(Luận văn thạc sĩ) So sánh trình tự gen GmDREB2 phân lập từ một số giống đậu tương trồng phổ biến ở miền Bắc Việt Nam

(Luận văn thạc sĩ) So sánh trình tự gen GmDREB2 phân lập từ một số giống đậu tương trồng phổ biến ở miền Bắc Việt Nam(Luận văn thạc sĩ) So sánh trình tự gen GmDREB2 phân lập từ một số giống đậu tương trồng phổ biến ở miền Bắc Việt Nam(Luận văn thạc sĩ) So sánh trình tự gen GmDREB2 phân lập từ một số giống đậu tương trồng phổ biến ở miền Bắc Việt Nam(Luận văn thạc sĩ) So sánh trình tự gen GmDREB2 phân lập từ một số giống đậu tương trồng phổ biến ở miền Bắc Việt Nam(Luận văn thạc sĩ) So sánh trình tự gen GmDREB2 phân lập từ một số giống đậu tương trồng phổ biến ở miền Bắc Việt Nam(Luận văn thạc sĩ) So sánh trình tự gen GmDREB2 phân lập từ một số giống đậu tương trồng phổ biến ở miền Bắc Việt Nam(Luận văn thạc sĩ) So sánh trình tự gen GmDREB2 phân lập từ một số giống đậu tương trồng phổ biến ở miền Bắc Việt Nam(Luận văn thạc sĩ) So sánh trình tự gen GmDREB2 phân lập từ một số giống đậu tương trồng phổ biến ở miền Bắc Việt Nam(Luận văn thạc sĩ) So sánh trình tự gen GmDREB2 phân lập từ một số giống đậu tương trồng phổ biến ở miền Bắc Việt Nam(Luận văn thạc sĩ) So sánh trình tự gen GmDREB2 phân lập từ một số giống đậu tương trồng phổ biến ở miền Bắc Việt Nam(Luận văn thạc sĩ) So sánh trình tự gen GmDREB2 phân lập từ một số giống đậu tương trồng phổ biến ở miền Bắc Việt Nam(Luận văn thạc sĩ) So sánh trình tự gen GmDREB2 phân lập từ một số giống đậu tương trồng phổ biến ở miền Bắc Việt Nam(Luận văn thạc sĩ) So sánh trình tự gen GmDREB2 phân lập từ một số giống đậu tương trồng phổ biến ở miền Bắc Việt Nam(Luận văn thạc sĩ) So sánh trình tự gen GmDREB2 phân lập từ một số giống đậu tương trồng phổ biến ở miền Bắc Việt Nam(Luận văn thạc sĩ) So sánh trình tự gen GmDREB2 phân lập từ một số giống đậu tương trồng phổ biến ở miền Bắc Việt Nam(Luận văn thạc sĩ) So sánh trình tự gen GmDREB2 phân lập từ một số giống đậu tương trồng phổ biến ở miền Bắc Việt Nam(Luận văn thạc sĩ) So sánh trình tự gen GmDREB2 phân lập từ một số giống đậu tương trồng phổ biến ở miền Bắc Việt Nam(Luận văn thạc sĩ) So sánh trình tự gen GmDREB2 phân lập từ một số giống đậu tương trồng phổ biến ở miền Bắc Việt Nam(Luận văn thạc sĩ) So sánh trình tự gen GmDREB2 phân lập từ một số giống đậu tương trồng phổ biến ở miền Bắc Việt Nam

