Nghiên cứu nhiễm giun, sán đường tiêu hóa và hô hấp ở lợn bản địa tỉnh điện biên, đặc điểm bệnh do giun phổi metastrongylus spp gây ra và biện pháp phòng trị

ĐẠI HỌC THÁI NGUYÊN TRƯỜNG ĐẠI HỌC NÔNG LÂM NCS NGUYỄN VĂN TUYÊN NGHIÊN CỨU NHIỄM GIUN, SÁN ĐƯỜNG TIÊU HĨA VÀ HƠ HẤP Ở LỢN BẢN ĐỊA TỈNH ĐIỆN BIÊN, ĐẶC ĐIỂM BỆNH DO GIUN PHỔI Metastrongylus spp GÂY RA VÀ BIỆN PHÁP PHÒNG TRỊ LUẬN ÁN TIẾN SĨ THÚ Y Thái Nguyên - 2022 ĐẠI HỌC THÁI NGUYÊN TRƯỜNG ĐẠI HỌC NÔNG LÂM NCS NGUYỄN VĂN TUYÊN NGHIÊN CỨU NHIỄM GIUN, SÁN ĐƯỜNG TIÊU HĨA VÀ HƠ HẤP Ở LỢN BẢN ĐỊA TỈNH ĐIỆN BIÊN, ĐẶC ĐIỂM BỆNH DO GIUN PHỔI Metastrongylus spp GÂY RA VÀ BIỆN PHÁP PHÒNG TRỊ Ngành: Ký sinh trùng Vi sinh vật học Thú y Mã số: 64 01 04 LUẬN ÁN TIẾN SĨ THÚ Y Người hướng dẫn khoa học: GS TS Nguyễn Thị Kim Lan PGS TS Nguyễn Thị Ngân Thái Nguyên - 2022 i LỜI CAM ĐOAN Tôi xin cam đoan cơng trình nghiên cứu riêng với hướng dẫn GS.TS Nguyễn Thị Kim Lan PGS.TS Nguyễn Thị Ngân Các số liệu, kết nghiên cứu luận án hoàn tồn trung thực chưa cơng bố cơng trình khoa học khác Mọi thơng tin trích dẫn luận án rõ nguồn gốc TÁC GIẢ Nguyễn Văn Tuyên ii LỜI CẢM ƠN Để hồn thành luận án này, tơi xin bày tỏ lòng biết ơn sâu sắc tới thầy hướng dẫn: GS TS Nguyễn Thị Kim Lan PGS TS Nguyễn Thị Ngân - người hướng dẫn, bảo, động viên tơi tận tình suốt q trình nghiên cứu hồn thành Luận án Tơi xin chân thành cảm ơn Thầy giáo, Cô giáo trường Đại học Nông Lâm - Đại học Thái Nguyên giảng dạy, hướng dẫn tơi hồn thành học phần chuyên đề suốt trình đào tạo Nhân dịp này, xin gửi lời cảm ơn tới Ban Giám đốc, Ban Đào tạo sau đại học - Đại học Thái Nguyên; Ban Giám hiệu, phòng Đào tạo, Ban Chủ nhiệm Khoa Chăn nuôi - Thú y, trường Đại học Nông Lâm tạo điều kiện thuận lợi để học tập nghiên cứu Tôi xin bày tỏ lời cảm ơn sâu sắc đến Ban Giám hiệu trường Cao đẳng Kinh tế - Kỹ thuật Điện Biên tạo điều kiện thời gian, hỗ trợ phần kinh phí cho tơi q trình học tập Tơi xin trân trọng cảm ơn PGS TS Phạm Ngọc Doanh - Viện Sinh thái Tài nguyên sinh vật Việt Nam; PGS TS Nguyễn Thanh Tùng - Trường Đại học Cần Thơ; kỹ thuật viên phòng Siêu cấu trúc - Viện Vệ sinh dịch tễ Trung ương, kỹ thuật viên khoa xét nghiệm Bệnh viện Đa khoa Trung ương Thái Nguyên, Chi cục Thú y tỉnh Điện Biên giúp đỡ tơi q trình thực đề tài Tôi xin chân thành cảm ơn chia sẻ thành với Cựu học sinh Lò Văn Dung (khóa 29); Khồng Văn Liễu, Nguyễn Thị Dung, Chu Dèn Sơn, Thào A Chìa, Vừ A Tủa, Lị Văn Thức, Sào Khóa Lèn (khóa 32) ngành Chăn ni Thú y cựu sinh viên Vàng A Sình (khóa 8); Cháng A Hạng, Hồ A Ly, Giàng Thị Dí (khóa 9); Quàng Văn Dy, Vừ A Dơ (khóa 10) ngành Chăn nuôi, trường Cao đẳng Kinh tế - Kỹ thuật Điện Biên tham gia thu thập mẫu giúp q trình triển khai thực đề tài Tơi xin bày tỏ lòng biết ơn chân thành tới người bạn, người thân gia đình, bố, mẹ, chị em gái giúp đỡ, kịp thời động viên tạo điều kiện thuận lợi suốt thời gian học tập, nghiên cứu hoàn thành luận án Xin trân trọng cảm ơn tất giúp đỡ quý báu Thái Nguyên, ngày tháng năm 2022 NGHIÊN CỨU SINH iii MỤC LỤC LỜI CAM ĐOAN i LỜI CẢM ƠN ii MỤC LỤC iii DANH MỤC CÁC BẢNG vi DANH MỤC CÁC HÌNH .viii MỞ ĐẦU 1 Tính cấp thiết đề tài Mục tiêu đề tài Ý nghĩa khoa học ý nghĩa thực tiễn đề tài Những đóng góp đề tài Chương 1: TỔNG QUAN TÀI LIỆU 1.1 Cơ sở khoa học đề tài 1.1.1 Giun, sán ký sinh lợn 1.1.2 Bệnh giun phổi lợn 1.2 Tình hình nghiên cứu giới Việt Nam 14 1.2.1 Trên giới 14 1.2.2 Ở Việt Nam 23 1.3 Điều kiện tự nhiên, điều kiện kinh tế - xã hội tình hình chăn ni lợn tỉnh Điện Biên .28 CHƯƠNG 2: ĐỐI TƯỢNG, VẬT LIỆU, NỘI DUNG VÀ PHƯƠNG PHÁP NGHIÊN CỨU 32 2.1 Đối tượng, thời gian địa điểm nghiên cứu 32 2.1.1 Đối tượng nghiên cứu 32 2.1.2 Thời gian địa điểm nghiên cứu 32 2.2 Vật liệu nghiên cứu 32 2.2.1 Động vật loại mẫu nghiên cứu 32 2.2.2 Dụng cụ hóa chất sử dụng nghiên cứu 33 2.3 Nội dung nghiên cứu 33 iv 2.3.1 Nghiên cứu thành phần loài đặc điểm nhiễm giun, sán đường tiêu hóa hơ hấp lợn địa tỉnh Điện Biên 33 2.3.2 Nghiên cứu giun phổi Metastrongylus spp bệnh giun phổi gây lợn địa 34 2.4 Phương pháp nghiên cứu 35 2.4.1 Phương pháp nghiên cứu thành phần loài đặc điểm nhiễm giun, sán đường tiêu