), Time Series Analysis, Statistics Department University of Auckland Jessica L., Eamonn K., Stefano L, et al (2003), "A symbolic representation of time series, with implications for streaming algorithms", Proceedings of the 8th ACM SIGMOD workshop on Research issues in data mining and knowledge discovery, ACM, San Diego, California, pp 2-11 Marno P., Bryden C., Bird W et al (2006), "How different measures of cold weather affect chronic obstructive pulmonary disease (COPD) hospital admissions in London", European Respiratory Review 15 (101), pp 185186 Martin C et al (2012), Time Series Analysis, European Regional Development Fund Massimo G., Benedetta B.; Fabio M.; et al (2011), "Seasonal Variation in Heart Failure Hospitalization", Clin Cardiol, 34(6): 389-394 McGregor G., Watkin H A., Cox M et al (2004), "Relationships between the seasonality of temperature and ischaemic heart disease mortality: implications for climate based health forecasting", Climate Research 25 (3), pp 253-263 Johan M., Alina P., Zoya L et al (2007), "Colon cancer: prognosis for different latitudes, age groups and seasons in Norway", The Journal of Photochemistry and Photobiology B: Biology 89 (2-3), pp 148–155 Shumway R H et al (2006 ), Time series analysis and its applications: with R examples, Springer Science & Business Media Ireneous N S and Daniel D R (2013), "An overview of health forecasting", Environmental Health and Preventive Medicine 18 (1), pp 1-9 WANG X et al (2011), "Application of exponential smoothing model in forecasting influenza incidence", China Tropical Medicine 8, pp 014 Wargon M., Guidet B., Hoang T D et al (2009), "A systematic review of models for forecasting the number of emergency department visits", Emergency Medicine Journal 26 (6), pp 395-399 Tuân thủ Luật sở hữu trí tuệ Quy định truy cập tài liệu điện tử Ghi rõ nguồn tài liệu trích dẫn Bản quyền tài liệu thuộc Thư viện Đại học Y Dược TP.Hồ Chí Minh PHỤ LỤC Quy trình cài đặt tạo phần mềm làm việc với R Quy trình tiến hành cài đặt tạo mơi trường làm việc vói phần mềm thống kê R trình bày Hình PL.1 Hình PL.1 Quy trình cài đặt làm việc với phần mềm thống kê R Tuân thủ Luật sở hữu trí tuệ Quy định truy cập tài liệu điện tử Ghi rõ nguồn tài liệu trích dẫn PL-1 Bản quyền tài liệu thuộc Thư viện Đại học Y Dược TP.Hồ Chí Minh Một số lƣu ý thực cài đặt làm việc với phần mềm thống kê R  Phần mềm thống kê R môi trƣờng tích hợp RStudio Phần mềm thống kê R mơi trường lập trình sử dụng để hỗ trợ thực phân tích thống kê biểu diễn kết trực quan dạng biểu đồ, tạo từ dự án GNU hai nhà thống kê học Ross Ihaka Robert Gentlement Phần mềm R cung cấp nhiều công cụ thống kê, nhiều kỹ thuật đồ họa tiếp tục mở rộng người dùng Tương tự, R sử dụng để tạo mơi trường phân tích dự báo thơng qua nhiều mơ hình kỹ thuật khác Một ưu điểm phần mềm R nghiên cứu ứng hồn tồn miễn phí, tính mà mang lại việc phân tích chuỗi liệu theo thời gian đáp ứng tất yêu cầu mà phần mềm thương mại cung cấp RStudio công cụ hỗ trợ cung cấp môi trường phát triển tích hợp (IDE Integrated Development