m ĐẠI HỌC THÁI NGUYÊN TRƢỜNG ĐẠI HỌC KHOA HỌC ĐINH THỊ HƢNG SO SÁNH TRÌNH TỰ GEN GmDREB2 PHÂN LẬP TỪ MỘT SỐ GIỐNG ĐẬU TƢƠNG TRỒNG PHỔ BIẾN Ở MIỀN BẮC VIỆT NAM LUẬN VĂN THẠC SĨ CÔNG NGHỆ SINH HỌC Thái Nguyên – 2014 Số hóa Trung tâm Học liệu http://www.lrc-tnu.edu.vn/ ĐẠI HỌC THÁI NGUYÊN TRƢỜNG ĐẠI HỌC KHOA HỌC ĐINH THỊ HƢNG SO SÁNH TRÌNH TỰ GEN GmDREB2 PHÂN LẬP TỪ MỘT SỐ GIỐNG ĐẬU TƢƠNG TRỒNG PHỔ BIẾN Ở MIỀN BẮC VIỆT NAM Chuyên ngành: Công nghệ sinh học Mã số: 60.42.02.01 LUẬN VĂN THẠC SĨ CÔNG NGHỆ SINH HỌC Ngƣời hƣớng dẫn khoa học: GS.TS Chu Hoàng Mậu Thái Nguyên – 2014 Số hóa Trung tâm Học liệu http://www.lrc-tnu.edu.vn/ i LỜI CAM ĐOAN Tơi xin cam đoan nội dung trình bày luận văn tơi tìm hiểu dƣới hƣớng dẫn GS.TS Chu Hoàng Mậu Các số liệu kết trình bày luận văn trung thực chƣa đƣợc công bố cơng trình Mọi trích dẫn luận văn ghi rõ nguồn gốc Tác giả Đinh Thị Hƣng Số hóa Trung tâm Học liệu http://www.lrc-tnu.edu.vn/ ii LỜI CẢM ƠN Tơi xin bày tỏ lịng biết ơn tới GS.TS Chu Hồng Mậu tận tình hƣớng dẫn, truyền đạt kiến thức kinh nghiệm quý báu để tơi hồn thành Bản luận văn thạc sĩ Cơng nghệ sinh học Tôi xin chân thành cảm ơn TS , ThS thầy cô Bộ môn Di truyền học & Sinh học đại, khoa Sinh – K , Trƣờng Đại học Sƣ phạm - Đại học Thái Nguyên giúp đỡ tạo điều kiện thuận lợi cho tơi suốt q trình thực Tơi xin cảm ơn PGS.TS Nguyễn Vũ Thanh Thanh, Trƣởng khoaKhoa Khoa học sống, Trƣờng Đại học Khoa học - Đại học Thái Ngun TS nhiệt tình giúp đỡ tơi trình thực đề tài - Cuối cùng, tơi xin bày tỏ lịng biết ơn tới tồn thể gia đình, cảm ơn bạn bè đồng nghiệp cổ vũ, động viên suốt thời gian qua Tác giả Đinh Thị Hƣng Số hóa Trung tâm Học liệu http://www.lrc-tnu.edu.vn/ iii MỤC LỤC Trang Trang phụ bìa Lời cảm ơn i Lời cam đoan ii Mục lục iii Danh mục ký hiệu, chữ viết tắt .vi Danh mục bảng vii Danh mục hình viii MỞ ĐẦU 1 Đặt vấn đề Mục tiêu nghiên cứu Nội dung nghiên cứu Chƣơng TỔNG QUAN TÀI LIỆU 1.1 CÂY ĐẬU TƢƠNG VÀ TÁC ĐỘNG CỦA HẠN ĐẾN CÂY ĐẬU TƢƠNG 1.1.1 Cây đậu tƣơng 1.1.2 Tác động hạn đến đậu tƣơng 11 1.1.3 Đặc điểm sinh học đậu tƣơng 1.1.4 Giá trị kinh tế đậu tƣơng 1.1.5 Tình hình sản xuất đậu tƣơng giới Việt Nam 1.2 GEN DREB VÀ DREB2 Ở CÂY ĐẬU TƢƠNG 13 1.2.1 Gen DREB 13 1.2.2 DREB2 gen GmDREB2 16 Chƣơng VẬT LIỆU VÀ PHƢƠNG PHÁP NGHIÊN CỨU 21 2.1 VẬT LIỆU, HÓA CHẤT VÀ THIẾT BỊ 21 2.1.1 Vật liệu nghiên cứu 21 2.1.2 Hoá chất thiết bị 22 2.1.3 Địa điểm nghiên cứu 22 2.2 PHƢƠNG PHÁP NGHIÊN CỨU 22 Số hóa Trung tâm Học liệu http://www.lrc-tnu.edu.vn/ iv 2.2.1 Các phƣơng pháp sinh học phân tử 22 2.2.2 Phƣơng pháp phân tích xử lý trình tự gen 30 Chƣơng KẾT QUẢ VÀ THẢO LUẬN 31 3.1 KẾT QUẢ TỪ HAI GIỐNG ĐẬU TƢƠNG CBD DVN5 31 3.1.1 Kết nhân gen DREB2 31 ả GmDREB2 32 3.2 SO SÁNH TRÌNH TỰ GEN DREB2 VÀ TRÌNH TỰ 36 GmDREB2 36 3.2.2 So sánh trình tự ống đậu tƣơng CBD, DVN5 vớ ố AAY89658 40 3.2.3 Kết so sánh vùng AP2 protein DREB2 số giống đậu tƣơng nghiên cứu 41 3.3 SO SÁNH TRÌNH TỰ NUCLEOTIDE VÀ TRÌNH TỰ AMINO 42 3.3.1 Kết so sánh trình tự gen