Khảo sát sự sinh enzyme carbapenemase và tình hình đề kháng kháng sinh của klebsiella pneumoniae trên các mẫu bệnh phẩm tại bệnh viện đa khoa thành phố cần thơ và bệnh viện đa khoa trung ươ

BỘ GIÁO DỤC VÀ ĐÀO TẠO BỘ Y TẾ TRƯỜNG ĐẠI HỌC Y DƯỢC CẦN THƠ NGUYỄN CHÍ NGUYỄN KHẢO SÁT SỰ SINH ENZYME CARBAPENEMASE VÀ TÌNH HÌNH ĐỀ KHÁNG KHÁNG SINH CỦA KLEBSIELLA PNEUMONIAE TRÊN CÁC MẪU BỆNH PHẨM TẠI BỆNH VIỆN ĐA KHOA THÀNH PHỐ CẦN THƠ VÀ BỆNH VIỆN ĐA KHOA TRUNG ƯƠNG CẦN THƠ NĂM 2021-2022 LUẬN VĂN THẠC SĨ CẦN THƠ – 2022 BỘ GIÁO DỤC VÀ ĐÀO TẠO BỘ Y TẾ TRƯỜNG ĐẠI HỌC Y DƯỢC CẦN THƠ NGUYỄN CHÍ NGUYỄN KHẢO SÁT SỰ SINH ENZYME CARBAPENEMASE VÀ TÌNH HÌNH ĐỀ KHÁNG KHÁNG SINH CỦA KLEBSIELLA PNEUMONIAE TRÊN CÁC MẪU BỆNH PHẨM TẠI BỆNH VIỆN ĐA KHOA THÀNH PHỐ CẦN THƠ VÀ BỆNH VIỆN ĐA KHOA TRUNG ƯƠNG CẦN THƠ NĂM 2021-2022 Chuyên ngành: Kỹ Thuật Xét Nghiệm Y Học Mã số: 8720601 LUẬN VĂN THẠC SĨ KỸ THUẬT XÉT NGHIỆM Y HỌC Người hướng dẫn khoa học: PGS TS TRẦN ĐỖ HÙNG CẦN THƠ – 2022 LỜI CAM ĐOAN Tôi xin cam đoan đề tài nghiên cứu riêng Các tài liệu trích dẫn, số liệu, kết đề tài trung thực tuân theo yêu cầu đề tài nghiên cứu Đề tài chưa cơng bố cơng trình khác Tác giả NGUYỄN CHÍ NGUYỄN LỜI CẢM ƠN Trong q trình thực đề tài, tơi nhận nhiều giúp đỡ quan tâm từ thầy giáo, gia đình bạn bè đồng nghiệp Trước hết tơi xin bày tỏ lịng kính trọng biết ơn sâu sắc tới thầy hướng dẫn mình, người thầy tận tâm nhiệt tình dẫn dắt, giúp đỡ tơi vượt qua khó khăn q trình học tập – PGS TS Trần Đỗ Hùng Thầy miệt mài công tác giảng dạy nghiên cứu Bản thân em (tôi) bạn học viên xem gương, nguồn động lực để tiếp tục học tập phấn đấu Tôi xin gửi lời cảm ơn chân thành đến Ban Giám Hiệu Thầy Cô Trường Đại học Y Dược Cần Thơ truyền đạt kiến thức chuyên môn tạo điều kiện tốt cho suốt thời gian học tập Tôi xin gửi lời cảm ơn đến Ths.Nguyễn Dương Hiển – Trưởng khoa xét nghiệm Bệnh viện đa khoa thành phố Cần Thơ, Bs CKI Nguyễn Thị Diệu Hiền – Trưởng khoa xét nghiệm vi sinh Bệnh viện Đa khoa Trung Ương Cần Thơ tất anh chị em đồng nghiệp hai bệnh viện tạo điều kiện thuận lợi cho lấy mẫu, thực đề tài nghiên cứu Cuối đặc biệt quan trọng, xin dành tất yêu thương lời cảm ơn tới gia đình, nơi hậu phương vững niềm động viên mạnh mẽ giúp tơi hồn thành luận văn Tác giả NGUYỄN CHÍ NGUYỄN MỤC LỤC Trang Lời cam đoan Danh mục chữ viết tắt Danh mục bảng Danh mục biểu đồ Danh mục sơ đồ - hình ảnh MỞ ĐẦU Chương TỔNG QUAN TÀI LIỆU 1.1 Klebsiella pneumoniae 1.2 Carbapenemase sinh carbapenemase Klebsiella pneumoniae 1.3 Kháng sinh đề kháng kháng sinh Klebsiella pneumoniae 10 1.4 Kiểu đề kháng kháng sinh chủng Klebsiella pneumoniae sinh enzyme carbapenemase 15 1.5 Tình hình đề kháng kháng sinh sinh enzyme carbapenemase Klebsiella pneumoniae giới Việt Nam 18 Chương ĐỐI TƯỢNG VÀ PHƯƠNG PHÁP NGHIÊN CỨU 22 2.1 Đối tượng 22 2.2 Phương pháp nghiên cứu 23 2.3 Đạo đức nghiên cứu 37 Chương KẾT QUẢ NGHIÊN CỨU 38 3.1 Một số đặc điểm Klebsiella pneumoniae dịch tễ bệnh nhân 38 3.2 Tỷ lệ sinh enzyme carbapenemase Klebsiella pneumoniae 41 3.3 Đánh giá mức độ đề kháng kháng sinh Klebsiella pneumoniae 44 3.4 Khảo sát số loại carbapenemase tìm hiểu kiểu đề kháng kháng sinh chủng CPKP 50 Chương BÀN LUẬN 55 4.1 Một số đặc điểm Klebsiella pneumoniae dịch tễ bệnh nhân 55 4.2 Tỷ lệ sinh enzyme carbapenemase Klebsiella pneumoniae 58 4.3 Đánh giá mức độ đề kháng kháng sinh Klebsiella