Environment) cho phép truy cập trực tiếp vào phần mềm R Công cụ mang lại nhiều ưu điểm so với phần mềm R truyền thống hỗ trợ nhiều tính nâng cao, thể rõ ràng thông tin làm việc với R từ giúp cho việc quản lý liệu phân tích thống kê R trở nên hiệu Phần mềm R RStudio tải máy từ trang web tương ứng https://cran.r-project.org https://rstudio.com  Cài đặt gói hỗ trợ khai báo thƣ viện phần mềm R Vốn ngơn ngữ máy tính, phần mềm R có cung cấp sẵn số hàm cho phân tích thống kê vẽ biểu đồ Trong trường hợp phức tạp hơn, việc phân tích với R yêu cầu số gói hỗ trợ (packages) tải máy tích hợp với phần mềm R Mỗi gói hỗ trợ phần mềm nhỏ phát triển bới nhà thống kê học nhằm giải vấn đề cụ thể, chạy mơi trường R Các gói hỗ trợ cài đặt trực tuyến với hộp thoại Install Packages (chọn Tools>>Install Packages…) thông qua câu Tuân thủ Luật sở hữu trí tuệ Quy định truy cập tài liệu điện tử Ghi rõ nguồn tài liệu trích dẫn PL-2 lệnh Bản quyền tài liệu thuộc Thư viện Đại học Y Dược TP.Hồ Chí Minh install.package (…) Nếu gói hỗ trợ tải xuống máy tính trước đó, cài đặt nhanh chóng cách chọn “Install package(s) from local zip file” Sau cài đặt vào phần mềm R, gói hỗ trợ sử dụng chúng khai báo thư viện thông qua lệnh library (…) Việc khai báo thư viện yêu cầu cho phiên làm việc R Nếu việc khai báo thư viện không thành công, cần kiểm tra lại xem gói hỗ trợ tương ứng cài đặt có tương thích với phiên R sử dụng hay không Sau thư viện khai báo thành cơng, phiên làm việc với R bắt đầu với hàm liên quan  Các thao tác làm việc với phần mềm R Nhập liệu với R Để thực phân tích thống kê, cần cung cấp liệu đầu vào cho R Q trình nhập liệu diễn trực tiếp thông qua hàm edit(data.frame(…)) Hàm sử dụng để tạo bảng liệu cửa sổ mới, với cấu trúc gồm cột, hàng, ô tương tự Excel, cho phép nhập trực tiếp liệu vào bảng Các cột mặc định có tên var1, var2, var3,… kiểu liệu tương ứng ký tự (character), nhiên thơng tin điều chỉnh trực tiếp hộp thoại Variable editor (Hình PL.2) Ngồi ra, R cho phép nhập sở liệu có sẵn, với định dạng đa dạng xlsx, csv, txt, spss , thông qua hàm đọc liệu tương ứng So với cách nhập liệu thông qua edit(data.frame( )), việc sử dụng hàm đọc liệu cho phép tiết kiệm thời gian tận dụng sở liệu từ nguồn sẵn có, đồng thời hạn chế sai số nhập liệu thủ công Tuân thủ Luật sở hữu trí tuệ Quy định truy cập tài liệu điện tử Ghi rõ nguồn tài liệu trích dẫn PL-3 Bản quyền tài liệu thuộc Thư viện Đại học Y Dược TP.Hồ Chí Minh Hình PL.2 Minh họa cách nhập liệu trực tiếp vào phần mềm thống kê R Phân tích R Các thao tác phân tích R thực thông qua hàm để giải vấn đề cụ thể Trong phạm vi đề tài nghiên cứu, thao tác phân tích R tập trung vào hai nội dung gồm (1) phân tích đặc điểm danh mục thuốc bệnh viện (2) phân tích xu hướng dự báo nhu cầu sử dụng thuốc Trích xuất kết từ R Kết phân tích thường trình bày trực tiếp hình làm việc R (R Console) RStudio Plots, tương ứng kết dạng số liệu biểu đồ Bên cạnh đó, số hàm R cho phép xuất kết dạng file bên ngồi, ví dụ bảng liệu dạng csv xls, biểu đồ dạng pdf png Tuy nhiên, hàm khơng có sẵn R, cần tải gói hỗ trợ khai báo thư