DREB2 số giống đậu tƣơng Việ 054363 42 3.3.2 So sánh trình tự amino acid suy diễn số giống đậu tƣơng Việ 89658 45 3.3.3 Kết so sánh vùng AP2 protein DREB2 tƣơng CBD, DVN5, BG, ống đậu 89658 46 KẾT LUẬN VÀ ĐỀ NGHỊ 48 KẾT LUẬN 48 ĐỀ NGHỊ 48 TÀI LIỆU THAM KHẢO 50 Số hóa Trung tâm Học liệu http://www.lrc-tnu.edu.vn/ v DANH MỤC CÁC KÝ HIỆU, CÁC CHỮ VIẾT TẮT ABA Abscisis acid bp Cặp base Cs Cộng cDNA Complementary DNA( Sợi DNA bổ sung đƣợc tổng hợp từ RNA thông tin nhờ enzym phiên mã ngƣợc) DREB Dehydration- Responsive Element Binding EDTA Ethyen Diamin Tetraacetic Acid kb Kilo base PCR Polymerase Chain Reaction (Phản ứng chuỗi polymerase) RNA Ribonucleic Acid TAE Tris acetat EDTA CBD Cao Bằng Đen DVN5 Giống ĐVN5 Số hóa Trung tâm Học liệu http://www.lrc-tnu.edu.vn/ vi DANH MỤC CÁC BẢNG Trang Bả ản lƣợng đậ , ệ .9 Bảng 2.1 Nguồn gốc giống đậu tƣơng nghiên cứu 21 2.2 Thành phần phản ứng tổng hợp cDNA .24 Bảng 2.3 Thành phần phản ứng PCR nhân gen DREB2 25 Bảng 2.4 Chu kỳ nhiệt cho phản ứng PCR nhân gen DREB2 25 Bảng 2.6 Thành phần phản ứng colony – PCR 28 Bảng 2.7 Chu trình nhiệt phản ứng colony – PCR 29 Bảng 3.1 Các vị trí sai khác trình tự đoạn gen GmDREB2 hai giống đậu tƣơng CBD DVN5 với gen GmDREB2 có mã số DQ054363 39 ữa trình tự Bả 89658 41 ữa trình tự Bả 89658 42 Gm 42 ữa trình tự đoạn genGmDREB2 giống đậu Bả tƣơng Việ ự có mã số DQ054363 .44 ữa trình tự amin Bảng 3.6 89658 46 ữa trình tự Bảng 3.7 tƣơng Việ Số hóa Trung tâm Học liệu 89658 47 http://www.lrc-tnu.edu.vn/ vii DANH MỤC CÁC HÌNH Trang Hình 1.1 Sơ đồ mơ tả gen vùng mã hóa gen GmDREB2 đậu tƣơng 18 Hình 1.2 Sơ đồ mơ tả protein DREB2 đậu tƣơng 19 Hình 1.3 Trình tự amino acid vùng AP2 protein DREB2 đậu tƣơng 19 Hình 2.1 Hạt hai giống đậu tƣơng nghiên cứu 21 ệ ản phẩ i giống đậ Gm ệ 32 ản phẩm PCR tinh 33 34 Hình 3.4 Hình ảnh điện di sản phẩm colony- PCR từ khuẩn lạc 35 Hình 3.5 Hình ảnh điện di sản phẩm tách plasmid tái tổ hợp mang đoạn gen GmDREB2 36 Hình 3.6 Trình tự đoạn gen DREB2 hai giống đậu tƣơng nghiên cứu giống đậu tƣơng GenBank có mã số DQ054363 38 Hình 3.7 tƣơng nghiên 89658 40 89658 41 Hình 3.9 Gm 054363 44 Hình 3.10 89658 45 89658 47 Số hóa Trung tâm Học liệu http://www.lrc-tnu.edu.vn/ MỞ ĐẦU Đặt vấn đề Cây đậu tƣơng (Glycine max (L.) Merrill ) loại trồng thuộc họ đậu, loại công nghiệp ngắn ngày có vai trị quan trọng khơng mặt kinh tế dinh dƣỡng mà việc cải tạo đất Hạt đậu tƣơng có hàm lƣợng protein cao, từ 20-45%, dễ tan chứa hầu hết loại acid amin, đặc biệt loại amino acid khơng thay Ngồi ra, rễ đậu tƣơng có nốt sần, kết cộng sinh vi khuẩn Rhizobium japonicum với rễ tạo khả cố định nitơ khơng khí Vì vậy, đậu tƣơng loại trồng có tác dụng cải