pneumoniae 64 4.4 Khảo sát số loại carbapenemase tìm hiểu kiểu đề kháng kháng sinh chủng CPKP 70 KẾT LUẬN 78 KIẾN NGHỊ 80 TÀI LIỆU THAM KHẢO PHỤ LỤC DANH MỤC CÁC CHỮ VIẾT TẮT Chữ viết tắt Tiếng Anh AES Advanced Expert System American type culture ATCC collection Antimicrobial Susceptibility AST Testing BA Blood Agar CA Chocolate Agar Centers for Disease Control CDC and Prevention Klebsiella pneumoniae CPKP producing carbapenemase Clinical and Laboratory CLSI Standards Institute CFU Colony Forming Unit DPA Dipicolinic acid EDTA Ethylenediaminetetraacetic acid Extended-spectrum ESBL betalactamases GES Guiana Extended Spectrum German imipenemase GIM GN ICU ID IMI KPC MBL mCIM Gram Negative Intensive Care Unit Identification Imipenem hydrolysing lactamase Klebsiella pneumoniae carbapenemase Metallo-beta-lactamase Modified carbapenem inactivation method Tiếng Việt Hệ thống phân tích cao cấp Thu Thập chủng chuẩn Mỹ Thử nghiệm nhạy cảm kháng sinh Thạch máu Thạch nâu Trung tâm kiểm soát phòng ngừa dịch bệnh Klebsiella pneumoniae sinh carbapenemase Viện tiêu chuẩn phịng thí nghiệm lâm sàng Đơn vị hình thành khuẩn lạc Enzym beta-lactamase phổ rộng Enzym german imipenemase Gram âm Khoa hồi sức tích cực Mã số nhận biết Enzym imipenem hydrolysing lactamase Enzym Klebsiella pneumoniae carbapenemase Enzym metallo beta lactamase Thử nghiệm bất hoạt carbapenem cải tiến MIC MRD NDM Non-CPKP OXA RND SME VIM Minimal inhibitory concentration Multi Drug Resistant Delhi metallo beta tactamase Non - Klebsiella pneumoniae producing carbapenemase Oxacilinase beta lactamase Resistance nodulation division Sarratia marcescens enzyme Verona integrin metallo beta lactamase Nồng độ ức chế tối thiểu Đa kháng thuốc Enzym Delhi metallo beta tactamase Klebsiella pneumoniae không sinh carbapenemase Enzym oxacilinase beta lactamase Enzym Sarratia marcescens Enzym verona integrin metallo beta lactamase DANH MỤC CÁC BẢNG Trang Bảng 2.1: Thang điểm Barlett dùng đánh giá mẫu đàm 28 Bảng 2.2: Điểm gãy kháng sinh thử nghiệm kháng sinh đồ chủng Klebsiella pneumoniae 32 Bảng 2.3: Phiên giải kết thử nghiệm D73C 35 Bảng 3.1: Đặc điểm nhóm tuổi bệnh nhân 38 Bảng 3.2: Đặc điểm nơi cư trú bệnh nhân 39 Bảng 3.3: Đặc điểm loại bệnh phẩm 39 Bảng 3.4: Phân bố CPKP theo giới tính bệnh nhân 41 Bảng 3.5: Phân bố CPKP theo nhóm tuổi bệnh nhân 42 Bảng 3.6: Phân bố CPKP theo nơi cư trú bệnh nhân 42 Bảng 3.7: Phân bố CPKP theo loại bệnh phẩm 43 Bảng 3.8: Phân bố CPKP theo khoa điều trị 43 Bảng 3.9: Phân bố CPKP theo đa kháng kháng sinh 50 Bảng 3.10: Phân bố CPKP theo mức độ đề kháng kháng sinh 51 Bảng 3.11: Tỷ lệ đề kháng kháng sinh CPKP non-CPKP 51 Bảng 3.12: Tỷ lệ đề kháng kháng sinh CPKP theo loại carbapenemase 52 Bảng 3.13: Giá trị MIC imipenem CPKP 53 Bảng 3.14: Giá trị MIC amikacin CPKP 53 Bảng 3.15: Giá trị MIC gentamicin CPKP 54 Bảng 3.16: Giá trị MIC trimethoprim/sulfamethoxazole CPKP 54 Bảng 4.1: So sánh loại bệnh phẩm với nghiên cứu khác 57 Bảng 4.2: So sánh tỷ lệ đề kháng kháng sinh với nghiên cứu khác 65 Bảng 4.3: Tỷ lệ đề kháng kháng sinh Klebsiella pneumoniae mẫu bệnh phẩm Bệnh viện đại học y dược thành phố Hồ Chí Minh năm 2019 67 Bảng 4.4: Tỷ lệ đề kháng kháng sinh của Klebsiella pneumoniae mẫu bệnh phẩm Trung Quốc 68 Bảng 4.5: So sánh tỷ lệ đề kháng kháng sinh CPKP với nghiên cứu 73 78 KẾT LUẬN Qua nghiên cứu 345 chủng