hóa hơ hấp lợn địa tỉnh Điện Biên 35 2.4.2 Phương pháp nghiên cứu giun phổi Metastrongylus spp bệnh giun phổi gây lợn địa 40 2.4.3 Phương pháp xử lý số liệu 48 Chương : KẾT QUẢ VÀ THẢO LUẬN 49 3.1 Thành phần loài đặc điểm nhiễm giun, sán đường tiêu hóa hơ hấp 49 3.1.1 Thành phần lồi giun, sán ký sinh lợn địa 49 3.1.2 Đặc điểm nhiễm giun, sán đường tiêu hóa hơ hấp lợn địa 55 3.2 Giun phổi Metastrongylus spp bệnh giun phổi gây lợn 65 3.2.1 Định danh loài giun phổi thu từ lợn địa 65 3.2.2 Đặc điểm dịch tễ bệnh giun phổi Metastrongylus spp lợn địa 75 3.2.3 Nguy nhiễm giun phổi lợn theo phương thức chăn nuôi 88 3.2.4 Vật chủ trung gian giun phổi 89 3.2.5 Đặc điểm bệnh lý lâm sàng bệnh giun phổi lợn địa 98 3.2.6 Nghiên cứu biện pháp phòng chống bệnh giun phổi cho lợn địa 109 3.2.7 Đề xuất biện pháp phòng chống tổng hợp bệnh giun phổi cho lợn 112 KẾT LUẬN VÀ ĐỀ NGHỊ 114 Kết luận 114 Đề nghị 115 TÀI LIỆU THAM KHẢO 117 v DANH MỤC CÁC TỪ VIẾT TẮT bp: base pair ĐC: Đối chứng n: dung lượng mẫu Nxb: Nhà xuất P: độ tin cậy PCR: Polymerase Chain Reaction SGN: Sau gây nhiễm STT Số thứ tự spp.: species pluralis TN: Thí nghiệm TT: Thể trọng A sufrartyfex Artyfechinostomum sufrartyfex A suum: Ascaris suum A strongylina Ascarops strongylina F buski: Fasciolopsis buski H rubidus Hyostrongylus rubidus O dentatum Oesophagostomum dentatum M elongatus: Metastrongylus elongatus M pudendotectus: Metastrongylus pudendotectus M salmi: Metastrongylus salmi M asymmetricus: Metastrongylus asymmetricus M hirudinaceus: Macracanthorhynchus hirudinaceus P sexalatus Physocephalus sexalatus T suis Trichocephalus suis S ransomi: Strongyloides ransomi vi DANH MỤC CÁC BẢNG Bảng 1.1 Thành phần loài giun, sán ký sinh ống tiêu hóa hơ hấp lợn Bảng 1.2 Tỷ lệ nhiễm loài giun, sán lợn giới 15 Bảng 1.3 Tỷ lệ nhiễm loài giun phổi lợn giới 18 Bảng 1.4 Tỷ lệ nhiễm loài giun, sán lợn Việt Nam .24 Bảng 1.5 Tỷ lệ nhiễm loài giun phổi lợn Việt Nam 27 Bảng 2.1 Số lượng mẫu kiểm tra theo tiêu nghiên cứu 36 Bảng 2.2 Sơ đồ bố trí thí nghiệm gây nhiễm giun phổi cho lợn địa 44 Bảng 2.3 Sơ đồ bố trí thí nghiệm tẩy giun phổi lợn gây nhiễm .46 Bảng 3.1 Thành phần loài phân bố lồi giun, sán đường tiêu hóa hơ hấp lợn địa tỉnh Điện Biên 49 Bảng 3.2 Tỷ lệ nhiễm giun, sán lợn địa tỉnh Điện Biên (qua mổ khám) 55 Bảng 3.3 Tỷ lệ nhiễm giun, sán lợn địa tỉnh Điện Biên (qua xét nghiệm phân) 57 Bảng 3.4 Tỷ lệ nhiễm giun, sán lợn địa theo lứa tuổi 59 Bảng 3.5 Tỷ lệ nhiễm giun, sán lợn địa theo phương thức chăn nuôi 61 Bảng 3.6 Tỷ lệ nhiễm giun, sán lợn địa theo mùa năm 62 Bảng 3.7 Tỷ lệ nhiễm giun, sán lợn địa theo địa hình 64 Bảng 3.8 Kết định danh loài giun phổi lợn địa tỉnh Điện Biên 65 Bảng 3.9 Kết đo kích thước giun M elongatus M pudendotectus ký sinh lợn địa tỉnh Điện Biên 66 Bảng 3.10 Khoảng cách di truyền loài Metastrongylus elongatus dựa phân tích trình tự ITS2 .71 Bảng 3.11 Khoảng cách di truyền loài M elongatus M pudendotectus dựa phân tích trình tự cox1 73 Bảng 3.12 Kết mổ khám thu thập giun phổi lợn địa Điện Biên .75 Bảng 3.13 Tỷ lệ cường độ nhiễm giun phổi lợn địa tỉnh Điện Biên 76 Bảng 3.14 Tỷ lệ cường độ nhiễm đơn lẻ hỗn hợp giun phổi 79 vii Bảng 3.15 Tỷ lệ cường độ nhiễm giun phổi lợn địa theo lứa tuổi .81 Bảng 3.16 Tỷ lệ cường độ nhiễm giun phổi lợn địa theo mùa năm 83 Bảng 3.17 Tỷ lệ cường độ nhiễm giun phổi lợn địa theo vùng địa hình 84 Bảng 3.18 Tỷ lệ cường độ nhiễm giun phổi lợn địa theo phương thức chăn nuôi 86 Bảng 3.19 Nguy nhiễm giun phổi lợn theo phương thức chăn nuôi .88 Bảng 3.20 Thành phần phân bố loài giun đất tỉnh Điện Biên 90 Bảng 3.21 Tỷ lệ cá thể theo loài giun đất thu thập tỉnh Điện Biên 96 Bảng 3.22 Tỷ lệ cường độ nhiễm ấu trùng giun phổi giun đất thu thập Điện Biên 97 Bảng 3.23 Thời gian giun phổi hồn thành vịng đời lợn gây nhiễm 99 Bảng 3.24 Diễn biến lâm sàng lợn địa sau gây nhiễm giun phổi 100 Bảng 3.25 Sự thay đổi tiêu hệ bạch cầu lợn địa sau gây nhiễm 101 Bảng 3.26 Tổn thương đại thể lợn mắc bệnh giun phổi gây nhiễm 103 Bảng 3.27 Tổn thương vi thể lợn mắc bệnh giun phổi gây nhiễm 105 Bảng 3.28 Triệu chứng lâm sàng lợn nhiễm giun phổi địa phương 107 