tạo đất, làm trồng vụ sau phát triển tốt hơn, góp phần phá vỡ chu kỳ sâu bệnh, chống ô nhiễm môi trƣờng lạm dụng phân bón thuốc trừ sâu [6] Việt Nam nƣớc nông nghiệp nhiệt đới, đậu tƣơng đƣợc trồng với ba mục đích giải vấn đề thiếu protein cho ngƣời gia súc, xuất cải tạo đất Trong năm gần biến đổi khí hậu tồn cầu, hạn hán xảy thƣờng xuyên làm cho đất nông nghiệp bị hoang hóa, tác động xấu đến sinh trƣởng, phát triển, làm giảm suất sản lƣợng trồng Đặc biệt đậu tƣơng loại trồng thuộc nhóm chịu hạn Bên cạnh kỹ thuật canh tác, ảnh hƣởng sâu bệnh giống hạn hán xảy nguyên nhân làm giảm khả sinh trƣởng, phát triển, giảm suất, chất lƣợng hạt, chọn giống đậu tƣơng theo định hƣớng tăng cƣờng khả chịu hạn cao cải thiện đặc tính chịu hạn đậu tƣơng yêu cầu thực tiễn đặt cho ngành nơng nghiệp nói chung ngành sản xuất đậu tƣơng nói riêng Đặc tính chịu hạn tính trạng đa gen, có nhóm gen mà sản phẩm chúng liên quan trực tiếp đến biểu Số hóa Trung tâm Học liệu http://www.lrc-tnu.edu.vn/ 40 3.2.2 So sánh trình tự amino acid AAY89658 trình tự amino acid GmDREB2 hai giống đậu tƣơng CBD, DVN5 vớ DREB2 có mã số AAY89658 GenBank (AAY89658 DQ054363 cho thấy trình tự amino acid có độ tƣơng đồng 98,1 96,9% 3.7) 3.2) Cụ thể acid CBD vị trí 3, 68, 90 DVN5 trình tự amino vị trí 14, 32, 68, 114, 153 Hình 3.7 ứ Số hóa Trung tâm Học liệu 89658 http://www.lrc-tnu.edu.vn/ 41 Bảng 3.2 khác trình tự 89658 TT Vị trí AAY89658 CBD DVN5 amino acid E V E 14 T T R 32 K K N 68 T A A 90 P A P 114 K K Q 153 E E G 3.2.3 Kết so sánh vùng AP2 protein DREB2 số giống đậu tƣơng nghiên cứu so sánh trình tự 89658 (Hình 3.10) Hình 3.8 89658 Kết cho thấy vùng AP2 protein DREB2 gồm 59 acid amin từ acid amin thứ 34 đến acid amin thứ 92 có độ tƣơng đồng cao so với giống có mã số AAY89658 Gi Số hóa Trung tâm Học liệu t vị trí (vị trí thứ http://www.lrc-tnu.edu.vn/ 42 35) tƣơng đồng 98.1%, giống CBD 35 57 (Bảng 3.3) Bảng 3.3 sai khác trình tự 89658 TT Vị trí amino acid AAY89658 CBD DVN5 35 T A A 57 P A P 3.3 SO SÁNH TRÌNH TỰ NUCLEOTIDE GEN GmDREB2 3.3.1 Kết so sánh trình tự gen GmDREB2 số giống đậu tƣơng Việt Nam 054363 GmDREB2 GmDREB2 DQ054363 3.9 3.4 GmDREB2 STT DQ054363 2006 Wang N et al DVN5 HG965098 2014 Dao TX et al CBD HG965099 2014 Dao TX et al BG HG965100 2014 Hoang TX et al BS HG965101 2014 Hoang TX et al Số hóa Trung tâm Học liệu http://www.lrc-tnu.edu.vn/ 43 Số hóa Trung tâm Học liệu http://www.lrc-tnu.edu.vn/ 44 Hình 3.9 n GmDREB2 g BG, BS, CBD, DVN5 v DQ054363 giống (CBD : 8, 10, 33, 41, 44, 69, 96, 159, 163, 165, 178, 202, 219, 261, 268, 284, 340, 458, 459, 465 3.5) Bảng 3.5 sai khác trình tự đoạn gen GmDREB2 giống đậu tƣơng Việt Nam v trình tự có mã