viện tương ứng để sử dụng hàm Tuân thủ Luật sở hữu trí tuệ Quy định truy cập tài liệu điện tử Ghi rõ nguồn tài liệu trích dẫn PL-4 Bản quyền tài liệu thuộc Thư viện Đại học Y Dược TP.Hồ Chí Minh Hƣớng dẫn cài đặt phân tích với phần mềm thống kê R  Cài đặt phần mềm R RStudio Phần mềm R sử dụng để hỗ trợ tiến hành phân tích thống kê biểu diễn mặt đồ họa (biểu đồ) cho phương pháp phân tích liệu Có thể thao tác với R trực tiếp nhiều trang điện tử (được minh họa Hình PL.3) hoặc tải phần mềm R sẵn máy tính để tiện thao tác mà không cần phụ thuộc vào kết nối internet q trình thực phân tích Hình PL.3 Minh họa môi trường làm việc trực tuyến phần mềm R https://www.online-ide.com/online_r_compiler Tuân thủ Luật sở hữu trí tuệ Quy định truy cập tài liệu điện tử Ghi rõ nguồn tài liệu trích dẫn PL-5 Bản quyền tài liệu thuộc Thư viện Đại học Y Dược TP.Hồ Chí Minh  Các bƣớc cài đặt phần mềm R Truy cập trang web: https://cran.r-project.org Lựa chọn Download R for Windows Lựa chọn base Tải xuống máy phiên Download R 4.1.2 for Windows Tiến hành cài đặt phần mềm thơng thường Tn thủ Luật sở hữu trí tuệ Quy định truy cập tài liệu điện tử Ghi rõ nguồn tài liệu trích dẫn PL-6 Bản quyền tài liệu thuộc Thư viện Đại học Y Dược TP.Hồ Chí Minh  Các bƣớc cài đặt phần mềm RStudio: Truy cập trang web: https://rstudio.com Lựa chọn Product >> Rstudio Lựa chọn Rstudio desktop >> Download RStudio Desktop Tải xuống máy phiên RStudio Tiến hành cài đặt phần mềm thơng thường Tn thủ Luật sở hữu trí tuệ Quy định truy cập tài liệu điện tử Ghi rõ nguồn tài liệu trích dẫn PL-7 Bản quyền tài liệu thuộc Thư viện Đại học Y Dược TP.Hồ Chí Minh Sau hồn tất việc tải phần mềm R RStudio máy, hình xuất hai biểu tượng tương ứng Giao diện khởi động R RStudio có khu vực làm việc (R Console), nhiên RStudio bổ sung thêm số cửa sổ làm việc, cho phép quản lý phân tích liệu phần mềm R dễ dàng (Hình PL.4) Do đó, hướng dẫn liên quan đến phân tích xu hướng dự báo nhu cầu sử dụng thuốc hướng dẫn minh họa giao diện RStudio Hình PL.4 Biểu tưởng giao diện làm việc phần mềm R RStudio Tuân thủ Luật sở hữu trí tuệ Quy định truy cập tài liệu điện tử Ghi rõ nguồn tài liệu trích dẫn PL-8 Bản quyền tài liệu thuộc Thư viện Đại học Y Dược TP.Hồ Chí Minh 3.2.2.2 Cài đặt gói hỗ trợ phân tích Từ giao diện làm việc phần mềm R, chọn Tool >> Install Packages… để cài đặt gói hỗ trợ liên quan Trong hộp thoại Install Packages xuất hiện, minh họa Hình PL.5, gõ tên gói hỗ trợ muốn cài đặt, thơng tin nguồn nơi lưu trữ gói hỗ trợ sau tải máy mặc định sẵn Sau kiểm tra thông tin hộp thoại Install Packages, nhấn Install để tiến hành cài đặt Hình PL.5 Minh họa cách cài đặt gói hỗ trợ openxlsx phần mềm RStudio Ngồi ra, việc cài đặt gói hỗ trợ thực thơng qua lệnh install.packages(….) Kết trả từ hai cách tương tự > install.packages("openxlsx") package „openxlsx‟ successfully unpacked and MD5 sums checked The downloaded binary packages are in C:\Users\cutha\AppData\Local\Temp\Rtmpst0F2p\downloaded_package Tuân thủ Luật sở hữu trí tuệ Quy định truy cập tài liệu điện tử Ghi rõ nguồn tài liệu trích dẫn PL-9