Klebsiella pneumoniae mức độ đề kháng kháng sinh sinh carbapenemase Bệnh viện Đa khoa thành phố Cần Thơ Bệnh viện Đa khoa Trung ương Cần Thơ từ tháng 6/2021 đến tháng 5/2022, rút kết luận sau: Tỷ lệ sinh carbapenemase Klebsiella pneumoniae số yếu tố liên quan Tỷ lệ CPKP nghiên cứu chiếm 31,9% (110/345) Các chủng CPKP phân bố bệnh nhân nam thấp so với bệnh nhân nữ 33,3% (49/147) Phân bố CPKP cao nhóm bệnh nhân từ 15 tuổi đến 45 tuổi với 34,3% (12/35) Phân bố CPKP bệnh nhân nội thành thấp bệnh nhân ngoại thành 32,1% (62/193) Tuy nhiên, có khác biệt phân bố CPKP theo giới tính, nhóm tuổi địa cư bệnh nhân khơng có ý nghĩa thống kê (p > 0,05) Các chủng CPKP phân bố nhiều bệnh phẩm máu với 64,3% (9/14) Phân bố CPKP cao khoa Ngoại với 44,0% (11/25) Sự khác biệt phân bố CPKP theo mẫu bệnh phẩm khoa phịng có ý nghĩa thống kê (p < 0,05) Mức độ đề kháng kháng sinh vi khuẩn Klebsiella pneumoniae Klebsiella pneumoniae đề kháng cao với ampicillin với tỷ lệ đề kháng 99,4% (343/345), đề kháng cephalosporins từ 61,2% - 76,5% Đối với kháng sinh phối hợp chất ức chế beta-lactamase piperacilin/tazobactam có tỷ lệ đề kháng với 52,2% (180/345) Tỷ lệ đề kháng cao nhóm Fluoroquinolones ciprofloxacin 69,9% (241/345) Tỷ lệ đề kháng Carbapenems mức trung bình từ 43,2% - 49,0% đề kháng thấp với amikacin 17,4% (60/345) Tỷ lệ Klebsiella pneumoniae đa kháng kháng sinh 75,7% (261/345), tỷ lệ đề kháng với kháng sinh chiếm 14,2%, kháng với 10 kháng sinh chiếm 13,0%, kháng 11 kháng sinh chiếm 10,7%, kháng 12 kháng sinh chiếm 10,7% 79 Phân loại số carbapenemse kiểu cách đề kháng CPKP Trong chủng CPKP, OXA-48 chiếm cao với 72,7% (80/110) Các chủng CPKP phân bố nhóm đa kháng kháng sinh chiếm 42,1% (110/261) CPKP đề kháng với kháng sinh chiếm 29,1%, đề kháng 10 kháng sinh chiếm 23,6%, đề kháng 11 kháng sinh chiếm 23,6%, đề kháng 12 kháng sinh chiếm 20,9% Các chủng CPKP đề kháng thấp với amikacin 32,7%, gentamicin 47,3% tỷ lệ đề kháng trimethoprim/sulfamethoxazole 61,8% Các chủng CPKP loại KPC có tỷ lệ đề kháng thấp amikacin 11,1%, chủng loại MBL đề kháng thấp amikacin 78,6% Các chủng CPKP loại OXA-48 đề kháng thấp với amikacin 26,3% Các chủng CPKP có MIC imipenem = 12 µg/mL chiếm tỷ lệ cao với 31,8%, MIC amikacin = 16 µg/mL chiếm tỷ lệ cao với 24,5%, chủng CPKP có MIC gentamicin = µg/mL chiếm tỷ lệ cao với 26,4%, MIC trimethoprim/sulfamethoxazole chiếm tỷ lệ cao 12 µg/mL với 20% 80 KIẾN NGHỊ Từ kết đề tài nghiên cứu, đề xuất số ý kiến nghị Cần Thơ sau: Hạn chế sử dụng rộng rải carbapenem điều trị bệnh lý nhiễm khuẩn cho bệnh nhân nhiễm Klebsiella pneumoniae Đối với việc điều trị bệnh nhân nhiễm chủng Klebsiella pneumoniae đề kháng hoàn toàn với kháng sinh, nên xác định nồng độ ức chế tối thiểu loại kháng sinh để bác sĩ lâm sàng lựa chọn điều chỉnh nồng độ thuốc phù hợp điều trị hiệu cho bệnh nhân Cần có thêm nghiên cứu kiểu gen để hiểu rõ phân bố dịch tễ học chủng CPKP Cần Thơ TÀI LIỆU THAM KHẢO Tiếng Việt Phạm Thị Hoài An (2014), Khảo sát kháng kháng sinh Klebsiella pneumoniae thành phố Hồ Chí Minh, Luận văn thạc sĩ sinh học, Trường Đại Học Sư Phạm TP Hồ Chí Minh, Thành Phố Hồ Chí Minh Bộ Y Tế (2015), Hướng dẫn sử dụng kháng sinh, Nhà Xuất Bản Y Học, Hà Nội Bộ Y Tế (2017), Hướng dẫn thực hành kỹ thuật xét nghiệm vi sinh lâm sàng, Nhà Xuất Bản Y Học, Hà Nội Lê Thùy Dương (2018), Sự đề kháng kháng sinh chủng trực khuẩn