Bảng 3.29 Tổn thương đại thể lợn mắc bệnh giun phổi địa phương 108 Bảng 3.30 Thử nghiệm hiệu lực thuốc tẩy giun phổi lợn gây nhiễm 109 Bảng 3.31 Hiệu lực thuốc tẩy giun phổi cho lợn diện hẹp thực địa .110 viii DANH MỤC CÁC HÌNH Hình 1.1 Phân loại trứng ký sinh lợn (Soulsby, 1988) Hình 1.2 Vịng đời phát triển giun phổi lợn Metastrongylus spp Hình 1.3 Bản đồ Việt Nam 29 Hình 1.4 Bản đồ tỉnh Điện Biên 29 Hình 3.1 Giun dày Gnathostoma sp thu thập từ dày lợn tỉnh Điện Biên 52 Hình 3.2 Hình thái giun dày Gnathostoma sp (hình kẻ vẽ) 52 Hình 3.3 Ảnh đầu phần thân trước giun Gnathostoma sp 52 Hình 3.4 Ảnh gai móc phần đầu giun Gnathostoma sp 52 Hình 3.5 Ảnh gai phần thân giun Gnathostoma sp 53 Hình 3.6 Ảnh gai phần giun Gnathostoma sp 53 Hình 3.7 Cây phát sinh chủng loại loài Gnathostoma xây dựng từ trình tự ITS2 phương pháp Maximum Likelihood 54 Hình 3.8 Cây phát sinh chủng loại loài Gnathostoma xây dựng từ trình tự cox1 phương pháp Maximum Likelihood .54 Hình 3.9 Giun trịn Metastrongylus elongatus Gmelin, 1790 ký sinh lợn Điện Biên 67 Hình 3.10 Giun trịn Metastrongylus pudendotectus Wostokow, 1905 ký sinh lợn Điện Biên .69 Hình 3.11 Cây phát sinh chủng loại loài Metastrongylus xây dựng từ trình tự ITS2 phương pháp Maximum Likekliwood .72 Hình 3.12 Cây phát sinh chủng loại loài Metastrongylus xây dựng từ trình tự cox1 phương pháp Maximum Likekliwood 74 Hình 3.13 Biểu đồ tỷ lệ nhiễm giun phổi lợn địa tỉnh Điện Biên 78 Hình 3.14 Biểu đồ cường độ nhiễm giun phổi lợn địa tỉnh Điện Biên .78 Hình 3.15 Biểu đồ tỷ lệ nhiễm đơn lẻ hỗn hợp giun phổi 79 Hình 3.16 Đồ thị biến động nhiễm giun phổi lợn địa theo tuổi 82 Hình 3.17 Biểu đồ tỷ lệ nhiễm giun phổi lợn địa theo mùa năm 83 Hình 3.18 Biểu đồ tỷ lệ nhiễm giun phổi lợn địa theo địa hình 85 145 Điện Biên 2.747 D Means that not share a letter are significantly different General Linear Model: Tỷ lệ nhiễm sán versus Tuổi Factor Tuổi Type fixed Levels Values > - 6, > - 12, ≤ 3, ≥ 12 Analysis of Variance for TLN SL, using Adjusted SS for Tests Source Tuổi Error Total DF 11 Seq SS 47.391 1.892 49.283 S = 0.486316 Adj SS 47.391 1.892 Adj MS 15.797 0.237 R-Sq = 96.16% F 66.79 P 0.000 R-Sq(adj) = 94.72% Unusual Observations for TLN SL Obs TLN SL 1.25786 Fit 0.41929 SE Fit 0.28077 Residual 0.83857 St Resid 2.11 R R denotes an observation with a large standardized residual Grouping Information Using Tukey Method and 95.0% Confidence Tuổi ≥ 12 > - 12 > - ≤ N 3 3 Mean 5.7247 3.3107 1.6525 0.4193 Grouping A B B C C Means that not share a letter are significantly different General Linear Model: Tỷ lệ nhiễm giun tròn versus Tuổi Factor Tuổi Type fixed Levels Values > - 6, > - 12, ≤ 3, ≥ 12 Analysis of Variance for TLN GT, using Adjusted SS for Tests Source Tuổi Error Total DF 11 S = 1.65297 Seq SS 2071.96 21.86 2093.82 Adj SS 2071.96 21.86 R-Sq = 98.96% Adj MS 690.65 2.73 F 252.77 P 0.000 R-Sq(adj) = 98.56% Unusual Observations for TLN GT Obs TLN GT 92.7778 Fit 89.7139 SE Fit 0.9543 Residual 3.0639 St Resid 2.27 R R denotes an observation with a large standardized residual 146 Grouping Information Using Tukey Method and 95.0% Confidence Tuổi > - > - 12 ≥ 12 ≤ N 3 3 Mean 89.71 82.61 74.39 54.60 Grouping A B C D Means that not share a letter are significantly different General Linear Model: Tỷ lệ nhiễm giun đầu gai versus Tuổi Factor Tuổi Type fixed Levels Values > - 6, > - 12, ≤ 3, ≥ 12 Analysis of Variance for TLN GĐG, using Adjusted SS for Tests Source Tuổi Error Total DF 11 S = 0.700569 Seq SS 521.16 3.93 525.08 Adj SS 521.16 3.93 Adj MS 173.72 0.49 R-Sq = 99.25% F 353.95 P 0.000 R-Sq(adj) = 98.97% Unusual Observations for TLN GĐG Obs TLN GĐG 8.0247 Fit 9.3159 SE Fit 0.4045 Residual -1.2912 St Resid -2.26 R R denotes an observation with a large standardized residual Grouping Information Using Tukey Method and 95.0% Confidence Tuổi ≥ 12 > - 12 > - ≤ N 3 3 Mean 17.1673 9.3159 2.9396 -0.0000 Grouping A B C D Means that not share a letter are significantly different General Linear Model: Tỷ lệ nhiễm sán versus Phương thức chăn nuôi Factor Phương thức chăn nuôi Type fixed Levels Values Bán chăn thả, Nhốt