số DQ054363 TT Vị trí nucleotide DQ054363 CBD DVN5 BG BS A T A A A 10 G G G G T 33 C C T C C 41 C C G C C 44 C C C C A 69 A A G A A 96 G G C G G 159 T C C C C 163 C A A A A 10 165 T G G G G 11 178 C T T T T 12 202 A G G G G 13 219 T C C C C 14 261 C T T T T 15 268 C G C C C 16 284 A A A A G Số hóa Trung tâm Học liệu http://www.lrc-tnu.edu.vn/ 45 17 340 A A C A A 18 458 A A G A A 19 459 G G A G G 20 465 C C C C G 3.3.2 So sánh trình tự amino acid suy diễn số giống 89658 so sánh g (CBD, DVN5, BG, BS) v 89658 3.10 Hình 3.10 T tƣơng CBD, DVN5, BG, BS v 89658 3.10 acid: 3, 14, 32, 68, 90, 114, 153 Số hóa Trung tâm Học liệu 3.6) http://www.lrc-tnu.edu.vn/ 46 Bảng 3.6 sai khác trình tự ami tƣơng CBD, DVN5, BG, BS v 89658 TT Vị trí amino acid AAY89658 CBD DVN5 BG BS E V E E E 14 T T R T T 32 K K N K K 68 T A A A A 90 P A P P P 114 K K Q K K 153 E E G E E 3.3.3 Kết so sánh vùng AP2 protein DREB2 tƣơng CBD, DVN5, BG, giống đậu 89658 Trên sở trình tự trình tự , DVN5, AAY89658 (Hình 3.10) Kết so sánh cho thấy vùng AP2 protein DREB2 gồm 59 amino acid, từ cao (98,3%), thứ 34 đến 92 độ tƣơng đồng hai vị trí amino acid (35, 57) (Bảng 3.7) Số hóa Trung tâm Học liệu http://www.lrc-tnu.edu.vn/ 47 Hình 3.11 T (BD, DVN5, BG, BS) 89658 Trên hình 3.11 cho thấy vùng AP2 có độ tƣơng đồng giống đậu tƣơng Việt Nam 98,3% Các giống BG, BS, DVN5 khác vị trí số 35 cịn giống CBD khác vị trí 35 57 (Bảng 3.7) Bảng 3.7 sai khác trình tự ệt Nam (BD, DVN5, BG, BS) 89658 Vị trí AAY89658 amino acid CBD DVN5 BG BS 35 T A A A A 57 P A P P P Số hóa Trung tâm Học liệu http://www.lrc-tnu.edu.vn/ 48 KẾT LUẬN VÀ ĐỀ NGHỊ KẾT LUẬN 1.1 Đã nhân bản, tách dịng thành cơng xác định trình tự nucleotide gen GmDREB2 từ hai giống CBD DVN5 Gen GmDREB2 có 480 nucleotide, mã hóa 159 amino acid có 59 amino acid vùng AP2 1.2 gen GmDREB2 98% hai , DVN5 protein DREB2 acid (35, 57) gen GmDREB2 13 acid protein ĐỀ NGHỊ gen GmDREB2 để thiết kế vector phục vụ tạo chuyển gen nhằm cải thiện khả chịu hạn đậu tƣơng Việt Nam Số hóa Trung tâm Học liệu http://www.lrc-tnu.edu.vn/ 49 Dao TX., Dinh HT,., Ho TM., Vu TTT., Nguyen TNT., Nguyen VTT,., Le VS and Chu HM (2014) Glycine max mRNA for transcription factor DREB2 protein (DREB2 gene), cultivar CaoBangDen (CBD) GenBank, HG965099.1 Dao TX., Dinh HT,., Ho TM., Vu TTT., Nguyen TNT., Nguyen VTT,., Le VS and Chu HM (2014) Glycine max mRNA for transcription factor DREB2 protein (DREB2 gene), cultivar VietNam5 (DVN5) GenBank, HG965098.1 Số hóa Trung tâm Học liệu http://www.lrc-tnu.edu.vn/ 50 TÀI LIỆU THAM KHẢO Tiếng Việt Ngô Thế Dân (1999), Cây Đậu Tương, Nxb Nông Nghiệp Đƣờng Hồng Dật (2008 , Cây Đậu Tương - thâm canh tăng suất đẩy mạnh