Gram âm gây bệnh thường gặp Bệnh viện Quân Y 175 từ 11/2017 đến 6/2018, Luận văn thạc sĩ y học, Trường Đại Học Y Dược Thành Phố Hồ Chí Minh, Thành Phố Hồ Chí Minh Nguyễn Bửu Huy (2018), Phân tích vi sinh tình hình sử dụng kháng sinh bệnh nhân viêm phổi bệnh viện khoa Hồi sức tích cực - chống độc Bệnh viện Đa khoa Thành phố Cần Thơ, Luận văn Thạc sĩ Dược học, Trường Đại Học Dược Hà Nội, Hà Nội Tống Phi Khanh (2017), Kỹ thuật xét nghiệm vi sinh y học, Nhà xuất y học, Đại học Y Dược Thành phố Hồ Chí Minh Nguyễn Tuấn Linh (2018), Tìm hiểu chế đề kháng carbapenem carbapenemase chủng Enterobacteriacaea kháng carbapenem kỹ thuật bất hoạt carbapenem cải tiến, khoanh giấy phối hợp PCR, Luận án thạc sỹ y học, Trường Đại học Y Hà Nội, Hà Nội Trần Diệu Linh (2018), Nghiên cứu mức độ phân tử khả kháng carbapenem số vi khuẩn Gram âm phân lập từ bệnh nhân Bệnh viện Việt Đức Bệnh viện Quân Đội 108, Luận án Tiến sĩ Sinh học, Trường Đại học Khoa học Tự nhiên, Hà Nội Lương Hồng Loan (2019), Khảo sát trực khuẩn Gram âm tiết men kháng β-lactam đề kháng kháng sinh, Luận văn thạc sĩ y học, Đại Học Y Dược Thành Phố Hồ Chí Minh, Thành Phố Hồ Chí Minh 10 Dương Trương Phú, Lê Ngọc Của, Lâm Vĩnh Niên, Đỗ Văn Mãi (2020), "Phân tích thực trạng đề kháng kháng sinh Klebsiella pneumoniae Bệnh viện Đa khoa Trung ương Cần Thơ năm 2019", Tạp Chí Y Dược Học Cần Thơ, Số 30, tr 115-121 11 Lê Văn Phủng (2009), Atlas hình thể vi khuẩn khuẩn lạc, Nhà xuất y học, Hà Nội 12 Lê văn Phủng (2009), Vi khuẩn y học, Nhà xuất Giáo dục Việt Nam, Hà Nội 13 Bùi Thanh Thuyết (2017), Nghiên cứu tính kháng khánh sinh gen liên quan kháng carbapenem Enterobacteriaceae phân lập Bệnh viện Quân Y 103 (2015-2016) Luận văn thạc sĩ y học, Học Viện Quân Y, Hà Nội 14 Trần Viết Tiến, Nguyễn Thị Phương (2018), "Nghiên cứu đặc điểm lâm sàng, cận lâm sàng tình trạng kháng kháng sinh cuat vi khuẩn Klebsiella bệnh nhân nhiễm khuẩn huyết (01-2015 đến 6-2016)", tạp chí y-dược học quân 43 (7), tr 52-59 15 Nguyễn Thành Tín, Nguyễn Thanh Bảo, Phạm Minh Châu, Nguyễn Tuấn Anh (2018), "Xác định kiểu hình kiểu gen vi khuẩn Escherichia coli Klebsiella pneumoniae tiết ESBL phân lập Bệnh viện tỉnh Bạc Liêu", Tạp chí Y Học Thành Phố Hồ Chí Minh, 22 (5), tr 246 251 16 Bùi Thế Trung, Trần Thiện Trung, Nguyễn Tuấn Anh (2018), "Tình hình Klebsiella pneumoniae mang gen kháng carbapenem bệnh nhân nhi", Tạp chí Y Học Thành Phố Hồ Chí Minh, 22 (5), tr 281-289 17 Nguyễn Quốc Trung (2017), Khảo sát in vitro phối hợp beta-lactam với số kháng sinh Escherichia coli Klebsiella pneumoniae đa kháng, Luận văn thạc sĩ kỹ thuật y học, Đại Học Y Dược Thành Phố Hồ Chí Minh, Thành Phố Hồ Chí Minh 18 Phạm Hùng Vân, Phạm Thánh Bình (2013), Kháng sinh - Đề kháng kháng sinh kỹ thuật sinh đồ vấn đề thường gặp, Nhà xuất Y học, Hà Nội 19 Phạm Thị Vân (2017), Nghiên cứu đặc điểm phân bố kiểu hình kháng kháng sinh chủng Enterobacteriaceae sinh β – Lactamase phổ rộng, carbapenemase phân lập Bệnh viện Quân Y 103 (2014-2016), Luận văn thạc sĩ y học, Học Viện Quân Y, Hà Nội 20 Trần Hải Yến (2020), Phân loại carbapenemase tìm hiểu kiểu cách đề kháng Klebsiella pneumoiae kháng carbapenem khoa Hồi sức cấp cứu Bệnh viện Hữu Nghị Việt Đức từ 5/2019 đến 5/2020, Luận văn chuyên khoa cấp II, Trường Đại Học Y Hà Nội, Hà Nội Tiếng Anh 21 Ainoda Y., Aoki K., Ishii Y., Okuda K., et al (2019), "Klebsiella