hồn tồn, Thả rơng Analysis of Variance for TLN SL, using Adjusted SS for Tests Source Phương thức chăn nuôi Error Total S = 0.388294 DF Seq SS 14.4274 0.9046 15.3321 R-Sq = 94.10% Adj SS 14.4274 0.9046 Adj MS 7.2137 0.1508 F 47.85 P 0.000 R-Sq(adj) = 92.13% Grouping Information Using Tukey Method and 95.0% Confidence 147 Phương thức chăn ni Thả rơng Bán chăn thả Nhốt hồn tồn N 3 Mean 3.6527 2.1987 0.5533 Grouping A B C Means that not share a letter are significantly different General Linear Model: Tỷ lệ nhiễm giun tròn versus Phương thức chăn nuôi Factor Phương thức chăn nuôi Type fixed Levels Values Bán chăn thả, Nhốt hoàn toàn, Thả rông Analysis of Variance for TLN GT, using Adjusted SS for Tests Source Phương thức chăn nuôi Error Total S = 1.64055 DF Seq SS 3744.7 16.1 3760.8 R-Sq = 99.57% Adj SS 3744.7 16.1 Adj MS 1872.3 2.7 F 695.67 P 0.000 R-Sq(adj) = 99.43% Unusual Observations for TLN GT Obs TLN GT 46.2810 Fit 43.0869 SE Fit 0.9472 Residual 3.1941 St Resid 2.38 R R denotes an observation with a large standardized residual Grouping Information Using Tukey Method and 95.0% Confidence Phương thức chăn ni Thả rơng Bán chăn thả Nhốt hồn tồn N 3 Mean 92.91 71.23 43.09 Grouping A B C Means that not share a letter are significantly different General Linear Model: Tỷ lệ nhiễm giun đầu gai versus phương thức chăn nuôi Factor Phương thức chăn nuôi Type fixed Levels Values Bán chăn thả, Nhốt hồn tồn, Thả rơng Analysis of Variance for TLN GĐG, using Adjusted SS for Tests Source Phương thức chăn nuôi Error Total S = 0.760655 DF Seq SS 131.620 3.472 135.092 R-Sq = 97.43% Adj SS 131.620 3.472 Adj MS 65.810 0.579 F 113.74 R-Sq(adj) = 96.57% Grouping Information Using Tukey Method and 95.0% Confidence P 0.000 148 Phương thức chăn nuôi Thả rông Bán chăn thả Nhốt hoàn toàn N 3 Mean 10.1778 5.0265 0.8266 Grouping A B C Means that not share a letter are significantly different General Linear Model: Tỷ lệ nhiễm sán versus Mùa Factor Mùa Type fixed Levels Values Đông, Hè, Thu, Xuân Analysis of Variance for TLN SL, using Adjusted SS for Tests Source Mùa Error Total DF 11 Seq SS 12.7302 3.5298 16.2600 S = 0.664248 Adj SS 12.7302 3.5298 Adj MS 4.2434 0.4412 R-Sq = 78.29% F 9.62 P 0.005 R-Sq(adj) = 70.15% Unusual Observations for TLN SL Obs TLN SL 2.24719 Fit 3.52796 SE Fit 0.38350 Residual -1.28077 St Resid -2.36 R R denotes an observation with a large standardized residual Grouping Information Using Tukey Method and 95.0% Confidence Mùa Hè Thu Xuân Đông N 3 3 Mean 3.528 3.419 1.569 1.281 Grouping A A B B Means that not share a letter are significantly different General Linear Model: Tỷ lệ nhiễm giun tròn versus Mùa Factor Mùa Type fixed Levels Values Đông, Hè, Thu, Xuân Analysis of Variance for TLN GT, using Adjusted SS for Tests Source Mùa Error Total DF 11 S = 1.79306 Seq SS 3261.5 25.7 3287.2 Adj SS 3261.5 25.7 Adj MS 1087.2 3.2 R-Sq = 99.22% F 338.14 P 0.000 R-Sq(adj) = 98.92% Unusual Observations for TLN GT Obs TLN GT Fit SE Fit Residual St Resid 149 69.1781 66.0848 1.0352 3.0932 2.11 R R denotes an observation with a large standardized residual Grouping Information Using Tukey Method and 95.0% Confidence Mùa Hè Thu Xuân Đông N 3 3 Mean 95.91 81.89 66.08 52.04 Grouping A B C D Means that not share a letter are significantly different General Linear Model: Tỷ lệ nhiễm giun đầu gai versus Mùa Factor Mùa Type fixed Levels Values Đông, Hè, Thu, Xuân Analysis of Variance for TLN GĐG, using Adjusted SS for Tests Source Mùa Error Total DF 11 Seq SS 82.901 5.096 87.998 S = 0.798156 Adj SS 82.901 5.096 Adj MS 27.634 0.637 R-Sq = 94.21% F 43.38 P 0.000 R-Sq(adj) = 92.04% Grouping Information Using Tukey Method and 95.0% Confidence Mùa Hè Thu Xuân Đông N 3 3 Mean 9.476 8.245 4.492 3.061 Grouping A A B B Means that not share a letter are significantly different General Linear Model: Tỷ lệ nhiễm sán versus Địa hình Factor Địa hình Type fixed Levels Values Vùng bán sơn địa, Vùng phẳng, Vùng núi cao Analysis of Variance for TLN SL, using Adjusted SS for Tests Source Địa hình Error Total DF S = 0.577602 Seq SS 40.099 2.002 42.101 Adj SS 40.099 