phát triển), Nxb Nơng Nghiệp Lê Dỗn Diên, Trƣơng Văn Đến, Nguyễn Bá Trinh (1989), Nâng cao chất lượng nông sản, tập 2,(đậu tương), Nxb Nông nghiệp, Hà Nội Trần Văn Điền (2007), Giáo Trình Cây Đậu Tương, Nxb Nơng Nghiệp Trần Thị Phƣơng Liên (1999), Nghiên cứu đặc tính hoá sinh sinh học phân tử số giống đậu tương có khả chịu nóng, chịu hạn Việt Nam, Luận án tiến sĩ Sinh học, Viện Cơng nghệ Sinh học, Hà Nội Trần Đình Long (2000), Cây đậu tương, Nxb Nông nghiệp Hà Nội з Chu Hồng Mậu (2008), Phương pháp phân tích di truyền đại chọn giống trồng, Nxb Đại học Thái Ngun Chu Hồng Mậu, Nơng Thị Man, Lê Trần Bình (2001), Đánh giá số tính trạng kinh tế quan trọngvà khả chịu hạn dòng đậu tương (Glycine max (L.) Merril) Đột biến, Tạp chí Khoa học Công nghệ,1(13), Đại Học Thái guyên,16-21 Chu Hoàng Mậu, Nguyễn Thị Thúy Hƣờng, Nguyễn Vũ Thanh Thanh, Chu Hồng Hà (2011), Gen đặc tính chịu hạn đậu tương Nxb Đại học Quốc Gia, Hà Nội 10 Phạm Văn Thiều (2008), Cây đậu Tương - Kỹ thuật trồng chế biến sản phẩm, Nxb Nơng nghiệp Số hóa Trung tâm Học liệu http://www.lrc-tnu.edu.vn/ 51 Tiếng Anh 11 Arumingtyas,E.L., Sugianto,A and Pahlevi,M.R.(2011),Glycine max cultivar Wilis dehydration-responsive element binding protein (DREB2) gene, partial cds,NCBI, JF946771 12 Chen F., Chen S.Y and Liu Q (2002), Isolation of a rice cDNA encoding a DREB-like protein induced by stresses NCBI, Gen Bank, Accession AY064403 13 Chen J, Xia X, Yin W (2009), Expression profiling and functionalcharacterization of a DREB2-type gene from Populus euphratica College of Forestry, Beijing Forestry University, No 35, Qinghua East Road, Beijing 100083,China 14 Chen M., Wang Q Y, Cheng X G, Xu Z S, Li L C, Ye X G, Xia L Q, Ma Y Z., (2007) GmDREB2, a soybean DRE-binding transcription factor, conferred drought and high-salt tolerance in transgenic plants Biochem Biophys Res Commun 353(2):299-305 15 Chen,M., Xu,Z., Xia,L., Li,L., Cheng,X., Dong,J., Wang,Q and Ma,Y, (2013),Glycine max dehydration responsive element-binding protein (DREB3), mRNA,NCBI, NM_001250024 16 Chen Y., Chen P and de los Reyes B.G (2004), Analysis of the expression of DREB1 gene orthologs in cultivated and wild species of soybean NCBI, Gen Bank, Accession AY802779 17 Fujita Y., Fujita M., Satoh R., Maruyama K., Parvez M M., Seki M., Hiratsu K., Ohme-Takagi M., Shinozaki K., Yamaguchi-Shinozaki K., (2005), AREB1 is a transcription activator of novel ABRE-dependent ABA signaling that enhances drought stress tolerance in Arabidopsis, Plant Cel, 17(12), pp 3470-88 18 Gaiyun Zhang, Ming Chen, Liancheng Li, Zhaoshi Xu, Xueping Chen, JiamingGuo and Youzhi Ma, (2009), Overexpression of the soybean Số hóa Trung tâm Học liệu http://www.lrc-tnu.edu.vn/ 52 GmERF3 gene, an AP2/ERF type transcription factor for increased tolerances to salt, drought, and diseases in transgenic tobacco , Journal of Experimental Botany, 60(13), pp 3781-3796 19 Huang B., Jin,L and Liu J.