pneumoniae carbapenemase (KPC)-producing Klebsiella pneumoniae ST258 isolated from a Japanese patient without a history of foreign travel - a new public health concern in Japan: a case report", BMC Infectious Diseases, 19 (1), pp 20 22 Al-Zalabani A., AlThobyane O A., Alshehri A H., et al (2020), "Prevalence of Klebsiella pneumoniae Antibiotic Resistance in Medina, Saudi Arabia, 2014-2018", Cureus, 12 (8), pp 9714 23 Alav I., Kobylka J., Kuth M S., et al (2021), "Structure, Assembly, and Function of Tripartite Efflux and Type Secretion Systems in GramNegative Bacteria", Chemical Reviews, 121 (9), pp 5479-5596 24 Alcántar-Curiel M D., et al (2018), "Association of Antibiotic Resistance, Cell Adherence, and Biofilm Production with the Endemicity of Nosocomial Klebsiella pneumoniae", Article, 4, pp 1-9 25 Alebel M (2021), "Extended-Spectrum β-Lactamase and Carbapenemase Producing Gram-Negative Bacilli Infections Among Patients in Intensive Care Units of Felegehiwot Referral Hospital: A Prospective Cross-Sectional Study",Infection and Drug Resistance, 14, pp.391-405 26 Aseem R., Shenoy S., Mala S S., et al (2016), "Approach to Carbapenemase Detection in Klebsiella pneumoniae in Routine Diagnostic Laboratories", J Clin Diagn Res, 10 (12), pp Dc24-dc27 27 Ashurst J V., Dawson A (2020), Klebsiella Pneumonia, StatPearls Publishing, Treasure Island (FL) 28 Awoke T., Teka B (2021), "High Prevalence of Multidrug-Resistant Klebsiella pneumoniae in a Tertiary Care Hospital in Ethiopia", Antibiotics, 10 (8), pp 1-9 29 Bonomo R A., Burd E M., Conly J., Limbago B M., et al (2018), "Carbapenemase-Producing Organisms: A Global Scourge", Clin Infect Dis, 66 (8), pp 1290-1297 30 Chiu S K., Ma L., Chan M C., et al (2018), "Carbapenem Nonsusceptible Klebsiella pneumoniae in Taiwan: Dissemination and Increasing Resistance of Carbapenemase Producers During 2012-2015", Sci Rep, (1), pp 8468 31 Clinical and Laboratory Standards Institute (2020), "Preformance standards for antimicrobial susceptibility testing; Thirty infomational supplement, M100-S30.", 40 (1), pp 118-130 32 Codjoe F S., Donkor E S (2017), "Carbapenem Resistance: A Review", Med Sci (Basel), (1), pp 1-28 33 Doi Y (2019), "Treatment Options for Carbapenem-resistant Gramnegative Bacterial Infections", Clinical Infectious Diseases, 69 (7), pp 565-575 34 Dortet L., Cuzon G., Ponties V., Nordmann P (2017), "Trends in carbapenemase-producing Enterobacteriaceae, France, 2012 to 2014", Euro Surveill, 22 (6), pp 1-9 35 European Centre for Disease Prevention and Control (ECDC) (2019), "Laboratory manual for carbapenem and colistin resistance detection and characterisation for the survey of carbapenem- and/or colistinresistant Enterobacteriaceae, Version 2.0", pp 1-10 36 Feretzakis G, Loupelis E, Sakagianni A, Skarmoutsou N, et al (2019), "A 2-Year Single-Centre Audit on Antibiotic Resistance of Pseudomonas aeruginosa, Acinetobacter baumannii and Klebsiella pneumoniae Strains from an Intensive Care Unit and Other Wards in a General Public Hospital in Greece", Antibiotics, (2), pp 1-62 37 Ferreira R L., da Silva B C M., Rezende G S., Nakamura-Silva R., et al (2019), "High Prevalence of Multidrug-Resistant Klebsiella pneumoniae Harboring Several Virulence and β-Lactamase Encoding Genes in a Brazilian Intensive Care Unit", Frontiers in Microbiology, (3198), pp 