2.002 R-Sq = 95.25% Adj MS 20.049 0.334 F 60.10 P 0.000 R-Sq(adj) = 93.66% Unusual Observations for TLN SL Obs TLN SL 6.97674 Fit 5.95860 SE Fit 0.33348 Residual 1.01814 St Resid 2.16 R R denotes an observation with a large standardized residual Grouping Information Using Tukey Method and 95.0% Confidence 150 Địa hình Vùng phẳng Vùng bán sơn địa Vùng núi cao N 3 Mean 5.9586 2.6753 0.8580 Grouping A B C Means that not share a letter are significantly different General Linear Model: Tỷ lệ nhiễm giun trịn versus Địa hình Factor Địa hình Type fixed Levels Values Vùng bán sơn địa, Vùng phẳng, Vùng núi cao Analysis of Variance for TLN GT, using Adjusted SS for Tests Source Địa hình Error Total DF S = 1.33411 Seq SS 2465.2 10.7 2475.9 Adj SS 2465.2 10.7 R-Sq = 99.57% Adj MS 1232.6 1.8 F 692.54 P 0.000 R-Sq(adj) = 99.42% Grouping Information Using Tukey Method and 95.0% Confidence Địa hình Vùng núi cao Vùng bán sơn địa Vùng phẳng N 3 Mean 91.03 72.17 50.52 Grouping A B C Means that not share a letter are significantly different General Linear Model: Tỷ lệ nhiễm giun đầu gai versus Địa hình Factor Địa hình Type fixed Levels Values Vùng bán sơn địa, Vùng phẳng, Vùng núi cao Analysis of Variance for TLN GĐG, using Adjusted SS for Tests Source Địa hình Error Total DF S = 0.617530 Seq SS 96.937 2.288 99.226 Adj SS 96.937 2.288 R-Sq = 97.69% Adj MS 48.469 0.381 F 127.10 P 0.000 R-Sq(adj) = 96.93% Grouping Information Using Tukey Method and 95.0% Confidence Địa hình Vùng núi cao Vùng bán sơn địa Vùng phẳng N 3 Mean 9.578 5.945 1.551 Grouping A B C Means that not share a letter are significantly different 151 Đặc điểm dịch tễ bệnh giun phổi lợn tỉnh Điện Biên General Linear Model: Tỷ lệ nhiễm giun phổi versus địa điểm (mổ khám) Factor Địa điểm Type fixed Levels Values Điện Biên Điện Biên Đông Mường Ảng Mường Chà Mường Nhé Analysis of Variance for Tỷ lệ nhiễm, using Adjusted SS for Tests Source Địa điểm Error Total DF 10 14 Seq SS 390,499 40,776 431,274 S = 2,01930 Adj SS 390,499 40,776 R-Sq = 90,55% Adj MS 97,625 4,078 F 23,94 P 0,000 R-Sq(adj) = 86,76% Unusual Observations for Tỷ lệ nhiễm Obs Tỷ lệ nhiễm 10,6700 Fit 14,1567 SE Fit 1,1658 Residual -3,4867 St Resid -2,11 R R denotes an observation with a large standardized residual Grouping Information Using Tukey Method and 95,0% Confidence Địa điểm Mường Nhé Mường Chà Điện Biên Đông Điện Biên Mường Ảng N 3 3 Mean 27,91 26,67 23,23 18,75 14,16 Grouping A A A B B C C Means that not share a letter are significantly different General Linear Model: Tỷ lệ nhiễm giun phổi versus địa điểm (xét nghiệm) Factor Địa điểm Type fixed Levels Values Điện Biên, Điện Biên Đông, Mường Ảng, Mường Chà, Mường Nhé Analysis of Variance for Tỷ lệ nhiễm, using Adjusted SS for Tests Source Địa điểm Error Total DF 10 14 Seq SS 573.29 60.52 633.81 Adj SS 573.29 60.52 Adj MS 143.32 6.05 F 23.68 P 0.000 S = 2.46014 R-Sq = 90.45% R-Sq(adj) = 86.63% Unusual Observations for Tỷ lệ nhiễm Obs 12 13 Tỷ lệ nhiễm 17.1875 25.7732 Fit 21.2560 29.8623 SE Fit 1.4204 1.4204 Residual -4.0685 -4.0891 St Resid -2.03 R -2.04 R R denotes an observation with a large standardized residual 152 Grouping Information Using Tukey Method and 95.0% Confidence Địa điểm Mường Nhé Mường Chà Điện Biên Đông Điện Biên Mường Ảng N 3 3 Mean 29.86 25.54 21.26 17.85 11.93 Grouping A A B B C C D D Means that not share a letter are significantly different General Linear Model: Tỷ lệ nhiễm giun phổi versus Tuổi Factor Tuổi Type fixed Levels Values > - 6, > - 12, ≤ 3, ≥ 12 Analysis of Variance for Tỷ lệ nhiễm, using Adjusted SS for Tests Source Tuổi Error Total DF 11 Seq SS 823.42 4.08 827.50 S = 0.713993 Adj SS 823.42 4.08 R-Sq = 99.51% Adj MS 274.47 0.51 F 538.41 P 0.000 R-Sq(adj) = 99.32% Grouping Information Using Tukey Method and 95.0% Confidence Tuổi > - > - 12 ≤ ≥ 12 N 3 3 Mean 31.80 22.57 14.02 10.35 Grouping A B C D Means that not share a letter are significantly different General Linear Model: Tỷ lệ nhiễm giun phổi versus Mùa vụ Factor Mùa vụ Type fixed Levels Values Đông, Hè, Thu, Xuân Analysis of Variance for Tỷ lệ nhiễm, using Adjusted SS for