(2007), Molecular cloning and functional characterization of a DREB1/CBF-like gene (GhDREB1L) from cotton, Sci China, C, Life Sci 50 (1), 7-14 20 Hoang TX,(.T.N.U.)., Pham TT,(.A.D.T.)., Le DH,(.T.N.U.)., Nguyen VTT, (.T.N.U.)., Le VS,(.A.D.T.) and Chu ,(.T.N.U.),(2014),Glycine max mRNA for transcription factor DREB2 protein (DREB2 gene), cultivar BacSon - LangSon (BS),NCBI,HG965101 21 Hoang TX,(.T.N.U.)., Pham TT,(.A.D.T.)., Le DH,(.T.N.U.)., Nguyen VTT,(.T.N.U.)., Le VS,(.A.D.T.) and Chu HM,(.T.N.U.),(2014),Glycine max mRNA for transcription factor DREB2 protein (DREB2 gene), cultivar BacGiang (BG),HG965100 22 Kobayashi F, Ishibashi M, Takumi S (2008) Transcriptional activation of Cor/Lea genes and increase in abiotic stress tolerance through expression of a wheat DREB2 homolog in transgenic tobacco Laboratory of Plant Genetics, Graduate School of Agricultural Science, Kobe University, 1-1 Rokkodai-cho, Nada-ku, Kobe, 657-8501, Japan 23 Li X.P., Tian A.G., Luo G.Z., Gong Z.Z., Zhang J.S., Chen S.Y., (2005), Soybean DRE-binding transcription factors that are responsive to abiotic stresses, Theor Appl Genet, 110(8), pp 1355-62 24 Liu L, Zhu K, Yang Y, Wu J, Chen F, Yu D.(2008), Molecular cloning, expression profiling and trans-activation property studies of a DREB2-like gene from chrysanthemum (Dendranthema vestitum) National Center for Soybean Improvement, National Key Laboratory of Crop Genetics and Số hóa Trung tâm Học liệu http://www.lrc-tnu.edu.vn/ 53 Germplasm Enhancement, Nanjing Agricultural University, Nanjing, 210095, People's Republic of China 25 Li,L.B., Bai,R., He,C.F., Ren,Q., Wang,Y.M., Zhang,J.X and Liu,(2007) Cymbidium insigne DRE-binding protein DREB1 (DREB1) mRNA, complete cds,NCBI, EF654657 26 Liu,M., Wang,N., Ma,Y.Z and Cheng,X.G(2005),Glycine max dehydration responsive element-binding protein 3, (DREB3) mRNA, complete cds,NCBI, DQ055133 27 Liao Y., Zou H.F., Wang H.W., Zhang W.K., Ma B., Zhang J.S., Chen S.Y., (2008), Soybean GmMYB76, GmMYB92, and GmMYB177 genes confer stress tolerance in transgenic Arabidopsis plants, Cell Res, 18(10), pp 1047–1060 28 Liu W and Feng F (2008), Nicotiana tabacum DREB4 mRNA, complete cds, College of Life Science, Henan Agricultural University, Wenhua Road, Zhengzhou, Henan 450002, P.R China 29 Lucas S., Hammon N., Glavina del Rio T., Detter J., Dalin E., Tice H., Pitluck S., Tuskan G., Chapman J., Putnam