1-15 38 Ghotaslou R., Sadeghi M R., Akhi M T., Hasani A., et al (2018), "Prevalence and Antimicrobial Susceptibility Patterns of ESBL, AmpC and Carbapenemase-producing Enterobactericeae Isolated from Hospitalized Patients in Azerbaijan, Iran", Iran J Pharm Res, 17, pp 79-88 39 Granata G., Petrosillo N (2017), "Resistance to Colistin in Klebsiella Pneumoniae: A 4.0 Strain?", Infect Dis Rep, (2), pp 7104 40 Grundmann H., Glasner C., Albiger B., Aanensen D M., et al (2017), "Occurrence of carbapenemase-producing Klebsiella pneumoniae and Escherichia coli in the European survey of carbapenemase-producing Enterobacteriaceae (EuSCAPE): a prospective, multinational study", Lancet Infect Dis, 17 (2), pp 153-163 41 Gurung S., Kafle S., (2020), "Detection of OXA-48 Gene in CarbapenemResistant Escherichia coli and Klebsiella pneumoniae from Urine Samples", Infection and Drug Resistance, 13, pp 2311-2321 42 Hammoudi D., Moubareck C A., Sarkis D K (2014), "How to detect carbapenemase producers? A literature review of phenotypic and molecular methods", J Microbiol Methods, 107, pp 106-118 43 Hu F., et al (2019), "Resistance reported from China antimicrobial surveillance network (CHINET) in 2018", European Journal of Clinical Microbiology & Infectious Diseases, 38 (12), pp 2275-2281 44 Ibrahim Y., Sani Y., Saleh Q., et al (2017), "Phenotypic Detection of Extended Spectrum Beta lactamase and Carbapenemase Co-producing Clinical Isolates from Two Tertiary Hospitals in Kano, North West Nigeria", Ethiop J Health Sci, 27 (1), pp 3-10 45 Jeong S H., et al (2016), "Prevalence and Molecular Characteristics of Carbapenemase-Producing Enterobacteriaceae From Five Hospitals in Korea", Ann Lab Med, 36 (6), pp 529-535 46 Khalifa S M (2021), "β-lactam resistance associated with β-lactamase production and porin alteration in clinical isolates of Escherichia coli and Klebsiella pneumoniae", Plos One, 16 (5), pp 1-22 47 Khan A U., Maryam L., Zarrilli R (2017), "Structure, Genetics and Worldwide Spread of New Delhi Metallo-β-lactamase (NDM): a threat to public health", BMC Microbiology, 17 (1), pp 101 48 Lee C R., Lee J H., Park K S., et al (2016), "Global Dissemination of Carbapenemase-Producing Klebsiella pneumoniae: Epidemiology, Genetic Context, Treatment Options, and Detection Methods", Front Microbiol, (895), pp 1-30 49 Lim F H., Modha D E., Collins E., et al (2020), "An outbreak of two strains of OXA-48 producing Klebsiella pneumoniae in a teaching hospital", Infection Prevention in Practice, (3), pp 1-5 50 Little M L., Qin X., Zerr D M., Weissman S J (2012), "Molecular diversity in mechanisms of carbapenem resistance in paediatric Enterobacteriaceae", Int J Antimicrob Agents, 39 (1), pp 52-57 51 Logan L K., Weinstein R A (2017), "The Epidemiology of CarbapenemResistant Enterobacteriaceae: The Impact and Evolution of a Global Menace", J Infect Dis, 215 (1), pp 28-36 52 Lopes E., et al (2020), "Epidemiology of carbapenemase-producing Klebsiella pneumoniae in northern Portugal: Predominance of KPC-2 and OXA-48", J Glob Antimicrob Resist, 22, pp 349-353 53 Manenzhe R I., Zar H J., Nicol M P., Kaba M (2014), "The spread of carbapenemase-producing bacteria in Africa: a systematic review", Journal of Antimicrobial Chemotherapy, 70 (1), pp 23-40 54 Mast Group (2017), MASTDISCS Combi Carba plus D73C manual, Mast