Tests Source Mùa vụ Error Total DF 11 Seq SS 135.276 6.279 141.555 S = 0.885920 Adj SS 135.276 6.279 R-Sq = 95.56% Adj MS 45.092 0.785 F 57.45 P 0.000 R-Sq(adj) = 93.90% Grouping Information Using Tukey Method and 95.0% Confidence Mùa vụ Hè Thu Xuân Đông N 3 3 Mean 24.72 21.93 18.65 15.82 Grouping A B C D Means that not share a letter are significantly different 153 General Linear Model: Tỷ lệ nhiễm giun phổi versus Phương thức chăn nuôi Factor Phương thức chăn nuôi Type fixed Levels Values Bán chăn thả, Nhốt hồn tồn, Thả rơng Analysis of Variance for Tỷ lệ nhiễm, using Adjusted SS for Tests Source Phương thức chăn nuôi Error Total S = 0.613907 DF Seq SS 640.28 2.26 642.54 R-Sq = 99.65% Adj SS 640.28 2.26 Adj MS 320.14 0.38 F 849.44 P 0.000 R-Sq(adj) = 99.53% Grouping Information Using Tukey Method and 95.0% Confidence Phương thức chăn nuôi Thả rông Bán chăn thả Nhốt hoàn toàn N 3 Mean 27.804 18.546 7.179 Grouping A B C Means that not share a letter are significantly different General Linear Model: Tỷ lệ nhiễm giun phổi versus Địa hình Factor Địa hình Type fixed Levels Values Vùng bán sơn địa, Vùng phẳng, Vùng núi cao Analysis of Variance for Tỷ lệ nhiễm, using Adjusted SS for Tests Source Địa hình Error Total DF S = 0.619871 Seq SS 578.06 2.31 580.37 Adj SS 578.06 2.31 R-Sq = 99.60% Adj MS 289.03 0.38 F 752.22 P 0.000 R-Sq(adj) = 99.47% Unusual Observations for Tỷ lệ nhiễm Obs Tỷ lệ nhiễm 17.9825 Fit 19.0535 SE Fit 0.3579 Residual -1.0711 St Resid -2.12 R R denotes an observation with a large standardized residual Grouping Information Using Tukey Method and 95.0% Confidence Địa hình Vùng núi cao Vùng bán sơn địa Vùng phẳng N 3 Mean 27.886 19.054 8.287 Grouping A B C Means that not share a letter are significantly different 154 Sự thay đổi số lượng công thức bạch cầu lợn gây nhiễm lợn đối chứng Two-Sample T-Test and CI: Bạch cầu, Lô lợn Two-sample T for Bạch cầu Lơ lợn Đối chứng Thí nghiệm N 10 10 Mean 15.84 21.78 StDev 2.51 1.62 SE Mean 0.79 0.51 Difference = mu (Đối chứng) - mu (Thí nghiệm) Estimate for difference: -5.932 99% CI for difference: (-8.715, -3.149) T-Test of difference = (vs not =): T-Value = -6.28 P-Value = 0.000 DF = 15 P-Value = 0.246 DF = 15 Two-Sample T-Test and CI: BC Lympho (LY), Lô lợn Two-sample T for BC Lympho (LY) Lô lợn Đối chứng Thí nghiệm N 10 10 Mean 5.86 6.347 StDev 1.08 0.684 SE Mean 0.34 0.22 Difference = mu (Đối chứng) - mu (Thí nghiệm) Estimate for difference: -0.489 99% CI for difference: (-1.352, 0.374) T-Test of difference = (vs not =): T-Value = -1.21 Two-Sample T-Test and CI: BC đơn nhân lớn (MO), Lô lợn Two-sample T for BC đơn nhân lớn (MO) Lơ lợn Đối chứng Thí nghiệm N 10 10 Mean 0.801 0.7433 StDev 0.269 0.0866 SE Mean 0.085 0.027 Difference = mu (Đối chứng) - mu (Thí nghiệm) Estimate for difference: 0.0582 95% CI for difference: (-0.1407, 0.2570) T-Test of difference = (vs not =): T-Value = 0.65 P-Value = 0.529 DF = 10 Two-Sample T-Test and CI: BC có hạt (GR), Lơ lợn Two-sample T for BC có hạt (GR) Lơ lợn Đối chứng Thí nghiệm N 10 10 Mean 8.92 14.19 StDev 1.58 1.34 SE Mean 0.50 0.42 Difference = mu (Đối chứng) - mu (Thí nghiệm) Estimate for difference: -5.266 99% CI for difference: (-7.169, -3.363) T-Test of difference = (vs not =): T-Value = -8.02 P-Value = 0.000 DF = 17 155 So sánh khối lượng lợn trước sau gây nhiễm giun phổi với lợn đối chứng Two-Sample T-Test and CI: Khối lượng trước TN, Lô lợn Two-sample T for Khối lượng trước TN Lô lợn Đối chứng Thí nghiệm N 5 Mean 6.200 6.220 StDev 0.332 0.377 SE Mean 0.15 0.17 Difference = mu (Đối chứng) - mu (Thí nghiệm) Estimate for difference: -0.020 99% CI for difference: (-0.806, 0.766) T-Test of difference = (vs not =): T-Value = -0.09 P-Value = 0.932 DF = Two-Sample T-Test and CI: Khối lượng sau TN, Lô lợn Two-sample T for Khối lượng sau TN Lô lợn Đối chứng Thí nghiệm N 5 Mean 25.260 18.80 StDev 0.841 1.01 SE Mean 0.38 0.45 Difference = mu (Đối chứng) - mu (Thí nghiệm) Estimate for difference: 6.460 99% CI for difference: (4.400, 8.520) T-Test of difference = (vs not =): T-Value = 10.97 P-Value = 0.000 So sánh nguy nhiễm giun