N.H., (2005), Populus trichocarpa AP2/ERF domain-containing transcription factor (DREB11), mRNA, US DOE Joint Genome Institute, 2800, Mitchell Drive B100, Walnut Creek, CA 94598-1698, USA 30 Nakashima K, Shinwari ZK, Skuma Y, Seki M, Miura S, Shinozaki K, Yamaguchi-Shinozaki K (2000), Organization and expression of two Arabidopsis DREB2 genes encoding DRE-binding proteins involved in dehydration- and high-salinity-responsive gene expression Biological Resources Division, Japan International Research Center for Agricultural Sciences, Tsukuba, Ibaraki Số hóa Trung tâm Học liệu http://www.lrc-tnu.edu.vn/ 54 31 Nguyen,V.T.T., Chu,H.M., Hoang,V.M.and Le,D.H(2011),Glycine max dreb5 gene for drought responsive element binding protein, cultivar VangNganSon (DREB5)gene,NCBI, HE647690 32.Nguyen,V.T.T., Chu,M.H., Hoang,M.V and Le,H.D(2012),Glycine max dreb5 gene for drought responsive element binding protein 5, cultivar XanhBaBe (DREB5)gene,NCBI, HE648567 33 Qin F., Li J., Zhao J., Chen S.-Y and Liu Q (2002) Isolation of a maize cDNA encoding an DREB-like protein induced by stress, NCBI, Gen Bank, Accession AF448789 34 Li X.P., Tian A.G., Luo G.Z., Gong Z.Z., Zhang J.S., Chen S.Y., (2005), Soybean DRE-binding transcription factors that are responsive to abiotic stresses, Theor Appl Genet, 110(8), pp 1355-62 35 Wang P.R., Deng X.J., Gao X.L., Chen J., Wan J., Jiang H., Xu Z.J., (2006), “Progress in the study on DREB transcription factor”, Yi Chuan, 28(3), pp 369-74 36 Yang K., Moon J.K., Jeong N., Back K., Kim H.M., Jeong S.C., (2008), Genome structure in soybean revealed by a genomewide genetic map constructed from a single population NCBI, Accession EU036414, Http://www.ncbi.nlm.nih.gov 37 Zhen Y and Ungerer M C (2008), “Relaxed selection on the CBF/DREB1 regulatory genes and reduced freezing tolerance in the southern range of Arabidopsis thaliana”Mol Biol E, 25 (12), 2547-2555 38 http://www.gos.gov.vn 39 http://www.ncbi.nlm.nih.gov/nucleccore} 40 http://faostat.fao.org Số hóa Trung tâm Học liệu http://www.lrc-tnu.edu.vn/ ... HỌC ĐINH THỊ HƢNG SO SÁNH TRÌNH TỰ GEN GmDREB2 PHÂN LẬP TỪ MỘT SỐ GIỐNG ĐẬU TƢƠNG TRỒNG PHỔ BIẾN Ở MIỀN BẮC VIỆT NAM Chuyên ngành: Công nghệ sinh học Mã số: 60.42.02.01 LUẬN VĂN THẠC SĨ CÔNG NGHỆ... định trình tự gen GmDREB2 từ hai mẫu đậu tƣơng nghiên cứu; (ii) So sánh trình tự gen GmDREB2 phân lập, trình tự amino acid suy diễn vùng AP2 protein DREB2 hai với trình tự cơng bố (iii) So sánh trình. .. 35 T A A 57 P A P 3.3 SO SÁNH TRÌNH TỰ NUCLEOTIDE GEN GmDREB2 3.3.1 Kết so sánh trình tự gen GmDREB2 số giống đậu tƣơng Việt Nam 054363 GmDREB2 GmDREB2 DQ054363 3.9 3.4 GmDREB2 STT DQ054363 2006