Group, United Kingdom 55 Mataseje L F., Boyd D A., Fuller J., et al (2017), "Characterization of OXA-48-like carbapenemase producers in Canada, 2011–14", Journal of Antimicrobial Chemotherapy, 73 (3), pp 626-633 56 Mathlouthi N., et al (2016), "Carbapenemases and extended-spectrum βlactamases producing Enterobacteriaceae isolated from Tunisian and Libyan hospitals", J Infect Dev Ctries, 10 (7), pp 718-727 57 Messaoudi A., Mansour W., Jaidane N., et al (2019), "Epidemiology of resistance and phenotypic characterization of carbapenem resistance mechanisms in Klebsiella pneumoniae isolates at Sahloul University Hospital-Sousse, Tunisia", Afr Health Sci, 19 (2), pp 2008-2020 58 Moges F., et al (2019), "High prevalence of extended-spectrum betalactamase-producing Gram-negative pathogens from patients attending Felege Hiwot Comprehensive Specialized Hospital, Bahir Dar, Amhara region", PLoS One, 14 (4), pp 1-13 59 Myat T O., et al (2017), "ESBL- and Carbapenemase-Producing Enterobacteriaceae in Patients with Bacteremia, Yangon, Myanmar, 2014", Emerg Infect Dis, 23 (5), pp 857-859 60 Navon-Venezia S., Kondratyeva K., Carattoli A (2017), "Klebsiella pneumoniae: a major worldwide source and shuttle for antibiotic resistance", FEMS Microbiology Reviews, 41 (3), pp 252-275 61 Nirwati H., et al (2019), "Biofilm formation and antibiotic resistance of Klebsiella pneumoniae isolated from clinical samples in a tertiary care hospital, Klaten, Indonesia", BMC Proc, 13 (11), pp 1-8 62 Padmini N., Ajilda A A K., Sivakumar N., Selvakumar G (2017), "Extended spectrum β-lactamase producing Escherichia coli and Klebsiella pneumoniae: critical tools for antibiotic resistance pattern", Journal Basis Microbiology, 57 (6), pp 460-470 63 Pemberton O A., Zhang X., (2017), "Molecular Basis of Substrate Recognition and Product Release by the Klebsiella pneumoniae Carbapenemase (KPC-2)", HHS Public Access, 60 (8), pp 3525-3530 64 Petrosillo N., Taglietti F., Granata G (2019), "Treatment Options for Colistin Resistant Klebsiella pneumoniae: Present and Future", J Clin Med, (7), pp 1-22 65 Pitout J D D., Peirano G., Kock M M., Strydom K A., et al (2019), "The Global Ascendency of OXA-48-Type Carbapenemases", Clinical Microbiology, 33 (1), pp 1-48 66 Shaikh S., Fatima J., Shakil S., et al (2015), "Antibiotic resistance and extended spectrum beta-lactamases: Types, epidemiology and treatment", Saudi J Biol Sci, 22 (1), pp 90-101 67 Shimasaki T., Seekatz A., Bassis C., et al (2019), "Increased Relative Abundance of Klebsiella pneumoniae Carbapenemase-producing Klebsiella pneumoniae Within the Gut Microbiota Is Associated With Risk of Bloodstream Infection in Long-term Acute Care Hospital Patients", Clin Infect Dis, 68 (12), pp 2053-2059 68 Sun J., Deng Z., Yan A (2014), "Bacterial multidrug efflux pumps: mechanisms, physiology and pharmacological exploitations", Biochem Biophys Res Commun, 453 (2), pp 254-267 69 Tran G M., Ho-Le T P., et al (2017), "Patterns of antimicrobial resistance in intensive care unit patients: a study in Vietnam", BMC Infect Dis, 17 (1), pp 429 70 Tzouvelekis L S., Markogiannakis A., Piperaki E., et al (2014), "Treating infections caused by carbapenemase-producing Enterobacteriaceae", Clin Microbiol Infect, 20 (9), pp 862-872 71 Tzouvelekis L S., Markogiannakis A., Psichogiou M., Tassios