phổi theo tập quán chăn nuôi + Nuôi thả rông, bán chăn thả Tiêu chí | + - | Total + -+ Nuôi thả rông | 243 631 | 874 Nuôi bán chăn thả | 118 518 | 636 + -+ Total | 361 1149 | 1510 Tests of significance Fisher exact test (one tailed) Fisher exact test (two tailed) Uncorrected chi-square p-value Yates corrected Chi-square p-value : : : : : : Measures of exposure effect [99% CI] Risk ratio : Odds ratio : Risk difference : Proportional attributable risk : Population proportional attr risk : Vaccine efficacy [99% CI] Vaccine efficacy : 0,000018 0,000031 17,31 0,000032 16,81 0,000041 1,50 1,69 0,09 0,33 0,22 -0,50 [1,16, [1,22, [0,04, [0,14, [0,08, 1,94] 2,35] 0,15] 0,48] 0,35] [-0,94, -0,16] DF = 156 Screening [99% CI] Prevalence Sensitivity Specificity Accuracy Predictive value of +ve result Predictive value of -ve result : : : : : : Matched data Z One-sided p-value Two-sided p-value McNemar Chi-square p-value McNemar odds ratio [99% CI] Difference in proportions [99% CI] : : : : : : : 0,24 0,67 0,45 0,50 0,28 0,81 18,71 0,000000 0,000000 349,99 0,000002 5,35 0,34 [0,21, [0,61, [0,41, [0,47, [0,24, [0,77, 0,27] 0,73] 0,49] 0,54] 0,32] 0,85] [4,11, 6,96] [0,29, 0,39] + Ni thả rơng, nhốt hồn tồn Tiêu chí | + - | Total + -+ Nuôi thả rông | 243 631 | 874 Ni nhốt hồn tồn | 26 336 | 362 -+ -+ Total | 269 967 | 1236 Tests of significance Fisher exact test (one tailed) Fisher exact test (two tailed) Uncorrected chi-square p-value Yates corrected Chi-square p-value : : : : : : Measures of exposure effect [99% CI] Risk ratio : Odds ratio : Risk difference : Proportional attributable risk : Population proportional attr risk : 0,000000 0,000000 63,93 0,000001 62,72 0,000001 3,87 4,98 0,21 0,74 0,67 Vaccine efficacy [99% CI] Vaccine efficacy : -2,87 Screening [99% CI] Prevalence Sensitivity Specificity Accuracy Predictive value of +ve result Predictive value of -ve result : : : : : : 0,22 0,90 0,35 0,47 0,28 0,93 Matched data Z : 23,56 [2,33, [2,84, [0,15, [0,57, [0,48, 6,43] 8,71] 0,26] 0,84] 0,79] [-5,43, -1,33] [0,19, [0,84, [0,31, [0,43, [0,24, [0,88, 0,25] 0,94] 0,39] 0,51] 0,32] 0,96] 157 One-sided p-value Two-sided p-value McNemar Chi-square p-value McNemar odds ratio [99% CI] Difference in proportions [99% CI] : : : : : : 0,000000 0,000000 555,28 0,000003 24,27 0,49 [14,34, 41,46] [0,44, 0,54] + Ni bán chăn thả, nhốt hồn tồn Tiêu chí | + - | Total -+ -+ Nuôi bán chăn thả | 118 518 | 636 Ni nhốt hồn tồn | 26 336 | 362 + -+ Total | 144 854 | 998 Tests of significance Fisher exact test (one tailed) Fisher exact test (two tailed) Uncorrected chi-square : : : 0,000000 0,000000 24,16 Yates corrected Chi-square : 23,25 p-value p-value : : Measures of exposure effect [99% CI] Risk ratio Odds ratio Risk difference Proportional attributable risk : : : 0,000001 0,000002 2,58 2,94 0,11 [1,52, 4,40] [1,64, 5,30] [0,06, 0,17] : 0,61 : -1,58 Prevalence : 0,14 [0,12, 0,18] Specificity : 0,39 [0,35, 0,44] Population proportional attr risk Vaccine efficacy [99% CI] Vaccine efficacy Screening [99% CI] Sensitivity Accuracy Predictive value of +ve result Predictive value of -ve result Matched data Z : : : : 0,50 0,82 0,45 0,19 : 0,93 : 21,05 One-sided p-value : McNemar Chi-square : 443,16 : 19,92 Two-sided p-value p-value McNemar odds ratio [99% CI] Difference in proportions [99% CI] : : : [0,34, 0,77] [0,25, 0,68] [-3,40, -0,52] [0,72, 0,89] [0,41, 0,50] [0,15, 0,23] [0,88, 0,96] 0,000000 0,000000 0,000002 0,49 [11,75, 34,12] [0,43, 0,55] 158 PHỤ LỤC SO SÁNH TRÌNH TỰ ITS2 VÀ cox1 CỦA CÁC MẪU GIUN PHỔI THU THẬP Ở LỢN BẢN ĐỊA TẠI TỈNH ĐIỆN BIÊN M elongatus Việt Nam-1 M elongatus Việt Nam-2 CACCCGAAAA AAAACCGAAT TGCAGACGCT TAGAGTGGTG AAATTTTGAA [ 50] [ 50] M elongatus Việt Nam-1 CGCATAGCGT CGTTGGGTTT TCCCTTCGGC ACATCTGGTT CAGGGTTGTT [100] M elongatus Việt Nam-1 M elongatus Việt Nam-2 AACGATAATA ATACACTCAC ATACATGCAA ATTGTTGAAT GTATGAAAGA [150] [150] M elongatus Việt Nam-1 ATTCATGAAT TCAAAACGTT CATGGTATCG TATGCTTGTA TGCATACGAT [200] [200] M elongatus Việt Nam-1 M elongatus Việt Nam-2 TGATGTGTGT GAGTGTGTGT CGAACGGTAT TTGTCGTCGT CGTCGTCGAT [250] [250] M elongatus Việt Nam-1 GCGATTACCC GTTCAAGTAA AGAATGAAAT GACAGCAACA TGTAATAATA [300] [300] M elongatus Việt Nam-1 M elongatus Việt Nam-2 TGTATGTATT ATTACACTAA ATACAATATG TAGTAGTATG CGTTTATGTT [350] [350] M elongatus Việt Nam-1 M elongatus Việt Nam-2 M elongatus Việt Nam-3 GGTATATATC GTTACTGCCA TCGTCGTGAT ATTGATTTTC AATGGGTATC [400] [400] [400] M elongatus Việt Nam-1 M elongatus Việt Nam-2 TTTGAAGATC ATGAAGTGAA TATTCGTCGA TGAATGACAA GAGTAATGAT [450] [450] M elongatus Việt Nam-1 M elongatus Việt Nam-2 M elongatus Việt Nam-3 ACTTGAATAC TATACATATT GCGAGTAGCA TATAGATTTC ATATTGTATT [500] [500] [500] M elongatus Việt Nam-1 M elongatus Việt Nam-2 TAATTTTTGC AAATGCAACC TGAACTCAGA TGTGATTACC CCCTGAATTT [550] [550] M elongatus Việt Nam-1 M elongatus Việt Nam-2 M elongatus Việt Nam-3 AGCCATAGAA AAGG [564] [564] [564] M elongatus Việt Nam-3 M elongatus Việt Nam-2 M elongatus Việt Nam-3 M elongatus Việt Nam-3 M elongatus Việt Nam-2 M elongatus Việt Nam-3 M elongatus Việt Nam-3 M elongatus Việt Nam-2 M elongatus Việt Nam-3 M elongatus Việt Nam-3 M elongatus Việt Nam-3 M elongatus Việt Nam-3 [ 50] [100] [100] [150] [200] [250] [300] [350] [450] [550] Hình 4.1 So sánh trình tự ITS2 mẫu thuộc loài M elongatus 159 M M M M M M pudendotectus VN-1 pudendotectus VN-2 pudendotectus VN-3 elongatus VN-1 elongatus VN-2 elongatus VN-3 GTA G T T T TTG A A A A ATT TTA CCA GCT TTT GGG A T T T ATT ATT AGT A A A CAT TCA G G G GCT TTG A A A [ [ [ [ [ [ 45] 45] 45] 45] 45] 45] M M M M M M pudendotectus VN-1 pudendotectus VN-2 pudendotectus VN-3 elongatus VN-1 elongatus VN-2 elongatus VN-3 TAT TTA ACT A G G GGT AAA G G G AAA G G G G GAG A A A GTT A A A A TTT GGT TAT TTA G GGA G G G ATG A A A GTT A A A [ [ [ [ [ [ 90] 90] 90] 90] 90] 90] M M M M M M pudendotectus VN-1 pudendotectus VN-2 pudendotectus VN-3 elongatus VN-1 elongatus VN-2 elongatus VN-3 TAT GCT ATT TTG A AGA T T T ATT GGT ATG A A A A ATT GGT TGT GTG A GTT A A A A TGG A A A A GCT [135] [135] [135] [135] [135] [135] M M M M M M pudendotectus VN-1 pudendotectus VN-2 pudendotectus VN-3 elongatus VN-1 elongatus VN-2 elongatus VN-3 CAT C C C CAT ATA G G G TAT ACT A G G G GTT A A A GGA ATG GAT TTG GAT TCT CGA T T T GCT TAT [180] [180] [180] [180] [180] [180] M M M M M M pudendotectus VN-1 pudendotectus VN-2 pudendotectus VN-3 elongatus VN-1 elongatus VN-2 elongatus VN-3 TTT ACT GCT GCT G G G ACT A A A ATG GTT ATT GCT G G G GTT CCT ACT G G G GGG A GTT A AAG A [225] [225] [225] [225] [225] [225] M M M M M M pudendotectus VN-1 pudendotectus VN-2 pudendotectus VN-3 elongatus VN-1 elongatus VN-2 elongatus VN-3 GTT TTT AGT TGA G G G ATA T T T GCT ACT TTG TTT GGA T T T ATA G G G G AAA G G G ATA G G G AAT G .G .G .G TTT [270] [270] [270] [270] [270] [270] M M M M M M pudendotectus VN-1 pudendotectus VN-2 pudendotectus VN-3 elongatus VN-1 elongatus VN-2 elongatus VN-3 CAA G G G G CCT G G G TTA TTG TTG A C C C TGG GTT A TTA G G G GGT TTT ATT TTT TTA G G G G TTT ACT [315] [315] [315] [315] [315] [315] M M M M M M pudendotectus VN-1 pudendotectus VN-2 pudendotectus VN-3 elongatus VN-1 elongatus VN-2 elongatus VN-3 ATT GGT GGT TTA G G G ACT GGG A GTA T T T ATT CTT T.G T.G T.G TCT AAT TCT AGA TTA G G G GAT [360] [360] [360] [360] [360] [360] M M M M M M pudendotectus VN-1 pudendotectus VN-2 pudendotectus VN-3 elongatus VN-1 elongatus VN-2 elongatus VN-3 ATT ATT TTG A C.T C.T C.T CAC T T T T GAT ACT A TAT TAT GTT GTT A A A AGT G G G [393] [393] [393] [393] [393] [393] Hình 4.2 So sánh trình tự cox1 loài M elongatus M pudendotectus ... chống bệnh cho đàn lợn địa tỉnh Điện Biên, thực đề tài: ? ?Nghiên cứu nhiễm giun, sán đường tiêu hóa hơ hấp lợn địa tỉnh Điện Biên, đặc điểm bệnh giun phổi Metastrongylus spp gây biện pháp phòng trị? ??... NCS NGUYỄN VĂN TUYÊN NGHIÊN CỨU NHIỄM GIUN, SÁN ĐƯỜNG TIÊU HĨA VÀ HƠ HẤP Ở LỢN BẢN ĐỊA TỈNH ĐIỆN BIÊN, ĐẶC ĐIỂM BỆNH DO GIUN PHỔI Metastrongylus spp GÂY RA VÀ BIỆN PHÁP PHÒNG TRỊ Ngành: Ký sinh... bố lồi giun, sán đường tiêu hóa hô hấp lợn địa tỉnh Điện Biên 49 Bảng 3.2 Tỷ lệ nhiễm giun, sán lợn địa tỉnh Điện Biên (qua mổ khám) 55 Bảng 3.3 Tỷ lệ nhiễm giun, sán lợn địa tỉnh Điện Biên