P T., et al (2012), "Carbapenemases in Klebsiella pneumoniae and other Enterobacteriaceae: an evolving crisis of global dimensions", Clin Microbiol Rev, 25 (4), pp 682-707 72 Virginio C., Yuly L., Estela M., Dora R (2019), "Relationship Between Biofilm Formation and Antimicrobial Resistance in Gram-Negative Bacteria", Microbial Drug Resistance, 25 (1), pp 72-79 73 Wang C., Yuan Z., Huang W., et al (2019), "Epidemiologic analysis and control strategy of Klebsiella pneumoniae infection in intensive care units in a teaching hospital of People's Republic of China", Infect Drug Resist, 12, pp 391-398 74 Wang G., et al (2020), "Association of CRISPR/Cas System with the Drug Resistance in Klebsiella pneumoniae", 13, pp 1929-1935 75 Wang Q., Wang X., Wang J., et al (2018), "Phenotypic and Genotypic Characterization of Carbapenem-resistant Enterobacteriaceae: Data From a Longitudinal Large-scale CRE Study in China (2012-2016)", Clin Infect Dis, 67 (s2), pp 196-205 76 World Health Organization (WHO) (2017), "Global priority list of antibiotic-resistant bacteria to guide research, discovery, and development of new antibiotics", pp 5-7 77 Yang T Y., Lu P L., Tseng S P (2019), "Update on fosfomycin-modified genes in Enterobacteriaceae", Journal of Microbiology, Immunology and Infection, 52 (1), pp 9-21 78 Yoon E J., Kang D Y., et al (2018), "New Delhi Metallo-BetaLactamase-Producing Enterobacteriaceae in South Korea Between 2010 and 2015", Frontiers in Microbiology, (571), pp 1-10 79 Younas S., Ejaz H., Zafar A., Ejaz A., et al (2018), "AmpC betalactamases in Klebsiella pneumoniae: An emerging threat to the paediatric patients", J Pak Med Assoc, 68 (6), pp 893-897 PHIẾU THU THẬP SỐ LIỆU Đề tài: “Khảo sát sinh enzyme carbapenemase tình hình đề kháng kháng sinh Klebsiella pneumoniae mẫu bệnh phẩm Bệnh viện Đa khoa thành phố Cần Thơ Bệnh viện Đa khoa Trung ương Cần Thơ năm 2021-2022” I PHẦN HÀNH CHÍNH STT: Họ tên: MSBN: Tuổi: 15 – 45 ; 46 – 60 ;; Giới: ; Nữ ; Nam Nơi cư trú: Nội thành ; >60 Ngoại thành ; ; Khoa/ phòng: Loại bệnh phẩm: Đàm ; Mủ ; Máu ; Nước tiểu ; Dịch khác ; II PHẦN CHUYÊN MÔN Kết sinh carbapenemase: Dương tính Loại carbapenemase : KPC ; MBL ; Âm tính ; OXA-48 ; ; Loại khác ; MIC chủng Klebsiella pneumoniae sinh carbapenemase với số loại kháng sinh Etest: - Imipenem (μg/mL): - Amikacin (μg/mL): - Gentamicin (μg/mL): - Trimethoprim/Sulfamethoxazole (μg/mL): Kết kháng sinh đồ: STT Ký hiệu Kháng Trung gian Nhạy Kháng sinh (R) Piperacillin/Tazobactam TZP Ampicillin AM Cefazolin CZ Ceftazidime CAZ Ceftriaxone CRO Cefepime FEP Amikacin AN Gentamicin GM Ciprofloxacin CIP 10 Trimethoprim/Sulfamethoxazole SXT 11 Imipenem IPM 12 Ertapenem ETP (I) (S) Cần Thơ, ngày…….tháng……năm 20… Người thu thập ... DỤC VÀ ĐÀO TẠO BỘ Y TẾ TRƯỜNG ĐẠI HỌC Y DƯỢC CẦN THƠ NGUYỄN CHÍ NGUYỄN KHẢO SÁT SỰ SINH ENZYME CARBAPENEMASE VÀ TÌNH HÌNH ĐỀ KHÁNG KHÁNG SINH CỦA KLEBSIELLA PNEUMONIAE TRÊN CÁC MẪU BỆNH PHẨM TẠI... nhiễm trùng Bệnh viện Đa khoa thành phố Cần Thơ Bệnh viện Đa khoa Trung ương Cần Thơ - Bệnh nhân có nhiều loại bệnh phẩm phân lập Klebsiella pneumoniae thu loại bệnh phẩm cho bệnh nhân - Bệnh nhân... 345 mẫu Trong đó, Bệnh viện Đa khoa thành phố Cần Thơ 135 mẫu Bệnh viện Đa khoa Trung ương Cần Thơ 210 mẫu 2.2.3 Phương pháp chọn mẫu Chọn mẫu thuận tiện đến phân lập đủ cỡ mẫu Klebsiella pneumoniae